Терапевтические dll4-связывающие белки
Иллюстрации
Показать всеНастоящее изобретение относится к области иммунологии. Предложено антитело и его антигенсвязывающий фрагмент, способные связываться с дельта-подобным лигандом 4 (DLL4) человека, в том числе в форме меченого антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, конструкции с константным доменом иммуноглобулина, конъюгата с терапевтическим или цитотоксическим средством и в кристаллизованной форме. Кроме того, рассмотрены: изолированная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело или его фрагмент по изобретению, вектор экспрессии, клетка-хозяин и способ получения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента; а также фармацевтическая композиция для модуляции заболевания или расстройства, способы снижения активности человеческого DLL4 и способ лечения пациента, страдающего расстройством, ассоциированным с негативным воздействием DLL4. Антитело по настоящему изобретению и его антигенсвязывающий фрагмент обладают способностью блокировать передачу сигнала Notch1, что может найти дальнейшее применение в терапии заболеваний, опосредованных повышенной активностью сигнального пути Notch1. 14 н. и 35 з.п. ф-лы, 31 табл., 11 пр.
Реферат
Ссылка на родственные заявки
В настоящей заявке испрашивается приоритет предварительной заявки на патент США № 61/238152, поданной 29 августа 2009 г., и предварительной заявки на патент США № 61/261728, поданной 16 ноября 2009 г.
Область, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение относится к получению и применению DLL4-связывающих белков с улучшенными свойствами, и к их использованию для подавления, предупреждения и/или лечения раковых заболеваний, опухолей и/или других ассоциированных с ангиогенезом заболеваний, таких как глазная неоваскуляризация, или заболеваний, не ассоциированных с ангиогенезом и характеризующихся нарушением экспрессии или активности DLL4, таких как аутоиммунные расстройства.
Предшествующий уровень техники
Межклеточные взаимодействия необходимы для осуществления множества биологических процессов, таких как дифференцировка, пролиферация и гомеостаз. Одной из систем, используемых эукариотами широкого ряда, является путь передачи сигнала Notch. Этот путь, а в частности, рецептор Notch, также играет важную роль в функциональном ангиогенезе опухоли. Таким образом, ингибирование функции рецептора Notch, блокирование рецептора Notch и/или блокирование пути передачи Notch-сигнала является стратегией, которая может быть применена для получения противораковых композиций и разработки методов лечения рака. Было установлено, что небольшие молекулы-ингибиторы рецептора Notch являются токсичными, поскольку они подавляют экспрессию рецептора Notch в тканях дикого типа (нормальных тканях) во всем организме. Таким образом, различные члены пути передачи сигнала Notch должны рассматриваться как потенциальные мишени для терапии.
Лигандом сосудистой сети для рецептора Notch является дельта 4 или дельта-подобный лиганд 4 (DLL4). DLL4, который экспрессируется, главным образом, в сосудистой сети, играет важную роль в развитии сосудов (Yan et al., Clin. Cancer Res., 13(24): 7243-7246 (2007); Shutter et al., Genes Dev., 14(11): 1313-1318 (2000); Gale et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101(45): 15949-15954 (2004); Krebs et al., Genes Dev., 14(11): 1343-1352 (2000)). Мыши, гетерозиготные по DLL4, погибают на стадии эмбрионального развития, что обусловлено значительными нарушениями развития сосудов (Gale et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101(45): 15949-15954 (2004); Duarte et al., Genes Dev., 18(20): 2474-2478 (2004); Krebs et al., Genes Dev., 18(20): 2469-2473 (2004)). Экспрессия DLL4 может быть индуцирована VEGF (Liu et al., Mol. Cell Biol, 23(1): 14-25 (2003); Lobov et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 104(9): 3219-3224 (2007)). В свою очередь, DLL4 может снижать передачу сигнала VEGF, частично посредством ингибирования VEGFR2 и индуцирования VEGRl (Harrington et al., Microvasc. Res., 75(2): 144-154 (2008); Suchting et al., Proc. Natl. Acad. Sci USA, 104(9): 3225-3230 (2007)). Тонкая координация между DLL4 и VEGF играет важную роль в функциональном ангиогенезе.
Помимо своей физиологической роли DLL4 также активируется в кровеносных сосудах опухолей (Gale et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101(45): 15949-15954 (2004); Mailhos et al., Differentiation, 69(2-3): 135-144 (2001); Patel et al., Cancer Res., 65(19): 8690-8697 (2005); Patel et al., Clin. Cancer Res., 12(16): 4836-4844 (2006); Noguera-Troise et al., Nature, 444(7122): 1032-1037 (2006)). Блокирование DLL4 приводит к сильному ингибированию роста первичной опухоли во многих моделях (Noguera-Troise et al., Nature, 444(7122): 1032-1037 (2006); Ridgway et al., Nature, 444(7122): 1083-1087 (2006); Scehnet et al., Blood, 109(11): 4753-4760 (2007)). Такое ингибирование DLL4 является эффективным даже по отношению к опухолям, резистентным к терапии анти-VEGF антителами. Комбинированное ингибирование DLL4 и VEGF приводит к повышению противоопухолевой активности. Интересно отметить, что в отличие от ингибирования VEGF, которое снижает образование опухолевых сосудов, блокирование DLL4 приводит к повышению плотности сосудистой сети опухоли, где указанные сосуды являются аномальными, не могут обеспечивать эффективное прохождение кровотока и являются функционально неэффективными. Таким образом, DLL4 является потенциальной мишенью для лечения рака.
Поэтому необходимо получить такие терапевтические средства, которые могут быть нацелены на путь DLL4-Notch и тем самым ингибировать этот путь или даже предотвращать ангиогенез и рост опухоли.
