Пептидомиметические макроциклы

Пептидомиметические макроциклы

Реферат

Перекрестная ссылка на родственные заявки

Настоящая заявка заявляет приоритет на основании предварительных заявок США № 61/373701, поданной 13 августа 2010 года, № 61/373638, поданной 13 августа 2010 года, и № 61/374163, поданной 16 августа 2010 года, которые включены в данное описание в качестве ссылки во всей полноте.

Уровень техники изобретения

Человеческий белок - фактор транскрипции p53 индуцирует прекращение клеточного цикла и апоптоз в ответ на повреждение ДНК и клеточный стресс и, следовательно, играет важную роль в защите клеток от злокачественной трансформации. E3 убихитин-лигаза HDM2 осуществляет отрицательную регуляцию функции p53 путем непосредственного связывающего взаимодействия, которое нейтрализует трансактивационную активность p53, приводя к экспорту белка p53 из ядра и деградации мишеней p53 по убихитилирующему - протеасомальному пути. Утрата активности p53 в результате делеции, мутации или сверхэкспрессии HDM2 представляет собой наиболее распространенный дефект при раковых заболеваниях человека. Опухоли, экспрессирующие p53 дикого типа, являются чувствительными к фармакологическим средствам, которые стабилизируют активный p53 или повышают его концентрацию. В данном контексте ингибирование активности HDM2 является обоснованным подходом к восстановлению активности p53 и возобновлению способности раковых клеток вступать в апоптоз in vitro и in vivo. Совсем недавно HDMX (HDM4) был идентифицирован как аналогичный отрицательный регулятор p53, причем исследования показали наличие значительной структурной гомологии среди p53-связывающих поверхностей HDM2 и HDMX.

Белок-белковые взаимодействия p53-HDM2 и p53-HDMX опосредуются одним и тем же альфа-спиральным трансактивационным доменом, состоящим из 15 остатков, который вставляется в гидрофобные щели на поверхности HDM2 и HDMX. Три остатка указанного домена p53 (F19, W23 и L26) являются необходимыми для связывания HDM2 и HDMX. Настоящее изобретение предлагает пептидомиметические макроциклы на основе p53, которые модулируют p53 путем ингибирования взаимодействий между p53 и HDM2, p53 и HDMX, или p53 и обоими белками HDM2 и HDMX, и которые можно использовать для лечения заболеваний, включающих в себя, без ограничения, рак и другие гиперпролиферативные болезни.

Сущность изобретения

Ниже описаны пептиды со стабильными поперечными связями, соединенные с фрагментом человеческого p53 ("p53-пептидомиметические макроциклы"). Указанные поперечносшитые пептиды содержат, по меньшей мере, две модифицированные аминокислоты, которые вместе образуют внутримолекулярную поперечную связь, способствующую стабилизации альфа-спиральной вторичной структуры фрагмента p53, что является важным для связывания p53 с HDM2 и для связывания p53 с HDMX. Соответственно, поперечносшитый полипептид, описанный в данном документе, может обладать улучшенной биологической активностью по сравнению с соответствующим полипептидом, не содержащим поперечных связей. Полагают, что p53 пептидомиметические макроциклы препятствуют связыванию p53 с HDM2 и/или p53 с HDMX, высвобождая функциональный p53 и ингибируя его разрушение. Описанные здесь p53 пептидомиметические макроциклы можно использовать в терапии, например, для лечения рака и других нарушений, характеризующихся нежелательно низким уровнем p53, или низкой активностью p53, и/или для лечения рака и других нарушений, характеризующихся нежелательно высоким уровнем HDM2 или HDMX. p53 пептидомиметические макроциклы также можно использовать для лечения любого заболевания, связанного с нарушением регуляции транскрипционного пути p53, приводящим к развитию состояний, связанных с избыточным выживанием клеток и пролиферацией, таких как рак и аутоиммунные заболевания, а также состояний, характеризующихся неадекватным прекращением клеточного цикла и апоптозом, таких как нейродегенерация и иммунодефициты. В некоторых случаях p53 пептидомиметические макроциклы связываются с HDM2 (например, GenBank®, № доступа: 228952; GI:228952) и/или HDMX (который также обозначают HDM4; GenBank®, № доступа: 88702791; GI:88702791).

