Композиции и способы изменения экспрессии генов

Композиции и способы изменения экспрессии генов

Реферат

ПЕРЕКРЕСТНЫЕ ССЫЛКИ НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИ

По настоящей заявке испрашивается приоритет по временной заявке США № 60/891171, поданной 22 февраля 2007 года, описание которой введено в настоящее описание ссылкой в полном объеме.

ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕ

Настоящее изобретение относится к композициям и способам регулирования экспрессии или транскрипции генов у растущего животного.

УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ, ПРЕДШЕСТВУЮЩИЙ ИЗОБРЕТЕНИЮ

Коммерчески доступные кормовые продукты для домашних животных, например кормовые продукты для кошек, включают композиции, специально составленные, чтобы отвечать различным нутритивным потребностям. Они включают, например, составы для различных пород, размеров и кондиций животного. Также они включают составы, отвечающие различным нутритивным потребностям животных на различных стадиях жизненного цикла. Как правило, эти стадии включают стадию роста, взрослое состояние и пожилое. Например, в патенте США 5851573 описывается композиция кормового продукта для домашнего животного для щенков крупных пород; в патенте США 6426100 описываются композиции для улучшения формирования костей и функционирования хондроцитов у растущих животных; в патенте США 6582752 описывается гендерно-специфичный кормовой продукт для щенков. Несмотря на доступность кормовых продуктов для домашних животных с такими составами, сохраняется необходимость в получении дополнительных составов, включающих инновационные ингредиенты и нутриенты для усиления развития животных.

Из предшествующего уровня техники известны нутриенты, оказывающие влияние на экспрессию генов. Нутригеномика занимается исследованием таких взаимодействий. Несмотря на уже известное, существует необходимость в получении композиций и способов, которые могут оказывать положительное влияние на экспрессию генов у животного.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ

В конкретных аспектах настоящее изобретение относится к композициям, которые могут быть использованы для усиления развития растущего животного. В частности, композиции по настоящему изобретению включают один или более нутриент или биоактивное вещество, которое может усиливать неврологическое развитие, содействовать здоровому состоянию костей и суставов и способствовать здоровой конституции тела растущего животного. В конкретных вариантах осуществления настоящего изобретения нутриенты и биоактивные вещества включают без ограничения жирные кислоты, антиоксиданты, незаменимые нутриенты, аминокислоты, минеральные вещества и микроэлементы, витамины и витаминоподобные вещества. Другие аспекты настоящего изобретения относятся к способам усиления развития растущего животного, включающим введение эффективных количеств композиций по настоящему изобретению непосредственно растущему животному или беременной самке указанного животного в то время, когда животное находится в ее утробе или на вскармливании молоком.

Следовательно, в одном аспекте настоящее изобретение относится к Композиции 1.0, композиции кормового продукта для домашнего животного, включающей:

от около 5 до около 70% белка,

от около 0,5 до около 1,6% метионина,

от около 50 до около 200 частей на миллион марганца,

от около 0,1 до около 0,5% ДГК (докозангексановая кислота),

от около 0,1 до около 0,7% ЭПК (эйкозанпентановая кислота),

от около 1200 до около 7500 частей на миллион холина,

от около 1000 до около 2000 частей на миллион таурина,

от около 2,5 до около 6% линолевой кислоты,

от около 1 до около 3% общих n-3 жирных кислот,

от около 50 до около 1200 МЕ/кг витамина Е,

от около 50 до около 500 частей на миллион витамина С,

от около 50 до около 500 частей на миллион карнитина и

от около 2,5 до около 7 г лизина/1000 ккал.

Также настоящее изобретение включает следующие композиции:

1.1. Композиция 1.0, включающая:

от около 0 до около 90% по массе углеводов;

от около 20% до около 60% по массе белка;

от около 2% до около 50% по массе жира;

от около 0,1% до около 20% по массе общих пищевых волокон; и

от около 0 до около 15% по массе витаминов, минеральных веществ и других нутриентов в варьирующих процентных соотношениях, отвечающих пищевым потребностям животного.

1.2. Композиция 1.0 или 1.1, включающая от около 5% до около 55% по массе углеводов.

1.3. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 20% до около 50% по массе белка, например от около 22% до около 50%.

1.4. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 5% до около 40% по массе жира, например, по меньшей мере, от около 8% или от около 9% до около 40% жира.

1.5. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 1% до около 11% по массе общих пищевых волокон.

1.6. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 0,1% до около 0,4% по массе ДГК, например около 0,5%.