Описание сущности изобретения
Настоящее изобретение относится к белкам, которые связываются с DLL4, включая антитела, CDR-привитые антитела и их связывающие фрагменты, обладающие способностью связываться с DLL4. Описанный здесь связывающий белок, предпочтительно, связывается с DLL4 с высокой аффинностью. Более предпочтительно, связывающий белок согласно изобретению обладает способностью нейтрализовать DLL4. Настоящее изобретение также относится к способам получения и применения DLL4-связывающих белков, включая человеческие DLL4-связывающие белки. Преимущество настоящего изобретения заключается в том, что оно не требует получения гуманизированных DLL4-связывающих белков, что позволяет избежать проблем, возникающих при использовании гуманизированных DLL4-связывающих белков.
В одном из своих аспектов настоящее изобретение относится к связывающему белку, содержащему антигенсвязывающий домен, способный связываться с человеческим DLL4, где указанный антигенсвязывающий домен включает по меньшей мере одну или несколько CDR, выбранных из группы, состоящей из:
CDR-H1: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7 (SEQ ID NO: 99), где:
X1 представляет собой S или N;
X2 представляет собой S, G или N;
X3 представляет собой S, N, T, G или R;
X4 представляет собой Y;
X5 представляет собой Y или H;
X6 представляет собой W; и
X7 представляет собой G;
CDR-H2: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15-X16 (SEQ ID NO: 100), где:
X1 представляет собой D;
X2 представляет собой I;
X3 представляет собой Y, N или S;
X4 представляет собой Y;
X5 представляет собой T, N, A, I, S или R;
X6 представляет собой G;
X7 представляет собой S, N, T или G;
X8 представляет собой T;
X9 представляет собой Y;
X10 представляет собой Y;
X11 представляет собой N;
X12 представляет собой P;
X13 представляет собой S;
X14 представляет собой L;
X15 представляет собой K; и
X16 представляет собой S, N, D или G;
CDR-H3: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11 (SEQ ID NO: 101), где:
X1 представляет собой E, Y, F, Q, W, L или A;
X2 представляет собой D, A, S, G, V, E или N;
X3 представляет собой V, M, L, P или A;
X4 представляет собой I, A, P, R, S, K, Q, V, G, M или E;
X5 представляет собой L, Y, F или M;
X6 представляет собой R, G, S, Q или A;
X7 представляет собой G;
X8 представляет собой G, A или S;
X9 представляет собой S, A, L, V, R или G;
X10 представляет собой D; и
X11 представляет собой Y, D, S, N, H, E, R, L, P, C, I, M, T, Q или K;
CDR-L1: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11 (SEQ ID NO: 102), где:
X1 представляет собой S;
X2 представляет собой G;
X3 представляет собой Q, E или D;
X4 представляет собой R, S, G, M, K, L или T;
X5 представляет собой L;
X6 представляет собой G;
X7 представляет собой D или E;
X8 представляет собой K;
X9 представляет собой Y;
X10 представляет собой A или V; и
X11 представляет собой S;
CDR-L2: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7 (SEQ ID NO: 103), где:
X1 представляет собой E или Q;
X2 представляет собой D;
X3 представляет собой S, L, T, A, E или F;
X4 представляет собой K, T, Е, N, Q, S или M;
X5 представляет собой R;
X6 представляет собой P; и
X7 представляет собой S;
и
CDR-L3: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9 (SEQ ID NO: 104), где:
X1 представляет собой Q;
X2 представляет собой A;
X3 представляет собой W;
X4 представляет собой D;
X5 представляет собой R, S, M, E, N, G или K;
X6 представляет собой D или E;
X7 представляет собой T, V, A, S или M;
X8 представляет собой G, A или C; и
X9 представляет собой V.
Предпочтительно, антигенсвязывающий домен DLL4-связывающего белка согласно изобретению содержит по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из:
остатков 31-37 SEQ ID NO: 1 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 1 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 1 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 111 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 111 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 111 (CDR-L3);
SEQ ID NO: 117 (CDR-H1); SEQ ID NO: 118 (CDR-H2); SEQ ID NO: 119 (CDR-H3); SEQ ID NO: 121 (CDR-H1); SEQ ID NO: 122 (CDR-H2); SEQ ID NO: 123 (CDR-H3); SEQ ID NO: 125 (CDR-H1); SEQ ID NO: 126 (CDR-H2); SEQ ID NO: 127 (CDR-H3); SEQ ID NO: 129 (CDR-H1); SEQ ID NO: 130 (CDR-H2); SEQ ID NO: 131 (CDR-H3); SEQ ID NO: 133 (CDR-H1); SEQ ID NO: 134 (CDR-H2); SEQ ID NO: 135 (CDR-H3); SEQ ID NO: 137 (CDR-H1); SEQ ID NO: 138 (CDR-H2); SEQ ID NO: 139 (CDR-H3); SEQ ID NO: 141 (CDR-H1); SEQ ID NO: 142 (CDR-H2); SEQ ID NO: 143 (CDR-H3); SEQ ID NO: 145 (CDR-H1); SEQ ID NO: 146 (CDR-H2); SEQ ID NO: 147 (CDR-H3); SEQ ID NO: 149 (CDR-H1); SEQ ID NO: 150 (CDR-H2); SEQ ID NO: 151 (CDR-H3); SEQ ID NO: 153 (CDR-H1); SEQ ID NO: 154 (CDR-H2); SEQ ID NO: 155 (CDR-H3); SEQ ID NO: 157 (CDR-HI); SEQ ID NO: 158 (CDR-H2); SEQ ID NO: 159 (CDR-H3); SEQ ID NO: 161 (CDR-H1); SEQ ID NO: 162 (CDR-H2); SEQ ID NO: 163 (CDR-H3); SEQ ID NO: 165 (CDR-H1); SEQ ID NO: 166 (CDR-H2); SEQ ID NO: 167 (CDR-H3); SEQ ID NO: 169 (CDR-H1); SEQ ID NO: 170 (CDR-H2); SEQ ID NO: 171 (CDR-H3); SEQ ID NO: 173 (CDR-H1); SEQ ID NO: 174 (CDR-H2); SEQ ID NO: 175 (CDR-H3); SEQ ID NO: 177 (CDR-H1); SEQ ID NO: 178 (CDR-H2); SEQ ID NO: 179 (CDR-H3); SEQ ID NO: 181 (CDR-H1); SEQ ID NO: 182 (CDR-H2); SEQ ID NO: 183 (CDR-H3); SEQ ID NO: 185 (CDR-H1); SEQ ID NO: 186 (CDR-H2); SEQ ID NO: 187 (CDR-H3); SEQ ID NO: 189 (CDR-H1); SEQ ID NO: 190 (CDR-H2); SEQ ID NO: 191 (CDR-H3); SEQ ID NO: 193 (CDR-H1); SEQ ID NO: 194 (CDR-H2); SEQ ID NO: 195 (CDR-H3); SEQ ID NO: 197 (CDR-H1); SEQ ID NO: 198 (CDR-H2); SEQ ID NO: 199 (CDR-H3); SEQ ID NO: 201 (CDR-H1); SEQ ID NO: 202 (CDR-H2); SEQ ID NO: 203 (CDR-H3); SEQ ID NO: 205 (CDR-H1); SEQ ID NO: 206 (CDR-H2); SEQ ID NO: 207 (CDR-H3); SEQ ID NO: 209 (CDR-H1); SEQ ID NO: 210 (CDR-H2); SEQ ID NO: 211 (CDR-H3); SEQ ID NO: 213 (CDR-H1); SEQ ID NO: 214 (CDR-H2); SEQ ID NO: 215 (CDR-H3); SEQ ID NO: 217 (CDR-L1); SEQ ID NO: 218 (CDR-L2); SEQ ID NO: 219 (CDR-L3); SEQ ID NO: 221 (CDR-L1); SEQ ID NO: 222 (CDR-L2); SEQ ID NO: 223 (CDR-L3); SEQ ID NO: 225 (CDR-L1); SEQ ID NO: 226 (CDR-L2); SEQ ID NO: 227 (CDR-L3); SEQ ID NO: 229 (CDR-L1); SEQ ID NO: 