Фосфодиэстераза 4d7 в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы
Иллюстрации
Показать всеНастоящее изобретение относится к фосфодиэстеразе 4D7 (PDE4D7) для применения в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где экспрессия маркера повышена при сравнении экспрессии в ткани агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы с экспрессией в нормальной ткани или ткани доброкачественной опухоли предстательной железы, и к применению PDE4D7 в качестве диагностического маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы. Также настоящее изобретение относится к композиции для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, к соответствующему способу обнаружения, к способу, позволяющему различить доброкачественный и агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, и к способу сбора данных, а также к соответствующим иммуноанализам. Также настоящее изобретение относится к способу идентификации индивидуума, соответствующего требованиям для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, а также к иммуноанализу для стратификации индивидуума с таким раком предстательной железы. Кроме того, настоящее изобретение относится к фармацевтическим композициям и к их применению для лечения агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы. Изобретение позволяет эффективно диагносцировать гормон-чувствительный рак предстательной железы. 12 н. и 20 з.п. ф-лы, 19 ил., 2 табл., 3 пр.
Реферат
ОБЛАСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Настоящее изобретение относится к фосфодиэстеразе 4D7 (PDE4D7) для применения в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где экспрессия маркера повышена при сравнении экспрессии в ткани агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы с экспрессией в нормальной ткани или ткани доброкачественной опухоли предстательной железы, и к применению PDE4D7 в качестве диагностического маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы. Также настоящее изобретение относится к композиции для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, к соответствующему способу обнаружения, к способу, позволяющему различить доброкачественную опухоль от агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, и к способу сбора данных, а также к соответствующим иммуноанализам. Также настоящее изобретение относится к способу идентификации индивидуума, соответствующего требованиям для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, а также к иммуноанализу для стратификации индивидуума с таким раком предстательной железы. Кроме того, настоящее изобретение относится к фармацевтическим композициям и к их применению для лечения агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы. Также настоящее изобретение относится к использованию антитела, специфичного для белка PDE4D7, для обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования злокачественной опухоли или для лечения злокачественной опухоли.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Злокачественная опухоль представляет собой класс заболеваний, при которых группа клеток отличается неконтролируемым ростом, инвазией и метастазированием. Эти три злокачественных свойства злокачественных опухолей отличают их от доброкачественных опухолей, которые являются самоограничивающимися, не инвазивными или не метастазирующими. В развитых странах среди мужчин тремя из наиболее часто диагностируемых злокачественных опухолей являются рак предстательной железы, рак легкого и рак ободочной и прямой кишки. В частности, рак предстательной железы является наиболее распространенной злокачественной опухолью у мужчин в Европе. Согласно оценкам, в 2002 году в Европе у 225000 мужчин был вновь диагностирован рак предстательной железы и приблизительно 83000 умерли от этого заболевания.
Была показана связь определенных фосфодиэстераз с развитием злокачественной опухоли. Например, было показано, что фосфодиэстераза PDE7 связана с хроническим лимфоцитарным лейкозом. В то же время для многих типов злокачественной опухоли или форм прогрессирования злокачественной опухоли отсутствует доступная надежная маркерная молекула.
Рак предстательной железы, например, традиционно диагностируют с помощью уровня простатспецифического антигена (PSA) в сыворотке. Однако PSA не является специфическим для рака предстательной железы и его уровень может увеличиваться при других обстоятельствах, что приводит к большому количеству ложноположительных результатов (злокачественную опухоль не находят приблизительно у 70% мужчин с повышенными уровнями PSA после проведения биопсии). Более того, возможно непредсказуемое количество ложноотрицательных результатов, когда в присутствии "нормального" теста PSA впоследствии развивается рак предстательной железы.
