Штамм бактерий bacillus spp. kr-083 в качестве средства для защиты растений от фитопатогенных микроорганизмов и стимуляции их роста

Изобретение относится к биотехнологии и касается нового штамма ризосферных бактерий Bacillus spp. KR-083, депонированного под №148 ВНИИСХИ-Д, в качестве средства для защиты сельскохозяйственных растений от фитопатогенных микроорганизмов и стимуляции их роста. Штамм Bacillus spp. KR-083 был выделен из корней риса, произрастающего в провинции Иенгнам Республики Южная Корея. Изобретение позволяет одновременно достичь защиты растений от фитопатогенных микроорганизмов и стимулировать рост растений. 6 табл.

Реферат

Изобретение относится к биотехнологии и касается нового штамма ризосферных бактерий Bacillus spp. KR-083 в качестве средства для защиты сельскохозяйственных растений от фитопатогенных микроорганизмов и стимуляции их роста.

Известно и описано изобретение «Биопрепарат Фитоспорин для защиты растений от болезней» по патенту РФ №2099947 с приоритетом от 15.11.1996 г. на имя Института Микробиологии и вирусологии НАН Украины (UA) и Научно-производственного объединения "Башкирское" (RU), публикация 27.12.1997 г.

Основу биопрепарата «Фитоспорин» составляет штамм бактерий Bacillus Subtilis ВНИИСХМ 128 с концентрацией клеток 109-1010 на 1 мл физраствора в количестве 92-98 об. % и наполнитель в количестве 2-8 об. %.

При этом штамм Bacillus Subtilis ВНИИСХМ 128 характеризуется высокой антагонистической активностью в отношении фитопатогенных бактерий и грибов, что позволяет использовать его для защиты различных видов сельскохозяйственных, декоративных, древесных растений (прототип).

Задачей заявленного изобретения является выявление штамма, пригодного для использования в сельском хозяйстве не только с целью защиты растений от фитопатогенных микроорганизмов, но и одновременно с целью стимуляции их роста.

Указанная задача решается за счет того, что для защиты сельскохозяйственных растений от фитопатогенных микроорганизмов и одновременно стимуляции их роста используется штамм ризосферных бактерий Bacillus spp. KR-083.

Сокращение «spp» в названии штамма означает, что бактерии принадлежат роду Bacillus, но не идентифицируются по виду, т.к. имеют значительные различия с имеющимися известными видами.

Штамм ризосферных бактерий Bacillus spp. KR-083 был выделен из корней риса, произрастающего в провинции Иенгнам Республики Южная Корея и депонирован под регистрационным номером «148 ВНИИСХМ-Д» от 14.07.2005 г.

Среда культивирования: картофельный агар (200 г картофеля, глюкоза 10 г, агар 20 г на 1 л среды). Температура 28°С, рН среды 6,8-7,0, микроаэрофил. Время культивирования при 28°С составляет 48 часов.

Штамм характеризуется следующими морфолого-культуральными и физиолого-биохимическими признаками.

Клетки имеют форму правильных палочек с закругленными концами и монополярным перитрихиальным расположением жгутиков. Размер клеток составляет (1,5-2,0)×(0,8-1,0) мкм. Через 24 часа роста на жидкой питательной среде наблюдается накопление поли-β-оксибутирата. Штамм образует споры, положительно окрашивается по Граму. Рост в жидкой и полужидкой питательной среде микроаэрофильный, метаболизм дыхательный.

На картофельно-декстрозном агаре образует круглые, непрозрачные, бесцветные, слизистые колонии с ровными краями. Диаметр колоний 3-5 мм. Оптимальная температура для роста (28-37)°С. При температуре более 45°С и менее 11°С рост замедленный. Оптимальное значение рН среды 6,8, рост происходит также при рН от 5,5 до 7,5.

Штамм KR-083 способен фиксировать молекулярный азот, не гидролизует казеин и крахмал, медленно коагулирует лакмусовое молоко с обесцвечиванием лакмуса. У штамма наблюдается рост при 4°С, наличии 7% NaCl и 0,001% лизоцима. Штамм обладает денитрифицирующей активностью до газообразного азота.

В качестве единственного источника углерода штамм KR-083 использует глюкозу, арабинозу, ксилозу, лактозу, галактозу, фруктозу, сахарозу, мальтозу, маннит с образованием кислоты, а также рамнозу декстрин и крахмал с образованием щелочи.