1.7. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 200 МЕ/кг до около 1200 МЕ/кг витамина Е; например от около 200 МЕ/кг до около 1000 МЕ/кг.

1.9. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 100 частей на миллион до около 500 частей на миллион карнитина, например от около 200 до около 400, или около 300 частей на миллион.

1.10. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 2,5/1000 ккал до около 7 г лизина/1000 ккал.

1.11. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 2500 частей на миллион до около 7500 частей на миллион холина, например, около 3000, около 3500, около 4000, около 4600, около 4625, около 4650, около 4700, около 4800 или около 6000 частей на миллион.

1.12. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 0,1% до около 0,6% ЭПК.

1.13. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 50 частей на миллион до около 150 частей на миллион марганца.

1.14. Любая из предшествующих композиций, включающая от около 0,8% до около 1,6% метионина.

В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам получения благоприятной модификации экспрессии генов у животного, а именно понижающей регуляции экспрессии гена или генов, связанных с нежелательным биологическим состоянием или направлением или заболеванием, и/или модификации повышенной экспрессии генов у животного, а именно повышающей регуляции экспрессии гена или генов, связанных с желаемым биологическим состоянием или направлением или способных оказывать положительное или профилактическое воздействие на заболевание для одного или более биологического состояния, направления или заболевания, приведенных в таблицах 2-15, включающим введение эффективного количества любой из композиций 1.0-1.14 непосредственно животному или беременной самке во время нахождения животного в ее утробе.

В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу 2.0, способу регулирования экспрессии генов у собак, включающему введение собаке любой композиции по настоящему изобретению, например композиций 1.0-1.14.

Также настоящее изобретение включает следующие способы:

2.1. Способ по 2.0, где собака является щенком.

2.2. Способ по 2.0 или 2.1, где щенок рожден от собаки, потребляющей во время беременности любую из композиций 1.0-1.14.

2.3. Способ по 2.2, где щенок находится в утробе.

2.4. Способ по 2.2, где собака перед наступлением беременности потребляет любую из композиций 1.0-1.14.

2.5. Способ по 2.2 или 2.4, где собака в течение большей части беременности потребляет любую из композиций 1.0-1.14.

2.6. Способ по любому из способов 2.2-2.5, где собака перед и во время беременности потребляет композиции, состоящие по существу из любой из композиций 1.0-1.14.

2.7. Способ по любому из предшествующих способов, где щенок перед отъемом потребляет любую из композиций 1.0-1.14, например, во время вскармливания молоком.

2.8. Способ по любому из предшествующих способов, где щенок потребляет любую из композиций 1.0-1.14 после отъема.

2.9. Способ по 2.8, где щенок потребляет любую из композиций кормового продукта, состоящую из любой композиции 1.0-1.14.

2.10. Способ по любому из предшествующих способов, где животному вводят эффективное количество композиции.

2.11. Способ по любому из предшествующих способов, где животному вводят композицию в течение периода времени, необходимого для эффективного воздействия.

2.12. Способ по 2.11, где собаке вводят композицию, по меньшей мере, в течение одно года после рождения или одного года после отъема.

2.13. Способ по любому из предшествующих способов, где ген выбирают из приведенных в Таблицах 2-15.

В дополнительном аспекте настоящее изобретение относится к применению любого рецептурного состава по настоящему изобретению при получении композиции для модифицирования экспрессии генов у животного.

Другие признаки и преимущества настоящего изобретения будут ясно видны специалисту в области техники, к которой относится изобретение, из детального описания и примеров, приведенных ниже.

ДЕТАЛЬНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Настоящее изобретение не ограничивается конкретными способами, методами и реагентами, описанными здесь, поскольку они могут варьировать. Кроме того, использованная здесь терминология приведена только для описания конкретных вариантов воплощения настоящего изобретения и не ограничивает объем притязаний по настоящему изобретению.

Если не указано иное, все использованные здесь технические и научные термины используются в общепринятом смысле, понятном для специалиста в области техники, к которой относится настоящее изобретение. Дополнительно все приведенные здесь ссылки приведены ссылкой в полном объеме. В случае расхождения определения по настоящему изобретению и приведенного в ссылке, приоритет принадлежит настоящему изобретению.

Использованные здесь и в приложенной формуле изобретения формы единственного числа включают и множественное число, если в контексте ясно не указано иное.

