Способ получения 6-о-альфа-d-глюкопиранозил-d-сорбита
Иллюстрации
Показать всеИзобретение относится к области биотехнологии и может быть использовано в пищевой промышленности. Для получения 6-O-α-D-глюкопиранозил-D-сорбита (1,6-GPS) изомальтулозу подают в реакционный раствор, содержащий фермент, обладающий способностью катализировать превращение изомальтулозы в 1,6-GPS, из которого выделяют целевой продукт после инкубации при температуре 20-40°С. До или во время инкубации в реакционный раствор добавляют восстановительные эквиваленты. Фермент выделяют посредством анионообменной и двух аффинных хроматографии из неочищенного экстракта микроорганизма рода Gluconobacter, содержащего ген фермента, обладающего способностью катализировать превращение изомальтулозы в 1,6-GPS. Получена нуклеиновая кислота, кодирующая фермент, обладающий способностью катализировать превращение изомальтулозы в 1,6-GPS. Вектор, содержащий данную нуклеиновую кислоту, предназначен для обеспечения экспрессии этого фермента в клетке-хозяине. Применение изобретения позволяет получить 6-О-α-D-глюкопиранозил-D-сорбит из изомальтулозы посредством одной единственной ферментативной реакции. 6 н. и 20 з.п. ф-лы, 2 ил., 1 табл.
Реферат
Изобретение относится к способу ферментативного получения 6-О-α-D-глюкопиранозил-D-сорбита (далее обозначенного 1,6-GPS) из изомальтулозы или сахарозы и средствам для проведения этого способа.
Известны способы получения 1,6-GPS из сахарозы, которые включают в себя ферментативное превращение сахарозы в изомальтулозу и затем химическое гидрирование полученной изомальтулозы до получения обоих стереоизомеров 1,6-GPS и 1-О-α-D-глюкопиранозил-D-маннит (далее обозначенный 1,1-GPM).
Из патента Германии DE 4414185 C1 известна сахарозоизомераза, которая катализирует превращение сахарозы в изомальтулозу.
Schiweck (alimenta 19 (1980), 5-16) описывает ферментативное превращение сахарозы в изомальтулозу и последующее гидрирование изомальтулозы на катализаторах, представляющих собой никель Ренея, с получением Palatinit® (также называемого изомальтом), почти эквимолярной смеси 1,6-GPS и 1,1-GPM. Эта публикация описывает получение изомальтулозы трансглюкозированием сахарозы с использованием Protaminobacter rubrum. Кроме того, описано, как полученная в присутствии катализаторов, представляющих собой никель Ренея, с использованием микроорганизмов изомальтулоза превращается посредством гидрирования в 1,6-GPS и 1,1-GPM и затем может быть обогащена кристаллизацией при упаривании и охлаждении.
Заявка DE 19701439 A1 описывает способ гидрирования изомальтулозы с использованием связанных с носителем никелевых катализаторов, при котором получают смесь 1,6-GPS и 1,1-GPM.
Заявка DE 19705664 A1 описывает способ получения обогащенных 1,6-GPS или 1,1-GPM смесей. В этой заявке раскрыт способ, при котором получают обогащенные 1,6-GPS и/или 1,1-GPM смеси из гидрированной изомальтулозы или из смесей, содержащих гидрированную изомальтулозу. С использованием этого способа можно получить чистый 1,6-GPS, концентрируя маточный щелок, обогащенный 1,6-GPS, при определенных условиях с последующей кристаллизацией охлаждением.
Заявка DE 19523008 A1 описывает способ получения 1,1-GPM и 1,6-GPS. Этот документ описывает, как при давлении ниже 50 атм использовать различные катализаторы таким образом, чтобы получить посредством гидрирования изомальтулозы смеси из 1,6-GPS и 1,1-GPM. Описанные катализаторы, на которых превращают изомальтулозу, содержат рутений, никель и их смеси.
Из Европейского патента ЕР 0625578 В1 известны способы получения 1,1-GPM- и 1,6-GPS-содержащих смесей сахароспиртов посредством ферментативной перегруппировки сахарозы в изомальтулозу и трегалулозу, а также последующего гидрирования до 1,1-GPM, 1,6-GPS и 1-O-α-глюкопиранозил-D-сорбита (1,1-GPS).
