Дополнительное исследование проб с применением остаточных материалов от предыдущего теста

Дополнительное исследование проб с применением остаточных материалов от предыдущего теста

Иллюстрации

Показать все

Реферат

УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ

Область техники

[0001] Варианты реализации изобретения, описанные в настоящей заявке, относятся к способам и системам выполнения последовательных, автоматизированных анализов, таких как тест-анализы на нуклеиновые кислоты.

Уровень техники

[0002] Автоматизация молекулярного исследования образцов становится все более распространенной, отчасти потому, что она позволяет уменьшить количество времени от взятия пробы до получения результатов, минимизировать изменчивость от эксперимента к эксперименту и уменьшить потребность в высококвалифицированных технических специалистах. Помимо преимуществ в области диагностики, автоматизация обработки и исследования проб необходимо обеспечить высокую производительность исследования. Как правило, автоматизированные устройства для обработки образцов и/или проб включают аппаратные средства и расходные материалы. Таким образом, желательно максимизировать автоматизацию молекулярного исследования при одновременном сведении к минимуму количества расходных используемых материалов.

[0003] Описанные варианты реализации изобретения обеспечивают улучшенное автоматизированное исследование образцов и/или проб, которое можно преимущественно использовать в клинических условиях и при научных исследованиях.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ

[0004] Настоящая технология относится к способам и системам для выполнения последовательных анализов, таких как тест-анализы на нуклеиновые кислоты. Некоторые варианты реализации изобретения относятся к последовательным анализам одного или более образцов, выполняемых на автоматизированном приборе. Согласно некоторым вариантам реализации технологии, представленной в настоящей заявке, предложены способы выполнения автоматизированного анализа множества проб, позволяющие улучшить надежность и удобство применения при анализе множества образцов на автоматизированном приборе. Указанные способы могут включать а) обеспечение автоматизированного прибора, выполненного с возможностью приема и обработки множества проб из множества образцов для определения одного или более заданных анализируемых веществ согласно одному или более соответствующим аналитическим технологическим процессам; b) обеспечение множества проб, подлежащих исследованию; с) автоматический перенос первой части каждой из множества проб, подлежащих исследованию, в соответствующее множество первых сосудов, содержащих реактивы для первого теста, для определения первого заданного анализируемого вещества; d) автоматическое выполнение первого теста на части из множества проб для определения присутствия первого заданного анализируемого вещества согласно первому аналитическому технологическому процессу; е) выбор проб подмножества из множества проб, в которых было определено присутствие первого заданного анализируемого вещества; f) автоматический перенос второй части подмножества проб, выбранных на стадии е), во второй сосуд, содержащий реактивы для второго теста, для определения присутствия второго заданного анализируемого вещества согласно второму аналитическому технологическому процессу; и g) автоматическое выполнение второго теста на второй части выбранного подмножества проб.

[0005] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения каждая проба из множества проб содержит предварительно обработанный раствор выделенных нуклеиновых кислот из соответствующего множества образцов. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения автоматизированным прибором автоматически обрабатывают множество образцов с получением соответствующего множества проб, содержащих выделенные нуклеиновые кислоты.

[0006] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения, применительно к каждой пробе, проба и первый сосуд, содержащий реактивы для первого теста, расположены на первой тест-полоске, так что стадия f) дополнительно включает автоматический перенос второй части пробы во второй сосуд, содержащий реактивы для второго теста, расположенный на второй тест-полоске.

[0007] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения стадия е) дополнительно включает e1) идентификацию подмножества из множества первых тест-полосок для второго теста; и е2) для каждой первой тест-полоски в подмножестве, обеспечение соответствующей второй тест-полоски, содержащей сосуд, содержащий реактивы для второго теста на второе анализируемое вещество.

[0008] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения вторая тест-полоска содержит по меньшей мере один наконечник для пипетки. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения указанный способ перед стадией f) включает добавление в пробу дополнительной жидкости.