Таким образом, существует потребность в предоставлении новой и эффективной альтернативной диагностической возможности для обнаружения, мониторинга и прогнозирования рака предстательной железы, в частности, агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Настоящее изобретение направлено на эту необходимость и представляет средства и способы, которые позволяют провести диагностику и обнаружение рака предстательной железы, в частности, агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы. Указанная выше задача решается с помощью фосфодиэстеразы 4D7 (PDE4D7), используемой в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где экспрессия маркера является повышенной при сравнении экспрессии в ткани агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы с экспрессией в нормальной ткани или ткани доброкачественной опухоли предстательной железы.
Авторами настоящего изобретения показано, что фосфодиэстераза 4D7 активируется в клетках или клеточных линиях рака предстательной железы. Таким образом, PDE4D7 рассматривается как биомаркер для прогнозирования рака предстательной железы и решающего инструмента для выбора стратегии контроля рака предстательной железы, а также для прогноза и мониторинга прогрессирования рака предстательной железы. В частности, авторами настоящего изобретения было продемонстрировано, что PDE4D7 активируется, в частности, в клетках и клеточных линиях агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, полученных у человека, а также в соответствующих образцах тканей человека. Таким образом, диагностические способы и варианты применения, основанные на PDE4D7 в качестве маркера рака предстательной железы, можно преимущественно использовать для (i) обнаружения и диагностики агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, (ii) прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, (iii) мониторинга прогрессирования злокачественной опухоли в направлении форм агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, и (iv) различения доброкачественной формы и злокачественной формы гормон-чувствительного рака предстательной железы.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к композиции для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, содержащей аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты и/или пептидный аффинный лиганд для продукта экспрессии или белка PDE4D7.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанная композиция содержит аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты или пептидный аффинный лиганд, которые модифицированы таким образом, что могут использоваться как контрастное средство.
В следующем предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанная композиция содержит набор олигонуклеотидов, специфичных к продукту экспрессии PDE4D7, зонд, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7, аптамер, специфичный к продукту экспрессии или белку PDE4D7, антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.
В следующем аспекте настоящее изобретение относится к использованию PDE4D7 в качестве маркера для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, предусматривающему по меньшей мере стадию определения уровня PDE4D7 в образце.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, где указанный способ позволяет отличить доброкачественную опухоль предстательной железы от агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, предусматривает стадии:
(a) определение уровня PDE4D7 в образце;
(b) определение уровня экспрессии эталонного гена в образце;
(c) нормализация измеренного уровня экспрессии PDE4D7 относительно экспрессии эталонного гена; и
(d) сравнение нормализованного уровня экспрессии с заданной пороговой величиной, выбранной так, чтобы исключить доброкачественную опухоль предстательной железы, где нормализованный уровень экспрессии выше пороговой величины указывает на агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, где указанная пороговая величина составляет от -2 до +2, предпочтительно, приблизительно равна 0.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу сбора данных, предусматривающему по меньшей мере стадии:
(a) тестирование у индивидуума экспрессии PDE4D7; и
(b) сравнение экспрессии, определенной на стадии (a), с контрольным уровнем.
