Новая композиция и способы лечения связанных с иммунитетом заболеваний

Новая композиция и способы лечения связанных с иммунитетом заболеваний

Иллюстрации

Показать все

Реферат

Область изобретения

Настоящее изобретение относится к композициям и способам, применимым для диагностики и лечения связанных с иммунитетом заболеваний.

Предпосылки изобретения

Связанные с иммунитетом и воспалительные заболевания представляют собой проявление или следствие достаточно сложных, часто многократно взаимосвязанных биологических путей, которые в нормальной физиологии являются критическими для ответа на поражение или травму, инициируют восстановление после поражения или травмы и устанавливают врожденную и приобретенную защиту против чужеродных организмов. Заболевание или патология возникают, когда эти нормальные физиологические пути вызывают дополнительное поражение или травму либо напрямую связанные с интенсивностью ответа, либо как следствие аномальной регуляции или избыточной стимуляции, либо как реакцию на «свое», либо как сочетание этих механизмов.

Хотя возникновение данных заболеваний часто вовлекает многоступенчатые пути, а часто - множество различных биологических систем/путей, вмешательство в критических точках в один или несколько из этих путей может вызывать улучшение или терапевтический эффект. Терапевтическое вмешательство может происходить посредством антагонизма вредоносному процессу/пути или посредством стимуляции благоприятного процесса/пути.

Известно много связанных с иммунитетом заболеваний, и их интенсивно изучают. Такие заболевания включают в себя иммуноопосредованные воспалительные заболевания, неиммуноопосредованные воспалительные заболевания, инфекционные заболевания, иммунодефицитные заболевания, неоплазию, и т.д.

T-лимфоциты (T-клетки) являются важным компонентом иммунного ответа млекопитающих. T-клетки узнают антигены, связанные с молекулой собственного организма, кодируемой генами главного комплекса гистосовместимости (MHC). Антиген может быть представлен вместе с молекулами MHC на поверхности антигенпредставляющих клеток, инфицированных вирусом клеток, раковых клеток, трансплантатов и т.д. Система T-клеток уничтожает эти измененные клетки, которые представляют угрозу здоровью млекопитающего-хозяина. T-клетки включают в себя хелперные T-клетки и цитотоксические T-клетки. Хелперные T-клетки экстенсивно пролиферируют после узнавания комплекса антиген-MHC на антигенпредставляющих клетках. Хелперные T-клетки также секретируют множество цитокинов, т.е. лимфокинов, играющих центральную роль в активации B-клеток, цитотоксических T-клеток и множества других клеток, участвующих в иммунном ответе.

Связанные с иммунитетом заболевания можно лечить подавлением иммунного ответа. Использование нейтрализующих антител, ингибирующих молекулы, обладающие иммуностимулирующей активностью, было бы выгодно при лечении иммуноопосредованных и воспалительных заболеваний. Можно использовать молекулы, подавляющие иммунный ответ (непосредственно белки или опосредованно используя антитела-агонисты) для подавления иммунного ответа и, таким образом, облегчения иммуноопосредованного заболевания.

Известно, что CD4+ T-клетки являются важными регуляторами воспаления. Здесь активировали CD4+ T-клетки и анализировали профиль генов, дифференциально экспрессирующихся при активации. Собственно специфические для активации гены могут представлять собой потенциальные терапевтические мишени. Костимуляция in vivo необходима для продуктивного иммунопролиферативного ответа. Список костимулирующих молекул достаточно обширный, и до сих пор не ясно даже, какие костимулирующие молекулы играют критические роли при различных типах и стадиях воспаления.

Термин воспалительное заболевание кишечника («IBD») означает группу хронических воспалительных расстройств с неизвестными причинами, при которых кишечник (пищеварительный тракт) становится воспаленным, часто вызывающими спазмы или диарею. Распространение IBD в США оценивают приблизительно составляющим 200 на 100000 популяции. Пациентов с IBD можно разделить на две главные группы: пациентов с язвенным колитом («UC») и пациентов с болезнью Крона («CD»).

У пациентов с UC присутствует воспалительная реакция, первоначально вовлекающая слизистую оболочку толстой кишки. Воспаление, как правило, является однородным и непрерывным без промежуточных областей нормальной слизистой. Поверхностные клетки слизистой оболочки, так же как и эпителий крипты и подслизистой оболочки, вовлечены в воспалительную реакцию с инфильтрацией нейтрофилов. В конечном счете эта ситуация, как правило, прогрессирует до разрушения эпителия с потерей эпителиальных клеток, приводя к множественным изъязвлениям, фиброзу, дисплазии и продольной ретракции толстой кишки.