[0009] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения, применительно к каждой пробе, проба, первый сосуд и гнездо для второго сосуда расположены на одной тест-полоске. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения способ включает, перед стадией е), стадии d1) идентификации подмножества из множества первых тест-полосок для проведения исследования на второе анализируемое вещество; и d2) для каждой тест-полоски в подмножестве, обеспечения в гнезде второго сосуда, содержащего реактивы для второго теста.

[0010] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения способ перед стадией f) включает стадию обеспечения наконечника для пипетки, выполненного с возможностью переноса второй части пробы во второй сосуд, содержащий реактивы для второго теста.

[0011] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения наконечник для пипетки может представлять собой, например, неиспользованный наконечник для пипетки или промытый наконечник для пипетки. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения способ перед стадией f) включает стадию добавления дополнительной жидкости в пробу.

[0012] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения первый тест или указанный тест включает реакцию, выбранную из группы, включающей: полимеразную цепную реакцию (PCR), транскрипционно-опосредованную амплификацию (ТМА), лигирование олигонуклеотидных зондов (OLA), лигазную цепную реакцию (LCR), амплификации по типу катящегося кольца (RCA), амплификации с замещением цепей (SDA) и реакции гибридизации.

[0013] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения способ дополнительно включает стадию сравнения идентификационных знаков на тест-полоске с набором аналитических специфических идентификационных данных, хранимых в приборе.

[0014] Кроме того, в настоящей заявке предложена система для выполнения автоматизированного анализа множества проб из соответствующего множества образцов, содержащая автоматизированный прибор, выполненный с возможностью приема и обработки множества проб согласно одному или более аналитическим технологическим процессам; при этом указанный прибор содержит множество тест-полосок; процессор; емкость запоминающего устройства; и программу для выполнения автоматизированного анализа, содержащую команды для а) обеспечения автоматизированного прибора, выполненного с возможностью приема и обработки множества проб согласно одному или более аналитическим технологическим процессам, при этом указанный прибор содержит множество тест-полосок; b) автоматического переноса первой части каждой пробы в соответствующее множество первых сосудов, содержащих реактивы для первого теста; с) выполнения первого теста для определения присутствия первого заданного анализируемого вещества; d) автоматического переноса второй части проб или выбранного подмножества проб в соответствующие вторые сосуды, содержащие реактивы для второго теста; и е) выполнения второго теста на второй части проб или выбранного подмножества проб для определения присутствия второго заданного анализируемого вещества.

[0015] Согласно некоторым вариантам реализации описанной выше системы программа дополнительно включает команды для автоматического выделения нуклеиновых кислот от множества образцов с получением соответствующего множества проб, содержащих выделенные нуклеиновые кислоты.

[0016] Согласно некоторым вариантам реализации описанной выше системы, применительно к каждой пробе, пробы и первый сосуд, содержащий реактивы для первого теста, расположены на первой тест-полоске, при этом стадия е) включает автоматический перенос части раствора экстрагированных нуклеиновых кислот во вторую содержащую мастер-микс пробирку, расположенную на второй тест-полоске.

[0017] Согласно некоторым вариантам реализации описанной выше системы, применительно к каждой пробе, проба, первый сосуд и гнездо для второго сосуда расположены на одной тест-полоске, при этом программа содержит команды для стадий d1) идентификации подмножества из множества первых тест-полосок для проведения исследования на второе анализируемое вещество; и d2) для каждой тест-полоски в подмножестве, обеспечения в гнезде соответствующего второго сосуда, содержащего реактивы для второго теста.