В одном аспекте настоящее изобретение предлагает пептидомиметический макроцикл, содержащий аминокислотную последовательность, которая, по меньшей мере, примерно на 60%, 80%, 90% или 95% идентична аминокислотной последовательности, выбранной из группы, включающей в себя аминокислотные последовательности, описанные в таблице 1, 2, 3 или 4. Альтернативно аминокислотная последовательность указанного пептидомиметического макроцикла выбрана из группы, включающей в себя аминокислотные последовательности, описанные в таблице 1. Альтернативно аминокислотная последовательность упомянутого пептидомиметического макроцикла выбрана из указанных выше последовательностей и, кроме того, макроцикл не содержит тиоэфир или триазол. В некоторых воплощениях пептидомиметический макроцикл содержит спираль, такую как α-спираль. В других воплощениях пептидомиметический макроцикл содержит α,α-дизамещенную аминокислоту. Пептидомиметический макроцикл настоящего изобретения может содержать поперечный линкер, который соединяет α-положения, по меньшей мере, двух аминокислот. По меньшей мере одна из двух указанных аминокислот может представлять собой α,α-дизамещенную аминокислоту.

В некоторых воплощениях пептидомиметический макроцикл имеет формулу:

Формула I

где:

каждый A, C, D и E независимо обозначает природную или неприродную аминокислоту, а D и E независимо и необязательно содержат кэпирующую группу;

B представляет собой природную или неприродную аминокислоту, аналог аминокислоты, , [-NH-L₃-CO-], [-NH-L₃-SO₂-] или [-NH-L₃-];

R₁ и R₂ независимо обозначают -H, алкил, алкенил, алкинил, арилалкил, циклоалкил, циклоалкилалкил, гетероалкил или гетероциклоалкил, незамещенный или замещенный галогеном;

R₃ обозначает водород, алкил, алкенил, алкинил, арилалкил, гетероалкил, циклоалкил, гетероциклоалкил, циклоалкилалкил, циклоарил или гетероциклоарил, необязательно замещенный R₅;

L обозначает макроцикл-образующий линкер формулы -L₁-L₂-;

L₁ и L₂ независимо обозначают алкилен, алкенилен, алкинилен, гетероалкилен, циклоалкилен, гетероциклоалкилен, циклоарилен, гетероциклоарилен или [-R₄-K-R₄-]_n, каждый из которых необязательно замещен R₅;

каждый R₄ обозначает алкилен, алкенилен, алкинилен, гетероалкилен, циклоалкилен, гетероциклоалкилен, арилен или гетероарилен;

каждый K обозначает O, S, SO, SO₂, CO, CO₂ или CONR₃;

каждый R₅ независимо обозначает галоген, алкил, -OR₆, -N(R₆)₂, -SR₆, -SOR₆, -SO₂R₆, -CO₂R₆, флуоресцентный фрагмент, радиоизотоп или терапевтическое средство;

каждый R₆ независимо обозначает -H, алкил, алкенил, алкинил, арилалкил, циклоалкилалкил, гетероциклоалкил, флуоресцентный фрагмент, радиоизотоп или терапевтическое средство;

R₇ обозначает -H, алкил, алкенил, алкинил, арилалкил, циклоалкил, гетероалкил, циклоалкилалкил, гетероциклоалкил, циклоарил или гетероциклоарил, необязательно замещенный R₅, или часть циклической структуры, содержащую остаток D;

R₈ обозначает -H, алкил, алкенил, алкинил, арилалкил, циклоалкил, гетероалкил, циклоалкилалкил, гетероциклоалкил, циклоарил или гетероциклоарил, необязательно замещенный R₅, или часть циклической структуры, содержащую остаток E;

v и w независимо обозначают целые числа в диапазоне 1-1000;

u обозначает целое число в диапазоне 1-10;

x, y и z независимо обозначают целые числа в диапазоне 0-10; и

n обозначает целое число в диапазоне 1-5.

В разных воплощениях пептидомиметический макроцикл содержит L₁ и L₂, где L₁ и L₂ ни по отдельности, ни в сочетании не содержат тиоэфир или триазол.