230 (CDR-L2); SEQ ID NO: 231 (CDR-L3); SEQ ID NO: 233 (CDR-L1); SEQ ID NO: 234 (CDR-L2); SEQ ID NO: 235 (CDR-L3); SEQ ID NO: 237 (CDR-L1); SEQ ID NO: 238 (CDR-L2); SEQ ID NO: 239 (CDR-L3); SEQ ID NO: 241 (CDR-L1); SEQ ID NO: 242 (CDR-L2); SEQ ID NO: 243 (CDR-L3); SEQ ID NO: 245 (CDR-L1); SEQ ID NO: 246 (CDR-L2); SEQ ID NO: 247 (CDR-L3); SEQ ID NO: 249 (CDR-L1); SEQ ID NO: 250 (CDR-L2); SEQ ID NO: 251 (CDR-L3); SEQ ID NO: 253 (CDR-L1); SEQ ID NO: 254 (CDR-L2); SEQ ID NO: 255 (CDR-L3); SEQ ID NO: 257 (CDR-L1); SEQ ID NO: 258 (CDR-L2); SEQ ID NO: 259 (CDR-L3); SEQ ID NO: 261 (CDR-L1); SEQ ID NO: 262 (CDR-L2); SEQ ID NO: 263 (CDR-L3); SEQ ID NO: 265 (CDR-L1); SEQ ID NO: 266 (CDR-L2); SEQ ID NO: 267 (CDR-L3); SEQ ID NO: 269 (CDR-L1); SEQ ID NO: 270 (CDR-L2); SEQ ID NO: 271 (CDR-L3); SEQ ID NO: 273 (CDR-L1); SEQ ID NO: 274 (CDR-L2); SEQ ID NO: 275 (CDR-L3); SEQ ID NO: 277 (CDR-L1); SEQ ID NO: 278 (CDR-L2); SEQ ID NO: 279 (CDR-L3); SEQ ID NO: 281 (CDR-L1); SEQ ID NO: 282 (CDR-L2); SEQ ID NO: 283 (CDR-L3); SEQ ID NO: 285 (CDR-L1); SEQ ID NO: 286 (CDR-L2); SEQ ID NO: 287 (CDR-L3); SEQ ID NO: 289 (CDR-L1); SEQ ID NO: 290 (CDR-L2); SEQ ID NO: 291 (CDR-L3); SEQ ID NO: 293 (CDR-L1); SEQ ID NO: 294 (CDR-L2); SEQ ID NO: 295 (CDR-L3); SEQ ID NO: 297 (CDR-L1); SEQ ID NO: 298 (CDR-L2); SEQ ID NO: 299 (CDR-L3); SEQ ID NO: 301 (CDR-L1); SEQ ID NO: 302 (CDR-L2); SEQ ID NO: 303 (CDR-L3); SEQ ID NO: 305 (CDR-L1); SEQ ID NO: 306 (CDR-L2); SEQ ID NO: 307 (CDR-L3); SEQ ID NO: 309 (CDR-L1); SEQ ID NO: 310 (CDR-L2); SEQ ID NO: 311 (CDR-L3); SEQ ID NO: 313 (CDR-L1); SEQ ID NO: 314 (CDR-L2); SEQ ID NO: 315 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 334 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 334 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 334 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 335 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 335 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 335 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 336 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 336 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 336 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 337 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 337 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 337 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 338 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 338 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 338 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 339 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 339 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 339 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 340 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 340 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 340 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 341 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 341 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 341 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 342 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 342 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 342 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 343 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 343 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 343 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 344 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 344 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 344 (CDR-H3);
остатков 24-34 SEQ ID NO: 345 (CDR-L1); остатков 50-56 SEQ ID NO: 345 (CDR-L2); остатков 89-97 SEQ ID NO: 345 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 346 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 346 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 346 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 347 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 347 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 347 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 348 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 348 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 348 (CDR-H3);
остатков 24-34 SEQ ID NO: 349 (CDR-L1); остатков 50-56 SEQ ID NO: 349 (CDR-L2); остатков 89-97 SEQ ID NO: 349 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 350 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 350 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 350 (CDR-H3);
остатков 24-34 SEQ ID NO: 351 (CDR-L1); остатков 50-56 SEQ ID NO: 351 (CDR-L2); остатков 89-97 SEQ ID NO: 351 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 352 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 352 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 352 (CDR-H3);
остатков 24-34 SEQ ID NO: 353 (CDR-L1); остатков 50-56 SEQ ID NO: 353 (CDR-L2); остатков 89-97 SEQ ID NO: 353 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 354 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 354 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 354 (CDR-H3);
остатков 24-34 SEQ ID NO: 355 (CDR-L1); остатков 50-56 SEQ ID NO: 355 (CDR-L2); остатков 89-97 SEQ ID NO: 355 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 356 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 356 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 356 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 357 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 357 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 357 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 358 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 358 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 358 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 359 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 359 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 359 (CDR-L3);
остатков 31-37 SEQ ID NO: 360 (CDR-H1); остатков 52-67 SEQ ID NO: 360 (CDR-H2); остатков 100-110 SEQ ID NO: 360 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 361 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 361 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 361 (CDR-L3).