Способы известного уровня техники считаются невыгодными прежде всего по двум причинам. Во-первых, при помощи существовавших до сих пор способов можно получать только смеси из 1,6-GPS и 1,1-GPM, из которых затем посредством дорогостоящих химических и физических способов разделения можно выделить представляющее интерес вещество (1,6-GPS или 1,1-GPM). Во-вторых, невозможно проводить весь способ превращения сахарозы до желаемых продуктов в виде одной стадии способа. Таким образом, в известном уровне техники применяют очень сложные процессы для получения 1,6-GPS из сахарозы, причем приходится использовать различные физические, химические и биологические стадии процесса в различных реакторах. Для гидрирования изомальтулозы, согласно уровню техники, необходимы специальные реакторы гидрирования и технический водород. Существенный недостаток известного гидрирования изомальтулозы до 1,6-GPS и 1,1-GPM состоит, следовательно, в требующихся технических затратах. Часто для гидрирования требуется давление приблизительно от 50 до более 100 атм, что требует специальной аппаратуры. Поскольку полученные продукты, как правило, используются в пищевой промышленности, ход процесса должен быть, кроме того, выбран таким образом, чтобы никакой токсичный материал, например, катализаторы, не попадали в конечные продукты реакции гидрирования. Образующийся продукт является смесью основных компонентов 1,6-GPS и 1,1-GPM, из которой целевой продукт должен быть отделен при помощи химических и химико-физических способов очистки. Таким образом, для получения химически чистого 1,6-GPS или 1,1-GPM требуются после проведенного гидрирования дорогостоящие стадии обогащения и выделения. Выход на этих стадиях часто является неудовлетворительным.
Задача данного изобретения состоит в том, чтобы обеспечить способ и средства для его проведения, которые обеспечивают простое, экономически эффективное и селективное получение 1,6-GPS из изомальтулозы.
Согласно изобретению задача решается способом ферментативного получения 1,6-GPS из изомальтулозы, при котором изомальтулозу подают в водный реакционный раствор, содержащий единицу, имеющую сорбитолдегидрогеназную (SDH)-активность, инкубируют и извлекают 1,6-GPS из реакционного раствора. Таким образом, данное изобретение позволяет гидрировать изомальтулозу биохимически или ферментативно до 1,6-GPS с использованием имеющей SDH-активность единицы. Имеющая SDH-активность единица восстанавливает изомальтулозу специфически до 1,6-GPS. Имеющая SDH-активность единица отличается тем, что она способна превращать изомальтулозу или содержащие ее смеси ферментативно до 1,6-GPS или содержащих 1,6-GPS смесей. Преимущество ферментативного превращения изомальтулозы до 1,6-GPS заключается, наряду с простотой способа получения, в высокой реакционной, субстратной и стереоспецифичности, в однородности продукта реакции, в экономии энергии и сырья и в его экологической безопасности.
Таким образом, данным изобретением неожиданно показано, что посредством специфического ферментативного способа из изомальтулозы можно целенаправленно получать 1,6-GPS. В соответствии с данным изобретением в водный реакционный раствор, который содержит имеющую сорбитол-дегидрогеназную (SDH)-активность единицу, подают выделенную изомальтулозу и инкубируют до тех пор, пока не образуется 1,6-GPS и пока он не сможет быть извлечен из реакционного раствора с использованием обычных способов, например, кристаллизации.
Согласно изобретению, под водным реакционным раствором подразумевается незабуференная или забуференная обычными буферными системами вода, в которой в зависимости от исходных или целевых условий содержатся дополнительно добавки, такие как стабилизаторы, индикаторные системы, восстановительные эквиваленты, регенерирующие средства, компоненты питательной среды, соли, сахара, сахароспирты и т.д.
В предпочтительном варианте осуществления данного изобретения имеющей SDH-активность единицей является фермент сорбитолдегидрогеназа (SDH). Таким образом, для ферментативного превращения изомальтулозы в 1,6-GPS согласно изобретению единица с SDH-активностью, следовательно, фермент SDH может добавляться в очищенном, обогащенном и/или выделенном виде в реакционный раствор, причем этот фермент может быть, например, ферментом природного происхождения. Само собой разумеется, применяемый в соответствии с данным изобретением фермент SDH может быть согласно изобретению также рекомбинантно полученным ферментом SDH из модифицированного генной инженерией организма. Предпочтительно, применять выделенную SDH, если должны проводиться исследования кинетики превращения изомальтулозы до 1,6-GPS с целью оптимизации этой реакции. В частности, все вопросы, связанные с химическим равновесием реакции превращения изомальтулозы до 1,6-GPS, требуют выделения ферментов, так как в противном случае нельзя достаточно точно анализировать стехиометрию, константы диссоциации, ингибирование или активацию фермента, проблемы кооперативности, начальной скорости, конформации, лигандов и всех других проблем кинетики фермента и представляющих интерес данных по связыванию. Прежде всего, чтобы направленно влиять на реакцию, предпочтительно, чтобы имеющая SDH-активность единица находилась в выделенной форме, так как в противном случае не может быть исключено, что в результате взаимодействия с другими компонентами реакционного раствора результаты модификаций показателя рН, концентрации ионов и температуры являются невоспроизводимыми, так как очищенные, частично очищенные и связанные с клетками ферменты обнаруживают при аналитических исследованиях расходящиеся показатели.