Выявлено и экспериментально установлено, что штамм KR-083 проявляет антагонистические свойства по отношению к возбудителям болезней сельскохозяйственных культур - фитопатогенных бактерий и грибов:

- для пшеницы озимой и яровой - штамм эффективен против мучнистой росы (Erysiphe graminis), бурой ржавчины (Puccinia recondita), фузариозной корневой гнили (Fusarium culmorum);

- для ячменя ярового - эффективен против плесневения семян (Penicillium, Alternaria), корневых гнилей (Bipolaris sorokiniana);

- для капусты белокочанной и цветной - эффективен против сосудистого бактериоза (Xanthomonas campestris), черной ножки (Rhizoctonia solani), питиозной корневой гнили (Pythium irregulare);

- для картофеля - эффективен против фитофтороза (Phytophtora infestans), ризоктониоза (Rhizoctonia solani), фузариозного увядания (Fusarium oxysporum);

- для винограда - эффективен против милдью (Plasmopara viticola), оидиума (Uncinula necator), серой гнили (Botrytis cinerea).

В таблице 1, 2 представлены сравнительные результаты по антагонистической активности двух штаммов бактерий: Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 (продуцента биопрепарата Фитоспорин) и заявляемого штамма Bacillus spp. KR083, по отношению к фитопатогенным микроорганизмам.

Таблица 1.Антагонистическая активность штаммов ризосферных бактерий по отношению к фитопатогенным бактериям
ШтаммЗона ингибирования роста, мм
Erwinia carotovora А-1Pseudomonas syringiae 8300Pseudomonas syringiae 2314Erwinia carotovora 3391Clavibacter michiganense 17-1
Bacillus subtilis 128 (Фитоспорин)14,2±1,318,9±1,611,8±0,928,8±2,116,0±1,2
Bacillus spp. KR-083 (заявленный)27,0±1,826,0±2,118,0±1,332,0±2,828,0±2,2

Из данных, приведенных в таблице 1, видно, что заявленный штамм бактерий Bacillus spp. KR-083 обладает большей антагонистической активностью по отношению к фитопатогенным бактериям по сравнению с прототипом - штаммом Bacillus subtilis 128 ВНИИСХМ - продуцентом биопрепарата Фитоспорин.

Таблица 2.Антагонистическая активность штаммов ризосферных бактерий по отношению к фитопатогенным грибам.
ШтаммЗона ингибирования роста, мм
Phytophtora capsiciRhizoctonia solaniFusarium culmorumFusarium solaniPythium spp.
Bacillus subtilis 128 (Фитоспорин)26,5±2,216,7±1,816,2±1,316,4±1,322,1±2,5
Bacillus spp. KR-083 (заявленный)36,1±2,830,7±1,734,0±4,423,7±1,728,1±2,9

Из данных, приведенных в таблице 2, видно, что заявленный штамм бактерий Bacillus spp. KR-083 обладает большей антагонистической активностью по отношению к фитопатогенным грибам по сравнению с прототипом - штаммом Bacillus subtilis 128 ВНИИСХМ - продуцентом биопрепарата Фитоспорин.

Для развития растений им требуется азот.

Азотфиксация - это включение азота воздуха в соединение, доступное для использования растениями и другими организмами. Биологическая азотфиксация осуществляется азотфиксирующими микроорганизмами. В связи с этим азотфиксирующая активность штамма является важной характеристикой, оказывающей влияние на стимуляцию роста растений.

Заявленный штамм бактерий Bacillus spp. KR-083 обладает азотфиксирующими свойствами, т.е. ростстимулирующими свойствами, в отличие от прототипа - штамма бактерии Bacillus subtilis 128 ВНИИСХМ, который азот не фиксирует.

Поэтому для сравнения (за эталон) азотфиксирующей активности штамма бактерий Bacillus spp. KR-083 была взята чистая культура ризобактерии Herbas-pirillum seropedicae ATCC 35892, выделенная также из корней риса (типовой штамм, хранящийся в Американской Коллекции типовых культур).

В таблице 3 представлены данные по азотфиксирующей активности штамма бактерий Bacillus spp. KR-083 по сравнению с эталоном - азотфиксирующей бактерией Herbaspirillum seropedicae ATCC 35892 (типовой штамм, хранящийся в Американской Коллекции типовых культур).