[0018] Кроме того, в настоящей заявке предложен способ выполнения дополнительного исследования множества образцов, включающий а) обеспечение множества образцов, подлежащих исследованию; b) обработку множества образцов с получением соответствующего множества проб; с) перенос первой части каждой пробы из множества проб, подлежащих исследованию, в соответствующее множество первых сосудов, содержащих реактивы для первого теста, для определения первого заданного анализируемого вещества; d) выполнение первого теста на части из множества проб для определения присутствия первого заданного анализируемого вещества; е) выбор проб подмножества из множества проб, в которых было определено присутствие первого заданного анализируемого вещества, для дополнительного теста; f) перенос второй части подмножества проб, выбранных на стадии е), во второй сосуд, содержащий реактивы для второго теста, для определения присутствия второго заданного анализируемого вещества; и g) выполнение второго теста на второй части выбранного подмножества проб.

[0019] Согласно некоторым вариантам реализации описанных выше способов первый тест включает тест на одновременное обнаружение метициллин-устойчивых Staphylococcus aureus и Staphylococcus aureus, при этом второй тест включает тест на обнаружение детерминанты устойчивости к мупироцину. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения детерминанта устойчивости к мупироцину содержит ген mupA.

[0020] Кроме того, в настоящей заявке представлен способ дополнительного исследования образца, включающий а) обеспечение образца, подлежащего исследованию; b) обработку образца с получением соответствующей пробы; с) перенос первой части пробы, подлежащей исследованию, в первый сосуд, содержащий реактивы для первого теста, для определения первого заданного анализируемого вещества; d) выполнение первого теста на первой части пробы для определения присутствия первого заданного анализируемого вещества; f) перенос второй части пробы во второй сосуд, содержащий реактивы для второго теста, для определения присутствия второго заданного анализируемого вещества, если первое заданное анализируемое вещество обнаружено в первой части пробы; и g) выполнение второго теста на второй части пробы.

[0021] Согласно некоторым вариантам реализации описанного выше способа первый тест включает тест на одновременное обнаружение метициллин-устойчивых Staphylococcus aureus и Staphylococcus aureus, при этом второй тест включает тест на обнаружение детерминанты устойчивости к мупироцину. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения детерминанта устойчивости к мупироцину содержит ген mupA.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ

[0022] На фиг. 1 показана тест-полоска согласно одному из вариантов реализации изобретения.

[0023] На фиг. 2 показана тест-полоска согласно одному из вариантов реализации изобретения.

[0024] На фиг. 3 показаны несколько тест-полосок, помещенных в держатель для полосок согласно одному из вариантов реализации изобретения.

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ

[0025] Заголовки разделов, применяемые в настоящем документе, предназначены только для организационных целей и не должны рассматриваться как ограничивающие каким-либо образом описываемый объект изобретения. Вся литература и подобные материалы, цитируемые в настоящей заявке, в том числе, но не ограничиваясь ими, патенты, заявки на патент, статьи, книги, научные труды и веб-страницы, независимо от формата такой литературы и подобных материалов, в полном объеме включены явным образом посредством ссылки для любой цели. В случае если в одном или более из включенных литературных и подобных материалов дано определение или используется термин таким образом, что это противоречит определению этого термина в настоящей заявке, заявка имеет приоритет. Хотя идеи настоящего изобретения описаны в сочетании с различными вариантами его реализации, это не подразумевает, что представленные идеи ограничены такими вариантами реализации. Напротив, идеи настоящего изобретения охватывают различные альтернативы, модификации и эквиваленты, как будет понятно специалистам в данной области техники.

[0026] Были описаны автоматизированные диагностические приборы, способные обрабатывать и исследовать несколько образцов и/или проб параллельно. Такие устройства можно преимущественно использовать при высокой производительности для облегчения приготовления и исследования образцов и/или проб. В качестве примера, автоматизированные диагностические приборы могут подготовить пробы для диагностических анализов, таких как амплификационные тесты на нуклеиновые кислоты, и выполнить амплификацию и обнаружение.