Таким образом, данное изобретение относится к способу частичного или полного выделения SDH из микроорганизмов, в частности, микроорганизмов рода Gluconobacter, особенно предпочтительно вида Gluconobacter suboxidans, при котором на первой стадии микроорганизмы разрушают обычными способами и гомогенизируют до неочищенного экстракта, на второй стадии имеет место разделение неочищенного экстракта при помощи анионообменной хроматографии, на третьей стадии при помощи гель-фильтрации и на четвертой стадии при помощи аффинной хроматографии с красителем. Предпочтительно, согласно изобретению предусматривается, что полученный при помощи аффинной хроматографии с красителем частично очищенный фермент при помощи хроматофокусирования или в другой предпочтительной форме очищают дополнительной аффинной хроматографией с красителем с последующей аффинной элюцией по меньшей мере одним восстановительным эквивалентом до гомогенности.
В одном особенно предпочтительном варианте осуществления данное изобретение относится к способу выделения SDH из микроорганизма, при котором этот микроорганизм на первой стадии способа выделяют и гомогенизируют до неочищенного экстракта, на второй стадии способа полученный неочищенный экстракт подвергают анионообменной хроматографии, на третьей стадии способа первой аффинной хроматографии с красителем-лигандом и на четвертой стадии способа второй аффинной хроматографии с красителем-лигандом. В одном еще более предпочтительном варианте осуществления данное изобретение относится к вышеописанному способу, в котором после первой и до второй аффинной хроматографии с красителем-лигандом проводят ультрафильтрацию. В особенно предпочтительном варианте осуществления сразу же после вышеописанного способа, следовательно, после второй аффинной хроматографии с красителем-лигандом, проводят аффинную элюцию чистой SDH, причем для этого используют восстановительный эквивалент, в частности, NADH.
В следующем предпочтительном варианте осуществления имеющей SDH-активность единицей является SDH-содержащий инактивированный или живой микроорганизм или его неочищенный экстракт или гомогенат. Предпочтительно согласно изобретению превращение с инактивированными, особенно предпочтительно высушенными микроорганизмами происходит предпочтительно после повторной гидратации их в присутствии раствора SDH-фермента в соответствии со стандартными способами, например, с применением таннина и/или глутарового альдегида, и является предпочтительным, так как растворимый фермент в более высокой концентрации прочно окружает микроорганизм. Само собой разумеется, повторная гидратация может проводиться также водой или можно совершенно избежать повторной гидратации так, что инактивированные организмы вносят непосредственно в водный реакционный раствор. Согласно изобретению превращение изомальтулозы жизнеспособными микроорганизмами имеет, среди прочего, преимущество, заключающееся в том, что оно связано с относительно низкими расходами.
Биореакторы, в которых используют микроорганизмы, как правило, являются обычно применяемыми реакторами и требуют, в сравнении с химически-катализируемыми превращениями изомальтулозы в 1,6-GPS более низких расходов энергии и расходов на техническое обслуживание. Само собой разумеется, условия реакции (показатель рН, концентрация ионов, потребность в кислороде/диоксиде углерода, микроэлементы, температуры и т.п.) должны быть выбраны таким образом, чтобы микроорганизмы были способны к оптимальному превращению изомальтулозы в 1,6-GPS. При этих условиях SDH в естественной микросреде, следовательно, внутри клетки, может проявлять более высокую стабильность и эффективность, чем выделенный фермент. Кроме того, при подходящих условиях возможно размножение клеток и, следовательно, повышение концентрации SDH. В противоположность существующему уровню техники, согласно которому нужно использовать дорогостоящие катализаторы и технический водород, ферментативное превращение с использованием микроорганизмов имеет, следовательно, существенное преимущество, касающееся надежности, автоматизации и простоты, а также качества и выхода конечного продукта способа.
