Композиции, реагенты, наборы и способы для диагностики, мониторинга и лечения ожирения и/или диабета

Композиции, реагенты, наборы и способы для диагностики, мониторинга и лечения ожирения и/или диабета

Иллюстрации

Показать все

Реферат

Перекрестная ссылка на родственную заявку

По настоящей заявке испрашивается приоритет патентной заявки США № 10/659782, поданной 11 сентября 2003, которая приведена здесь в качестве ссылки в полном объеме.

Область изобретения

Настоящее изобретение относится к маркерам ожирения и диабета, к реагентам, которые могут выявлять маркерные транскрипты и продукты трансляции, к наборам и способам для детекции маркерных транскриптов и продуктов трансляции ожирения и диабета, к способам и наборам для скрининга и диагностики ожирения и диабета у индивидуумов и мониторинга ответа на лечение, прогрессирования заболевания и рецидива заболевания у пациентов с диагнозом ожирение и диабет, к соединениям, специфически, которые связываются с продуктами трансляции ожирения и/или маркерными транскриптами диабета, к лечению ожирения и/или диабета с применением композиции с одним или несколькими маркерами ожирения и диабета или продуктов их трансляции в качестве терапевтических средств, к композициям и способам для лечения ожирения и/или диабета.

Предпосылки изобретения

Ожирение является второй по важности причиной предотвращаемой смерти в Соединенных Штатах, превышаемой только курением сигарет. Было подсчитано, что в Соединенных Штатах ожирением страдает 58000000 человек и ежегодно ожирение приводит к 300000 смертей и его распространение увеличивается. Индивидуумы, страдающие этим заболеванием, подвержены повышенному риску возникновения заболеваний, таких как гипертензия, липидные расстройства, коронарная болезнь сердца, диабет II типа, инсульт, заболевание желчного пузыря, остеоартрит, синдром ночного апноэ, респираторные нарушения и некоторые злокачественные опухоли.

Ожирение развивается вследствие избыточных потреблений энергии над используемой. Причины такого избытка могут различаться у разных пациентов, и полагают, что их причиной являются различные генетические, социальные факторы и факторы внешней среды. Современные исследования поддерживают точку зрения, что при одинаковых условиях внешней среды разные люди набирают вес в разной степени, и количество, которое они набирают, вероятно, определено генетически. Предполагают, что естественный отбор вынуждал наших далеких предков приобретать «экономичные гены», которые поддерживали способность запасать жир при каждом приеме пищи, чтобы поддерживать тело при следующем голодании. В современном окружении избытка пищи «в западном стиле» с высоким содержанием жира и калорий «экономичные гены» становятся помехой.

Все больше ученых и терапевтов приходят к отказу от традиционного убеждения, что за развитие ожирения отвечает исключительно плохая диета и отсутствие упражнений, и в большей мере проявляют стремление рассматривать его как медицинское состояние. Экономисты в области здравоохранения с применением перспективных исследований и статистических данных национального здравоохранения вычислили затраты, связанные с ожирением в США, в 1995 г. как 99,2 миллиарда $. Было сделано предположение, что в 2005 г. более 120 миллионов людей в мире будут страдать ожирением.

В настоящее время экономическое влияние ожирения в США сравнимо с влиянием диабета и по уровню приближается к расходам, связанным с заболеванием сердца и гипертензией. Медицинские исследователи подсчитали, что по меньшей мере 88% всех случаев диабета II типа, 57% случаев коронарной болезни сердца, 11% раков молочной железы и 10% раков кишечника, диагностированных у американцев с избыточным весом, можно отнести к ожирению.

Всемирная организация здравоохранения классифицирует ситуацию с ожирением как эпидемию и учредила специальную комиссию для ограничения распространения одной из величайших опасностей для здоровья и благосостояния человека.