В других воплощениях пептидомиметический макроцикл может содержать поперечный линкер, соединяющий скелетную аминогруппу первой аминокислоты со второй аминокислотой, входящей в состав пептидомиметического макроцикла. Например, изобретение предлагает пептидомиметические макроциклы формулы (IV) или (IVa):

Формула (IV)

Формула (IVa)

где:

каждый A, C, D и E независимо обозначает природную или неприродную аминокислоту, а D и E независимо и необязательно содержат кэпирующую группу;

B обозначает природную или неприродную аминокислоту, аналог аминокислоты, , [-NH-L₃-CO-], [-NH-L₃-SO₂-] или [-NH-L₃-];

R₁ и R₂ независимо обозначают -H, алкил, алкенил, алкинил, арилалкил, циклоалкил, циклоалкилалкил, гетероалкил или гетероциклоалкил, незамещенный или замещенный галогеном, или часть циклической структуры, содержащей остаток E;

R₃ обозначает водород, алкил, алкенил, алкинил, арилалкил, гетероалкил, циклоалкил, гетероциклоалкил, циклоалкилалкил, циклоарил или гетероциклоарил, необязательно замещенный R₅;

L₁ и L₂ независимо обозначают алкилен, алкенилен, алкинилен, гетероалкилен, циклоалкилен, гетероциклоалкилен, циклоарилен, гетероциклоарилен или [-R₄-K-R₄-]_n, каждый из которых необязательно замещен R₅;

каждый R₄ обозначает алкилен, алкенилен, алкинилен, гетероалкилен, циклоалкилен, гетероциклоалкилен, арилен или гетероарилен;

каждый K обозначает O, S, SO, SO₂, CO, CO₂ или CONR₃;

каждый R₅ независимо обозначает галоген, алкил, -OR₆, -N(R₆)₂, -SR₆, -SOR₆, -SO₂R₆, -CO₂R₆, флуоресцентный фрагмент, радиоизотоп или терапевтическое средство;

каждый R₆ независимо обозначает -H, алкил, алкенил, алкинил, арилалкил, циклоалкилалкил, гетероциклоалкил, флуоресцентный фрагмент, радиоизотоп или терапевтическое средство;

R₇ обозначает -H, алкил, алкенил, алкинил, арилалкил, циклоалкил, гетероалкил, циклоалкилалкил, гетероциклоалкил, циклоарил или гетероциклоарил, необязательно замещенный R₅;

v и w независимо обозначают целые числа в диапазоне 1-1000;

u обозначает целое число в диапазоне 1-10;

x, y и z независимо обозначают целые числа в диапазоне 0-10; и

n обозначает целое число в диапазоне 1-5.

Кроме того, изобретение предлагает способ лечения рака у субъекта, включающий в себя введение субъекту пептидомиметического макроцикла настоящего изобретения. Изобретение также предлагает способ модуляции активности p53, или HDM2, или HDMX, у субъекта, включающий в себя введение субъекту пептидомиметического макроцикла настоящего изобретения, или способ препятствования взаимодействию p53 с белками HDM2 и/или HDMX у субъекта, включающий в себя введение субъекту такого пептидомиметического макроцикла.

Включение в качестве ссылки

Все публикации, патенты и патентные заявки, упомянутые в данном описании, включены в настоящий документ в качестве ссылки в такой степени, как если бы по поводу каждой отдельной публикации, каждого отдельного патента и каждой отдельной патентной заявки было бы конкретно и индивидуально указано, что они включены в качестве ссылки.

Краткое описание чертежей

Новые признаки настоящего изобретения подробно описаны в прилагающейся формуле изобретения. Облегчить понимание признаков и преимуществ настоящего изобретения помогают приведенные в нижеследующем подробном описании иллюстративные воплощения, основанные на принципах настоящего изобретения, и прилагаемые рисунки:

На фиг.1 описан синтез Fmoc-Me-6-хлортриптофана и Fmoc-6-хлортриптофана.

На фиг.2 показаны результаты анализа Me-6-хлор-(Boc)триптофан-Ni-S-BPB методом ЖХ-МС.

На фиг.3 показан ¹H-ЯМР-спектр Me-6-хлор-(Boc)триптофан-Ni-S-BPB.

На фиг.4 показаны результаты анализа Fmoc-Me-6-хлор-(Boc)триптофана методом ЖХ-МС.

На фиг.5 показан ¹H-ЯМР-спектр Fmoc-Me-6-хлор-(Boc)триптофана.

На фиг.6A-F описаны результаты анализа жизнеспособности клеток, конкурентного анализа ELISA, анализа GRIP, определения значений Kd, анализа активации p21, флуоресцентного поляризационного анализа конкурентного связывания и определения циклической спиральности для типичных пептидомиметических макроциклов настоящего изобретения.

На фиг.7A-D приведены данные для ряда макроциклов.

На фиг.8A-B приведены данные для ряда макроциклов.

Подробное описание изобретения

В настоящем описании термин "макроцикл" относится к молекуле, химическая структура которой содержит кольцо или цикл, образованный по меньшей мере 9 ковалентно связанными атомами.