Таблица 3.Азотфиксирующая (ацетиленредуктазная) активность чисты культур ризобактерий, выделенных из корней риса
ШтаммАзотфиксирующая (ацетиленредуктазная) активность (наномолей С2Н4/4 мл среды)
через 12 чЧерез 24 ччерез 48 ччерез 72 ччерез 96 ч
Herbaspirillum seropedicae ATCC 35892 (эталон)0,937,89170,931025,441726,75
Bacillus spp. KR-083 (заявленный)0,4521,48249,68635,09943,61

Из данных, приведенных в таблице 3, видно, что заявленный штамм бактерий Bacillus spp. KR-083 на начальном этапе (24-48) часов обладает большей азотфиксирующей активностью по сравнению с эталоном - типовым штаммом азотфиксирующей бактерии Herbaspirillum seropedicae ATCC 35892, выделенным так же, как и заявленный штамм, из корней риса.

Ростстимулирующая активность штамма Bacillus spp. KR-083 и штамма Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 определялась двумя методами:

а) методом стимуляции корней проростков кукурузы;

б) методом биотеста с хлореллой.

а) Определение ростстимулирующей активности штаммов методом стимуляции корней проростков кукурузы.

Семена кукурузы промывались в проточной воде в течение 2 часов, помещались в пластиковые подносы с влажной фильтровальной бумагой проростками вверх, укрывались влажной фильтровальной бумагой и помещались для проращивания в инкубатор при 28°С. Через 48 ч отбирались проростки длиной 1-1,5 см.

Кончики корней кукурузы на 2-3 мм погружались в бактериальную суспензию соответствующих штаммов бактерий (например, в рабочую культуру, полученную описанным ниже способом) различной концентрации на 1,5 часа.

В качестве контроля использовали стерильную питательную среду - среду культивирования штамма Bacillus spp. KR-083. Затем проростки кукурузы помещались в пластиковые подносы с увлажненной фильтровальной бумагой так, чтобы кончики корней находились на одной стартовой линии. Проростки укрывали влажной фильтровальной бумагой и помещали в инкубатор при 28°С. Через 24 ч корни проростков, пересекшие стартовую линию, отрезались и измерялась их длина. Ростстимулирующую активность сравниваемых штаммов Bacillus spp. KR-083 и Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 рассчитывали по отношению к контрольным проросткам.

б) Определение ростстимулирующей активности штаммов методом биотеста с хлореллой.

Во ВНИИСХМ был разработан метод оценки ростстимулирующей активности ризобактерий с помощью водоросли Chlorella vulgaris. Штамм Chlorella vulgaris 157 (получен от проф. Б.В.Громова, С.-Петербургский Госуниверситет) был выращен на модифицированной среде Хата (KNO3 - 0,1 г/л, КН2PO4 - 0,07 г/л, MgSO4×7H2O - 0,033, пептон - 1 г/л, глюкоза - 1 г/л, дрожжевой экстракт - 0,1 г/л, агар - 10 г/л, рН 6,5) при 20°С и освещенности 2500 люкс. Пятидневная культура с одного косяка смешивалась со 150 мл агаровой среды Хата (t=50°C) и разливалась в чашки Петри. После застывания агара пробочным сверлом делали колодцы диаметром 4 мм, в которые помещались 100 мкл бактериальной суспензии (рабочей культуры), полученной на основе штамма бактерий Bacillus spp. KR-083, a также на основе штамма, взятого за прототип Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 - продуцента биопрепарата Фитоспорин.

В качестве контроля использовали питательную среду - среду культивирования штамма Bacillus spp. KR-083. Инокулированные чашки помещались на свет, и диаметр колоний подсчитывался на 5 день инкубации.

Данные по ростстимулирующей активности штамма Bacillus spp. KR-083 и штамма, взятого за прототип Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 - продуцента биопрепарата Фитоспорин, которая была определена двумя вышеописанными методами, представлены в таблице 4.

Таблица 4.Ростстимулирующая активность ризобактерий, выделенных из корней риса, определенная методом биотестов с хлореллой и методом стимуляции корней проростков кукурузы
ШтаммРост хлореллы через 5 дней (⊘, мм)Рост корней проростков кукурузы (% к контролю)*
при разведении 1:1при разведении 1:50при разведении 1:100
Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 (Фитоспорин)0+7,9+2,3+1,2
Bacillus spp. KR-083 (заявленный)3,0±0,2-20,4+26,3+11,1
* - среднее из десяти повторностей (замеров)

Из данных, приведенных в таблице 4, видно, что заявленный штамм бактерий Bacillus spp. KR-083 обладает более сильной ростстимулирующей активностью по сравнению с прототипом - штаммом Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128, в частности в методе стимуляции корней проростков кукурузы - при наиболее часто применяемом на практике разведении (концентрации) бактериальной суспензии (маточной культуры штамма) 1:50 и 1:100.