Настоящее изобретение относится к любому животному, предпочтительно млекопитающему, более предпочтительно к животному-компаньону. Термин «животное-компаньон» относится к любому животному, тесно связанному с человеком, и включает без ограничения собак и кошек любой породы. Например, в объем понятия этого термина также входит любое животное, чей рацион может контролироваться человеком и на которых может быть оказано положительное воздействие при скармливании составов по настоящему изобретению. Эти животные, например, могут включать одомашненных сельскохозяйственных животных (например, крупный рогатый скот, лошадей, свиней и тому подобное) наряду с неодомашненными животными, содержащимися в неволе, например в зоопарках и тому подобное. Предпочтительно животное представляют собой собаку. Предпочтительно собака представляет собой растущую собаку, например щенка.

Используемый здесь термин «благоприятная модификация экспрессии генов» относится, например, к понижающей регуляции генов, экспрессирующих белки, связанные с заболеванием, и/или повышающей регуляции генов, экспрессирующих белки, которые оказывают положительное или оздоравливающее воздействие по сравнению с подходящим контролем, что может быть определено при использовании традиционных способов, например при использовании технологии микрочипа (например, генный чип Affymetrix), известных специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение. Кроме того, специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение, известны связи между заболеваниями и определенными генами, приведенными в таблицах ниже, таким образом, понятно, что является желательным - повышение или понижение экспрессии определенных генов.

Используемый здесь термин период «роста» животного относится к периоду от рождения или отнятия (возраст от около 8 недель) до около 1 года или старше в зависимости от вида и породы животного.

Используемый здесь термин «щенок» относится к неполовозрелой собаке, как правило, в возрасте от рождения до 12 месяцев.

Используемый здесь термин «незаменимые аминокислоты» относится к аминокислотам, которые не могут быть синтезированы de novo в организме и, следовательно, должны поступать из рациона. Специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение, следует понимать, что незаменимые аминокислоты варьируют от вида к виду в зависимости от метаболизма организма. Например, общеизвестно, что незаменимыми аминокислотами для собак и кошек (и людей) являются фенилаланин, лейцин, метионин, лизин, изолейцин, валин, треонин, триптофан, гистидин и аргинин.

Специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение, следует понимать, что используемый здесь термин «лимитирующие аминокислоты» относится к аминокислотам, присутствующим в недостаточных количествах в рационе, что в результате ведет к ограничению усвояемости других, даже если другие незаменимые аминокислоты присутствуют в количествах, более чем достаточных. В композициях по настоящему изобретению лимитирующая аминокислота представляет собой лизин. Следовательно, остальные незаменимые аминокислоты количественно введены в состав или «сбалансированы» по отношению к количеству лизина, определенному как критическое для получения заданного биологического результата. Используемый здесь термин «сбалансированные аминокислоты» относится к взаимосвязи аминокислоты лизина с энергией таким образом, чтобы гарантировать оптимальный рост и развитие животного.

Используемый здесь термин «незаменимые нутриенты» относится к нутриентам, необходимым для нормального функционирования организма, которые не могут быть в нем синтезированы. Категории незаменимых нутриентов включают витаминные и минеральные вещества рациона, жирные кислоты и аминокислоты. Специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение, понятно, что незаменимые нутриенты варьируют от вида к виду в зависимости от метаболизма организма. Например, незаменимые нутриенты для собак и кошек включают витамины A, D, Е, K, В₁, В₆, В₁₂, рибофлавин, ниацин, пантотеновую кислоту, фолиевую кислоту, кальций, фосфор, магний, натрий, калий, хлор, железо, медь, цинк, марганец, селен и йод. Среди других частично незаменимых нутриентов может быть включен холин, как правило относимый к витаминам группы В. Дополнительно незаменимый нутриент для кошек представляет собой таурин, при этом технически являющийся не аминокислотой, а производным цистеина.

Карнитин, также известный как L-карнитин (левокарнитин), представляет собой четвертичное аммониевое соединение, синтезируемое из аминокислот лизина и метионина и ответственное за транспорт жирных кислот из цитозоля в митохондрию.