Согласно изобретению, предпочтительная форма выполнения изобретения предусматривает отделение или определенных клеточных компартментов или их частей друг от друга или их объединение друг с другом. Углеводные структуры, липиды или белки и/или пептиды, а также нуклеиновые кислоты, которые способны влиять на имеющую SDH-активность единицу или на фермент, могут таким образом объединяться или отделяться. Для целенаправленного исключения этого влияния или его использования, микроорганизмы выделяют из неочищенных экстрактов. Это может осуществляться посредством обработки ультразвуком, выдавливанием, гомогенизацией, смешиванием со стеклянными гранулами, посредством детергентов, с использованием электрических полей, механической обработки в жидком азоте или посредством ферментативного переваривания клеточных мембран и стенок. На следующей стадии в предпочтительной форме выполнения полученный экстракт можно центрифугировать для проведения превращения согласно изобретению с использованием супернатанта или осадка. Получение неочищенного экстракта имеет дополнительное преимущество, заключающееся в том, что посредством простого измерения экстинкции (оптической плотности) можно определять соотношение нуклеиновых кислот и фермента. При определенных условиях может быть необходимым отделение нуклеиновых кислот, так как нуклеиновые кислоты могут вступать в комплексы с имеющей SDH-активность единицей и таким образом снижать эффективность превращения изомальтулозы в 1,6-GPS. Получение неочищенного экстракта согласно изобретению включает в себя также все приемы способа, которые стабилизируют неочищенный экстракт или оптимизируют его каталитическое действие. К этим приемам могут относиться добавление протаминсульфата, хлорида марганца и лизоцима, а также изменение ионной силы и все меры, для модифицирования протеазной активности неочищенного экстракта данного изобретения таким образом, что имеющая SDH-активность единица стабилизируется и оптимизируется в своем действии.
В следующем предпочтительном варианте осуществления SDH-содержащий микроорганизм или организм, из которого происходит полностью или частично очищенная SDH, является организмом рода Gluconobacter, в частности, Gluconobacter suboxidans, особенно предпочтительно Gluconobacter suboxidans DSM 2003. В частности, в особенно предпочтительной комбинации данного изобретения с регенерирующей системой с коферментом SDH/FDH (формиатдегидрогеназа) можно достичь с указанными штаммами очень хорошего выхода 1,6-GPS. Однако, это ферментативное превращение микроорганизмами отнюдь не ограничивается этими обоими штаммами. Все организмы, в частности, микроорганизмы, которые в состоянии превращать изомальтулозу в 1,6-GPS, могут применяться в соответствии с данным изобретением, например, также грибы, дрожжи, клеточные культуры и т.д. К ним могут быть причислены мутанты, измененные генной инженерией модификации вышеуказанных организмов, например, организмы, которые в результате введения SDH-кодирующей нуклеотидной последовательности обнаруживают SDH-активность. Предпочтительными являются организмы, которые обнаруживают также сахарозомутазную активность, так что с использованием одного единственного типа организма сахароза может превращаться в 1,6-GPS.
В следующем предпочтительном варианте осуществления имеющие SDH-активность единицы, в частности, микроорганизмы, неочищенные экстракты, их части и/или обогащенные или выделенные ферменты, являются иммобилизованными. Посредством иммобилизации ферменты, клеточные органеллы и клетки переводятся в нерастворимое и пространственно ограниченное в отношении реакции состояние. Согласно изобретению имеющую SDH-активность единицу данного изобретения иммобилизуют в условиях, в которых она по возможности обнаруживает высокие ферментативные активности SDH. В соответствии с данным изобретением предусматривается также включение жизнеспособных клеток в полимеры. Иммобилизацию можно проводить (i) связыванием, а также (ii) включением. При иммобилизации посредством связывания имеющей SDH-активность единицы имеет место связывание с носителем (ионное или ковалентное) и образование поперечных связей (сшивка друг с другом или сшивка с другими полимерами). При иммобилизации посредством включения имеющей SDH-активность единицы предусматривается включение в гель-структуры (глобулы, волокна и т.