Влияние штамма бактерии Bacillus spp. KR-083 на повышение урожайности различных сельскохозяйственных культур (картофеля, яровой и озимой пшеницы, ячменя, риса, сахарной свеклы, подсолнечника, капусты, моркови, свеклы, салата, редиса) была экспериментально подтверждена.

Эффективность штаммов Bacillus spp.KR-083 и Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 в вегетационных опытах с редисом с.Жара (при обработке семян и по вегетации после всходов) представлена в таблице 5. При этом вегетационные опыты проводили по принятой методике (Доспехов, 1986 г.), причем под "% NPK" понимались агрономически рекомендуемые дозы внесения азота, фосфора и калия по действующему веществу при выращивании редиса.

Таблица 5.Эффективность штаммов ризобактерий в вегетационных опытах с редисом с.Жара
Вариант опытаРедис с.Жара
Урожай (г/сосуд)% прибавки к контролю
Контроль 50% NPK5,87-
Контроль 100% NPK8,0536,7
Фон 50% NPK
Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 + (Фитоспорин)6,8316,4
Bacillus spp. KR-083 + (заявленный)7,7822,5
Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 +++ (Фитоспорин)7,3224,7
Bacillus spp. KR-083 +++ (заявленный)9,3158,6
Условные обозначения: + - обработка семян;
+++ - обработка семян и две обработки по вегетации через 7 и 15 дней после всходов

Из данных, приведенных в таблице 5, видно, что в вегетационных полевых опытах с редисом с.Жара инокуляция заявленным штаммом бактерий Bacillus spp. KR-083 способствует увеличению урожая редиса, причем в большей степени, чем аналогичная обработка штаммом Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 (прототипом) -продуцентом биопрепарата Фитоспорин.

Сравнительные данные, характеризующие влияние штаммов Bacillus spp. KR-083 и Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 на повышение урожайности картофеля с.Невский в производственных опытах в Ленинградской области (ГП ОПХ «Каложицы»), приведены в таблице 6.

Таблица 6.Урожайность картофеля с.Невский в производственных опытах в Ленинградской области (ГП ОПХ «Каложицы»)
Вариант опытаУрожайность (ц/га)Прибавка к контролю
(ц/га)(%)
Контроль366,6--
Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 (Фитоспорин)387,420,85,7
Bacillus spp. KR-083 (заявленный)483,3116,731,8

Из данных, приведенных в таблице 6, видно, что инокуляция заявленным штаммом бактерий Bacillus spp. KR-083 в производственных опытах с картофелем с.Невский способствовала увеличению урожайности картофеля в большей степени, чем штаммом - прототипом Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128 - продуцентом биопрепарата Фитоспорин.

То есть примеры, приведенные в таблицах 5 и 6, подтверждают, что инокуляция посевного материала и обработка всходов заявленным штаммом бактерий Bacillus spp. KR-083 способствует увеличению урожайности овощей на (15-32) %.

Таким образом, из данных, приведенных выше в таблицах следует, что заявленный штамм бактерий Bacillus spp. KR-083 обладает большей антагонистической активностью по отношению к фитопатогенным микроорганизмам (бактериям и грибам), а также более высокой ростстимулирующей активностью растений благодаря способности биологической азотфиксации по сравнению со штаммом-прототипом Bacillus subtilis ВНИИСХМ 128, а его применение в сельском хозяйстве способствует увеличению урожайности культур.

Важным является также и то, что при использовании указанного штамма в составе биопрепаратов бактерии Bacillus spp. KR-083 образуют споры, что позволяет сохранять эти препараты без потери жизнеспособности бактерий в течение длительного срока, не менее 12 месяцев с момента их получения.

Концентрация (количество жизнеспособных клеток и спор) штамма бактерии Bacillus spp. KR-083 для его эффективного использования в составе различных биопрепаратов должна составлять 106-108 клеток в 1 мл культуральной жидкости.

Экспериментально установлено, что использование штамма в концентрации менее 106 кл/мл ведет к снижению антагонистического эффекта, а увеличение концентрации свыше 109 кл/мл не приводит к увеличению эффективности защитного и ростостимулирующего действия.

Ниже приведен пример получения жидкой формы микробиологического препарата на основе заявляемого штамма ризосферных бактерий Bacillus spp. KR-083.

1. Чистая культура в колбах.