Не ограничиваясь какой-либо теорией или конкретным механизмом действия, настоящее изобретение основывается на неожиданном открытии, что добавление определенных ингредиентов в композиции кормового продукта для домашних животных и введение этих композиций животным усиливает развитие растущего животного. Например, данные указывают, что животные, потребляющие композиции по настоящему изобретению (или животные, во время внутриутробного развития которых беременные самки потребляли композиции в период беременности, перед отъемом и в период роста помета), демонстрируют усиленное неврологическое развитие, более лучшее состояние костей и суставов, иммунную функцию и в целом более здоровую конституцию тела. Интересно, что данные микрочипа также указывают на значительное изменение экспрессии гена у этих животных по сравнению с таковым у контроля, что, как правило, отражает благоприятную модификацию (то есть повышающую или понижающую регуляцию) экспрессии большинства генов, связанных с биологическими процессами, включая вовлеченные в рост и развитие. Следовательно, в одном аспекте настоящее изобретение относится к композициям и способам усиления развития растущего животного, как описано детально здесь.

Специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение, известны «полностью питательно сбалансированные композиции кормовых продуктов для домашних животных» наряду с нутриентами и ингредиентами, подходящими для композиций кормовых продуктов для домашних животных и их рекомендованные количества (см., например, в Требованиях по питанию собак и кошек Национального научно-исследовательского совета (National Research Council), National Academy Press, Washington D. C. 2006 или в Официальной публикации Ассоциации американских официальных контролеров по качеству кормов (Official Publication of the Association of American Feed Сontrol Officials) Inc., Требования по нутриентам для собак и кошек, 2006).

Дополнительно композиции по настоящему изобретению могут включать антиоксиданты, добавки, стабилизаторы, загустители, ароматизаторы, усилители вкусовой привлекательности и красители в количествах и комбинациях, известных специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение. Используемый здесь термин «антиоксиданты» относится к веществу, способному реагировать с или снижать продуцирование свободных радикалов и нейтрализовать их. Примеры включают без ограничения бета-каротин, селен, коэнзим Q₁₀ (убихвинон), лютеин, токотриенолы, изофлавоны сои, S-аденозилметионин, глютатион, таурин, N-ацетилцистеин, витамин E, витамин D, витамин C, флавоноиды, антоцианидины и липоевую кислоту.

Кормовые продукты по настоящему изобретению могут иметь любую консистенцию или содержание влаги, предпочтительно композиции по настоящему изобретению, например могут представлять собой влажный, полусухой или сухой кормовой продукт. Используемый здесь термин «влажный» кормовой продукт относится к кормовому продукту, представленному на рынке в консервных банках или пакетиках из фольги с содержанием влаги в пределах от около 70 до около 90%. Используемый здесь термин «сухой» кормовой продукт относится к кормовому продукту с содержанием влаги в пределах от около 5 до около 15% и, как правило, производимому в форме маленьких кусочков или крупных гранул. Используемый здесь термин «полусухие композиции» относится к композициям с содержанием влаги в пределах от около 15% до около 70%. Также согласно настоящему изобретению композиции по настоящему изобретению могут включать компоненты с различной консистенцией, наряду с этим они могут включать более чем одну консистенцию, например мягкие, жевкие, подобные мясу частицы, при этом крупные гранулы имеют внешний зерновой компонент и внутренний кремовый компонент, как описано, например, в патенте США № 6517877.

Для получения и расфасовки композиций по настоящему изобретению могут быть использованы различные способы, известные специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение.

Также способы по настоящему изобретению включают способы получения благоприятной модификации экспрессии генов у животного, а именно понижающей регуляции экспрессии гена или генов, связанных с нежелательным биологическим состоянием или направлением или заболеванием, и/или повышающей регуляции экспрессии гена или генов, связанных с желаемым биологическим состоянием или направлением или способных оказывать положительное или профилактическое воздействие на заболевание, например, для одного или более биологического состояния, направления или заболевания, приведенного в Таблицах 14-27, включающие введение эффективного количества любой из композиций по настоящему изобретению непосредственно животному или беременной самке во время нахождения животного в ее утробе. Конечно, как описано здесь ниже в Примерах 7 и 8, оказание воздействия на животное на генном уровне введением композиций по настоящему изобретению или непосредственно животному или беременной самке во время нахождения животного в ее утробе может оказывать положительное воздействие, даже профилактическое, оздоравливающее воздействие на животное за счет оказания воздействия на экспрессию одного или более гена, приведенного в Таблицах 2-15. Например, введение животному эффективного количества композиции по настоящему изобретению может способствовать здоровому состоянию костей и суставов за счет понижающей регуляции генов, связанных с повреждением артритом хряща и связок, например, интерлейкина 1-бета, фибронектина, лакторансферрина и тому подобного. (См. Таблицу 2).