В другом варианте изобретения связывающий белок содержит по меньшей мере 3 CDR, описанные выше.
Предпочтительно, DLL4-связывающий белок согласно изобретению содержит одну или несколько описанных выше CDR. Более предпочтительно, указанный связывающий белок содержит три или более CDR, описанных выше. Наиболее предпочтительно, DLL4-связывающий белок согласно изобретению содержит шесть CDR, описанных выше, то есть CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3, CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3, описанные выше.
В предпочтительном варианте изобретения связывающий белок содержит по меньшей мере 3 CDR, выбранных из группы, состоящей из описанных выше последовательностей.
Более предпочтительно, связывающий белок содержит 3 CDR, выбранных из набора CDR вариабельного домена, выбранного из нижеследующей группы:
Набор VH E9 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 1
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 1
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 1
Набор VL E9 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 111
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 111
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 111
Набор VH E9.4 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 117
CDR-H2: SEQ ID NO: 118
CDR-H3: SEQ ID NO: 119
Набор VL E9.4 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 229
CDR-L2: SEQ ID NO: 230
CDR-L3: SEQ ID NO: 231
Набор VH E9.11 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 121
CDR-H2: SEQ ID NO: 122
CDR-H3: SEQ ID NO: 123
Набор VL E9.11 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 233
CDR-L2: SEQ ID NO: 234
CDR-L3: SEQ ID NO: 235
Набор VH E9.14 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 125
CDR-H2: SEQ ID NO: 126
CDR-H3: SEQ ID NO: 127
Набор VL E9.14 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 237
CDR-L2: SEQ ID NO: 238
CDR-L3: SEQ ID NO: 239
Набор VH E9.17 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 129
CDR-H2: SEQ ID NO: 130
CDR-H3: SEQ ID NO: 131
Набор VL E9.17 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 241
CDR-L2: SEQ ID NO: 242
CDR-L3: SEQ ID NO: 243
Набор VH E9.18 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 133
CDR-H2: SEQ ID NO: 134
CDR-H3: SEQ ID NO: 135
Набор VL E9.18 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 245
CDR-L2: SEQ ID NO: 246
CDR-L3: SEQ ID NO: 247
Набор VH E9.19 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 137
CDR-H2: SEQ ID NO: 138
CDR-H3: SEQ ID NO: 139
Набор VL E9.19 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 249
CDR-L2: SEQ ID NO: 250
CDR-L3: SEQ ID NO: 251
Набор VH E9.22 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 141
CDR-H2: SEQ ID NO: 142
CDR-H3: SEQ ID NO: 143
Набор VL E9.22 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 253
CDR-L2: SEQ ID NO: 254
CDR-L3: SEQ ID NO: 255
Набор VH E9.48 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 145
CDR-H2: SEQ ID NO: 146
CDR-H3: SEQ ID NO: 147
Набор VL E9.48 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 257
CDR-L2: SEQ ID NO: 258
CDR-L3: SEQ ID NO: 259
Набор VH E9.65 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 149
CDR-H2: SEQ ID NO: 150
CDR-H3: SEQ ID NO: 151
Набор VL E9.65 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 261
CDR-L2: SEQ ID NO: 262
CDR-L3: SEQ ID NO: 263
Набор VH E9.66 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 153
CDR-H2: SEQ ID NO: 154
CDR-H3: SEQ ID NO: 155
Набор VL E9.66 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 265
CDR-L2: SEQ ID NO: 266
CDR-L3: SEQ ID NO: 267
Набор VH E9.71 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 157
CDR-H2: SEQ ID NO: 158
CDR-H3: SEQ ID NO: 159
Набор VL E9.71 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 269
CDR-L2: SEQ ID NO: 270
CDR-L3: SEQ ID NO: 271
Набор VH E9.13 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 161
CDR-H2: SEQ ID NO: 162
CDR-H3: SEQ ID NO: 163
Набор VL E9.13 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 217
CDR-L2: SEQ ID NO: 218
CDR-L3: SEQ ID NO: 219
Набор VH E9.16 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 165
CDR-H2: SEQ ID NO: 166
CDR-H3: SEQ ID NO: 167
Набор VL E9.16 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 221
CDR-L2: SEQ ID NO: 222
CDR-L3: SEQ ID NO: 223
Набор VH E9.38 CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 169
CDR-H2: SEQ ID NO: 170
CDR-H3: SEQ ID NO: 171
Набор VL E9.38 CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 225
CDR-L2: SEQ ID NO: 226
CDR-L3: SEQ ID NO: 227
Набор VH E9.2В CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 173
CDR-H2: SEQ ID NO: 174
CDR-H3: SEQ ID NO: 175
Набор VL E9.2В CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 273
CDR-L2: SEQ ID NO: 274
CDR-L3: SEQ ID NO: 275
Набор VH E9.1F CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 177
CDR-H2: SEQ ID NO: 178
CDR-H3: SEQ ID NO: 179
Набор VL E9.1F CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 277
CDR-L2: SEQ ID NO: 278
CDR-L3: SEQ ID NO: 279
Набор VH E9.10H CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 181
CDR-H2: SEQ ID NO: 182
CDR-H3: SEQ ID NO: 183
Набор VL E9.10H CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 301
CDR-L2: SEQ ID NO: 302
CDR-L3: SEQ ID NO: 303
Набор VH E9.5E CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 185
CDR-H2: SEQ ID NO: 186
CDR-H3: SEQ ID NO: 187
Набор VL E9.5E CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 293
CDR-L2: SEQ ID NO: 294
CDR-L3: SEQ ID NO: 295
Набор VH E9.10C CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 189
CDR-H2: SEQ ID NO: 190
CDR-H3: SEQ ID NO: 191
Набор VL E9.10C CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 281
CDR-L2: SEQ ID NO: 282
CDR-L3: SEQ ID NO: 283
Набор VH E9.7E CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 193
CDR-H2: SEQ ID NO: 194
CDR-H3: SEQ ID NO: 195
Набор VL E9.7E CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 289
CDR-L2: SEQ ID NO: 290
CDR-L3: SEQ ID NO: 291
Набор VH E9.12B CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 197