п.) и в мембраны (микрокапсулы и мембранные реакторы). Таким образом, под иммобилизацией подразумевают все способы, которые служат для ограничения подвижности и растворения имеющей SDH-активность единицы биологическим, химическим или физическим путем. Это, в частности, может происходить посредством адсорбции на инертных или электрически заряженных, неорганических или органических носителях, причем неорганическими материалами являются, например, пористые стекла, силикагель, оксид алюминия и гидроксиапатит или оксиды металлов; природными полимерами могут быть, например, целлюлоза, крахмал, декстран или агароза, а синтетическими полимерами могут быть полиакриламид, поливиниловый спирт, найлон или другие. Данным изобретением предусматривается также включение имеющей SDH-активность единицы в трехмерную сетчатую структуру; в одном варианте изобретения это может быть желатин или агар. Далее, можно предусмотреть иммобилизацию посредством поперечного сшивания с бифункциональными агентами, такими как глутаровый альдегид или бензидин. Возможно также микроинкапсулирование имеющей SDH-активность единицы, которое приводит к локализации пространства реакции при помощи искусственных или биологических мембран. Данное изобретение включает в себя также иммобилизацию без носителей посредством флокуляции и «сшивки», а также одновременную иммобилизацию живых и/или инактивированных клеток со свободными или иммобилизованными ферментами. Увеличение молекулярной массы, например, связыванием с декстраном, согласно изобретению также служит иммобилизации. В случае иммобилизованного фермента речь может идти о ферменте, который связан в компартменте микроорганизма или в полученном в полном виде жизнеспособном или высушенном микроорганизме, но согласно изобретению термин «иммобилизованный» может также обозначать, что фермент один или фермент в соединении с компартментами организма связан с носителем. Важно то, что загруженный матрикс может приходить в соприкосновение с изомальтулозой таким образом, что протекает желаемая ферментативная реакция до 1,6-GPS. Однако, само собой разумеется, что данное изобретение относится также к указанной имеющей SDH-активность единице в свободной, т.е. в неиммобилизованной форме.
В следующем предпочтительном варианте осуществления ферментативное превращение в соответствии с данным изобретением проводят с регулированием рН или без регулирования рН. В частности, поскольку в особенно предпочтительном варианте осуществления используют восстановительные эквиваленты в форме переносчиков водорода, выбор рН влияет на равновесие химической реакции, а также на общий выход 1,6-GPS. Таким образом, ферментативное превращение изомальтулозы в 1,6-GPS может подразделяться на реакции, при которых не происходит регулирования значения рН, и реакции, при которых регулируется значение рН. Регулирование рН может происходить добавлением или удалением веществ, которые способны повышать, понижать или стабилизировать показатель рН. Согласно изобретению, могут использоваться кислоты или основания согласно определению Lowry-Brönsted или Lewis-Pearson, при этом протоны, ионы гидроксония, гидроксидные ионы или свободные пары электронов могут отщепляться и тем самым поступать в среду или присоединяться. Например, можно предусмотреть газацию водного реакционного раствора CO2, которое в виде введения кислоты является мерой регулирования показателя рН. Предпочтительно, можно стремиться к тому, чтобы показатель рН был установлен в диапазоне, который считается оптимальным для активности фермента. Этот оптимум рН может быть установлен с использованием различных буферов или добавлением понижающих или повышающих показатель рН веществ. Однако, в целом регулирование показателя рН отнюдь не ограничивается химическими способами, такими как, например, процессы комплексообразования, титрования или т.п. Любое вмешательство в систему, которое приводит к тому, что показатель рН каким-либо образом регулируется или стабилизируется, относится согласно изобретению к регулированию показателя рН. В предпочтительном варианте осуществления данного изобретения показатель рН водного реакционного раствора составляет, например, 6,0-8,0, предпочтительно рН 7,0.
В предпочтительном варианте осуществления данного изобретения к водному реакционному раствору, наряду с имеющей SDH-активность единицей, добавляют также восстановительные эквиваленты, в частности, в том случае, если применяют очищенную или выделенную сорбитолдегидрогеназу (SDH). Восстановительными эквивалентами согласно изобретению являются переносчики водорода или носители электрона, которые могут существовать в форме коферментов или простетических групп. Такими восстановительными эквивалентами могут быть, например, NAD+/NADH, NAPD+/NADPH, FMN/FMNH2 или FAD/FADH2. Коферменты и простетические группы окислительно-восстановительных реакций служат в качестве диссоциируемых и/или прочно связанных с белками переносчиков водорода и/или переносчиков электрона. Однако в качестве восстановительных эквивалентов могут также служить другие коферменты/простетические группы, которые способны переносить атомы водорода или электроны. Согласно изобретению, предпочтительными являются, в частности, циклические тетрапирролы, глутатион, липоевая кислота, хиноны, железо-серусодержащие белки, флавопротеины, флавиннуклеотиды и другие, которые во время ферментативного катализа могут переносить протоны, атомы и/или электроны или функциональные группы.