Согласно настоящему изобретению композиции по настоящему изобретению могут быть введены животному как сами по себе, в качестве полностью питательно сбалансированного рациона, так и совместно с кормовыми добавками, витаминами и/или другими оказывающими положительное нутритивное воздействие агентами, известными специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение как часть общей программы хорошего самочувствия животного. Также композиции по настоящему изобретению могут быть использованы в качестве ветеринарного терапевтического продукта. По существу композиции необязательно могут содержать подходящий носитель, растворитель или наполнитель, известный специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение.

Также согласно настоящему изобретению, композиции по настоящему изобретению могут быть введены непосредственно растущему животному, например растущему щенку или котенку, композиция может быть введена беременной самке, в утробе которой находится животное, или когда животное находится на молочном вскармливании.

Следующие примеры только дополнительно иллюстрируют настоящее изобретение, не ограничивая его. Следует понимать, что при описании рецептурных составов они могут быть описаны в рамках ингредиентов, известных из предшествующего уровня техники, несмотря на то, что эти ингредиенты могут реагировать друг с другом в данном рецептурном составе при получении, хранении и использовании, и такие продукты входят в рецептурные составы, описанные здесь.

Следующие примеры дополнительно описывают и демонстрируют иллюстрирующие варианты воплощения настоящего изобретения, не выходящие за рамки настоящего изобретения. Примеры приведены только для иллюстрации настоящего изобретения и не ограничивают многочисленные варианты, не выходящие за рамки настоящего изобретения. Специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение, следует понимать, что различные модификации настоящего изобретения в дополнение к приведенным здесь также входят в объем притязаний формулы настоящего изобретения.

Если ясно не указанно иное, все проценты в описании приведены как массовые проценты по сухому веществу. Термин «по сухому веществу» означает концентрацию компонентов в композиции после удаления из композиции любой влаги.

ПРИМЕРЫ

Пример 1

Генетическое воздействие на собак в возрасте от зачатия до одного года

Для описания воздействия на генотип потребления композиции, рецептурный состав которой составлен таким образом, чтобы усиливать рост животного, проводят эксперимент для определения изменений в экспрессии генов у щенков в возрасте одного года от самок, потреблявших композиции, приведенные в Таблице 1.

Таблица 1
Средние профили анализируемых нутриентов кормовых продуктов, используемых в исследовании
Ингредиент, %	Лечебный кормовой продукт Н	Контрольный кормовой продукт Р
Влага, %	6,09	7,44
Сырой белок, %	29,4	27,9
Жир, %	17,6	14,2
Сa, %	1,43	1,46
P, %	1,2	0,96
ДГК, %	0,19	0,01
ЭПК, %	0,31	<0,01
Линолевая кислота, %	3,8	2,14
Общие n-3 жирные кислоты, %	3,7	2,6
Общие n-6 жирные кислоты, %	0,14	0,08
Таурин, %	312,1	Не анализируют
Метионин, %	1,3	0,52
Цистеин, %	0,4	0,39
Марганец, частей на миллион	94,5	64
Витамин Е, МЕ/кг	816	43,8
Витамин С, частей на миллион	168,6	<10
Холин, частей на миллион	4876	Не анализируют

Композиция Р представляет собой композицию коммерчески доступного кормового продукта для собак. Композиция Н представляет собой экспериментальную композицию кормового продукта для собак.

В течение, по меньшей мере, 10 дней перед зачатием самки потребляли Композицию Н или Композицию Р. Самки входили в группу до момента подтверждения у них беременности при пальпации, и затем они переходили в группу беременных. Щенки от самок потребляют до достижения одного года те же самые кормовые продукты, что и самки (включая период до отъема и после отъема). Затем у щенков берут образцы крови и выделяют мРНК с использованием традиционных способов. Исследование с микрочипом проводят с использованием генного чипа Affymetrix Canine-2 согласно традиционным способам.

В Таблицах, приведенных ниже, приведены гены, сгруппированные по функциям и направлению экспрессии, где повышающая регуляция Композиции H («H») по сравнению с Композицией P («P») демонстрирует повышение экспрессии генов у щенков, потребляющих Композицию H, по сравнению со щенками, потребляющими Композицию P. Аналогично, понижающая регуляция гена у щенков, потребляющих Композицию H, по сравнению со щенками, потребляющими Композицию P, демонстрирует пониженную экспрессию генов у щенков, потребляющих Композицию H, по сравнению со щенками, потребляющими Композицию P.