В настоящем описании термин "пептидомиметический макроцикл" или "поперечносшитый полипептид" относится к соединению, содержащему совокупность аминокислотных остатков, соединенных рядом пептидных связей, и, по меньшей мере, один макроцикл-образующий линкер, который образует макроцикл путем соединения первого природного или неприродного аминокислотного остатка (или его аналога) со вторым природным или неприродным аминокислотным остатком (или его аналогом), входящим в состав той же молекулы. Пептидомиметический макроцикл включает в себя воплощения, в которых макроцикл-образующий линкер соединяет атом углерода первого аминокислотного остатка (или его аналога) с атомом углерода второго аминокислотного остатка (или его аналога). Пептидомиметические макроциклы необязательно содержат одну или несколько непептидных связей, соединяющих два или более аминокислотных остатков и/или аналогов аминокислотных остатков, и необязательно содержат один или несколько неприродных аминокислотных остатков или аналогов аминокислотных остатков помимо образующих макроцикл. Термин "соответствующий полипептид, не содержащий поперечных связей", упоминающийся в контексте пептидомиметического макроцикла, относится к полипептиду такой же длины, что и макроцикл, который содержит природные аминокислоты, эквивалентные аминокислотам последовательности макроцикла дикого типа.

В настоящем описании термин "стабильность" относится к поддержанию определенной вторичной структуры пептидомиметического макроцикла настоящего изобретения в растворе, что определяют методом кругового дихроизма, ЯМР или другим биофизическим методом, или к устойчивости к протеолитической деградации in vitro или in vivo. Неограничивающие примеры вторичных структур, охватываемых настоящим изобретением, включают в себя α-спирали, β-изгибы и β-складки.

В настоящем описании термин "стабильность спиральной структуры" относится к поддержанию спиральной структуры пептидомиметического макроцикла настоящего изобретения, измеряемому методом кругового дихроизма или ЯМР. Например, в некоторых воплощениях по данным кругового дихроизма α-спиральность пептидомиметических макроциклов настоящего изобретения, по меньшей мере, в 1,25, 1,5, 1,75 или 2 раза превышает α-спиральность соответствующего макроцикла, не содержащего поперечных связей.

Термин "α-аминокислота" или просто "аминокислота" относится к молекуле, которая содержит аминогруппу и карбоксильную группу, присоединенные к атому углерода, обозначаемому "α-атом углерода". Подходящие аминокислоты включают в себя, без ограничения, D- и L-изомеры природных аминокислот, а также неприродных аминокислот, полученных путем органического синтеза или других метаболических процессов. Если контекст конкретно не указывает иначе, термин "аминокислота" в настоящем описании охватывает аналоги аминокислот.

Термин "природная аминокислота" относится к любой из двадцати аминокислот, обычно присутствующих в пептидах, синтезированных в природе, и имеющих однобуквенные обозначения A, R, N, C, D, Q, E, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y и V.

Термин "аналог аминокислоты" или "неприродная аминокислота" относится к молекуле, структурно подобной аминокислоте, которая может замещать аминокислоту при образовании пептидомиметического макроцикла. Аналоги аминокислот включают в себя, без ограничения, соединения, структурно идентичные аминокислотам, в соответствии с приведенным здесь определением, за исключением вставки одной или нескольких дополнительных метиленовых групп между аминогруппой и карбоксильной группой (например, α-амино-β-карбоновые кислоты), или замены аминогруппы или карбоксильной группы подобной реакционноспособной группой (например, замены первичной аминогруппы вторичной или третичной аминогруппой, или замены карбоксильной группы сложноэфирной группой). Неприродные аминокислоты могут содержать следующие структуры:

.

"Не необходимый" аминокислотный остаток представляет собой остаток последовательности полипептида дикого типа, который можно изменить без утраты или существенного изменения основной биологической или биохимической активности (такой как связывание или активация рецептора) полипептида. "Необходимый" аминокислотный остаток представляет собой остаток последовательности полипептида дикого типа, изменение которого приводит к утрате или существенному изменению основной биологической или биохимической активности полипептида.