CDR-H2: SEQ ID NO: 198
CDR-H3: SEQ ID NO: 199
Набор VL E9.12B CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 297
CDR-L2: SEQ ID NO: 298
CDR-L3: SEQ ID NO: 299
Набор VH E9.10E CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 201
CDR-H2: SEQ ID NO: 202
CDR-H3: SEQ ID NO: 203
Набор VL E9.10E CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 285
CDR-L2: SEQ ID NO: 286
CDR-L3: SEQ ID NO: 287
Набор VH E9.6A CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 205
CDR-H2: SEQ ID NO: 206
CDR-H3: SEQ ID NO: 207
Набор VL E9.6A CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 305
CDR-L2: SEQ ID NO: 306
CDR-L3: SEQ ID NO: 307
Набор VH E9.7A CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 209
CDR-H2: SEQ ID NO: 210
CDR-H3: SEQ ID NO: 211
Набор VL E9.7A CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 309
CDR-L2: SEQ ID NO: 310
CDR-L3: SEQ ID NO: 311
Набор VH E9.8H CDR
CDR-H1: SEQ ID NO: 213
CDR-H2: SEQ ID NO: 214
CDR-H3: SEQ ID NO: 215
Набор VL E9.8H CDR
CDR-L1: SEQ ID NO: 313
CDR-L2: SEQ ID NO: 314
CDR-L3: SEQ ID NO: 315
Набор VH E9.1 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 334
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 334
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 334
Набор VL E9.1 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 335
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 335
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 335
Набор VH E9-SE1 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 336
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 336
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 336
Набор VL E9-SE1 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 337
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 337
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 337
Набор VH E9-SE2 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 338
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 338
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 338
Набор VL E9-SE2 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 339
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 339
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 339
Набор VH E9-SE3 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 340
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 340
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 340
Набор VL E9-SE3 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 341
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 341
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 341
Набор VH E9-SE4 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 342
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 342
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 342
Набор VL E9-SE4 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 343
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 343
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 343
Набор VH E9-SE5 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 344
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 344
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 344
Набор VL E9-SE5 CDR
CDR-L1: остатки 24-34 SEQ ID NO: 345
CDR-L2: остатки 50-56 SEQ ID NO: 345
CDR-L3: остатки 89-97 SEQ ID NO: 345
Набор VH E9-SE6 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 346
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 346
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 346
Набор VL E9-SE6 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 347
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 347
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 347
Набор VH E9-SE7 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 348
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 348
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 348
Набор VL E9-SE7 CDR
CDR-L1: остатки 24-34 SEQ ID NO: 349
CDR-L2: остатки 50-56 SEQ ID NO: 349
CDR-L3: остатки 89-97 SEQ ID NO: 349
Набор VH E9-SE8 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 350
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 350
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 350
Набор VL E9-SE8 CDR
CDR-L1: остатки 24-34 SEQ ID NO: 351
CDR-L2: остатки 50-56 SEQ ID NO: 351
CDR-L3: остатки 89-97 SEQ ID NO: 351
Набор VH E9-FR1 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 352
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 352
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 352
Набор VL E9-FR1 CDR
CDR-L1: остатки 24-34 SEQ ID NO: 353
CDR-L2: остатки 50-56 SEQ ID NO: 353
CDR-L3: остатки 89-97 SEQ ID NO: 353
Набор VH E9-FR2 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 354
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 354
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 354
Набор VL E9-FR2 CDR
CDR-L1: остатки 24-34 SEQ ID NO: 355
CDR-L2: остатки 50-56 SEQ ID NO: 355
CDR-L3: остатки 89-97 SEQ ID NO: 355
Набор VH E9.71 CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 356
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 356
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 356
Набор VL E9.71 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 357
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 357
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 357
Набор VH E9.71(M) CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 358
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 358
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 358
Набор VL E9.71(M) CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 359
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 359
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 359
Набор VH E9.71(L) CDR
CDR-H1: остатки 31-37 SEQ ID NO: 360
CDR-H2: остатки 52-67 SEQ ID NO: 360
CDR-H3: остатки 100-110 SEQ ID NO: 360
Набор VL E9.71(L) CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 361
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 361
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 361.