[0027] Диагностические тесты по природе являются гипотетически управляемыми. При проведении гипотетически управляемого теста, такого как исследование проб на специфическое анализируемое вещество, полученный результат теста может привести к необходимости проведения теста с другой целью, т.е. к необходимости дополнительного теста. Однако во многих случаях полезно исследовать только подмножество исходных проб и не будет экономически эффективным исследовать все пробы. В качестве примера, в клинических условиях может быть необходимым исследовать образец на один или более патогенов. Если тест выявляет присутствие конкретного патогена, желательно выполнить дополнительное исследование, например, для определения присутствия детерминанты устойчивости к антибиотикам. Получение дополнительного образца для дальнейшего исследования, например, от пациента, исследование образца которого дало положительный результат на анализируемое вещество, что указывает на присутствие конкретного патогена, может быть трудным и может замедлить проведение дополнительного исследования, которое является желательным. Помимо потенциальной трудности получения нескольких образцов для исследования, если ему подвергается несколько образцов, ручные способы переноса образцов пациента или проб, приготовленных из указанных образцов для исследования (например, проведения исследования на нуклеиновые кислоты), в новый реакционный сосуд могут привести к ошибке, а также быть неэффективными и трудоемкими. Кроме того, при необходимости обработки образцов перед исследованием, желательно минимизировать затраты, связанные с обработкой (например, реактивы и т.п.). Таким образом, существует огромная потребность в улучшенных способах выполнения дополнительных исследований в автоматизированном режиме.

[0028] Соответственно, «дополнительный тест» относится к последующему тесту (например, второму тесту), который проводят на основе результатов, полученных в предыдущем тесте (например, в первом тесте). Неограничивающие примеры первых тестов и дополнительных тестов включают, например, первый тест на метициллин-устойчивый Staphylococcus aureus MRSA и метициллин-чувствительный S. aureus (MSSA). Для проб, тест на MRS А или MSSA которых был положительным, также может быть желательным определить, содержат ли пробы детерминанты устойчивости к мупироцину (антибиотику). Так как устойчивость к мупироцину обычно важна только для проб, показавших положительный результат на MRSA или MSSA, часто экономически неэффективно исследовать пробы с отрицательными результатами на MRSA и MSSA на устойчивость к мупироцину. Различные исследования и дополнительные тесты, применимые согласно вариантам реализации настоящего изобретения, описанным в настоящей заявке, более подробно представлены ниже.

[0029] Способы и системы, описанные в настоящей заявке, преимущественно используют остаточный материал, оставшийся от первоначального теста, а не требуют новый образец, получаемый от пациента. Например, может быть особенно предпочтительным использовать остаточный материал, который уже был подвергнут интенсивной переработке и требует только небольшой дополнительной работы для проведения дополнительного теста.

Образцы и пробы

[0030] Варианты реализации изобретения, описанные в настоящей заявке, можно использовать для исследования образцов с помощью автоматизированных молекулярных анализов. В настоящей заявке термин "образец" может относиться к клиническому образцу или пробе, отобранной из одного или любого количества источников, в том числе, но не ограничиваясь ими, из физиологических жидкостей (в том числе, но не ограничиваясь ими, из крови, мочи, сыворотки, лимфы, слюны, анальных и вагинальных выделений, пота, жидкости брюшной полости, плеврального выпота, экссудатов, перитонеального выпота, гнойных выделений, смывных жидкостей, дренируемых жидкостей, образцов соскобов, полученных с помощью кисточки, взятой для биопсии ткани, эксплантированных медицинских изделий, инфицированных катетеров, гноя, биопленок и спермы) фактически любого организма, при этом в настоящем изобретении находят применение пробы, отобранные у млекопитающих, в частности, пробы, взятые у человека, и пробы окружающей среды (в том числе, но не ограничиваясь ими, пробы воздуха, сельскохозяйственных растений, воды и почвы). Кроме того, пробы могут быть отобраны при переработке пищевых продуктов, что может включать как пробы исходного сырья (например, зерновых культур, молока или туш животных), пробы на промежуточных стадиях обработки, а также пробы конечного пищевого продукта, готового для потребления потребителем.