"Консервативная аминокислотная замена" представляет собой замену аминокислотного остатка другим аминокислотным остатком, содержащим подобную боковую цепь. В данной области определены семейства аминокислотных остатков, содержащих подобные боковые цепи. Указанные семейства включают в себя аминокислоты, содержащие основные боковые цепи (например, K, R, H), кислые боковые цепи (например, D, E), незаряженные полярные боковые цепи (например, G, N, Q, S, T, Y, C), неполярные боковые цепи (например, A, V, L, I, P, F, M, W), бета-разветвленные боковые цепи (например, T, V, I) и ароматические боковые цепи (например, Y, F, W, H). Таким образом, определенный теоретически не необходимый аминокислотный остаток, входящий в состав полипептида, например, предпочтительно заменяют другим аминокислотным остатком, относящимся к тому же семейству боковых цепей. Другие примеры приемлемых замен включают в себя замены на основе изостерических факторов (например, замена норлейцина на метионин) или других свойств (например, замена 2-тиенилаланин на фенилаланин).

Термин "кэпирующая группа" относится к химическому фрагменту, находящемуся на карбокси- или аминоконце полипептидной цепи указанного пептидомиметического макроцикла. Кэпирующая группа карбоксиконца включает в себя немодифицированную карбоксильную группу (т.е. -COOH) или карбоксильную группу, содержащую заместитель. Например, карбоксиконец может быть замещен аминогруппой с получением карбоксамида на C-конце. Разные заместители включают в себя, без ограничения, первичные и вторичные аминогруппы, в том числе пэгилированные вторичные аминогруппы. Типичные вторичные аминогруппы для кэпирования С-конца включают в себя:

.

Кэпирующая группа аминоконца включает в себя немодифицированную аминогруппу (т.е. -NH₂) или аминогруппу, содержащую заместитель. Например, аминоконец может быть замещен ацильной группой с получением карбоксамида на N-конце. Разные заместители включают в себя, без ограничения, замещенные ацильные группы, такие как C₁-C₆ карбонилы, C₇-C₃₀ карбонилы и пэгилированные карбаматы. Типичные кэпирующие группы для N-конца включают в себя:

.

В настоящем описании в объем термина "член", используемого в применении к макроциклам или макроцикл-образующим линкерам, входят атомы, которые образуют или могут образовать макроцикл, но не атомы заместителей или боковых цепей. Так, например, циклодекан, 1,2-дифтордекан и 1,3-диметилциклодекан считаются десятичленными макроциклами, поскольку заместители водород или фтор, или метильные боковые цепи не участвуют в образовании макроцикла.

Символ "", используемый для обозначения части молекулярной структуры, означает, что связь может представлять собой одинарную связь или транс- или цис- двойную связь.

Термин "боковая цепь аминокислоты" относится к фрагменту, присоединенному к α-атому углерода аминокислоты. Например, аминокислотная боковая цепь аланина представляет собой метил, аминокислотная боковая цепь фенилаланина представляет собой фенилметил, аминокислотная боковая цепь цистеина представляет собой тиометил, аминокислотная боковая цепь аспартата представляет собой карбоксиметил, аминокислотная боковая цепь тирозина представляет собой 4-гидроксифенилметил, и т.д. В объем термина также входят другие, неприродные аминокислотные боковые цепи, например, встречающиеся в природе (такие как метаболит аминокислоты) или полученные синтетическими способами (такие как α,α-дизамещенная аминокислота).

Термин "α,α-дизамещенная аминокислота" относится к молекуле или фрагменту, в которых аминогруппа и карбоксильная группа связаны с атомом углерода (α-атомом углерода), к которому присоединены две природные или неприродные аминокислотные боковые цепи.

Термин "полипептид" обозначает молекулу, содержащую две или более природных или неприродных аминокислот, соединенных ковалентной связью (например, амидной связью). Описанные здесь полипептиды включают в себя полноразмерные белки (например, полностью процессированные белки), а также более короткие аминокислотные последовательности (например, фрагменты природных белков или синтетических полипептидов).