Остается необходимость в специфических маркерах ожирения и/или диабета. Остается необходимость в реагентах и наборах, которые можно применять для выявления присутствия маркеров ожирения и/или диабета в образцах, взятых у пациентов. Остается необходимость в реагентах и наборах, которые можно применять для выявления будущей предрасположенности к развитию ожирения и/или диабета по образцам, взятым у пациентов. Остается необходимость в способах скрининга и диагностики индивидуумов, страдающих ожирением и/или диабетом, и способах мониторинга ответа на лечение, прогрессирования заболевания и рецидива заболевания у пациентов с диагнозом ожирение и/или диабет.

Остается необходимость в реагентах, наборах и способах для определения типа ожирения и/или диабета у индивидуума, страдающего ожирением. Остается необходимость в композициях, специфическими мишенями для которых являются клетки, связанные с ожирением и/или диабетом. Остается необходимость в улучшенных способах лечения индивидуумов, предположительно страдающих ожирением и/или диабетом.

Словарь

В следующих ниже описании и формуле изобретения периодически будет применено множество терминов, и значение таких терминов, как они должны быть поняты по изобретению, следующее:

«Последовательности нуклеиновых кислот при ожирении и/или диабете» - последовательности, представленные любыми последовательностями SEQ ID NO:1 - SEQ ID NO:4 и SEQ ID NO:22 - SEQ ID NO:25, которые по меньшей мере на 90% идентичны (см. ниже, таблица 2) указанным последовательностям и фрагментам вышеупомянутых последовательностей (см. ниже, таблица 2) длиной по меньшей мере 15 п.о. Данные последовательности представляют собой последовательности, кодирующие природные варианты альтернативного сплайсинга природного и известного адипонектина, представленного в Locus Link как локус Hs. 9370 под инвентарным номером NM_004797, который представляет собой последовательность, кодирующую гликопротеин человека размером 30 кДа из 244 аминокислот. Следует подчеркнуть, что новые варианты по настоящему изобретению представляют собой природные последовательности, полученные путем альтернативного сплайсинга адипонектина, а не просто укороченные, мутантные или фрагментированные формы гена.

- последовательности, представленные любыми последовательностями SEQ ID NO:5 - SEQ ID NO:9 и SEQ ID NO:26 - SEQ ID NO:30, которые по меньшей мере на 90% идентичны (см. ниже) указанным последовательностям и фрагментам вышеупомянутых последовательностей (см. ниже, таблица 2) длиной по меньшей мере 15 п.о. Данные последовательности представляют собой последовательности, кодирующие природные варианты альтернативного сплайсинга, природного и известного адипонектина, представленного в Locus Link как локус Mm. 11450 под инвентарным номером NM_009605, который представляет собой последовательность, кодирующую гликопротеин мыши размером 30 кДа из 247 аминокислот. Следует подчеркнуть, что новые варианты по настоящему изобретению представляют собой природные последовательности, полученные путем альтернативного сплайсинга адипонектина, а не просто укороченные, мутантные или фрагментированные формы гена.

- последовательности, представленные любыми последовательностями SEQ ID NO:10 - SEQ ID NO:11 и SEQ ID NO:31 - SEQ ID NO:32, которые по меньшей мере на 90% идентичны (см. ниже, таблицу 2) указанным последовательностям и фрагментам вышеупомянутых последовательностей (см. ниже, таблица 2) длиной по меньшей мере 15 п.о. Данные последовательности представляют собой последовательности, кодирующие природные варианты альтернативного сплайсинга природного и известного грелина, представленного в Locus Link как локус Hs. 51738 под инвентарным номером NM_016362, который представляет собой последовательность, кодирующую гликопротеин человека размером 13 кДа из 117 аминокислот. Следует подчеркнуть, что новые варианты по настоящему изобретению представляют собой природные последовательности, полученные путем альтернативного сплайсинга грелина, а не просто укороченные, мутантные или фрагментированные формы гена.