В следующем предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения диагностирование, обнаружение, мониторинг, прогнозирование или сбор данных проводят с помощью образца, полученного от индивидуума.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к иммуноанализу для обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, предусматривающему по меньшей мере стадии:
(a) тестирование в образце, полученном от индивидуума, экспрессии PDE4D7,
(b) тестирование в контрольном образце экспрессии PDE4D7,
(c) определение отличий в экспрессии PDE4D7 на стадиях (a) и (b); и
(d) принятие решения о наличии или стадии злокачественной опухоли или прогрессировании злокачественной опухоли, исходя из результатов, полученных на стадии (c), где указанные стадии тестирования основаны на применении антитела, специфично связывающегося с PDE4D7.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к иммуноанализу для различения между доброкачественной опухолью предстательной железы и агрессивным гормон-чувствительным раком предстательной железы, предусматривающему стадии:
(a) определение уровня PDE4D7 в образце;
(b) определение уровня экспрессии эталонного гена в образце;
(c) нормализация измеренного уровня экспрессии PDE4D7 к экспрессии эталонного гена; и
(d) сравнение нормализованного уровня экспрессии с заданной пороговой величиной, выбранной так, чтобы исключить доброкачественную опухоль предстательной железы, где нормализованный уровень экспрессии выше пороговой величины указывает на агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, где указанная пороговая величина составляет приблизительно от -2 до +2, предпочтительно, приблизительно равна 0.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу идентификации индивидуума как подходящего для терапии агрессивного гормон-чувствительного рака, предусматривающему:
(a) тестирование в образце, полученном от индивидуума, экспрессии PDE4D7;
(b) тестирование в указанном образце экспрессии эталонного гена и/или тестирование в контрольном образце экспрессии PDE4D7;
(c) классификация уровней экспрессии стадии (a) относительно уровней в контрольных образцах PDE4D7 стадии (b); и
(d) идентификация индивидуума как подходящего для получения терапии против агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где образец индивидуума классифицирован как имеющий увеличенный уровень экспрессии PDE4D7.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к иммуноанализу стратификации индивидуума или группы индивидуумов с агрессивным гормон-чувствительным раком предстательной железы, предусматривающему:
(a) тестирование в образце, полученном от индивидуума, экспрессии PDE4D7;
(b) тестирование в указанном образце экспрессии эталонного гена и/или тестирование в контрольном образце экспрессии PDE4D7;
(c) определение отличия в экспрессии PDE4D7 на стадии (a) и экспрессии PDE4D7 и/или эталонного гена на стадии (b); и
(d) стратификация индивидуума или группы индивидуумов для терапии агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, исходя из результатов, полученных на стадии (c), где образец индивидуума имеет повышенный уровень экспрессии PDE4D7.
В следующем предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанное тестирование или определение экспрессии проводят, или дополнительно проводят, измерением уровней нуклеиновой кислоты или белка или определением биологической активности PDE4D7 или эталонного гена.
В следующем предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный способ или иммуноанализ включает дополнительную стадию сравнения измеренных уровней нуклеиновой кислоты или белка или измеренной биологической активности с контрольным уровнем.
В следующем предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный эталонный ген представляет собой ген домашнего хозяйства, особенно предпочтительно, GAPDH или PBGD, или ген другой фосфодиэстеразы, особенно предпочтительно, PDE4D5.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанную стадию определения проводит путем измерения уровней нуклеиновой кислоты или белка или путем определения биологической активности PDE4D7.
В следующем предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный способ включает дополнительную стадию сравнения измеренных уровней нуклеиновой кислоты или белка или измеренной биологической активности с контрольным уровнем.
В следующем предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный способ или иммуноанализ включает дополнительную стадию определения уровня простатспецифического антигена (PSA).
В следующем особенно предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения уровень PSA от 2,5 до 4 нг/мл, определенный на дополнительной стадии способа или иммуноанализа, как определено выше, указывает на агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы.