В настоящем описании термин "реагент макроциклизации" или "макроцикл-образующий реагент" относится к любому реагенту, который может способствовать получению пептидомиметического макроцикла путем опосредования реакции между двумя реакционноспособными группами. Если реакционнопособные группы представляют собой, например, азид и алкин, реагент макроциклизации включает в себя, без ограничения, Cu-содержащие реагенты, например, реагенты, предоставляющие реакционноспособные соединения Cu(I), такие как CuBr, CuI или CuOTf, а также соли Cu(II), такие как Cu(CO₂CH₃)₂, CuSO₄ и CuCl₂, которые можно превратить in situ в активный реагент Cu(I) путем добавления восстанавливающего средства, такого как аскорбиновая кислота или аскорбат натрия. Реагенты макроциклизации также могут включать в себя, например, известные в данной области реагенты Ru, такие как Cp*RuCl(PPh₃)₂, [Cp*RuCl]₄ или другие реагенты Ru, которые могут предоставлять реакционноспособные соединения Ru(II). В других случаях реакционноспособные группы представляют собой концевые олефины. В таких воплощениях реагенты макроциклизации или макроцикл-образующие реагенты представляют собой катализаторы метатезиса, включающие в себя, без ограничения, стабилизированные карбеновые комплексы поздних переходных металлов, такие как карбеновые комплексы переходных металлов VIII группы. Например, такие катализаторы содержат в центре пентакоординированные металлы Ru и Os в степени окисления +2 и с числом электронов 16. Другие катализаторы описаны в Grubbs et al., "Ring Closing Metathesis и Related Processes in Organic Synthesis" Acc. Chem. Res. 1995, 28, 446-452, и патенте США № 5811515. В других случаях реакционноспособные группы представляют собой тиольные группы. В таких воплощениях реагент макроциклизации представляет собой, например, линкер, функционализированный двумя тиольными реакционноспособными группами, такими как галоген-содержащие группы.

Термин "галоген" включает в себя атомы фтора, хлора, брома или йода, или их радикалы.

Термин "алкил" относится к линейной или разветвленной углеводородной цепи, содержащей указанное число атомов углерода. Например, C₁-C₁₀ обозначает группу, содержащую от 1 до 10 (включительно) атомов углерода. При отсутствии какого-либо численного обозначения "алкил" представляет собой цепь (линейную или разветвленную), содержащую от 1 до 20 (включительно) атомов углерода.

Термин "алкилен" обозначает двухвалентный алкил (т.е. -R-).

Термин "алкенил" относится к линейной или разветвленной углеводородной цепи, содержащей одну или несколько углерод-углеродных двойных связей. Алкенильный фрагмент содержит указанное число атомов углерода. Например, C₂-C₁₀ обозначает группу, содержащую от 2 до 10 (включительно) атомов углерода. Термин "низший алкенил" относится к C₂-C₆ алкенильной цепи. При отсутствии какого-либо численного обозначения "алкенил" представляет собой цепь (линейную или разветвленную), содержащую от 2 до 20 (включительно) атомов углерода.

Термин "алкинил" относится к линейной или разветвленной углеводородной цепи, содержащей одну или несколько углерод-углеродных тройных связей. Алкинильный фрагмент содержит указанное число атомов углерода. Например, C₂-C₁₀ обозначает группу, содержащую от 2 до 10 (включительно) атомов углерода. Термин "низший алкинил" относится к C₂-C₆ алкинильной цепи. При отсутствии какого-либо численного обозначения "алкинил" представляет собой цепь (линейную или разветвленную), содержащую от 2 до 20 (включительно) атомов углерода.

Термин "арил" относится к 6-углеродной моноциклической или 10-углеродной бициклической ароматической системе, где 0, 1, 2, 3 или 4 атома в каждом цикле замещены заместителем. Примеры арильных групп включают в себя фенил, нафтил и т.п. Термин "арилалкил" или термин "аралкил" относится к алкилу, замещенному арилом. Термин "арилалкокси" относится к алкоксильной группе, замещенной арилом.

"Арилалкил" представляет собой арильную группу, определенную выше, в которой один из атомов водорода замещен C₁-C₅ алкильной группой, определенной выше. Иллюстративные примеры арилалкильной группы включают в себя, без ограничения, 2-метилфенил, 3-метилфенил, 4-метилфенил, 2-этилфенил, 3-этилфенил, 4-этилфенил, 2-пропилфенил, 3-пропилфенил, 4-пропилфенил, 2-бутилфенил, 3-бутилфенил, 4-бутилфенил, 2-пентилфенил, 3-пентилфенил, 4-пентилфенил, 2-изопропилфенил, 3-изопропилфенил, 4-изопропилфенил, 2-изобутилфенил, 3-изобутилфенил, 4-изобутилфенил, 2-втор-бутилфенил, 3-втор-бутилфенил, 4-втор-бутилфенил, 2-трет-бутилфенил, 3-трет-бутилфенил и 4-трет-бутилфенил.

Термин "ариламидо" относится к арильной группе, определенной выше, в которой один из атомов водорода замещен одной или несколькими группами -C(O)NH₂. Иллюстративные примеры группы ариламидо включают в себя 2-C(O)NH₂-фенил, 3-C(O)NH₂-фенил, 4-C(O)NH₂-фенил, 2-C(O)NH₂-пиридил, 3-C(O)NH₂-пиридил и 4-C(O)NH₂-пиридил.