В другом варианте изобретения связывающий белок содержит набор из 3 CDR вариабельных тяжелых цепей (VH), выбранных из любого набора из 3 CDR VH в вышеуказанной группе, и набор из 3 CDR вариабельных легких цепей (VL), выбранных из любого набора из 3 CDR VL в вышеуказанной группе.
В другом варианте изобретения связывающий белок содержит набор из 3 CDR цепей, обозначенных VH, и набор из 3 CDR цепей, соответственно обозначенных VL, в вышеуказанной группе. Предпочтительно, связывающий белок согласно изобретению содержит по меньшей мере два набора CDR вариабельных доменов, выбранные из группы наборов CDR вариабельных доменов, состоящей из:
набора VH E9 CDR и набора VL E9 CDR,
набора VH E9.4 CDR и набора VL E9.4 CDR,
набора VH E9.11 CDR и набора VL E9.11 CDR,
набора VH E9.14 CDR и набора VL E9.14 CDR,
набора VH E9.17 CDR и набора VL E9.17 CDR,
набора VH E9.18 CDR и набора VL E9.18 CDR,
набора VH E9.19 CDR и набора VL E9.19 CDR,
набора VH E9.22 CDR и набора VL E9.22 CDR,
набора VH E9.48 CDR и набора VL E9.48 CDR,
набора VH E9.65 CDR и набора VL E9.65 CDR,
набора VH E9.66 CDR и набора VL E9.66 CDR,
набора VH E9.71 CDR и набора VL E9.71 CDR,
набора VH E9.13 CDR и набора VL E9.13 CDR,
набора VH E9.16 CDR и набора VL E9.16 CDR,
набора VH E9.38 CDR и набора VL E9.38 CDR,
набора VH E9.2B CDR и набора VL E9.2B CDR,
набора VH E9.1F CDR и набора VL E9.1F CDR,
набора VH E9.10H CDR и набора VL E9.10H CDR,
набора VH E9.5E CDR и набора VL E9.5E CDR,
набора VH E9.10C CDR и набора VL E9.10C CDR,
набора VH E9.7E CDR и набора VL E9.7E CDR,
набора VH E9.12B CDR и набора VL E9.12B CDR,
набора VH E9.10E CDR и набора VL E9.10E CDR,
набора VH E9.6A CDR и набора VL E9.6A CDR,
набора VH E9.7A CDR и набора VL E9.7A CDR,
набора VH E9.8H CDR и набора VL E9.8H CDR,
набора VH E9-SE1 CDR и набора VL E9-SE1 CDR,
набора VH E9-SE2 CDR и набора VL E9-SE2 CDR,
набора VH E9-SE3 CDR и набора VL E9-SE3 CDR,
набора VH E9-SE4 CDR и набора VL E9-SE4 CDR,
набора VH E9-SE5 CDR и набора VL E9-SE5 CDR,
набора VH E9-SE6 CDR и набора VL E9-SE6 CDR,
набора VH E9-SE7 CDR и набора VL E9-SE7 CDR,
набора VH E9-SE8 CDR и набора VL E9-SE8 CDR,
набора VH E9-FR1 CDR и набора VL E9-FR1 CDR,
набора VH E9-FR2 CDR и набора VL E9-FR2 CDR,
набора VH E9.71 CDR и набора VL E9.71 CDR,
набора VH E9.71(M) CDR и набора VL E9.71(M) CDR, и
набора VH E9.71(L) CDR и набора VL E9.71(L) CDR.
В другом варианте изобретения описанный выше связывающий белок также содержит человеческую акцепторную каркасную область. Предпочтительно, человеческая акцепторная каркасная область содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из:
последовательностей акцепторной каркасной области тяжелой цепи SEQ ID NO: 6-22,
акцепторных последовательностей тяжелой цепи SEQ ID NO: 35-62,
акцепторных последовательностей легкой цепи SEQ ID NO: 23-34, и
акцепторных последовательностей легкой цепи SEQ ID NO: 63-98.
В другом варианте изобретения вышеописанный связывающий белок содержит человеческую акцепторную каркасную область, которая включает по меньшей мере одну аминокислотную замену в каркасной области, где указанная аминокислотная последовательность каркасной области по меньшей мере на 65% идентична последовательности указанной человеческой акцепторной каркасной области и содержит по меньшей мере 70 аминокислотных остатков, идентичных остаткам указанной человеческой акцепторной каркасной области.
В другом варианте изобретения описанный здесь связывающий белок содержит человеческую акцепторную каркасную область, включающую по меньшей мере одну аминокислотную замену в каркасной области в положении ключевого остатка, где указанный ключевой остаток выбран из группы, состоящей из:
остатка, смежного с CDR;
остатка сайта гликозилирования;
редкого остатка;
остатка, способного взаимодействовать с человеческим DLL4;
канонического остатка;
остатка зоны контактирования вариабельной области тяжелой цепи с вариабельной областью легкой цепи;
остатка в зоне Верньера; и
остатка в области, которая перекрывается с областью CDR1 вариабельной тяжелой цепи, определенной по Чотиа, и с первой каркасной областью тяжелой цепи, определенной по Кэбату. Предпочтительно, ключевой остаток выбран из группы, состоящей из: 2H, 4H, 24H, 26H, 27H, 29H, 34H, 35H, 37H, 39H, 44H, 45H, 47H, 48H, 49H, 50H, 51H, 58H, 59H, 60H, 63H, 67H, 69H, 71H, 73H, 76H, 78H, 91H, 93H, 94H, 2L, 4L, 25L, 29L, 27bL, 33L, 34L, 36L, 38L, 43L, 44L, 46L, 47L, 48L, 49L, 55L, 58L, 62L, 64L, 71L, 87L, 89L, 90L, 91L, 94L, 95L.