- последовательности, представленные любыми последовательностями SEQ ID NO:12 - SEQ ID NO:18 и SEQ ID NO:33 - SEQ ID NO:39 по меньшей мере, которые на 90% идентичны (см. ниже, таблица 2) указанным последовательностям и фрагментам вышеупомянутых последовательностей (см. ниже, таблица 2) длиной по меньшей мере 15 п.о. Данные последовательности представляют собой последовательности, кодирующие варианты альтернативного сплайсинга природного и известного 11-β-HSD, представленного в Locus Link как локус Hs. 3290 под инвентарным номером NM_005525, который представляет собой последовательность, кодирующую гликопротеин человека размером 32 кДа из 292 аминокислот. Следует подчеркнуть, что новые варианты по настоящему изобретению представляют собой природные последовательности, полученные путем альтернативного сплайсинга 11-β-HSD, а не просто укороченные, мутантные или фрагментированные формы гена.

- последовательности, представленные любыми последовательностями SEQ ID NO:19 - SEQ ID NO:21 и SEQ ID NO:40 - SEQ ID NO:42, которые по меньшей мере на 90% идентичны (см. ниже, таблица 2) указанным последовательностям и фрагментам вышеупомянутых последовательностей (см. ниже, таблица 2) длиной по меньшей мере 15 п.о. Данные последовательности представляют собой последовательности, кодирующие варианты альтернативного сплайсинга природного и известного 11-β-HSD, представленного в Locus Link как локус Mm. 15483 под инвентарным номером NM_008288, который представляет собой последовательность, кодирующую гликопротеин мыши размером 32 кДа из 292 аминокислот. Следует подчеркнуть, что новые варианты по настоящему изобретению представляют собой природные последовательности, полученные путем альтернативного сплайсинга 11-β-HSD, а не просто укороченные, мутантные или фрагментированные формы гена.

Описание связанных с ожирением и/или диабетом вариантов генов и их отличия от исходной последовательности суммированы в таблице 1, представленной ниже:

Таблица 1
SEQ ID NO:	Гены, связанные с ожирением и диабетом	ID локуса человека в GenBank	ID локуса мыши в GenBank	Обозначение гена	Описание варианта
1	Адипонектин-WT(Вариант 1)	9370	(11450)	APM	Нуклеотидная последовательность белка дикого типа человека (человек)
2	АдипонектинВариант 2				Нуклеотидная последовательность 2 варианта (человек)
3	АдипонектинВариант 3				Нуклеотидная последовательность 3 варианта (человек)
4	АдипонектинВариант 4				Нуклеотидная последовательность 4 варианта (человек)
5	Адипонектин-WT(Вариант 1)	(9370)	11450	APM	Нуклеотидная последовательность белка дикого типа мыши (мышь)
6	АдипонектинВариант 2				Нуклеотидная последовательность 2 варианта (мышь)
7	АдипонектинВариант 3				Нуклеотидная последовательность 3 варианта (мышь)
8	АдипонектинВариант 4				Нуклеотидная последовательность 4 варианта (мышь)
8	АдипонектинВариант 4				Нуклеотидная последовательность 4 варианта (мышь)
9	АдипонектинВариант 5				Нуклеотидная последовательность 5 варианта (мышь)
10	Грелин-WT(вариант 1)	51738	(58991)	GHRL	Нуклеотидная последовательность белка дикого типа человека
11	ГрелинВариант 2				Нуклеотидная последовательность 2 варианта (человек)
12	11-β-HSD-WT(Вариант 1)	3290	(15483)	HSD11B1	Нуклеотидная последовательность белка дикого типа человека
13	11-β-HSDВариант 2				Нуклеотидная последовательность 2 варианта (человек)
14	11-β-HSDВариант 3				Нуклеотидная последовательность 3 варианта (человек)
15	11-β-HSDВариант 4				Нуклеотидная последовательность 4 варианта (человек)
16	11-β-HSDВариант 5				Нуклеотидная последовательность 5 варианта (человек)
17	11-β-HSDВариант 6				Нуклеотидная последовательность 6 варианта (человек)
18	11-β-HSDВариант 7				Нуклеотидная последовательность 7 варианта (человек)
19	11-β-HSD-WT(Вариант 1)				Нуклеотидная последовательность белка дикого типа мыши
20	11-β-HSDВариант 8				Нуклеотидная последовательность 8 варианта (мышь)
21	11-β-HSDВариант 9				Нуклеотидная последовательность 9 варианта (мышь)
22	Адипонектин-WT(Вариант 1)	9370	(11450)	APM	Последовательность белка дикого типа человека
23	АдипонектинВариант 2				Альтернативная инициация (человек)
24	АдипонектинВариант 3
25	АдипонектинВариант 4
26	Адипонектин-WT(Вариант 1)	(9370)	11450	APM	Последовательность белка дикого типа мыши
27	АдипонектинВариант 2				Альтернативная инициация (мышь)
28	АдипонектинВариант 3				Альтернативные 45 аминокислот от положения 111 в белке дикого типа, создающие вариант из 156 аминокислот (мышь)
29	АдипонектинВариант 4				Альтернативные 58 аминокислот от положения 111 в белке дикого типа, создающие вариант из 169 аминокислот (мышь)
30	АдипонектинВариант 5				Короткий вариант длиной 76 аминокислот (мышь)
31	Грелин-WT(вариант 1)	51738	(58991)	GHRL	Последовательность белка дикого типа человека
32	ГрелинВариант 2				Альтернативные 70 аминокислот от положения 35 в белке дикого типа, создающие вариант из 117 аминокислот (человек)
33	11-β-HSD-WT(Вариант 1)	3290	(15483)	HSD11B1	Последовательность белка дикого типа человека
34	11-β-HSDВариант 2				Делеция 18 аминокислот от аминокислоты 64 в белке дикого типа и альтернативный экзон из 16 аминокислот, заменяющий остальные аминокислоты от аминокислоты 165 в белке дикого типа (человек)
35	11-β-HSDВариант 3				Альтернативные 9 аминокислот от аминокислоты 286, создающие вариант из 295 аминокислот (человек)
36	11-β-HSDВариант 4				Делеция 18 аминокислот от аминокислоты 137 до аминокислоты 155 в белке дикого типа (человек)
37	11-β-HSDВариант 5				Делеция 20 аминокислот от аминокислоты 64 до аминокислоты 84 в белке дикого типа (человек)
38	11-β-HSDВариант 6				Альтернативная инициация от аминокислоты № 31 в белке дикого типа (человек)
39	11-β-HSDВариант 7				Делеция 48 аминокислот от аминокислоты 173 до аминокислоты 221 в белке дикого типа (человек)
40	11-β-HSD-WT(Вариант 1)				Последовательность белка дикого типа мыши
41	11-β-HSDВариант 8				Делеция 32 аминокислот от аминокислоты 29 до аминокислоты 71 в белке дикого типа
42	11-β-HSDВариант 9				Альтернативные 19 аминокислот от аминокислоты 173, создающие вариант из 192 аминокислот (мышь)

SEQ ID NO:1-21 представляют собой нуклеотидные последовательности.

SEQ ID NO:22-42 представляют собой последовательности белков, кодируемых SEQ ID NO:1-21.

«Варианты продуктов при ожирении и/или диабете», также называемые «вариантами белков при ожирении и/или диабете» или «вариантами полипептидов при ожирении и/или диабете», представляют собой последовательности аминокислот, кодируемые вариантами последовательностей нуклеиновых кислот при ожирении и/или диабете, которые представляют собой природные последовательности мРНК, полученные в результате альтернативного сплайсинга. Последовательности аминокислот могут представлять собой пептид, белок, также как пептиды и белки с химически модифицированными аминокислотами (см. ниже), такие как гликопептид или гликопротеин. Варианты продуктов при ожирении и/или диабете представлены на любом SEQ ID NO:22 - SEQ ID NO:42. Термин относится также к гомологам (см. ниже) указанных последовательностей, в которых одна или несколько аминокислот добавлена, делетирована, заменена (см. ниже) или химически модифицирована (см. ниже), также как к фрагментам (см. ниже) указанных последовательностей, имеющим по меньшей мере 10 аминокислот.

«Фрагменты вариантов последовательностей нуклеиновых кислот, связанных с ожирением и/или диабетом,» - неполная последовательность по любому SEQ ID NO:1 - SEQ ID NO:21, включающая в себя области, содержащие нуклеотиды, отличающиеся между измененной и исходной последовательностями. Такие области (на аминокислотном уровне) представлены выше в таблице 1.