Таблица 2Гены, связанные с артритом/воспалением костей и суставов
Название	Обозначение	Направление экспрессии H по сравнению с P
Интерлейкин 1-бета	CfaAffx.11741.1.S1_s_at	понижающая
Фибронектин	Cfa.3707.1.A1_s_at	понижающая
Гомолог v-fos онкогена вируса остеосаркомы мыши FBJ	Cfa.9039.1.A1_at	понижающая
Фосфатаза 1 двойной специфичности	CfaAffx.25714.1.S1_s_at	понижающая
Лактотрансферрин	CfaAffx.21286.1.S1_s_at	понижающая
Рецептор компонента 5a комплемента	CfaAffx.7180.1.S1_s_at	понижающая
Ксантиндегидрогеназа	CfaAffx.9452.1.S1_s_at	понижающая
Секретируемый фосфобелок 1	CfaAffx.l5042.1.S1_s_at	понижающая

Таблица 3Гены, связанные с репликацией и репарацией ДНК
Название	Обозначение	Направление экспрессии H по сравнению с P
Фрагментация ДНК
Интерлейкин 1-бета	CfaAffx.11741.1.S1_s_at	понижающая
Фибронектин	Cfa.3707.1.A1_s_at	понижающая
Нейрегулин 1	CfaAffx.10523.1.S1_s_at	понижающая
Фосфатаза 1 двойной специфичности	CfaAffx.25714.1.S1_s_at	понижающая
DFFA-подобный эффектор a, индуцирующий гибель клеток	CfaAffx.28752.1.S1_at	понижающая
Контроль процессинга собственной ДНК
Почкование, не ингибируемое гомологом бензимидазола 1	Cfa.l559.1.A1_at	повышающая
Топоизомераза II-альфа	Cfa.l8946.1.S1_s_at	повышающая
Кинетохор, связывающая 2	Cfa.3066.1.S1_s_at	повышающая
Гомолог класпина	CfaAffx.6235.1.S1_s_at	повышающая
Циклин B1	CfaAffx.l2419.1.S1_s_at	повышающая
Циклин B2	Cfa.ll939.1.A1_s_at	повышающая
G белок конденсирования человеческой хромосомы	CfaAffx.25509.1.S1_at	повышающая
Лейциновая молния белка 5	CfaAffx.8781.1.S1_s_at	повышающая
23 член семейства кинезина	Cfa.15293.1.A1_at	повышающая
Флэп структуроспецифичная эндонуклеаза 1	Cfa.1854.1.A1_at	повышающая

Таблица 4Гены, связанные с раком
Название	Probe Датчик	Направление экспрессии H по сравнению с P
Интерлейкин 1-бета	CfaAffx.11741.1.S1_s_at	понижающая
Фибронектин	Cfa.3707.1.A1_s_at	понижающая
Гомолог v-fos онкогена вируса остеосаркомы мыши FBJ	Cfa.9039.1. A1_at	понижающая
Фосфатаза 1 двойной специфичности	CfaAffx.25714.1.S1_s_at	понижающая
Рецептор компонента 5a комплемента	CfaAffx.7180.1.S1_s_at	понижающая
Ксантиндегидрогеназа	CfaAffx.9452.1.S1_s_at	понижающая
Клеточный репрессор E1A-стимулированных 1 генов	Cfa.10558.3.A1_at	понижающая
Хондротинсульфат протеогликана 2	CfaAffx.13597.1.Sl_s_at	понижающая
Транскобаламин II, микроцитарная анемия	CfaAffx.19852.1.S1_s_at	понижающая
Ингибитор серпинпептидазы, член 10 монофилетической группы B	CfaAffx.1043.1.S1_s_at	понижающая
coli понижающая регуляция 1 аденоматозного полипоза	CfaAffx.28621.1.S1_at	понижающая
Шестой мембранный эпителиальный антиген простаты 2	Cfa.1933.1.S1_at	понижающая
Аланиламинопептидаза	Cfa.3774.1.A1_s_at	понижающая
Кандидат 5 предрасположенности к раку	Cfa.1126.1.S1_at	повышающая
Экспрессируемый отцовский 3	Cfa.4482.1.S1_at	повышающая
Топоизомераза II-альфа	Cfa.18946.1.S1_s_at	повышающая
Тубулин альфа 6	CfaAffx.13667.1.S1_at	повышающая
Циклин B1	CfaAffx.12419.1.S1_s_at	повышающая
Связанный с 1 циклом деления клеток	CfaAffx.20529.1.S1_at	повышающая
Связанный с 2 циклом деления клеток	CfaAffx.20006.1.S1_at	повышающая
Полипептид М2 рибонуклеотидредуктазы	CfaAffx.6059.1.S1_at	повышающая
Анти-эстроген устойчивый рак молочной железы 3	Cfa.651.1.S1_at	повышающая
Член 17 суперсемейства рецептора фактора некроза опухолей	CfaAffx.28790.1.S1_at	повышающая
Протеинкиназа С, йота	CfaAffx.22822.1.S1_s_at	повышающая