[0031] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения пробы получают из образцов и проводят на пробах тесты. Например, согласно некоторым вариантам реализации изобретения образцы можно обработать для получения проб, подходящих для молекулярного исследования. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения образцы можно анализировать напрямую и не подвергать предварительной обработке перед исследованием. Например, «прямая проба» представляет собой образец, который отбирают у субъекта и исследуют с применением способов, описанных в настоящей заявке, без выделения или культивирования бактерий из образца или без обработки образца для выделения перед исследованием нуклеиновых кислот. По существу, прямые пробы, в общем, только минимально обрабатывают перед скринингом. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения образцы, описанные в настоящей заявке, обрабатывают с получением проб, подходящих для исследования. Например, перед исследованием образцы, содержащие клетки, можно обработать путем лизирования клеток и выделения клеточных компонентов, такие как нуклеиновые кислоты, белки и т.п. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения образцы можно обработать с получением проб, содержащих выделенные нуклеиновые кислоты. В настоящей заявке, фраза «выделить нуклеиновые кислоты» относится к очистке нуклеиновых кислот от одного или более клеточных компонентов. Опытный специалист поймет, что пробы, обработанные для «выделения нуклеиновых кислот» из указанных проб, могут включать компоненты и примеси, отличные от нуклеиновых кислот. Пробы, содержащие выделенные нуклеиновые кислоты, можно приготовить из образцов, используя любой приемлемый способ, известный в данной области техники. Например, клетки можно лизировать с помощью известных лизирующих агентов, и нуклеиновые кислоты можно очистить или частично очистить от других клеточных компонентов. Подходящие реактивы и протоколы для экстракции ДНК и РНК можно найти, соответственно, в публикациях заявок на патент США №№US 2010-0009351 и US 2009-0131650, каждая из которых в полном объеме включена в настоящую заявку посредством ссылки. При исследовании нуклеиновых кислот (например, способами амплификации и гибридизации, более подробно описанными ниже), раствор экстрагированных нуклеиновых кислот можно добавить непосредственно к реактивам (например, или в жидкость, связанную с субстратом, в лиофилизированной форме, или т.п., как более подробно описано ниже), необходимым для выполнения теста согласно вариантам реализации изобретения, описанным в настоящей заявке.

[0032] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения тесты, например, первые тесты и дополнительные тесты, описанные в настоящей заявке, представляют собой тесты для определения присутствия заданного анализируемого вещества в образце или пробе. В настоящей заявке, термин «заданное анализируемое вещество» может относиться к разным типам анализируемых веществ, представляющих интерес, в том числе, например, заданным нуклеиновым кислотам, заданным белкам или другим представляющим интерес заданным молекулам. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения устройства и способы, описанные в настоящей заявке, применяют для выполнения дополнительных тестов для определения присутствия заданных нуклеиновых кислот, хотя опытный специалист поймет, что варианты реализации изобретения, описанные в настоящей заявке, можно легко приспособить для выполнения тестов на другие виды заданных анализируемых веществ.

[0033] Согласно описанному выше, варианты реализации изобретения, предложенные в настоящей заявке, преимущественно обеспечивают улучшенные способы автоматического исследования образцов и проб на заданные анализируемые вещества. Способы выполнения автоматизированного анализа множества проб. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения предложенный способ может включать а) обеспечение автоматизированного прибора, выполненного с возможностью приема и обработки множества проб из указанного множества образцов для определения одного или более заданных анализируемых веществ согласно одному или более соответствующим аналитическим технологическим процессам; b) обеспечение множества проб, подлежащих исследованию; с) автоматический перенос первой части каждой из указанного множества проб, подлежащих исследованию, в соответствующее множество первых сосудов, содержащих реактивы для первого теста, для определения первого заданного анализируемого вещества; d) автоматическое выполнение первого теста на части указанного множества проб для определения присутствия первого заданного анализируемого вещества согласно первому аналитическому технологическому процессу; е) выбор проб подмножества из множества проб, в которых было определено присутствие первого заданного анализируемого вещества; f) автоматический перенос второй части подмножества проб, выбранных на стадии е), во второй сосуд, содержащий реактивы для второго теста, для определения присутствия второго заданного анализируемого вещества согласно второму аналитическому технологическому процессу; и g) автоматическое выполнение второго теста на второй части выбранного подмножества проб.