«Фрагменты вариантов продуктов, связанных с ожирением и/или диабетом,» - аминокислотные последовательности, кодируемые указанным выше фрагментом нуклеиновой кислоты, содержащие области, в которых вариант отличается от исходной последовательности, как указано в таблице 1.

«Нуклеотидная последовательность» - последовательность, состоящая из нуклеотидов ДНК, нуклеотидов РНК или сочетания обоих типов, которая может включать в себя природные нуклеотиды, химически модифицированные нуклеотиды и синтетические нуклеотиды.

«Аминокислотная последовательность» - последовательность, состоящая из любых из 20 природных аминокислот, аминокислот, подвергшихся химической модификации (см. ниже), или состоящая из синтетических аминокислот.

«Гомологи вариантов/продуктов» - аминокислотные последовательности вариантов, в которых одна или несколько аминокислот добавлены, делетированы или заменены. Измененные аминокислоты должны находиться в областях, в которых вариант отличается от исходной последовательности, например, согласно объяснению в таблице 1.

«Консервативная замена» относится к замене аминокислоты одного класса аминокислотой того же класса, где класс определен общими физико-химическими свойствами боковой цепи аминокислоты и высокими частотами замен в гомологичных белках, обнаруженных в природе, как определено, например, с применением общеупотребительной мутационной диаграммы Дайхофф или матрицы BLOSUM. Классифицируют шесть основных классов боковых цепей аминокислот, включающих в себя: класс I (Cys); класс II (Ser, Thr, Pro, Ala, Gly); класс III (Asn, Asp, Gln, Glu); класс IV (His, Arg, Lys); класс V (Ile, Leu, Val, Met) и класс VI (Phe, Tyr, Trp). Например, замена Asp другим остатком класса III, таким как Asn, Gin и Glu, является консервативной заменой.

«Неконсервативная замена» относится к замене аминокислоты одного класса аминокислотой из другого класса; например, замена Ala, остатка II класса, остатком III класса, таким как Asp, Asn, Glu или Gln.

«Химически модифицированный» - когда относится к продукту по изобретению, то означает продукт (белок), в котором по меньшей мере один из его аминокислотных остатков модифицирован посредством природных процессов, таких как процессинг или другие посттрансляционные модификации, или посредством способов химической модификации, хорошо известных в данной области. Среди многочисленных известных модификаций, характерные, но не ограничивающие примеры включают в себя: ацетилирование, ацилирование, октаноилирование, амидирование, ADP-рибозилирование, гликозилирование, формирование GPI-якоря, ковалентное присоединение липида или липидного производного, метилирование, миристоилирование, пегилирование, пренилирование, фосфорилирование, убиквитинилирование или другие подобные процессы.

«Биологически активный» относится к варианту продукта, обладающему каким-либо видом биологической активности, например способностью связывать ген, связанный с ожирением и/или диабетом, или другие известные агонисты исходного гена, связанного с ожирением и/или диабетом.

«Иммунологически активный» определяет способность природного, рекомбинантного или синтетического варианта продукта или любого его фрагмента индуцировать специфический иммунный ответ у соответствующих животных или в соответствующих клетках и связываться со специфическими антителами. Таким образом, например, иммунологически активный фрагмент варианта продукта означает фрагмент, который сохраняет некоторые или все иммунологические свойства варианта продукта, например может связывать специфические антитела к варианту продукта, или который может вызывать иммунный ответ, приводящий к образованию таких антител или вызывающий пролиферацию специфических иммунных клеток, продуцирующих вариант продукта.