Предпочтительно, для ферментативного получения 1,6-GPS используют живые имеющие SDH-активность клетки, так что добавление восстановительных эквивалентов является излишним.
В следующем особенно предпочтительном варианте осуществления ферментативное превращение изомальтулозы в 1,6-GPS происходит в присутствии регенерирующих агентов, таких как формиатдегидрогеназа (FDH) и/или формиат, в частности, в том случае, если применяют очищенную или выделенную сорбитолдегидрогеназу (SDH). Посредством добавления SDH и FDH в водный реакционный раствор возможна химическая реакция, во время которой формиат все время превращается в CO2, а изомальтулоза в 1,6-GPS. Превращение формиата в СО2 происходит через FDH. Поглощаемые при этом окислении атомы водорода от присутствующего в реакционном растворе восстановителя, например, NAD+, используются при параллельно протекаемом восстановлении изомальтулозы в 1,6-GPS. Само собой разумеется, могут рассматриваться вместо FDH также совершенно другие дегидрогеназы или ферменты с другими субстратными специфичностями в качестве кофермента этой регенерирующей системы, следовательно, в качестве регенерирующих агентов. Например, другие карбоновые кислоты или их соли применимы в качестве регенерирующих агентов. Важно, чтобы добавляемые вещества, в частности, FDH/формиат, могли реагировать с переносчиками водорода, коферментами или простетическими группами с тем, чтобы электроны и/или атомы водорода переносились так, чтобы возможным было непрерывное образование 1,6-GPS. В случае применения живых клеток в качестве имеющей SDH-активность единицы можно опустить добавление регенерирующего агента и восстановительных эквивалентов.
В следующем особенно предпочтительном варианте осуществления происходт превращение изомальтулозы в 1,6-GPS в виде непрерывного способа. Непрерывный способ данного изобретения проводится в проточном реакторе, в котором имеет место микробный рост и, следовательно, образование продукта, синтез 1,6-GPS. Таким образом могут быть получены очень большие количества 1,6-GPS. Посредством применения непрерывного способа циклы очистки и подготовки выбираются свободно и не устанавливаются заранее параметрами конкретных ферментеров или определенными физиологическими свойствами микроорганизмов, так как в системах непрерывного действия окружающая микроорганизмы среда не изменяется потребляемым субстратом и возникающими продуктами, потому что эти продукты постоянно отводятся, а субстраты постоянно добавляются. Кроме того, биореакторы или установки в непрерывном способе могут быть выполнены конструктивно гораздо меньшими и не требующими больших затрат. Под непрерывным способом согласно изобретению понимают также все дополнительные меры, которые служат для уменьшения опасности инфекции другими организмами, которые могут быстро распространяться в системе через затвор введения субстрата. Они могут включать в себя стерильные, а также нестерильные условия. Данное изобретение относится также к мероприятиям и средствам способа, которые обеспечивают непрерывную ферментацию посредством экстремальных условий таким образом, чтобы она была стабильной против возможных инфекций благодаря выбранным экстремальным условиям (например, забуферивание при очень низком рН или применение антибиотиков). При этом могут применяться вариации или модификации вышеуказанных имеющих SDH-активность единиц, которые приспособлены к этим направленным против инфекции условиям, например, устойчивых к антибиотикам микроорганизмов. Однако, под непрерывным способом согласно изобретению может подразумеваться также любая система растущих клеток и катализирующих ферментов, к которой, с одной стороны, подается питательный раствор, а, с другой стороны, культуральный раствор, в том числе ферментативно образованный 1,6-GPS, отводятся; при этом речь может идти о гомогенных, а также негомогенных системах.
Данное изобретение относится, само собой разумеется, также к полунепрерывному или периодическому режимам способа.
В следующем предпочтительном варианте осуществления изомальтулозу, которая является исходным веществом для реакции превращения до 1,6-GPS, получают ферментативным превращением сахарозы. Применяемая в способе данного изобретения изомальтулоза может быть получена ферментативным превращением (трансгликозированием) с использованием очищенных или обогащенных ферментов, исходных экстрактов или микроорганизмов из сахарозы, которые обнаруживают сахарозомутазную активность. Под сахарозомутазой согласно изобретению имеют в виду фермент, который способен к изомеризации сахарозы до изомальтулозы и также известен как сахарозоизомераза.