В следующем предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения образец, упоминаемый выше, представляет собой образец ткани, образец мочи, биоптат, образец осадка мочи, образец крови, образец слюны, образец семенной жидкости, образец, содержащий циркулирующие опухолевые клетки или образец, содержащий секретируемые предстательной железой экзосомы.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к ингибиторной фармацевтической композиции, содержащей по меньшей мере один элемент, выбранный из группы:
(a) соединение, непосредственно ингибирующее активность PDE4D7, предпочтительно, антагонист ферментативной активности PDE4D7;
(b) соединение, косвенно ингибирующее активность PDE4D7;
(c) доминантно-негативная форма белка PDE4D7 или ее биологически активный эквивалент;
(d) нуклеиновая кислота, кодирующая и экспрессирующая доминантно-негативную форму PDE4D7;
(e) miРНК, специфичная к PDE4D7;
(f) антисмысловая молекула для PDE4D7;
(g) siРНК, специфичная к PDE4D7;
(h) аптамер, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7 или к белку PDE4D7;
(i) низкомолекулярное соединение или пептидомиметик, способные специфично связываться с белком PDE4D7; и
(j) антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к ингибиторной фармацевтической композиции для лечения или профилактики агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, содержащей по меньшей мере один элемент, выбранный из группы:
(a) соединение, непосредственно ингибирующее активность PDE4D7, предпочтительно, антагонист ферментативной активности PDE4D7;
(b) соединение, косвенно ингибирующее активность PDE4D7;
(c) доминантно-негативная форма белка PDE4D7 или ее биологически активный эквивалент;
(d) нуклеиновая кислота, кодирующая и экспрессирующая доминантно-негативную форму PDE4D7;
(e) miРНК, специфичная к PDE4D7;
(f) антисмысловая молекула для PDE4D7;
(g) siРНК, специфичная к PDE4D7;
(h) аптамер, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7 или к белку PDE4D7;
(i) низкомолекулярное соединение или пептидомиметик, способные специфично связываться с белком PDE4D7; и
(j) антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.
Поскольку фосфодиэстераза 4D7 активируется в условиях агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, в качестве лекарственных средств можно преимущественно использовать ингибиторы PDE4D7 и средства, модифицирующие, например, ингибирующие PDE4D7, модифицирующие экспрессию PDE4D7, например, ингибирующие экспрессию PDE4D7, или модифицирующие взаимодействия PDE4D7, например, ингибирующие взаимодействия PDE4D7. Таким образом, для противодействия наблюдаемому процессу активации ингибиторы и/или средства для модификации PDE4D7 можно применять в качестве лекарственного средства, например в качестве лекарственного средства, препятствующего всем или некоторым из эффектов, связанных с высокой экспрессией PDE4D7 или его активацией.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к стимулирующей фармацевтической композиции, содержащей по меньшей мере один элемент, выбранный из группы:
(a) соединение, непосредственно стимулирующее или модулирующее активность PDE4D7, предпочтительно, аллостерический агонист ферментативной активности PDE4D7;
(b) соединение, косвенно стимулирующее или модулирующее активность PDE4D7;
(c) белок PDE4D7 или его биологически активный эквивалент;
(d) нуклеиновая кислота, кодирующая и экспрессирующая PDE4D7;
(e) ингибитор miРНК, специфичный к miРНК PDE4D7;
(f) деметилирующий агент; и
(g) вытесняющий фосфодиэстеразу фактор.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения для лечения рака предстательной железы можно использовать либо указанную ингибиторную, либо указанную стимулирующую фармацевтическую композицию, в зависимости от уровня экспрессии PDE4D7, где определение и/или мониторинг уровня экспрессии проводят согласно стадиям:
(a) определение уровня PDE4D7 в образце;
(b) определение уровня экспрессии эталонного гена в образце; и
(c) нормализация измеренного уровня экспрессии PDE4D7 к экспрессии эталонного гена.
В следующем особенно предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения в случае увеличенных и/или увеличивающихся уровней PDE4D7 вводят указанную ингибиторную фармацевтическую композицию, а в случае сниженных и/или снижающихся уровней PDE4D7 вводят указанную стимулирующую фармацевтическую композицию.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к использованию антитела, специфичного к белку PDE4D7, и/или варианта антитела, специфичного к белку PDE4D7, для обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования злокачественной опухоли или для лечения злокачественной опухоли, предпочтительно, рака предстательной железы, более предпочтительно, агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы.
В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанная злокачественная опухоль, упоминаемая выше, представляет собой рак предстательной железы.
В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения указанный рак предстательной железы представляет собой агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной
железы.
В особенно предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы представляет собой гормон-чувствительный рак предстательной железы стадии I-IV, гормон-чувствительный рецидивирующий рак предстательной железы или гормон-чувствительный метастазирующий рак предстательной железы.