В другом варианте изобретения описанный здесь связывающий белок содержит консенсусный человеческий вариабельный домен.
В предпочтительном варианте изобретения вышеописанный связывающий белок содержит по меньшей мере один вариабельный домен, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: 1, 111, 116, 228, 120, 232, 124, 236, 128, 240, 132, 244, 136, 248, 140, 252, 144, 256, 148, 260, 152, 264, 156, 268, 160, 216, 164, 220, 168, 224, 172, 272, 176, 276, 180, 300, 184, 292, 188, 280, 192, 288, 196, 296, 200, 284, 204, 304, 208, 308, 212, 312, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360 и 361.
В другом варианте изобретения связывающий белок согласно изобретению содержит два вариабельных домена, где указанные два вариабельных домена имеют аминокислотные последовательности, выбранные из группы, состоящей из: SEQ ID NO: 1 и 111, SEQ ID NO: 116 и 228, SEQ ID NO: 120 и 232, SEQ ID NO: 124 и 236, SEQ ID NO: 128 и 240, SEQ ID NO: 132 и 244, SEQ ID NO: 136 и 248, SEQ ID NO: 140 и 252, SEQ ID NO: 144 и 256, SEQ ID NO: 148 и 260, SEQ ID NO: 152 и 264, SEQ ID NO: 156 и 268, SEQ ID NO: 160 и 216, SEQ ID NO: 164 и 220, SEQ ID NO: 168 и 224, SEQ ID NO: 172 и 272, SEQ ID NO: 176 и 276, SEQ ID NO: 180 и 300, SEQ ID NO: 184 и 292, SEQ ID NO: 188 и 280, SEQ ID NO: 192 и 288, SEQ ID NO: 196 и 296, SEQ ID NO: 200 и 284, SEQ ID NO: 204 и 304, SEQ ID NO: 208 и 308, SEQ ID NO: 212 и 312, SEQ ID NO: 334 и 335, SEQ ID NO: 336 и 337, SEQ ID NO: 338 и 339, SEQ ID NO: 340 и 341, SEQ ID NO: 342 и 343, SEQ ID NO: 344 и 345, SEQ ID NO: 346 и 347, SEQ ID NO: 348 и 349, SEQ ID NO: 350 и 351, SEQ ID NO: 352 и 353, SEQ ID NO: 354 и 355, SEQ ID NO: 356 и 357, SEQ ID NO: 358 и 359, SEQ ID NO: 360 и 361.
В одном из вариантов изобретения связывающий белок согласно изобретению содержит вариабельный домен тяжелой цепи (VH), где, предпочтительно, VH включает аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из:
SEQ ID NO: 1, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140, 144, 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 334, 336, 338, 340, 342, 344, 346, 348, 350, 352, 354, 356, 358 и 360.
В другом варианте изобретения связывающий белок согласно изобретению содержит вариабельный домен легкой цепи (VL), где, предпочтительно, VL включает аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из:
SEQ ID NO: 111, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 216, 220, 224, 272, 276, 300, 292, 280, 288, 296, 284, 304, 308, 312, 335, 337, 339, 341, 343, 345, 347, 349, 351, 353, 355, 357, 359 и 361.
В предпочтительном варианте изобретения связывающий белок согласно изобретению содержит VH и VL, где, предпочтительно, VH и VL представляют собой любую из описанных выше последовательностей.
В другом варианте настоящее изобретение относится к связывающему белку, обладающему способностью связываться с человеческим DLL-4, где указанный связывающий белок содержит:
константную область тяжелой цепи Ig, имеющую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2 и SEQ ID NO: 3;
константную область легкой цепи Ig, имеющую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 4 и SEQ ID NO: 5;
вариабельную область тяжелой цепи Ig, имеющую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из:
SEQ ID NO: 1, 116, 120, 124, 128, 132, 136, 140, 144, 148, 152, 156, 160, 164, 168, 172, 176, 180, 184, 188, 192, 196, 200, 204, 208, 212, 334, 336, 338, 340, 342, 344, 346, 348, 350, 352, 354, 356, 358 и 360; и
вариабельную область легкой цепи Ig, имеющую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из:
SEQ ID NO: 111, 228, 232, 236, 240, 244, 248, 252, 256, 260, 264, 268, 216, 220, 224, 272, 276, 300, 292, 280, 288, 296, 284, 304, 308, 312, 335, 337, 339, 341, 343, 345, 347, 349, 351, 353, 355, 357, 359 и 361.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к связывающему белку, содержащему антигенсвязывающий домен, обладающий способностью связываться с человеческим DLL4, где указанный антигенсвязывающий домен содержит по меньшей мере одну или несколько CDR, выбранных из группы, состоящей из:
CDR-H1: X1-X2-X3-X4-Х5 (SEQ ID NO: 105), где
X1 представляет собой S, N или D;
X2 представляет собой H или Y;
X3 представляет собой W;
X4 представляет собой M;
X5 представляет собой S или H;
CDR-H2: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15-X16-Х17 (SEQ ID NO: 106), где:
X1 представляет собой I, D, M или Т;
X2 представляет собой I;
X3 представляет собой S;
X4 представляет собой Y, N, S, Q, V, T, H или D;
X5 представляет собой D;
X6 представляет собой G;
X7 представляет собой S, R, I, T, G, K, H или N;
X8 представляет собой N, Y, S, I или T;
X9 представляет собой K, M, N, Q, E, T, R, S, A или L;
X10 представляет собой Y, D или E;
X11 представляет собой S или Y;
X12 представляет собой А;
X13 представляет собой D;
X14 представляет собой S;
X15 представляет собой V;
X16 представляет собой К; и
X17 представляет собой G;
CDR-H3: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10 (SEQ ID NO: 107), где:
X1 представляет собой A;
X2 представляет собой G, А или R;
X3 представляет собой G;
X4 представляет собой G, S или А;
X5 представляет собой N;
X6 представляет собой V или М;
X7 представляет собой G;
X8 представляет собой F, L, Y или M;
X9 представляет собой D; и
X10 представляет собой I, S или L;
CDR-L1: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11 (SEQ ID NO: 108), где:
X1 представляет собой S;
X2 представляет собой А или G;
X3 представляет собой D;
X4 представляет собой K, N, L, Q, M, E, S, T, G или D;
X5 представляет собой L;
X6 представляет собой G;
X7 представляет собой T, S, N, A, G или E;
X8 представляет собой K, Q, N или R;
X9 представляет собой Y;
X10 представляет собой V или I; и
X11 представляет собой S;
CDR-L2: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7 (SEQ ID NO: 109), где:
X1 представляет собой Q;
X2 представляет собой D;
X3 представляет собой A, G, W, S или D;
X4 представляет собой K, M, Q, N, L, T, I или E;
X5 представляет собой R;
X6 представляет собой P; и
X7 представляет собой S; и
CDR-L3: X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9 (SEQ ID NO: 110), где:
X1 представляет собой Q;
X2 представляет собой S или A;
X3 представляет собой W;
X4 представляет собой D;
X5 представляет собой R, S, Q, P, A, V, W или M;
X6 представляет собой S, G, I, N, R или T;
X7 представляет собой D или G;
X8 представляет собой V, A, P или E; и
X9 представляет собой V.