Примерами клеток, которые содержат нуклеотидные последовательности, кодирующие белок с сахарозомутазной активностью, являются, в частности, микроорганизмы родов Protaminobacter, Erwinia, Serratia, Leuconostoc, Pseudomonas, Agrobacterium, Klebsiella и Enterobacter. Конкретными примерами таких микроорганизмов являются Protaminobacter rubrum (CBS 547.77), Erwinia rhapontici (NCPPB 1578), Serratia plymuthica (ATCC 15928), Serratia marcescens (NCIB 8285), Leuconostoc mesenteroides NRRL B-521f (ATCC 10830a), Pseudomonas mesoacidophila MX-45 (FERM 11808 или FERM BP 3619), Agrobacterium radiobacter MX-232 (FERM 12397 или FERM BP 3620), Klebsiella subspecies и Enterobacter species.
Конкретные примеры белков с сахарозомутазной активностью и кодирующих их нуклеиновых кислот из Р. rubrum, E. rhapontici, Enterobacter spec. SZ62 и Р. mesoacidophila описаны в РСТ/ЕР 95/00165.
Описанные клетки или белки или нуклеотидные последовательности из этих клеток могут применяться вместе с имеющей SDH-активность единицей данного изобретения для получения 1,6-GPS из сахарозы, например, посредством введения SDH-кодирующих нуклеотидных последовательностей под контролем регуляторных элементов в вышеуказанные клетки и их экспрессии.
В одном особенно предпочтительном варианте осуществления ферментативное превращение сахарозы в изомальтулозу проводят предпочтительно с использованием иммобилизованных клеток Р. rubrum (Protaminobacter rubrum) или продукта расщепления клеток или неочищенного экстракта Р. rubrum или полностью очищенной сахарозомутазы. Это превращение происходит в реакционном растворе предпочтительно вместе с SDH-зависимым превращением изомальтулозы до 1,6-GPS.
Ферментативная перегруппировка сахарозы в изомальтулозу описана, например, в заявке Германии DE 19523560 A1 или патенте Германии DE 4414185 С1, которые в отношении описанных там микроорганизмов, последовательностей ДНК, ферментов и способа получения изомальтулозы ферментативным превращением из сахарозы полностью включены в объем данной заявки.
Иммобилизация имеющих сахарозомутазу клеток, например, Р. rubrum, из продуктов расщепления клеток микроорганизма или выделенного фермента (сахарозомутазы) служит для ограничения подвижности и растворимости используемых биокатализаторов биологическим, химическим и/или физическим путем. Иммобилизация в соответствии с изобретением может проводиться различными способами, такими как, например, связывание биокатализаторов друг с другом или с носителями, фиксированием в сетчатой структуре полимерного матрикса или окружением искусственными или природными мембранами, что, разумеется, включает в себя применение инверсных мицелл. Посредством иммобилизации клеток, продуктов разрушения клеток или/и сахарозомутазы полученные таким образом биокатализаторы становятся не только пригодными для повторного использования, но прежде всего они могут после или во время этого процесса легко отделяться для замены их в случае необходимости другими катализаторами, которые катализируют другие реакции, такие как превращение изомальтулозы в 1,6-GPS. Существенным преимуществом является то, что клетки или ферменты посредством иммобилизации могут использоваться в значительно более высоких локальных концентрациях и прежде всего в непрерывных проточных системах. Иммобилизация может при этом происходить на керамических носителях, на полимерах, на различных гелях и желатине, посредством включения в полиакриламид или другими способами.
В следующем предпочтительном варианте осуществления происходит превращение сахарозы в изомальтулозу и изомальтулозы в 1,6-GPS в одной единственной стадии, то есть обе ферментативные реакции превращения протекают одновременно, в случае необходимости, слегка смещенные во времени в одном и том же водном реакционном растворе. Превращение сахарозы в 1,6-GPS может поэтому происходить на одной стадии способа, так как обе отдельные реакции превращения могут протекать ферментативно при одинаковых или сходных условиях способа.
В одном особенно предпочтительном варианте осуществления превращение сахарозы в 1,6-GPS происходит в одном единственном биореакторе (так называемая "реакция в одном сосуде").
Эти формы выполнения изобретения включают в себя прямое ферментативное получение 1,6-GPS из сахарозы, при котором как для превращения сахарозы в изомальтулозу, так и для превращения изомальтулозы в 1,6-GPS могут использоваться указанные выше неиммобилизованные и иммобилизованные клетки, неочищенные экстракты и/или ферменты, которые обнаруживают в каждом отдельном случае сорбитолдегидрогеназную (SDH) и сахарозомутазную активности.