Некоторые другие объекты изобретения перечислены ниже по пунктам:
1. Фосфодиэстераза 4D7 (PDE4D7) для применения в качестве маркера для агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где экспрессия маркера увеличена при сравнении экспрессии в ткани агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы с экспрессией в нормальной ткани или ткани доброкачественной опухоли предстательной железы.
2. Композиция для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, содержащая аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты и/или пептидный аффинный лиганд для продукта экспрессии или белка PDE4D7.
3. Композиция по п.2, где указанный аффинный лиганд в виде нуклеиновой кислоты или пептидный аффинный лиганд модифицированы, чтобы они функционировали в качестве контрастного средства.
4. Композиция по п.2, где указанный аффинный лиганд представляет собой набор олигонуклеотидов, специфичных к продукту экспрессии PDE4D7, зонд, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7, аптамер, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7 или к белку PDE4D7, антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.
5. Применение PDE4D7 в качестве маркера для диагностики, обнаружения, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы.
6. Способ обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, включающий по меньшей мере стадию определения уровня PDE4D7 в образце.
7. Способ диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, где указанный способ различает между доброкачественной опухолью предстательной железы и агрессивным гормон-чувствительным раком предстательной железы, включающий стадии
(a) определение уровня PDE4D7 в образце;
(b) определение уровня экспрессии эталонного гена в образце;
(c) нормализация измеренного уровня экспрессии PDE4D7 к экспрессии эталонного гена; и
(d) сравнение нормализованного уровня экспрессии с заданной пороговой величиной, выбранной так, чтобы исключить доброкачественную опухоль предстательной железы, где нормализованный уровень экспрессии выше пороговой величины указывает на агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, где указанная пороговая величина составляет приблизительно от -2 до +2, предпочтительно, приблизительно равна 0.
8. Способ сбора данных, включающий по меньшей мере стадии:
(a) тестирование у индивидуума экспрессии PDE4D7; и
(b) сравнение экспрессии, определенной на стадии (а) с контрольным уровнем.
9. Иммуноанализ для обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы или прогрессирования в агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, включающий по меньшей мере стадии
(a) тестирование в образце, полученном от индивидуума, экспрессии PDE4D7,
(b) тестирование в контрольном образце экспрессии PDE4D7,
(c) определение отличий в экспрессии PDE4D7 на стадиях (а) и (b);
(d) принятие решения о наличии или стадии злокачественной опухоли или прогрессировании злокачественной опухоли, исходя из результатов, полученных на стадии (с),
где указанные стадии тестирования основаны на применении антитела, специфично связывающегося с PDE4D7.
10. Иммуноанализ для различения между доброкачественной опухолью предстательной железы и агрессивным гормон-чувствительным раком предстательной железы, включающий стадии
(a) определение уровня PDE4D7 в образце;
(b) определение уровня экспрессии эталонного гена в образце;
(c) нормализация измеренного уровня экспрессии PDE4D7 к экспрессии эталонного гена; и
(d) сравнение нормализованного уровня экспрессии с заданной пороговой величиной, выбранной так, чтобы исключить доброкачественную опухоль предстательной железы, где нормализованный уровень экспрессии выше пороговой величины указывает на агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы, где указанная пороговая величина составляет приблизительно от -2 до +2, предпочтительно, приблизительно равна 0.
11. Способ идентификации индивидуума, подходящего для терапии агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, включающий:
(a) тестирование в образце, полученном от индивидуума, экспрессии PDE4D7;
(b) тестирование в указанном образце экспрессии эталонного гена и/или в контрольном образце экспрессии PDE4D7;
(c) классификация уровней экспрессии стадии (а) относительно уровней на стадии (b); и
(d) идентификация индивидуума как подходящего для получения терапии агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, где образец индивидуума классифицирован как имеющий увеличенный уровень экспрессии PDE4D7.