Для получения этой культуры для бактерий Bacillus spp. KR-083 готовят жидкую питательную среду следующего состава, г/л:

пептон - 20,0

глицерин - 10,0

K2HPO4 - 1,5

MgSO4 - 1,5

Значение рН смеси подводят перед стерилизацией до значения 7,0. Полученную жидкую питательную среду разливают в 750 мл качалочные колбы по 100 мл и стерилизуют при 1 атм 30 минут. Инокуляцию колб проводят стерильно микробиологической петлей из пробирки со скошенным питательным агаром (200 г картофеля, 10 г глюкозы, 20 г агара на 1 л среды), содержащим чистую культуру бактерий Bacillus spp. KR-083, помещают на качалку (220 об/мин) и культивируют 48 часов при температуре 28°С.

2. Маточная культура в колбах.

Маточную культуру выращивают на среде и при условиях, указанных в п.1 для чистой культуры. Засев колб производят 5 мл чистой культуры и выращивают 48 часов. При этом достигается титр около 5×109 кое/мл (колониеобразующих единиц в 1 мл).

Посевной материал (чистую и маточную культуры) хранят в холодильнике до 1 месяца при температуре (4-6)°С.

3. Рабочая культура

Рабочую культуру получают в бутылях или ферментерах на аналогичных средах, допускается разбавление питательной среды в 2 раза. Норма инокуляции маточной культурой составляет 2-5% объема среды. Продолжительность культивирования - 48 часов при температуре 28-30°С. При выращивании рабочих культур допускается повышение температуры до 33°С.

Таким образом, получают концентрат суспензии препарата.

4. Жидкая форма биопрепарата на основе штамма бактерии Bacillus spp. KR-083 KR-083.

Благодаря относительно высокой биологической активности используемого штамма и высокой скорости роста жидкий препарат в готовом виде, а также в производстве, практически не заражается посторонней микрофлорой. Тем не менее, необходим постоянный контроль всех этапов производства.

Для приготовления жидкой формы препарата необходимо использовать помещение площадью 20-40 м2, отделанное кафелем и полами с твердым покрытием, пригодным для ежедневной мойки и стерилизации. Помещение должно содержаться в отличном санитарном состоянии, быть достаточно сухим и хорошо вентилируемым. В помещении ежедневно производится влажная уборка и обработка его антисептиками (0,5% раствором хлорной извести, хлорамином, фенолом или формалином).

Воздух помещения периодически очищается от микрофлоры путем осаждения ее стерильной водой, распыляемой с помощью гидропульта. Перед началом работы в помещении (за 2-3 часа) включается система бактерицидных ламп (БУВ, ПРК-2 или ПРК-4). УФ-лампы расположены в центре рабочего помещения над рабочими столами и под столами, имея в виду, что основная «грязь» поступает в основном с пола. Чистота воздуха контролируется микробиологическими пробами, взятыми после пятиминутной экспозиции на три чашки Петри с МПА + 0,5% глюкозы. Чашки с высевами просматриваются после выдержки в термостате при температуре 37°С в течение 3-5 суток. В случае выявления большого количества (10-15 колоний) микрофлоры в воздухе бокса производится дезинфекция.

Работа производится в чистых, накрахмаленных, хорошо проглаженных халатах и колпаках, отдельной обуви, которые находятся в тамбуре рабочего помещения, где работающие надевают их и снимают по окончании работы в помещении.

Полученный концентрат суспензии препарата на основе штамма KR-083 (рабочую культуру) разводят стерильной водой в соотношении 1:10 или 1:20, чтобы получить конечную концентрацию не менее 100 миллионов колониеобразующих единиц в 1 мл препарата (не менее 108 кое/мл).

Жидкий препарат стерильно разливают в полиэтиленовые бутылки или канистры емкостью 0,25; 0,5; 1,0 и 10,0 литров. Полиэтиленовые бутылки или канистры ополаскивают спиртом. На бутылки или канистры размещают тарные этикетки и инструкции по применению.

Полученную жидкую форму препарата выдерживают в течение 3-5 дней при 20-25°С, после чего ее можно применять для обработки сельскохозяйственных культур. Строгий контроль и правильное ведение процесса приготовления жидкой формы предопределяют высокое качество биопрепарата на основе штамма KR-083 и его соответствующую активность при возделывании сельскохозяйственных культур.

Штамм ризосферных бактерий Bacillus spp. KR-083, депонированный под №148 ВНИИСХМ-Д, в качестве средства для защиты сельскохозяйственных растений от фитопатогенных микроорганизмов и стимуляции их роста.