Таблица 5Гены, связанные с повреждением клетки
Название	Обозначение	Направление экспрессии H по сравнению с P
Интерлейкин 1-бета	CfaAffx.11741.1.S1_s_at	понижающая
Фибронектин	Cfa.3707.1.A1_s_at	понижающая
Нейрегулин 1	CfaAffx.10523.1.S1_s_at	понижающая
Гомолог v-fos онкогена вируса остеосаркомы мыши FBJ	Cfa.9039.1.A1_at	понижающая
Фосфатаза 1 двойной специфичности	CfaAffx.25714.1.S1_s_at	понижающая
Рецептор компонента 5a комплемента	CfaAffx.7180.1.S1_s_at	понижающая
Ксантиндегидрогеназа	CfaAffx.9452.1.S1_s_at	понижающая
Рецептор макрофага с коллагеновой структурой	Cfa.15713.1.A1_s_at	понижающая
Циклин B1	CfaAffx.12419.1.S1_s_at	повышающая
Связанный с 2 циклом деления клеток	CfaAffx.20006.1.S1_at	повышающая
Гемоглобин эпсилон 1	CfaAffx.10240.1.S1_s_at	повышающая
Протеинкиназа С, йота	CfaAffx.22822.1.S1_s_at	повышающая

Таблица 6Гены, связанные со сборкой клетки
Название	Обозначение	Направление экспрессии H по сравнению с P
Интерлейкин 1-бета	CfaAffx.11741.1.S1_s_at	понижающая
Фибронектин	Cfa.3707.1.A1_s_at	понижающая
Нейрегулин 1	CfaAffx.10523.1.S1_s_at	понижающая
Хондротинсульфат протеогликана 2	CfaAffx.13597.1.Sl_s_at	понижающая
Холинергический мускариновый 3 рецептор	Cfa.8414.1.A1_s_at	понижающая
Ксантиндегидрогеназа	CfaAffx.9452.1.S1_s_at	понижающая
Рецептор макрофага с коллагеновой структурой	Cfa.15713.1.A1_s_at	понижающая
Циклин B1	CfaAffx.12419.1.S1_s_at	повышающая
Связанный с 2 циклом деления клеток	CfaAffx.20006.1.S1_at	повышающая
Лейциновая молния белка 5	CfaAffx.8781.1.S1_s_at	повышающая
23 член семейства кинезина	Cfa.15293.1.A1_at	повышающая
Почкование, не ингибируемое гомологом бензимидазола 1	Cfa.l559.1.A1_at	повышающая
Циклин B2	Cfa.11939.1.A1_s_at	повышающая
Топоизомераза II-альфа	Cfa.18946.1.S1_s_at	повышающая
Кинетохор, связывающая 2	Cfa.3066.1.S1_s_at	повышающая
Связанный с 1 циклом деления клеток	CfaAffx.20529.1.S1_at	повышающая
G белок конденсированния человеческой хромосомы	CfaAffx.25509.1.S1_at	повышающая
11 член семейства кинезина	CfaAffx.12118.1.S1_s_at	повышающая
Якорный белок 2 киназы (PRKA)	Cfa.10574.1.А1_at	повышающая
Тимопиотен	Cfa.18367.2.S1_s_at	повышающая