Предпочтительно, антигенсвязывающий домен DLL4-связывающего белка согласно изобретению содержит по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из:
остатков 31-35 SEQ ID NO: 112 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 112 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 112 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 113 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 113 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 113 (CDR-L3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 316 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 316 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 316 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 317 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 317 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 317 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 318 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 318 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 318 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 319 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 319 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 319 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 320 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 320 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 320 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 321 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 321 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 321 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 322 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 322 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 322 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 323 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 323 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 323 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 324 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 324 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 324 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 325 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 325 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 325 (CDR-H3);
остатков 31-35 SEQ ID NO: 326 (CDR-H1); остатков 50-66 SEQ ID NO: 326 (CDR-H2); остатков 99-108 SEQ ID NO: 326 (CDR-H3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 327 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 327 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 327 (CDR-L3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 328 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 328 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 328 (CDR-L3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 329 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 329 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 329 (CDR-L3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 330 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 330 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 330 (CDR-L3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 331 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 331 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 331 (CDR-L3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 332 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 332 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 332 (CDR-L3);
остатков 23-33 SEQ ID NO: 333 (CDR-L1); остатков 49-55 SEQ ID NO: 333 (CDR-L2); остатков 88-96 SEQ ID NO: 333 (CDR-L3).
В другом варианте изобретения связывающий белок содержит по меньшей мере 3 CDR, описанных выше.
Предпочтительно, DLL4-связывающий белок согласно изобретению содержит одну или несколько описанных выше CDR. Более предпочтительно, указанный связывающий белок содержит три или более CDR, описанных выше. Наиболее предпочтительно, DLL4-связывающий белок согласно изобретению содержит шесть CDR, описанных выше, то есть CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3, CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3, описанные выше.
В предпочтительном варианте изобретения связывающий белок содержит по меньшей мере 3 CDR, выбранных из группы, состоящей из описанных выше последовательностей.
В другом предпочтительном варианте изобретения, связывающий белок содержит 3 CDR, выбранных из набора CDR вариабельного домена, выбранного из нижеследующей группы:
набор VH A10 CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 112
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 112
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 112
набор VL A10 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 113
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 113
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 113
набор VH A10.3 CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 316
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 316
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 316
набор VL A10.3 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 327
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 327
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 327
набор VH A10.К30 CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 317
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 317
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 317
набор VH A10.К42 CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 318
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 318
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 318
набор VH A10.9А CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 319
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 319
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 319
набор VH A10.8А CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 320
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 320
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 320
набор VH A10.1А CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 321
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 321
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 321
набор VH A10.5D CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 322
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 322
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 322
набор VH A10.3А CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 323
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 323
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 323
набор VL A10.3А CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 330
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 330
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 330
набор VH A10.6В CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 324
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 324
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 324
набор VL A10.6В CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 331
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 331
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 331
набор VH A10.3D CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 325
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 325
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 325
набор VL A10.3D CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 332
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 332
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 332
набор VH A10.4С CDR
CDR-H1: остатки 31-35 SEQ ID NO: 326
CDR-H2: остатки 50-66 SEQ ID NO: 326
CDR-H3: остатки 99-108 SEQ ID NO: 326
набор VL A10.4С CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 333
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 333
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 333
набор VL A10.L45 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 328
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 328
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 328
набор VL A10.L73 CDR
CDR-L1: остатки 23-33 SEQ ID NO: 329
CDR-L2: остатки 49-55 SEQ ID NO: 329
CDR-L3: остатки 88-96 SEQ ID NO: 329.
В другом варианте изобретения связывающий белок содержит набор из 3 CDR вариабельных тяжелых цепей (VH), выбранных из любого набора из 3 CDR VH в вышеуказанной группе, и набор из 3 CDR вариабельных легких цепей (VL), выбранных из любого набора из 3 CDR VL в вышеуказанной группе.
В другом варианте изобретения связывающий белок содержит набор из 3 CDR цепей, обозначенных VH, и набор из 3 CDR цепей, соответственно обозначенных VL в вышеуказанной группе. Предпочтительно, связывающий белок согласно изобретению содержит по меньшей мере два набора CDR вариабельных доменов, выбранные