[0034] Автоматизированные приборы, применимые согласно вариантам реализации изобретения, описанным в настоящей заявке, могут включать, например, приборы, описанные в патенте США №8133671, в публикации заявки на патент США №2009-0111059, которые в полном объеме включены в настоящую заявку посредством ссылки. Однако опытный специалист поймет, что варианты реализации изобретения, описанные в настоящей заявке, можно легко адаптировать к любой подходящей автоматизированной системе для обработки и исследования образцов и/или проб. При необходимости, автоматизированные системы выполнены с возможностью проведения обработки или исследования множества проб согласно одному или более технологическим процессам. В настоящей заявке, термины «технологический процесс», «аналитический технологический процесс», «анализ», «протокол анализа», «тест» и тому подобные термины относятся к процедуре обработки образца и/или пробы. Согласно типичным вариантам реализации изобретения технологический процесс может включать стадии подготовки проб, такие как клеточный лизис, экстракция нуклеиновых кислот, очистка нуклеиновых кислот, расщепление нуклеиновых кислот, модификация нуклеиновых кислот, экстракция белков, очистка белков и т.п. В данной области техники известны некоторые способы экстракции нуклеиновых кислот, применимые в вариантах реализации изобретения, описанных в настоящей заявке. Примеры обсуждения экстракции нуклеиновых кислот можно найти, например, в публикации заявки на патент США №2009-0131650, публикации заявки на патент США №2010-0009351 и публикации заявки на патент США №2006-016623311/281247, которые в полном объеме включены в настоящую заявку посредством ссылки. Подобным образом, примеры обсуждения экстракции белка можно найти, например, в патентах США №№8053239 и 6864100, которые в полном объеме включены в настоящую заявку посредством ссылки.

[0035] Согласно некоторым типичным вариантам реализации изобретения технологический процесс может также включать реакции амплификации нуклеиновых кислот. Согласно некоторым типичным вариантам реализации изобретения технологический процесс может дополнительно включать процедуры анализа данных.

[0036] Как описано выше, согласно некоторым вариантам реализации изобретения часть (например, первую часть и, в некоторых случаях, вторую часть) пробы, подвергаемой исследованию или химическому анализу, переносят в сосуд, содержащий реактивы для выполнения теста. В настоящей заявке термин «сосуд» относится к любому типу предмета, способному вмещать пробу, в том числе, но не ограничиваясь ими, пробиркам, сосудам в пластинах микротитратора и т.п. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения сосуд расположен внутри тест-полоски. В настоящей заявке, термин «тест-полоска» или «индикаторная полоска» относится к пакету, который содержит один или более расходных компонентов для автоматизированного анализа. Соответственно, тест-полоски можно выполнить с возможностью применения в устройстве, которое осуществляет автоматизированную подготовку образцов и/или проб, такое устройство описано, например, в международной публикации заявки на патент №WO 09/054870, в полном объеме включенной в настоящую заявку посредством ссылки.