«Оптимальное выравнивание» определяют как выравнивание, дающее наивысший показатель процента идентичности. Такое выравнивание можно проводить с применением множества коммерчески доступных программ для анализа последовательностей, таких как программа для локального сравнения LALIGN с применением размера участка максимального совпадения - 1, параметров и PAM по умолчанию. Предпочтительным является выравнивание, осуществляемое с применением программы CLUSTAL-W от MacVector™, действующей со штрафом на внесение пропуска 10,0; со штрафом на продолжение пропуска 0,1 и матрицей подобия BLOSUM. Если нужно ввести пропуск в первую последовательность для оптимального выравнивания ее со второй последовательностью, процент идентичности вычисляют только с использованием остатков, парных соответствующим аминокислотным остаткам (т.е. вычисление не учитывает остатки второй последовательности, попадающие в «пропуск» первой последовательности). В случае выравнивания известных последовательностей гена с новым вариантом оптимальное выравнивание неизменно включает совместное выравнивание идентичных частей обеих последовательностей, затем раздельное сохранение и отмена выравнивания участков последовательностей, отличающихся друг от друга.

«Которые идентичны по меньшей мере на 90%» - по отношению к двум аминокислотным последовательностям или последовательностям нуклеиновой кислоты относится к процентному содержанию остатков, идентичных в двух последовательностях, когда последовательности оптимально выровнены. Таким образом, 90% идентичность аминокислотной последовательности означает, что 90% аминокислот в двух или более оптимально выровненных полипептидных последовательностях являются идентичными.

«Отдельная молекула нуклеиновой кислоты, обладающая последовательностью варианта нуклеиновой кислоты,» - молекула нуклеиновой кислоты, включающая в себя связанный с ожирением и/или диабетом вариант кодирующей последовательности нуклеиновой кислоты. Указанная отдельная молекула нуклеиновой кислоты может включать в себя связанный с ожирением и/или диабетом вариант последовательности нуклеиновой кислоты в качестве независимой вставки; может включать в себя связанный с ожирением и/или диабетом вариант последовательности нуклеиновой кислоты, присоединенный к дополнительным кодирующим последовательностям, вместе кодирующие гибридный белок, в котором последовательность, кодирующая вариант, является основной кодирующей последовательностью (например, дополнительная кодирующая последовательность может кодировать сигнальный пептид); связанный с ожирением и/или диабетом вариант кодирующей последовательности нуклеиновой кислоты может присутствовать в сочетании с некодирующими последовательностями, например интронами, или контрольными элементами, такими как промоторные или терминаторные элементы или 5'- и/или 3'- нетранслируемые области, эффективные для экспрессии кодирующей последовательности в соответствующем хозяине; или может существовать вектор, в котором связанный с ожирением и/или диабетом вариант последовательности, кодирующей белок, является гетерологичным.

«Экспрессирующий вектор» относится к векторам, способным включать и экспрессировать гетерологичные фрагменты ДНК в чужеродной клетке. Известно и/или коммерчески доступно множество прокариотических и эукариотических экспрессирующих векторов. Выбор подходящих экспрессирующих векторов в компетенции специалистов в данной области.

«Делеция» - изменение нуклеотидной или аминокислотной последовательности, при котором отсутствуют один или несколько нуклеотидов или аминокислотных остатков, соответственно.

«Вставка» или «добавление» - изменение нуклеотидной или аминокислотной последовательности, обусловленное добавлением одного или нескольких нуклеотидов или аминокислотных остатков соответственно по сравнению с природной последовательностью.

«Замена» - замена одного или нескольких нуклеотидов или аминокислот другими нуклеотидами или аминокислотами соответственно. Что касается аминокислотных последовательностей, замена может быть консервативной или неконсервативной.

«Антитело» относится к антителу IgG, IgM, IgD, IgA и IgG. Определение включает в себя поликлональные антитела или моноклональные антитела. Данный термин относится к полноразмерным антителам или фрагментам антител, включающим в себя антигенсвязывающий домен антител к варианту продукта, например антителам без Fc-фрагмента, одноцепочечным антителам, фрагментам, главным образом состоящим только из вариабельного, антигенсвязывающего домена антитела и т.д.

«Лечение заболевания» относится к введению терапевтического вещества, эффективного для облегчения связанных с заболеванием симптомов, для уменьшения тяжести или излечения заболевания, или для предупреждения возникновения заболевания.

«Детекция» относится к способу выявления заболевания, расстройства, патологического или нормального состояния. Данный термин может относиться к выявлению предрасположенности к заболеванию, а также к установлению прогноза для пациента посредством определения тяжести заболевания.