Согласно изобретению превращение возможно также путем периодической ферментации и/или периодической ферментации с подачей питательной среды (прерываемой ферментации), при которой питательную среду подают в определенный момент времени и ферментацию заканчивают после потребления лимитирующего субстрата, которым могут быть, например, сахароза, другие субстраты или ферменты/коферменты, или в другой подходящий момент времени. Однако, условия реакции могут быть выбраны таким образом, что лимитирующее влияние субстрата в значительной степени будет исключено. Периодические реакции могут проводиться в так называемой закрытой системе. Эти системы, согласно данному изобретению, понимают как закрытые системы, если к закрытой жидкой фазе непрерывно подается кислород, воздух или другой газ или смесь газов. В периодическом способе окружение клеток постоянно изменяется, так как может происходить уменьшение субстрата и, среди прочего, увеличение 1,6-GPS и при некоторых обстоятельствах также увеличение концентрации клеток. Вышеуказанный "способ в одном сосуде" может проводиться согласно данному изобретению также при сохранении равновесного потока - при постоянном отводе 1,6-GPS в виде непрерывного ферментативного катализа.
В следующем предпочтительном варианте осуществления температура водного реакционного раствора при ферментативном превращении составляет 20°С-40°С, в частности, 25°С. При температуре 25°С очищенная SDH обнаруживает стабильность приблизительно в течение одной недели. Таким образом, температура в этом диапазоне являются пригодной для проведения долгосрочного катализируемого ферментом способа.
В следующем предпочтительном варианте осуществления данное изобретение относится к получению 1,6-GPS из сахарозы, при котором сахароза сначала ферментативно превращается в изомальтулозу и после этого изомальтулоза ферментативно превращается в 1,6-GPS. Этот общий процесс может протекать непрерывно, полунепрерывно или прерываемо, в виде одной или в виде нескольких стадий способа и в одном или нескольких биореакторах.
Данное изобретение относится также к молекуле нуклеиновой кислоты, кодирующей фермент с активностью сорбитолдегидрогеназы (SDH), выбранной из группы, состоящей из
a) молекул нуклеиновых кислот, которые кодируют белок, имеющий представленную в SEQ ID NO: 1 аминокислотную последовательность или комплементарную ей цепь;
b) молекул нуклеиновых кислот, которые включают представленную в SEQ ID NO: 2 нуклеотидную последовательность или комплементарную ей цепь;
c) молекул нуклеиновых кислот, которые гибридизуются с указанной в а) или в b) молекулой нуклеиновой кислоты;
d) молекул нуклеиновых кислот, нуклеотидная последовательность которых вследствие вырожденности генетического кода отличается от последовательности указанных в b) или с) молекул нуклеиновых кислот.
Согласно изобретению под ферментом с сорбитолдегидрогеназной активностью понимают белок или пептид, который способен катализировать превращение изомальтулозы в 1,6-GPS. При этом превращаемая изомальтулоза может образовываться из ферментативного превращения сахарозы.
Молекулы нуклеиновых кислот согласно изобретению могут быть выделены из природных источников, преимущественно из Gluconobacter spec., или они могут быть синтезированы известными способами. При помощи общепринятых способов можно ввести разнообразные мутации в молекулы нуклеиновых кислот данного изобретения, благодаря чему возможен синтез ферментов с возможно измененными биологическими свойствами, которые также включены в данное изобретение. Мутации согласно изобретению относятся также ко всем делеционным мутациям, которые приводят к образованию укороченных ферментов. Посредством других молекулярных механизмов, таких как инсерции, удвоения, транспозиции, генные слияния, обмен нуклеотидами, а также перенос генов между различными штаммами микроорганизмов и другие, можно, например, получить модификации ферментативной активности и/или регуляцию фермента. Таким путем могут быть получены, например, мутантные ферменты, которые имеют измененный показатель Кm, Ki или Ка и/или обычно уже не подчиняются или подчиняются в измененной форме обычно существующим в клетках регуляторным механизмам. Далее, могут быть получены согласно изобретению мутантные ферменты, которые имеют измененные стабильность, субстратную специфичность, специфичность продукта или измененный спектр эффекторов или модифицированный профиль активности, температуры, показателя рН и/или концентрации. Кроме того, изобретение относится к ферментам, которые имеют измененную активную концентрацию ферментов, модифицированную структуру субъединиц, пред- или посттрансляционные модификации, например, сигнальных и/или транспортных пепт