Термин "алкилгетероцикл" относится к C₁-C₅ алкильной группе, определенной выше, в которой один из атомов углерода замещен гетероциклом. Иллюстративные примеры алкилгетероциклической группы включают в себя, без ограничения, -CH₂CH₂-морфолин, -CH₂CH₂-пиперидин, -CH₂CH₂CH₂-морфолин и -CH₂CH₂CH₂-имидазол.

"Алкиламидо" относится к C₁-C₅ алкильной группе, определенной выше, в которой один из атомов углерода замещен группой -C(O)NH₂. Иллюстративные примеры алкиламидной группы включают в себя, без ограничения, -CH₂-C(O)NH₂, -CH₂CH₂-C(O)NH₂, -CH₂CH₂CH₂C(O)NH₂, -CH₂CH₂CH₂CH₂C(O)NH₂, -CH₂CH₂CH₂CH₂CH₂C(O)NH₂, -CH₂CH(C(O)NH₂)CH₃, -CH₂CH(C(O)NH₂)CH₂CH₃, -CH(C(O)NH₂)CH₂CH₃, -C(CH₃)₂CH₂C(O)NH₂, -CH₂-CH₂-NH-C(O)-CH₃, -CH₂-CH₂-NH-C(O)-CH₃-CH₃ и -CH₂-CH₂-NH-C(O)-CH=CH₂.

Термин "алканол" относится к C₁-C₅ алкильной группе, определенной выше, в которой один из атомов углерода замещен гидроксильной группой. Иллюстративные примеры алканола включают в себя, без ограничения, -CH₂OH, -CH₂CH₂OH, -CH₂CH₂CH₂OH,-CH₂CH₂CH₂CH₂OH, -CH₂CH₂CH₂CH₂CH₂OH, -CH₂CH(OH)CH₃, -CH₂CH(OH)CH₂CH₃, -CH(OH)CH₃ и -C(CH₃)₂CH₂OH.

Термин "алкилкарбокси" относится к C₁-C₅ алкильной группе, определенной выше, в которой один из атомов углерода замещен группой -COOH. Иллюстративные примеры алкилкарбоксильной группы включают в себя, без ограничения, -CH₂COOH, -CH₂CH₂COOH, -CH₂CH₂CH₂COOH, -CH₂CH₂CH₂CH₂COOH, -CH₂CH(COOH)CH₃, -CH₂CH₂CH₂CH₂CH₂COOH, -CH₂CH(COOH)CH₂CH₃, -CH(COOH)CH₂CH₃ и -C(CH₃)₂CH₂COOH.

Термин "циклоалкил" в соответствии с настоящим описанием охватывает насыщенные и частично ненасыщенные циклические углеводородные группы, содержащие от 3 до 12 атомов углерода, предпочтительно от 3 до 8 атомов углерода, и более предпочтительно от 3 до 6 атомов углерода, где циклоалкильная группа также может быть необязательно замещена. Некоторые циклоалкильные группы включают в себя, без ограничения, циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклопентенил, циклогексил, циклогексенил, циклогептил и циклооктил.

Термин "гетероарил" относится к ароматической 5-8-членной моноциклической, 8-12-членной бициклической, или 11-14-членной трициклической системе, содержащей 1-3 гетероатомов в случае моноциклической системы, 1-6 гетероатомов в случае бициклической системы, или 1-9 гетероатомов в случае трициклической системы, где указанные гетероатомы выбраны из O, N или S (например, гетероарил содержит атомы углерода и 1-3, 1-6 или 1-9 гетероатомов, выбранных из O, N или S, в случае моноциклической, бициклической или трициклической системы, соответственно), где 0, 1, 2, 3 или 4 атома каждого цикла замещены заместителем. Примеры гетероарильных групп включают в себя пиридил, фурил или фуранил, имидазолил, бензимидазолил, пиримидинил, тиофенил или тиенил, хинолинил, индолил, тиазолил и т.п.

Термин "гетероарилалкил" или термин "гетероаралкил" относится к алкилу, замещенному гетероарилом. Термин "гетероарилалкокси" относится к алкокси, замещенному гетероарилом.

Термин "гетероарилалкил" или термин "гетероаралкил" относится к алкилу, замещенному гетероарилом. Термин "гетероарилалкокси" относится к алкокси, замещенному гетероарилом.