[0037] Согласно типичным вариантам реализации изобретения тест-полоска может содержать сосуд, такой как пробирка, лунка или т.п., для размещения предварительно обработанной пробы, раствора, содержащего выделенные нуклеиновые кислоты, полученные из образца. Как правило, тест-полоска может также содержать сосуд для размещения реактивов для молекулярного теста, такого как тест на нуклеиновые кислоты (например, реактивы, применяемые при амплификации нуклеиновых кислот, как более подробно описано в настоящей заявке в другом месте). Согласно некоторым вариантам реализации изобретения тест-полоска может включать дополнительные сосуды для проведения подготовки проб и размещения реактивов и других расходных материалов, такие как наконечники для пипетки. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения тест-полоска или индикаторная полоска содержит одно или более гнезд или отверстий, выполненных с возможностью размещения реакционных сосудов, содержащих химические реактивы. Соответственно, согласно некоторым вариантам реализации изобретения сосуды, содержащие реактивы для применения в анализах, описанных в настоящей заявке, являются однократными или составляют одно целое с тест-полоской, тогда как согласно некоторым вариантам реализации изобретения сосуды, содержащие реактивы для применения в анализах, описанных в настоящей заявке, не встроены в тест-полоску, но адаптированы для закрепления в гнезде или отверстии в тест-полоске. Неограничивающие примеры тест-полосок или индикаторных полосок, применимых согласно вариантам реализации изобретения, описанным в настоящей заявке, приведены на фиг. 1 и 2, в патентах США D618820, D637737 и в предварительной заявке на патент США №61/541991 поданной 30 сентября 2011 года и озаглавленной «UNITZED REAGENT STRIP», каждый из которых тем самым в полном объеме включен посредством ссылки. На фиг. 1 и фиг. 2 показаны типичные тест-полоски/индикаторные полоски, применимые согласно вариантам реализации изобретения, описанным в настоящей заявке.

[0038] Автоматизированный прибор может содержать или может быть выполнен с возможностью размещения, например, в хранилище, одного или более держателей для полосок, при этом каждый держатель для полосок или штативы способны вмещать множество тест-полосок и, возможно, пробирки, например, пробирки для переноса образцов. Согласно типичным вариантам реализации изобретения тест-полоски расположены в одном или более держателях для полосок или штативах, которые установлены в автоматизированном приборе. Типичные держатели для полосок или штативы, применимые согласно вариантам реализации изобретения, предложенным в настоящей заявке, описаны, например, в публикации заявки на патент США №2009-0136386, хотя опытный специалист поймет, что можно использовать различные другие конфигурации держателей для полосок или штативов, подходящие для применения с автоматизированной системой, описанной в настоящей заявке. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения держатели для тест-полосок или штативы выполнены с возможностью размещения множества тест-полосок или индикаторных полосок, например, в разных рядах. Например, держатель для тест-полосок может содержать 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или более рядов, выполненных с возможностью размещения в любом место от 2 до 24 соответствующих тест-полосок или индикаторных полосок.

[0039] В способах, описанных в настоящей заявке, в зависимости от результатов первого теста, выполненного на пробе, проводят дополнительный тест. Если по результатам первого теста появляется необходимость выполнения дополнительного (последующего) теста, согласно способам, описанным в настоящей заявке, вторую (или остаточную) часть пробы, оставшуюся после первой процедуры исследования, автоматически переносят во второй сосуд, содержащий реактивы для дополнительного (последующего) теста. Автоматический перенос второй части пробы можно осуществить любым из нескольких способом. Например, согласно некоторым вариантам реализации изобретения сосуд, содержащий остаток или остаточную часть пробы после первого теста, можно перенести во вторую тест-полоску, после чего по меньшей мере часть пробы автоматически переносится в сосуд, содержащий реактивы для второго теста. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения вторую часть пробы автоматически переносят непосредственно из первой тест-полоски во вторую содержащую мастер-микс пробирку, установленную во второй тест-полоске. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения вторую часть пробы можно автоматически перенести непосредственно из первой тест-полоски во второй сосуд, расположенный в первой тест-полоске. Следует иметь в виду, что хотя некоторые варианты реализации изобретения описаны ниже более подробно, согласно способам, предложенным в настоящей заявке, можно реализовать любую подходящую методологию автоматического переноса раствора экстрагированных нуклеиновых кислот во вторую содержащую мастер-микс пробирку.

