Антигенные пептиды
Иллюстрации
Показать всеИзобретение относится к новым способам производства семейства антигенных пептидов, обладающих антивирусным действием, а также к пептидным библиотекам, полученным с использованием указанных способов, и композициям на их основе. Способ производства антигенных пептидов включает выявление множества вариабельных позиций в участке белка патогенного организма; выбор пептидной последовательности белка патогенного организма, включающей множество вариабельных позиций; подбор одного или более замещающих аминокислотных остатков для одной из вариабельных позиций или последовательностей, обладающих антигенным сходством с аминокислотными остатками в вариабельной позиции данного белка в естественных условиях, с помощью матрицы антигенного сходства аминокислот, показывающей возможность замены одного аминокислотного остатка другим с сохранением взаимодействия антитела с антигеном, скорректированный в соответствии с частотами аминокислот в гипервариабельных участках; включение подобранных замещающих аминокислотных остатков в пептидную последовательность; синтез семейства антигенных пептидов. Изобретение также относится к способу вызова иммунного ответа и способу диагностики ВИЧ-инфекции с использованием семейства пептидов, полученных согласно способам изобретения. 12 н. и 221 з.п. ф-лы, 43 табл., 1 ил.
Реферат
Текст описания приведен в факсимильном виде.
1. Способ производства семейства антигенных пептидов, обладающих антивирусным действием, включающий:
выявление множества вариабельных позиций в участке белка патогенного организма;
выбор пептидной последовательности белка патогенного организма, включающей множество вариабельных позиций;
подбор одного или более замещающих аминокислотных остатков для одной из вариабельных позиций или последовательностей, обладающих антигенным сходством с аминокислотными остатками в вариабельной позиции данного белка в естественных условиях, с помощью матрицы антигенного сходства аминокислот, показывающей возможность замены одного аминокислотного остатка другим с сохранением взаимодействия антитела с антигеном, скорректированный в соответствии с частотами аминокислот в гипервариабельных участках;
включение подобранных замещающих аминокислотных остатков в пептидную последовательность;
синтез семейства антигенных пептидов.
2. Способ по п.1, отличающийся тем, что подбор одного или более замещающих аминокислотных остатков включает в себя определение частоты встречаемости каждого аминокислотного остатка в семействе антигенных пептидов.
3. Способ по п.1, отличающийся тем, что белок патогенного организма связан с вирусом.
4. Способ по п.3, отличающийся тем, что вирус - это ВИЧ.
5. Способ по п.1, отличающийся тем, что белок патогенного организма - это белок gp 120 ВИЧ.
6. Способ по п.5, отличающийся тем, что участок выбирается из множества, включающего в себя участки V1, V2, V3, V4 и V5.
7. Способ по п.1, включающий в себя определение антигенного сходства между пептидом семейства и участком человеческого белка.
8. Способ по п.7, включающий в себя удаление пептида из семейства антигенных пептидов перед созданием семейства в случае, если выявленное антигенное сходство пептида семейства с участком человеческого белка превышает заданный порог.
9. Способ по п.1, отличающийся тем, что семейство антигенных пептидов включает в себя члены, не встречающиеся в естественных условиях в рассматриваемой позиции, в сумме обладающие антигенным сходством со всеми встречающимися в естественных условиях последовательностями участка белка патогенного организма.
10. Способ по п.1, отличающийся тем, что подбор последовательностей включает в себя идентификацию пептидных последовательностей семейства, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
11. Способ по п.10, отличающийся тем, что идентифицируют менее 500 последовательностей.
12. Способ по п.10, отличающийся тем, что идентификация включает в себя расчет расстояний между пептидными последовательностями семейства.
13. Способ по п.12, отличающийся тем, что расчет расстояний включает в себя использование матрицы антигенного сходства, указанной в п.1.
14. Способ по п.1, отличающийся тем, что создание семейства антигенных пептидов включает в себя химический синтез семейства пептидов.
15. Способ по п.14, отличающийся тем, что химический синтез включает в себя комбинаторный синтез, в ходе которого пептиды формируются в смеси различных последовательностей.
16. Способ по п.14, отличающийся тем, что химический синтез включает в себя параллельный синтез, в ходе которого каждый пептид формируется отдельно от других пептидов.
17. Способ по п.16, включающий в себя смешивание отдельных пептидов.
18. Композиция для создания вакцины для профилактики и терапии вирусных заболеваний, включающая в себя семейство антигенных пептидов, полученных по способу по п.1, в котором каждый антигенный пептид семейства отличается от других антигенных пептидов этого семейства по положению хотя бы одной аминокислоты.
19. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
20. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 1000 антигенных пептидов.
21. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
22. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 50000 антигенных пептидов.
23. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя от 1000 до 50000 антигенных пептидов.
24. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что белок патогенного организма - это белок gp120 ВИЧ.