«Зонд» - вариант последовательности нуклеиновой кислоты при ожирении и/или диабете или, кроме того, комплементарной последовательности, когда его применяют для детекции присутствия в образце других подобных последовательностей, или последовательностей, обладающих некоторой гомологией с данной последовательностью. Детекцию осуществляют посредством идентификации гибридизационных комплексов между зондом и анализируемой последовательностью. Зонд можно присоединить к твердой подложке или к детектируемой метке.

«Исходные гены, связанные с ожирением и/или диабетом,» - аминокислотная или нуклеотидная последовательность, от которой связанные с ожирением и/или диабетом варианты по изобретению отличаются в результате альтернативного сплайсинга. Исходная нуклеотидная последовательность представляет собой последовательность связанного с ожирением и/или диабетом гена человека, представленную как SEQ ID NO:1 для адипонектина человека, и кодируемая ею последовательность представляет собой исходную аминокислотную последовательность; SEQ ID NO:5 для адипонектина мыши, и кодируемая ею последовательность представляет собой исходную аминокислотную последовательность; SEQ ID NO:10 для грелина, и кодируемая ею последовательность представляет собой исходную аминокислотную последовательность; SEQ ID NO:12 для 11-β-HSD человека, и кодируемая ею последовательность представляет собой исходную аминокислотную последовательность; SEQ ID NO:19 для 11-β-HSD мыши, и кодируемая ею последовательность представляет собой исходную аминокислотную последовательность.

Сущность изобретения

Настоящее изобретение относится к отдельным молекулам нуклеиновой кислоты с последовательностью, выбранной из группы, включающей: SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21 и их фрагментов, включающих в себя по меньшей мере 15 нуклеотидов. Настоящее изобретение относится к отдельным молекулам нуклеиновой кислоты, включающим в себя SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21, и к отдельным молекулам нуклеиновой кислоты, включающим в себя фрагменты SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21, включающим в себя по меньшей мере 15 нуклеотидов.

Настоящее изобретение относится к праймерам для ПЦР, с которыми можно амплифицировать продукты с применением в качестве матриц последовательностей SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21.

Настоящее изобретение относится к способам скрининга, диагностики и мониторинга индивидуумов на предмет ожирения и/или диабета. Способы включают в себя определение присутствия, отсутствия или количества в образце продукта транскрипции, включающего в себя последовательность, выбранную из группы, включающей: SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21. Присутствие или количество вышеупомянутого продукта транскрипции является показательным для ожирения и/или диабета.

Настоящее изобретение относится к способам лечения индивидуумов, страдающих от ожирения и/или диабета, предусматривающим стадию введения продукта трансляции транскрипта с последовательностью, выбранной из группы, включающей: SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21.

Настоящее изобретение относится к наборам для скрининга, диагностики и мониторинга у индивидуумов ожирения и/или диабета.

Настоящее изобретение относится к белкам, кодируемым последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, включающей: SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21, и их иммуногенным фрагментам.

Настоящее изобретение относится к антителам, специфически связывающим эпитоп белка, кодируемого последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, включающей: SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21.

Настоящее изобретение относится к антителам, специфически связывающим эпитоп белка, кодируемого последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, включающей: SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21, к которым присоединены детектируемые метки или активные вещества.

Настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, включающей в себя антитела, специфически связывающие эпитоп белка, кодируемого последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, включающей из: SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21, к которым присоединены активные вещества.

Настоящее изобретение относится к способам лечения индивидуумов, предположительно страдающих ожирением и/или диабетом. Способы предусматривает стадию введения индивидуумам антител, специфически связывающих эпитоп белка, кодируемого последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, включающей: SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21, к которым присоединены активные вещества.

Настоящее изобретение относится к способам доставки молекулы нуклеиновой кислоты к пораженной ожирением и/или диабетом клетке индивидуума. Способ предусматривает стадию введения указанному индивидууму фармацевтической композиции, содержащей антитела, специфически связывающие эпитоп белка, кодируемого последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, включающей: SEQ ID NO:2-4, 6-9, 11, 13-18, 20-21, и молекулы нуклеиновой кислоты.