Перенос на новую тест-полоску

[0040] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения, применительно к каждой пробе, проба и сосуд или пробирка, содержащая реактивы для первого теста, расположены на одной тест-полоске, например, первой тест-полоске, и стадия автоматического переноса части пробы включает автоматический перенос второй части пробы во вторую содержащую мастер-микс пробирку, расположенную на второй отдельной тест-полоске.

[0041] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения первая и вторая тест-полоски расположены в отдельных держателях для полосок или штативах. В качестве одного неограничивающего примера, первые тест-полоски можно установить в рядах с 1 по 6 первого держателя для полосок и вторые тест-полоски можно установить в рядах с 1 по 6 второго держателя для полосок. Пример тест-полосок, расположенных в держателе для полосок, показан на фиг. 3.

[0042] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения первая и вторая тест-полоски расположены в одном и том же держателе для полосок. В качестве одного неограничивающего примера, первые тест-полоски устанавливают в рядах 1, 3, 5, 7, 9 и 11 и соответствующие вторые тест-полоски можно разместить в рядах 2, 4, 6, 8, 10 и 12 одного и того же держателя для полосок. В качестве еще одного неограничивающего примера, первые тест-полоски можно установить в рядах с 1 по 6 и соответствующие вторые тест-полоски можно установить в рядах с 7 по 12 одного и того же держателя для полосок. Следует иметь в виду, что можно использовать любую подходящую конфигурацию размещения первой и второй тест-полосок. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения в автоматизированном приборе на каждой тест-полоске можно использовать идентификационные знаки, такие как штриховой код, код радиочастотной идентификации (RFID) или т.п.для идентификации положения первой и/или второй тест-полоски. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения способ дополнительно включает стадию сравнения идентификационных знаков на тест-полоске, сосуде внутри тест-полоски или пробирке для образцов с набором аналитических специфических идентификационных данных, хранимых в приборе.

[0043] Таким образом, согласно некоторым вариантам реализации изобретения пользователь может выбрать одну или более первых тест-полосок для второго, дополнительного теста и перенести одну или более выбранных тест-полосок в новый штатив, содержащий вторые тест-полоски с сосудами, содержащими реактивы для второго, дополнительного теста. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения пользователь может выбрать одну или более первых тест-полосок для второго, дополнительного теста, и автоматизированный прибор или пользователь может перенести вторую часть пробы во вторую тест-полоску, расположенную во втором, отдельном держателе для тест-полосок или штативе. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения автоматизированный прибор может иметь доступ к идентификационным знакам на пробирках для образцов или тест-полосках, применяемых в первом тесте, и эту информацию можно использовать для отслеживания проб при их обработке во время второго или дополнительного теста. Соответственно, согласно некоторым вариантам реализации описанных выше способов перед переносом второй части пробы во второй сосуд способ может включать идентификацию подмножества из множества первых тест-полосок для дополнительного исследования, например, для второго теста; и для каждой первой тест-полоски в подмножестве, обеспечение соответствующей второй тест-полоски. Вторая тест-полоска может включать второй сосуд, содержащий реактивы для второго теста. Согласно некоторым вариантам реализации изобретения вторая тест-полоска может также содержать по меньшей мере один наконечник для пипетки.

Перенос на одну и ту же тест-полоску

[0044] Согласно некоторым вариантам реализации изобретения, применительно к каждой пробе, раствор пробы и первый сосуд, содержащий реактивы для первого теста, расположены на первой тест-полоске, и стадия перемещения части раствора экстрагированных нуклеиновых кислот включает перенос части раствора экстрагированных нуклеиновых кислот во второй сосуд, содержащий реактивы для второго теста, который тоже расположен на первой тест-полоске.

[0045] Согласно некоторым вариантам реализации описанных выше способов, перед переносом второй части пробы во второй сосуд способ может включа