12. Иммуноанализ для стратификации индивидуума или группы индивидуумов с агрессивным гормон-чувствительным раковым заболеванием предстательной железы, включающий:
(a) тестирование в образце, полученном от индивидуума, экспрессии PDE4D7;
(b) тестирование в указанном образце экспрессии эталонного гена и/или в контрольном образце экспрессии PDE4D7;
(c) определение отличий в экспрессии PDE4D7 на стадиях (а) и экспрессии PDE4D7 и/или эталонного гена на стадии (b); и
(d) стратификация индивидуума или группы индивидуумов для терапии агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы исходя из результатов, полученных на стадии (с), где образец индивидуума имеет повышенный уровень экспрессии PDE4D7.
13. Способ по любому из пп.6, 7 или 11, или иммуноанализ по п.10 или 12, где указанное тестирование или определение экспрессии проводят или дополнительно проводят измерением уровней нуклеиновой кислоты или белка или путем определения биологической активности PDE4D7 или эталонного гена.
14. Способ или иммуноанализ по п.13, где указанный способ или иммуноанализ включает дополнительную стадию сравнения измеренных уровней нуклеиновой кислоты или белка или измеренной биологической активности с контрольным уровнем.
15. Способ по любому из пп.7, 11, 13 или 14 или иммуноанализ по любому из пп.10, 12, 13 или 14, где указанный эталонный ген представляет собой другую фосфодиэстеразу, предпочтительно, PDE4D5, или ген домашнего хозяйства, предпочтительно, GAPDH или PBGD.
16. Способ по любому из пп.7, 11, 13, 14 или 15, или иммуноанализ по любому из пп.12, 13, 14 или 15, где указанный способ или иммуноанализ включает дополнительную стадию определения уровня простатспецифического антигена (PSA).
17. Способ или иммуноанализ по п.16, где уровень PSA от 2,5 до 4 нг/мл указывает на агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы.
18. Способ по любому из пп.6, 7, 11 или 13-17, или иммуноанализ по любому из пп.9, 10, или 12-17, где указанный образец представляет собой образец ткани, биоптат, образец мочи, образец осадка мочи, образец крови, образец слюны, образец семенной жидкости, образец, содержащий циркулирующие опухолевые клетки, или образец, содержащий секретируемые предстательной железой экзосомы.
19. Ингибиторная фармацевтическая композиция, содержащая по меньшей мере один элемент, выбранный из группы:
(a) соединение, непосредственно ингибирующее активность PDE4D7, предпочтительно, антагонист ферментативной активности PDE4D7;
(b) соединение, косвенно ингибирующее активность PDE4D7;
(c) доминантно-негативная форма белка PDE4D7 или ее биологически активный эквивалент;
(d) нуклеиновая кислота, кодирующая и экспрессирующая доминантно-негативную форму PDE4D7;
(e) miPHK, специфичная к PDE4D7;
(f) антисмысловая молекула для PDE4D7;
(g) siPHK, специфичная к PDE4D7;
(h) аптамер, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7 или к белку PDE4D7;
(i) низкомолекулярное соединение или пептидомиметик, способные специфично связываться с белком PDE4D7; и
(j) антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.
20. Ингибиторная фармацевтическая композиция для лечения или профилактики агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы, содержащая по меньшей мере один элемент, выбранный из группы:
(a) соединение, непосредственно ингибирующее активность PDE4D7, предпочтительно, антагонист ферментативной активности PDE4D7;
(b) соединение, косвенно ингибирующее активность PDE4D7;
(c) доминантно-негативная форма белка PDE4D7 или ее биологически активный эквивалент;
(d) нуклеиновая кислота, кодирующая и экспрессирующая доминантно-негативную форму PDE4D7;
(e) miPHK, специфичная к PDE4D7;
(f) антисмысловая молекула для PDE4D7;
(g) siPHK, специфичная к PDE4D7;
(h) аптамер, специфичный к продукту экспрессии PDE4D7 или к белку PDE4D7;
(i) низкомолекулярное соединение или пептидомиметик, способные специфично связываться с белком PDE4D7; и
(j) антитело, специфичное к белку PDE4D7, и/или вариант антитела, специфичный к белку PDE4D7.