Краткое описание чертежей

На фиг.1 проиллюстрировано множественное выравнивание четырех аминокислотных последовательностей человеческого происхождения (представленных на SEQ ID NO:22 - SEQ ID NO:25) друг с другом и с исходной последовательностью;

На фиг.2 проиллюстрировано множественное выравнивание пяти аминокислотных последовательностей мышиного происхождения (представленных на SEQ ID NO:26 - SEQ ID NO:30) друг с другом и с исходной последовательностью;

На фиг.3 проиллюстрировано выравнивание двух аминокислотных последовательностей человеческого происхождения (представленных на SEQ ID NO:31 - SEQ ID NO:32) с исходной последовательностью;

На фиг.4 проиллюстрировано множественное выравнивание семи аминокислотных последовательностей человеческого происхождения (представленных на SEQ ID NO:33 - SEQ ID NO:39) друг с другом и с исходной последовательностью;

На фиг.5 проиллюстрировано множественное выравнивание трех аминокислотных последовательностей человеческого происхождения (представленных на SEQ ID NO:40 - SEQ ID NO:42) друг с другом и с исходной последовательностью;

На фиг.6 проиллюстрировано множественное выравнивание четырех последовательностей нуклеиновых кислот человеческого происхождения (представленных на SEQ ID NO:1 - SEQ ID NO:4) друг с другом и с исходной последовательностью;

На фиг.7 проиллюстрировано множественное выравнивание пяти последовательностей нуклеиновых кислот мышиного происхождения (представленных на SEQ ID NO:5 - SEQ ID NO:9) друг с другом и с исходной последовательностью;

На фиг.8 проиллюстрировано выравнивание двух последовательностей нуклеиновых кислот человеческого происхождения (представленных на SEQ ID NO:10 - SEQ ID NO:11) с исходной последовательностью;

На фиг.9 проиллюстрировано множественное выравнивание семи последовательностей нуклеиновых кислот человеческого происхождения (представленных на SEQ ID NO:12 - SEQ ID NO:18) друг с другом и с исходной последовательностью;

На фиг.10 проиллюстрировано множественное выравнивание трех аминокислотных последовательностей человеческого происхождения (представленных на SEQ ID NO:19 - SEQ ID NO:21) друг с другом и с исходной последовательностью.

Подробное описание предпочтительных вариантов осуществления

Авторы конкретно проводят здесь полное содержание всех цитируемых в данном описании ссылок. Далее, когда количество, концентрация или другое значение параметра приведено как диапазон, предпочтительный диапазон, или список верхних предпочтительных значений и нижних предпочтительных значений, его следует понимать, как все специфически включенные диапазоны, сформированные из любой пары любого верхнего предела диапазона или предпочтительного значения и любого нижнего предела диапазона или предпочтительного значения, независимо от того, приведены ли диапазоны по отдельности. Там, где в патенте перечислен диапазон числовых значений, пока не указано иначе, подразумевается, что диапазон включает его конечные точки и все целые и дроби внутри диапазона. Не подразумевается, что объем изобретения ограничен конкретными значениями, перечисленными при определении диапазона.

Последовательность вариантов нуклеиновых кислот при ожирении и/или диабете

Последовательности нуклеиновых кислот по изобретению включают последовательности нуклеиновых кислот, кодирующих продукты вариантов при ожирении и/или диабете, их фрагменты и аналоги. В качестве альтернативы, последовательности нуклеиновых кислот могут представлять собой последовательности, комплементарные вышеуказанным кодирующим последовательностям или областям указанной кодирующей последовательности. Длина комплементарной последовательности является достаточной для прекращения экспрессии кодирующей последовательности. Последовательности нуклеиновых кислот могут быть в форме РНК или в форме ДНК и включать в себя матричную РНК, синтетическую РНК и ДНК, кДНК и геномную ДНК. ДНК может быть двухцепочечной или одноцепочечной, и если является одноцепочечной, может представлять собой кодирующую цепь и