25. Композиция по п.24, отличающаяся тем, что вариабельный участок выбирается из множества, включающего в себя участок V3.
26. Композиция по п.25, отличающаяся тем, что семейство антигенных пептидов включает в себя последовательности, обладающие антигенным сходством с последовательностями определенного подтипа ВИЧ.
27. Композиция по п.26, отличающаяся тем, что подтип выбирается из множества, включающего в себя подтип А, подтип В, подтип С, подтип D, подтип F, подтип G и их комбинации.
28. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
29. Композиция по п.18, отличающаяся тем, что семейство включает в себя множественный антигенный пептид.
30. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипов А, В, С, D, F, G формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-T-R-X4-X5-X6-X7-X8-G-X9-G-X10-X11-X12-X13-X14-T-G-X15-I-X16-G-X17-I-R-X18-A-X19-C-X20,
где каждый из участков Х1-Х20 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
31. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, V, Т или Е.
32. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X2 обозначает аминокислоту Т или I.
33. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту N, S, G или Y.
34. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту K, Q или Т.
35. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту S, G или R.
36. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту I, Т или М.
37. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту Н, R, Р, S или N.
38. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X8 обозначает аминокислоту I или М.
39. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту Р или L.
40. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту R или Q.
41. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X11 обозначает аминокислоту А, Т или V.
42. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту F или W.
43. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту Y, F или Н.
44. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту А или Т.
45. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту D, Q, А или R.
46. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту I или Т.
47. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту D или N.
48. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х18 обозначает аминокислоту Q или K.
49. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X19 обозначает аминокислоту Н или Y.
50. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х20 обозначает аминокислоту N или Т.
51. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, V, Т или Е; знак X2 обозначает аминокислоту Т или I; знак X3 обозначает аминокислоту N, S, G или Y; знак X4 обозначает аминокислоту K, Q или Т; знак X5 обозначает аминокислоту S, G или R; знак X6 обозначает аминокислоту I, Т или М; знак X7 обозначает аминокислоту Н, R, Р, S или N; знак Х8 обозначает аминокислоту I или М; знак Х9 обозначает аминокислоту Р или L; знак X10 обозначает аминокислоту R или Q; знак Х11 обозначает аминокислоту А, Т или V; знак Х12 обозначает аминокислоту F или W; знак Х13 обозначает аминокислоту Y, F или Н; знак X14 обозначает аминокислоту А или Т; знак X15 обозначает аминокислоту D, Q, А или R; знак X16 обозначает аминокислоту I или Т; знак X17 обозначает аминокислоту D или N; знак X18 обозначает аминокислоту Q или K; знак X19 обозначает аминокислоту Н или Y; знак Х20 обозначает аминокислоту N или Т.
52. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
53. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
54. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
55. Пептидная библиотека по п.30, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
56. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа А, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-X4-R-X5-X6-V-X7-I-G-P-G-X8-X9-F-X10-X11-X12-X13-X14-I-X15-G-X16-I-R-X17-A-X18-C-X19,
где каждый из участков Х1-Х19 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
57. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, Т или D.
58. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X2 обозначает аминокислоту Т или I.
59. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту N, G или S.
60. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту Т или K.
61. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту K, Т или Q.
62. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту S, G, R или N.
63. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту R или Н.
64. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х8 обозначает аминокислоту Q или R.
65. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту А, Т или V.
66. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту Y, F или Н.
67. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X11 обозначает аминокислоту А или Т.
68. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту Т, R, А или отсутствие остатка.
69. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту G, D или отсутствие остатка.
70. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту D, A, N, R или V.
71. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту I или Т.
72. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту D или N.
73. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту Q, К или Е.
74. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X18 обозначает аминокислоту Н или Y.
75. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X19 обозначает аминокислоту N, Т или Е.
76. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, Т или D; знак X2 обозначает аминокислоту Т или I; знак X3 обозначает аминокислоту N, G или S; знак X4 обозначает аминокислоту Т или К; знак X5 обозначает аминокислоту K, Т или Q; знак X6 обозначает аминокислоту S, G, R или N; знак X7 обозначает аминокислоту R или Н; знак X8 обозначает аминокислоту Q или R; знак X9 обозначает аминокислоту А, Т или V; знак X10 обозначает аминокислоту Y, F или Н; знак X11 обозначает аминокислоту А или Т; знак X12 обозначает аминокислоту Т, R, А или отсутствие остатка; знак Х13 обозначает аминокислоту G, D или отсутствие остатка; знак X14 обозначает аминокислоту D, А, N, R или V; знак X15 обозначает аминокислоту I или Т; знак X16 обозначает аминокислоту D или N; знак X17 обозначает аминокислоту Q, К или Е; знак X18 обозначает аминокислоту Н или Y; знак X19 обозначает аминокислоту N, Т или Е.
77. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
78. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
79. Пептидная библиотека по п.56, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
80. Пептидная библиотека по п.56(73), отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
81. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа В, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-T-R-K-X4-I-X5-X6-G-X7-G-X8-X9-X10-X11-X12-T-X13-X14-I-X15-G-X16-I-R-X17-A-X18-C-X19,
где каждый из участков Х1-Х19 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
82. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N, Т или Н.
83. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х2 обозначает аминокислоту Т или I.
84. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту N, S или G.
85. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту S, G или R.
86. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту Н, Р, N, Т или Y.
87. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту I или М.
88. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту Р, L или W.
89. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X8 обозначает аминокислоту R, Q, G или S.
90. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту А, V или Т.
91. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту F, W или V.
92. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х11 обозначает аминокислоту Y, F или Н.
93. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту Т или А.
94. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту G, Е или R.
95. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту Е, Q, R или G.
96. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту I или Т.
97. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту D или N.
98. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту Q или K.
99. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х18 обозначает аминокислоту Н или Y.
100. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X19 обозначает аминокислоту N или Т.
101. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х1 обозначает аминокислоту N, Т или Н; знак Х2 обозначает аминокислоту Т или I; знак X3 обозначает аминокислоту N, S или G; знак X4 обозначает аминокислоту S, G или R; знак X5 обозначает аминокислоту Н, Р, N, Т или Y; знак X6 обозначает аминокислоту I или М; знак Х7 обозначает аминокислоту Р, L или W; знак Х8 обозначает аминокислоту R, Q, G или S; знак X9 обозначает аминокислоту А, V или Т; знак X10 обозначает аминокислоту F, W или V; знак Х11 обозначает аминокислоту Y, F или Н; знак Х12 обозначает аминокислоту Т или А; знак Х13 обозначает аминокислоту G, Е или R; знак X14 обозначает аминокислоту Е, Q, R или G; знак X15 обозначает аминокислоту I или Т; знак X16 обозначает аминокислоту D или N; знак X17 обозначает аминокислоту Q или K; знак X18 обозначает аминокислоту Н или Y; знак X19 обозначает аминокислоту N или Т.
102. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
103. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
104. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
105. Пептидная библиотека по п.81, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
106. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа С, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-T-R-X4-X5-X6-X7-I-G-P-G-Q-X8-F-X9-X10-T-X11-X12-I-X13-G-X14-I-R-Х15-А-Х16-С-Х17,
где каждый из участков X1-X17 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
107. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту V, N, Е, Т, М или R.
108. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х2 обозначает аминокислоту Т, I или А.
109. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту N, G, S или Н.
110. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту K, Е или Q.
111. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту S или G.
112. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту I или М.
113. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту R или G.
114. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X8 обозначает аминокислоту Т, А или V.
115. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту Y или F.
116. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту А или Т.
117. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х11 обозначает аминокислоту G, N, D, K или Т.
118. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту D, G, N, S или I.
119. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту I или Т.
120. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту D или N.
121. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту Q, K, Е, L или Н.
122. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту Н, Y или N.
123. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту N, Т, I, D или Н.
124. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту V, N, Е, Т, М или R; знак X2 обозначает аминокислоту Т, I или А; знак X3 обозначает аминокислоту N, G, S или Н; знак X4 обозначает аминокислоту K, Е или Q; знак X5 обозначает аминокислоту S или G; знак X6 обозначает аминокислоту I или М; знак X7 обозначает аминокислоту R или G; знак Х8 обозначает аминокислоту Т, А или V; знак Х9 обозначает аминокислоту Y или F; знак Х10 обозначает аминокислоту А или Т; знак Х11 обозначает аминокислоту G, N, D, K или Т; знак X12 обозначает аминокислоту D, G, N, S или I; знак X13 обозначает аминокислоту I или Т; знак X14 обозначает аминокислоту D или N; знак X15 обозначает аминокислоту Q, K, Е, L или Н; знак X16 обозначает аминокислоту Н, Y или N; знак X17 обозначает аминокислоту N, Т, I, D или Н.
125. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
126. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
127. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
128. Пептидная библиотека по п.106, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
129. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа D, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-X4-X5-X6-R-X7-X8-X9-X10-I-G-X11-G-X12-X13-X14-X15-X16-T-X17-X18-G-X19-I-X20-Х21-А-Х22-С-Х23,
где каждый из участков Х1-Х23 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
130. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N или Т.
131. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х2 обозначает аминокислоту Т или I.
132. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту Y или N.
133. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту N или К.
134. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту N или К.
135(167). Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту Т, I или К.
136. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту Q или R.
137. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х8 обозначает аминокислоту S, R или G.
138. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту Т или I.
139. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту Н, Р, S или R.
140. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х11 обозначает аминокислоту Р, L, S или Q.
141. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту Q или R.
142. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту А или Т.
143. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту L или Y.
144. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту Y или F.
145. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту Т или А.
146. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту I или K.
147. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X18 обозначает аминокислоту I, Т или K.
148. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X19 обозначает аминокислоту D или N.
149. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X20 обозначает аминокислоту R или G.
150. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X21 обозначает аминокислоту Q или К.
151. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X22 обозначает аминокислоту Н или Y.
152. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X23 обозначает аминокислоту N, Т или K.
153. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х1 обозначает аминокислоту N или Т; знак Х2 обозначает аминокислоту Т или I; знак X3 обозначает аминокислоту Y или N; знак X4 обозначает аминокислоту N или K; знак X5 обозначает аминокислоту N или K; знак X6 обозначает аминокислоту Т, I или K; знак X7 обозначает аминокислоту Q или R; знак X8 обозначает аминокислоту S, R или G; знак X9 обозначает аминокислоту Т или I; знак X10 обозначает аминокислоту Н, Р, S или R; знак Х11 обозначает аминокислоту Р, L, S или Q; знак Х12 обозначает аминокислоту Q или R; знак X13 обозначает аминокислоту А или Т; знак X14 обозначает аминокислоту L или Y; знак X15 обозначает аминокислоту Y или F; знак X16 обозначает аминокислоту Т или А; знак Х17 обозначает аминокислоту I или K; знак Х18 обозначает аминокислоту I, Т или K; знак X19 обозначает аминокислоту D или N; знак X20 обозначает аминокислоту R или G; знак X21 обозначает аминокислоту Q или K; знак X22 обозначает аминокислоту Н или Y; знак X23 обозначает аминокислоту N, Т или K.
154. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
155. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
156. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
157. Пептидная библиотека по п.129, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
158. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа F, формулы
X1-C-T-R-P-X2-N-N-X3-R-K-X4-I-X5-L-G-P-G-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-I-X14-G-Х15-I-R-X16-A-X17-C-Х18,
где каждый из участков Х1-X18 имеет длину 0, 1, 2 или 3 аминокислотных остатка.
159. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X1 обозначает аминокислоту N или Т.
160. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х2 обозначает аминокислоту N или S.
161. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X3 обозначает аминокислоту Т или I.
162. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X4 обозначает аминокислоту S, G или R.
163. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X5 обозначает аминокислоту Н, R, Q, Р, Y или S.
164. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X6 обозначает аминокислоту Q, R или Н.
165. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X7 обозначает аминокислоту А, V или Т.
166. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X8 обозначает аминокислоту F или I.
167. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X9 обозначает аминокислоту Y, Н или F.
168. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X10 обозначает аминокислоту А или Т.
169. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X11 обозначает аминокислоту Т или А.
170. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X12 обозначает аминокислоту G, D или S.
171. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X13 обозначает аминокислоту D, А или N.
172. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X14 обозначает аминокислоту I или Т.
173. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X15 обозначает аминокислоту D или N.
174. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X16 обозначает аминокислоту К или Q.
175. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак X17 обозначает аминокислоту Н или Y.
176. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х18 обозначает аминокислоту N, I, D или K.
177. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что для каждого пептида семейства знак Х1 обозначает аминокислоту N или Т; знак Х2 обозначает аминокислоту N или S; знак X3 обозначает аминокислоту Т или I; знак X4 обозначает аминокислоту S, G или R; знак X5 обозначает аминокислоту Н, R, Q, Р, Y или S; знак X6 обозначает аминокислоту Q, R или Н; знак X7 обозначает аминокислоту А, V или Т; знак X8 обозначает аминокислоту F или I; знак X9 обозначает аминокислоту Y, Н или F; знак X10 обозначает аминокислоту А или Т; знак Х11 обозначает аминокислоту Т или А; знак X12 обозначает аминокислоту G, D или S; знак X13 обозначает аминокислоту D, А или N; знак X14 обозначает аминокислоту I или Т; знак X15 обозначает аминокислоту D или N; знак X16 обозначает аминокислоту К или Q; знак X17 обозначает аминокислоту Н или Y; знак Х18 обозначает аминокислоту N, I, D, K или X.
178. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что, по меньшей мере, два семейства антигенных пептидов смешаны вместе.
179. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что семейство включает в себя более 150 антигенных пептидов.
180. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 100000 антигенных пептидов.
181. Пептидная библиотека по п.158, отличающаяся тем, что семейство включает в себя менее 500 пептидных последовательностей, рассматриваемых в качестве представителей разнообразия последовательностей семейства в целом.
182. Пептидная библиотека, включающая в себя семейство пептидов, полученных по способу по п.1, обладающая антигенным сходством с участком V3 белка gp120 ВИЧ подтипа G, формулы
X1-C-X2-R-P-X3-N-N-T-R-K-S-X4-X5-X6