Таблица 7Гены, связанные с регуляцией клеточного цикла
Название	Обозначение	Направление экспрессии H по сравнению с P
Интерлейкин 1-бета	CfaAffx.11741.1.S1_s_at	понижающая
Фибронектин	Cfa.3707.1.A1_s_at	понижающая
Нейрегулин 1	CfaAffx.10523.1.S1_s_at	понижающая
Гомолог v-fos онкогена вируса остеосаркомы мыши FBJ	Cfa.9039.1.A1_at	понижающая
Холинергический мускариновый 3 рецептор	Cfa.8414.1.A1_s_at	понижающая
Фосфатаза 1 двойной специфичности	CfaAffx.25714.1.S1_s_at	понижающая
Клеточный репрессор E1A-стимулированных 1 генов	Cfa.10558.3.A1_at	понижающая
Циклин B1	Cfa.11939.1.A1_s_at	повышающая
Связанный с 2 циклом деления клеток	CfaAffx.20006.1.S1_at	повышающая
Лейциновая молния белка 5	CfaAffx.8781.1.S1_s_at	повышающая
Центромерный белок F,350/400 ka (митозин)	CfaAffx.19534.1.S1_at	повышающая
Анти-эстроген устойчивый рак молочной железы 3	Cfa.651.1.S1_at	повышающая
Почкование, не ингибируемое гомологом бензимидазола 1	Cfa.l559.1.A1_at	повышающая
Циклин B2	Cfa.11939.1.A1_s_at	повышающая
Топоизомераза II-альфа	Cfa.18946.1.S1_s_at	повышающая
Кинетохор связывающая 2	Cfa.3066.1.S1_s_at	повышающая
Связанный с 1 циклом деления клеток	CfaAffx.20529.1.S1_at	повышающая
G белок конденсирования человеческой хромосомы	CfaAffx.25509.1.S1_at	повышающая
11 член семейства кинезина	CfaAffx.12118.1.S1_s_at	повышающая

Таблица 8 Гены, связанные с различными функциями
Название	Обозначение	Направление экспрессии H по сравнению с P
Кальцифозинподобный	Cfa.21214.1.S1_s_at	понижающая
ELKS/RAB6 взаимодействующий/член 2 семейства CAST	Cfa.21214.1.S1_at	понижающая
Глютамил-т-РНК синтетаза 2	Cfa.2057.1.A1_at	понижающая
Домен 3, содержащий двойную спираль	Cfa.9084.1.A1_at	понижающая
Хромосома 16 клона RP11-26P10	Cfa.3834.1.S1_at	понижающая
Белок 1, содержащий Домен SAM - и домен HD	CfaArfx.13689.1.S1_at	понижающая
AJ420591	Cfa.15196.1.A1_at	понижающая
Член А семейства с последовательностью, аналогичной 46	CfaArfx.5194.1.S1_at	понижающая
Антиген CD1a	Cfa.18390.1.S1_s_at	понижающая
Маркер (CD1a) эпидермальных дендритных клеток	CfaAffx.17796.1.S1_at	понижающая
Мотив анкирина	CfaAffx.6104.1.S1_s_at	понижающая
RP11-549H3 на хромосоме X	Cfa.9597.1.S1_at	понижающая
Член 1 рибонуклеопротеинового домена семейства La	Cfa.14608.1.A1_at	понижающая
coli понижающая регуляция 1 аденоматозного полипоза	CfaAffx.28621.1.S1_at	понижающая
Открытая рамка считывания 3 хромосомы 21	CfaAffx.20763.1.S1_at	понижающая
EGF-подобный модуль, содержащий рецептор 1 муциноподобного гормона	CfaAffx.28381.1.S1_s_at	понижающая
Ацилтрансферазаподобный 1	CfaAffx.14833.1.S1_at	понижающая
RP11-95J15 из 7	Cfa.6138.1.A1_at	понижающая
Антиген CD8, бета-полипептида 2	Cfa.21011.1.S1_at	понижающая
Мультимерин 1	CfaAffx.l5515.1.S1_s_at	понижающая
Не связан ни с какими заболеваниями	Cfa.12500.1.A1_at	понижающая
Гипотетический белок FLJ21062	Cfa.1933.2.A1_at	понижающая
Специфичный нормальной слизистой пищевода 1	Cfa.11815.1.A1_at	понижающая
Регулятор передачи G-белка 7	CfaAffx.24021.1.S1_s_at	понижающая
Аутоантиген 1 островной клетки	Cfa.H691.1.A1_at	понижающая
Специфичный нормальной слизистой пищевода 1(NMESl), транскрипт вариант 2	CfaAffx.851.1.S1_s_at	понижающая
Не связан ни с какими заболеваниями	Cfa.5989.1.A1_s_at	понижающая
Субъединица 3 гамма-фактора инициации трансляции эукариот 2	Cfa.9060.1.A1_at	понижающая
Серин/треонинкиназа 17A	CfaAffx.21987.1.S1_at	понижающая
RP11-542F9 на хромосоме 6	CfaAffx.21067.1.S1_at	повышающая
Открытая рамка считывания 172 хромосомы 20	CfaAffx.13625.1.S1_at	повышающая