21. Стимулирующая фармацевтическая композиция, содержащая по меньшей мере один элемент, выбранный из группы:
(a) соединение, непосредственно стимулирующее или модулирующее активность PDE4D7, предпочтительно, аллостерический агонист ферментативной активности PDE4D7;
(b) соединение, косвенно стимулирующее или модулирующее активность PDE4D7;
(c) белок PDE4D7 или его биологически активный эквивалент;
(d) нуклеиновая кислота, кодирующая и экспрессирующая PDE4D7;
(e) ингибитор miPHK, специфичный к miPHK PDE4D7;
(f) деметилирующий агент; и
(g) вытесняющий фосфодиэстеразу фактор.
22. Ингибиторная фармацевтическая композиция по п.19 или стимулирующая фармацевтическая композиция по п.21, где либо указанную ингибиторную, либо указанную стимулирующую фармацевтическую композицию, применяют для лечения рака предстательной железы в зависимости от уровня экспрессии PDE4D7, где указанный уровень экспрессии определяют и/или подвергают мониторингу согласно стадиям (а)-(с) п.7.
23. Фармацевтическая композиция по п.22, где в случае увеличенных и/или увеличивающихся уровней PDE4D7 вводят указанную ингибиторную фармацевтическую композицию, и в случае сниженных и/или снижающихся уровней PDE4D7 вводят указанную стимулирующую фармацевтическую композицию.
24. Способ по любому из пп.11 или 13-18, или иммуноанализ по любому из пп.12-18, где терапия рака предстательной железы включает введение фармацевтической композиции по п.19, или введение фармацевтической композиции по п.19 в комбинации с дополнительной терапией злокачественной опухоли, предпочтительно, лучевой терапией или химиотерапией.
25. Применение антитела, специфичного к белку PDE4D7, и/или варианта антитела, специфичного к белку PDE4D7, для обнаружения, диагностики, мониторинга или прогнозирования злокачественной опухоли или для лечения злокачественной опухоли, предпочтительно, рака предстательной железы, более предпочтительно, агрессивного гормон-чувствительного рака предстательной железы.
26. Фосфодиэстераза по п.1, композиция по любому из пп.2-4, применение по п.5, способ по любому из пп.6, 7, 11, 13-18 или 24, иммуноанализ по любому из пп.9, 10, 12-18 или 24, ингибиторная фармацевтическая композиция по п.20, или применение по п.25, где указанный агрессивный гормон-чувствительный рак предстательной железы представляет собой гормон-чувствительный рак предстательной железы стадии I-IV, гормон-чувствительный рецидивирующий рак предстательной железы, или гормон-чувствительный метастазирующий рак предстательной железы.
Эти и другие характеристики, признаки и задачи настоящего изобретения станут понятными из представленного ниже подробного описания, учитывая прилагаемые фигуры и примеры, которые демонстрируют путем иллюстрации принципы изобретения.
Описание приведено только для примера, не ограничивающего объем изобретения.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ
На фиг.1, фигуры 1А и 1В (продолжение фиг.1А), представлен обзор исследований образцов тканей человека способом RT-PCR в отношении относительной экспрессии PDE4D7 относительно GAPDH. Указаны возраст и пол пациента, предоставившего образец, тип ткани, внешний вид образца, диагноз, степень опухоли (показатель Gleason), стадия согласно системе определения стадии TNM (как определено UICC), стадия опухоли и соответствующее гистологическое подтверждение, независимое от применения маркера.