Термин "гетероциклил" относится к неароматической 5-8-членной моноциклической, 8-12-членной бициклической или 11-14-членной трициклической системе, содержащей 1-3 гетероатомов в случае моноциклической системы, 1-6 гетероатомов в случае бициклической системы, или 1-9 гетероатомов в случае трициклической системы, где указанные гетероатомы выбраны из O, N или S (например, гетероциклил содержит атомы углерода и 1-3, 1-6 или 1-9 гетероатомов, выбранных из O, N или S, в случае моноциклической, бициклической или трициклической системы, соответственно), где 0, 1, 2 или 3 атома в каждом цикле замещены заместителем. Примеры гетероциклильных групп включают в себя пиперазинил, пирролидинил, диоксанил, морфолинил, тетрагидрофуранил и т.п.

Термин "заместитель" относится к группе, замещающей второй атом или вторую группу, например, атом водорода, в молекуле, соединении или фрагменте. Подходящие заместители включают в себя, без ограничения, такие группы как галоген, гидрокси, меркапто, оксо, нитро, галогеналкил, алкил, алкарил, арил, аралкил, алкокси, тиоалкокси, арилокси, амино, алкоксикарбонил, амидо, карбокси, алкансульфонил, алкилкарбонил и циано.

В некоторых воплощениях соединения настоящего изобретения содержат один или несколько асимметричных центров и, следовательно, могут находиться в виде рацематов и рацемических смесей, отдельных энантиомеров, отдельных диастереомеров и смесей диастереомеров. Если однозначно не указано иначе, все изомерные формы указанных соединений входят в объем настоящего изобретения. В некоторых воплощениях соединения настоящего изобретения также могут присутствовать в виде нескольких таутомерных форм, и в таких случаях изобретение охватывает все таутомерные формы описанных здесь соединений (например, если алкилирование циклической системы приводит к присоединению алкила в нескольких положениях, изобретение охватывает все такие продукты реакции). Если однозначно не указано иначе, все изомерные формы указанных соединений входят в объем настоящего изобретения. Все кристаллические формы описанных здесь соединений также входят в объем настоящего изобретения, если контекст однозначно не указывает иначе.

В настоящем описании термины "увеличивает" и "уменьшает" означают, соответственно, что соединение вызывает статистически значимое (т.е. p<0,1) увеличение или уменьшение, составляющее, по меньшей мере, 5%.

В настоящем описании указание диапазона численных значений переменной означает, что изобретение можно осуществлять при любом значении переменной, попадающим в указанный диапазон. Таким образом, если переменная является по существу дискретной, она может иметь значение, равное любому целому числу, входящему в указанный численный диапазон, включая граничные значения диапазона. Подобным образом, если переменная является по существу непрерывной величиной, она может иметь значение, равное любому действительному числу, входящему в указанный численный диапазон, включая граничные значения диапазона. Например, и без ограничения, если указано, что переменная может иметь значения в диапазоне от 0 до 2, ее значение может быть равно 0, 1 или 2, если переменная является по существу дискретной, или ее значение может быть равно 0,0, 0,1, 0,01, 0,001 или любому другому действительному числу >0 и <2, если переменная является по существу непрерывной.

Если не указано иначе, в настоящем описании слово "или" используется во включающем смысле "и/или", а не в исключающем смысле "либо/либо".

Термин "в среднем" обозначает среднее значение, полученное при выполнении, по меньшей мере, трех независимых повторов для каждой экспериментальной точки.

Термин "биологическая активность" охватывает структурные и функциональные свойства макроцикла настоящего изобретения. К биологической активности относится, например, структурная стабильность, альфа-спиральность, сродство к мишени, устойчивость к протеолитической деградации, способность проникать в клетки, внутриклеточная стабильность, стабильность in vivo или любое сочетание вышеуказанных свойств.

Детали одного или нескольких конкретных воплощений настоящего изобретения описаны в прилагающихся чертежах и в приведенном ниже описании. Другие признаки, цели и преимущества настоящего изобретения станут очевидны из нижеследующих описания, чертежей и формулы изобретения.

В некоторых воплощениях пептидные последовательности получены из белка p53.

Ниже приведен неограничивающий иллюстративный список пептидов p53, подходящих для применения в настоящем изобретении.

Таблица 1

Таблица 2

Таблица 3

В таблице 3, а также в других местах, "Aib" обозначает остаток 2-аминоизомасляной кислоты, а "Ac3c" обозначает остаток аминоциклопропанкарбоновой кислоты.

Пептидомиметические макроциклы

В некоторых воплощени