На фиг. 2 представлена коробчатая диаграмма относительных уровней экспрессии PDE4D7 относительно GAPDH в нормальных, доброкачественных и злокачественных образцах ткани предстательной железы. В колонке 1 показаны относительные уровни экспрессии PDE4D7 относительно GAPDH в нормальных/контрольных образцах ткани, в колонке 2 показаны относительные уровни экспрессии PDE4D7 относительно GAPDH в доброкачественных образцах ткани и в колонке 3 указаны относительные уровни экспрессии PDE4D7 относительно GAPDH в злокачественных образцах ткани.
На фиг. 3 представлена диаграмма разброса относительных уровней экспрессии PDE4D7 относительно GAPDH в нормальных, доброкачественных и злокачественных образцах ткани. Указаны индивидуальные величины относительной экспрессии PDE4D7 в нормальной, доброкачественной и злокачественной тканях предстательной железы. Величины экспрессии представлены относительно экспрессии GAPDH.
На фиг. 4 представлен анализ на основе ROC-кривой экспрессии PDE4D7 в доброкачественных против злокачественных образцов предстательной железы.
На фиг. 5 представлена коробчатая диаграмма величин PSA человека в крови у 90 мужчин с доброкачественным и различными стадиями злокачественного заболевания предстательной железы. В колонке 1 указаны мужчины с доброкачественным заболеванием предстательной железы, в колонке 2 указаны мужчины со злокачественным заболеванием предстательной железы, имеющие небольшие злокачественные опухоли, и в колонке 3 указаны мужчины со злокачественным заболеванием предстательной железы, имеющие выраженные злокачественные опухоли.
На фиг. 6 представлен анализ на основе ROC-кривой уровней PSA в крови у мужчин с доброкачественным против различных стадий злокачественного заболевания предстательной железы.
На фиг. 7 представлена относительная экспрессия гена PDE4D5 человека в 96 различных образцах, происходящих из панелей I и II Origene HPRT. Указаны индивидуальные величины относительной экспрессии PDE4D5 человека на тканях предстательной железы человека и данные измерений относительно срединного значения для данных для каждой группы пациентов.
На фиг. 8 представлена относительная экспрессия гена PDE4D5 человека в 96 различных образцах, происходящих из панелей I и II Origene HPRT. На фигуре представлена коробчатая диаграмма индивидуальных данных относительно результатов измерений экспрессии PDE4D5 человека, причем блок включает 75% всех результатов измерений. Срединная величина относительной экспрессии указана в качестве границы между двумя окрашенными блоками.
На фиг. 9 представлена относительная экспрессия гена PDE4D7 в 96 различных образцах, происходящих из панелей I и II Origene HPRT. Указаны индивидуальные величины относительной экспрессии PDE4D7 человека на тканях предстательной железы и данные измерений относительно срединного значения для данных для каждой группы пациентов.
На фиг. 10 представлена относительная экспрессия гена PDE4D7 в 96 различных образцах, происходящих из панелей I и II Origene HPRT. На фигуре представлена коробчатая диаграмма индивидуальных данных относительно результатов измерений экспрессии PDE4D7 человека, причем блок включает 75% всех результатов измерений. Срединная величина относительной экспрессии указана в качестве границы между двумя окрашенными серым цветом блоками.
На фиг. 11 представлены изображения ROC-кривых для экспрессии гена PDE4D7 на образцах ткани предстательной железы человека, показывающие AUC для различных попарных сравнений. На фиг. 11A показаны нормальная (N) против опухолевой ткани. На фиг. 11B представлена доброкачественная (очаг повреждения + гиперплазия (B)) против опухолевой ткани. На фиг. 11C представлены очаг повреждения (L) против опухолевой ткани. На фиг. 11D представлена гиперплазия (H) против опухолевой ткани. На фиг. 11E представлена нормальная + доброкачественная (NB) против опухолевой ткани.
На фиг. 12 представлено соотношение относительной экспрессии генов PDE4D7 и PDE4D5 (дельта(Ct[PDE4D5 человека] - Ct[PDE4D7 человека])). Величи