CD отличается от UC тем, что воспаление распространяется через все слои стенки кишечника и вовлекает брыжейку, так же как лимфатические узлы. CD может поражать любую часть пищеварительного тракта, от рта до ануса. Заболевание часто является периодическим, т.е. отрезки тяжелого заболевания кишечника разделены областями, кажущимися свободными от заболевания. При CD стенка кишечника также утолщается, что может привести к обструкциям. Кроме того, нередки фистулы и трещины.

Клинически IBD характеризуется разнообразными проявлениями, часто приводящими к хроническому, непредсказуемому течению. Геморрагический понос и боль в животе часто сопровождаются лихорадкой и потерей веса. Нередка анемия, так как это тяжелое истощение. Часто с IBD связаны суставные манифестации, лежащие в диапазоне от артралгии до острого артрита, та кже как и патологии функции почек. Пациенты с IBD подвержены также увеличенному риску карцином толстой кишки по сравнению с общей популяцией. Во время острых «приступов» IBD работа и другая нормальная активность обычно невозможны, и часто пациента госпитализируют.

Хотя причина IBD остается неизвестной, вовлечены несколько факторов, таких как генетическая, инфекционная и иммунологическая предрасположенность. IBD является наиболее распространенным у европеоидов, особенно у европеоидов еврейского происхождения. Хроническая воспалительная природа состояния побуждает к интенсивному поиску возможной инфекционной причины. Хотя обнаружены агенты, стимулирующие острое воспаление, ни для одного из них не показана инициация хронического воспаления, связанного с IBD. Гипотеза, что IBD представляет собой аутоиммунное заболевание, поддерживается упомянутым ранее внекишечной манифестацией IBD, например артритом суставов, и известным положительным ответом IBD на лечение такими терапевтическими средствами, как адренальные глюкокортикоиды, циклоспорин и азатиоприн, известные как подавляющие иммунный ответ. Кроме того, ЖК-тракт больше любого другого органа организма постоянно подвергается воздействию потенциальных антигенных веществ, таких как белки из пищи, побочные продукты бактерий (LPS) и т.д.

Кроме того, риск рака толстой кишки сильно повышен у пациентов с тяжелым язвенным колитом, особенно если заболевание существовало несколько лет. Приблизительно 20-25% пациентов с IBD в конечном счете нуждаются в операции по удалению толстой кишки из-за обширного кровотечения, хронического истощающего заболевания, прободения толстой кишки или риска рака. Операцию также иногда проводят, когда другие формы медицинского лечения неэффективны или когда побочные эффекты стероидов или других лекарственных средств угрожают здоровью пациента. Поскольку операция является инвазивной и существенно изменяющей жизнь, она является не очень желательной схемой лечения и, как правило, является последним средством лечения. Чтобы лучше понять это заболевание и, возможно, лечить его, экспериментально определили, регуляция какого гена повышена как при CD, так и при UC по сравнению с нормальной тканью.

Несмотря на вышеуказанный прогресс в исследовании иммунного расстройства существует большая потребность в дополнительных диагностических и терапевтических средствах, способных детектировать присутствие иммунных расстройств у млекопитающих и эффективно уменьшать эти расстройства. Соответственно целью настоящего изобретения является идентификация и характеризация полипептида, сверхэкспрессируемого в различных иммунных клетках, вовлеченных в различные иммунные расстройства, и применение указанного полипептида и кодирующих его нуклеиновых кислот для получения смеси химически связанных веществ, применимой в терапевтическом лечении и диагностической детекции иммунных расстройств у млекопитающих.

СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ

A. Варианты осуществления

Настоящее изобретение относится к композициям и способам, применимым для диагностики и лечения связанного с иммунитетом заболевания у млекопитающих, включая человека. Настоящее изобретение основано на идентификации белков (включая антитела-агонисты и антагонисты), которые появляются в результате стимуляции иммунного ответа у млекопитающих. Связанные с иммунитетом заболевания можно лечить подавлением или усилением иммунного ответа. Молекулы, усиливающие иммунный ответ, стимулируют или усиливают иммунный ответ на антиген. Молекулы, стимулирующие иммунный ответ, можно применять терапевтически, когда усиление иммунного ответа является благоприятным. Альтернативно молекулы, подавляющие иммунный ответ, ослабляют или уменьшают иммунный ответ на антиген (например, нейтрализующие антитела), можно применять терапевтически, когда ослабление иммунного ответа является благоприятным (например, воспаление). Соответственно полипептиды PRO87299, их агонисты и антагонисты также применимы для получения лекарственных средств и медикаментов для лечения связанных с иммунитетом и воспалительных заболеваний. В конкретном аспекте такие лекарственные средства и медикаменты содержат терапевтически эффективное количество полипептида PRO87299, его агониста или антагониста с фармацевтически приемлемым носителем. Предпочтительно смесь является стерильной.

В дополнительном варианте осуществления изобретение относится к способу идентификации агонистов или антагонистов полипептида PRO87299, включающему контакт полипептида PRO87299 с молекулой-кандидатом и мониторирование биологической активности, опосредованной указанным полипептидом PRO87299. Предпочтительно полипептид PRO87299 представляет собой природную последовательность полипептида PRO87299. В конкретном аспекте агонист или антагонист PRO87299 представляет собой анти-PRO87299 антитело.

В другом варианте осуществления изобретение относится к смеси химически связанных веществ, содержащей полипептид PRO87299 или антитело-агонист или антагонист, связывающее полипептид, в смеси с носителем или наполнителем. В одном из аспектов композиция содержит терапевтически эффективное количество полипептида или антитела. В другом аспекте, где композиция содержит иммуностимулирующую молекулу, композиция является применимой для: (a) увеличения инфильтрации воспалительных клеток в ткань нуждающегося в этом млекопитающего, (b) стимуляции или усиления иммунного ответа у нуждающегося в этом млекопитающего, (c) увеличения пролиферации иммунных клеток в ответ на антиген у нуждающегося в этом млекопитающего, (d) стимуляции активности иммунных клеток или (e) увеличения проницаемости сосудов. В дополнительном аспекте, когда композиция содержит иммуноподавляющую молекулу, композиция является применимой для: (a) уменьшения инфильтрации воспалительных клеток в ткань нуждающегося в этом млекопитающего, (b) подавления или уменьшения иммунного ответа у нуждающегося в этом млекопитающего, (c) уменьшения активности иммунных клеток или (d) уменьшения пролиферации иммунных клеток в ответ на антиген у нуждающегося в этом млекопитающего. В другом аспекте композиция содержит дополнительный активный ингредиент, который может являться, например, дополнительным антителом или цитотоксическим или химиотерапевтическим средством. Предпочтительно композиция является стерильной.

В другом варианте осуществления изобретение относится к способу лечения связанного с иммунитетом расстройства у нуждающегося в этом млекопитающего, включающему введение млекопитающему эффективного количества полипептида PRO87299, его агониста или его антагониста. В предпочтительном аспекте связанное с иммунитетом расстройство выбрано из группы, состоящей из: системной красной волчанки, ревматоидного артрита, остеоартрита, ювенильного хронического артрита, спондилоартропатий, системного склероза, идиопатических воспалительных миопатий, синдрома Шегрена, системного васкулита, саркоидоза, аутоиммунной гемолитической анемии, аутоиммунной тромбоцитопении, тиреоидита, сахарного диабета, иммуноопосредованного заболевания почек, демиелинизирующих заболеваний центральной и периферической нервных систем, таких как рассеянный склероз, идиопатическая демиелинизирующая полиневропатия, или синдром Гийена-Барре, и хроническая воспалительная демиелинизирующая полиневропатия, гепатобилиарных заболеваний, таких как инфекционный, аутоиммунный хронический активный гепатит, первичный биллиарный цирроз, гранулематозный гепатит и склерозирующий холангит, воспалительного заболевания кишечника, глютензависимой энтеропатии и болезни Уиппла, аутоиммунных или иммуноопосредованных заболеваний кожи, полиморфной эритемы и контактного дерматита, псориаза, аллергических заболеваний, таких как астма, аллергический ринит, атопический дерматит, гиперчувствительность к пище и уртикария, иммунологических заболеваний легкого, таких как эозинофильные пневмонии, идиопатический фиброз легких и гиперчувствительный пневмонит, связанных с трансплантацией заболеваний, включая отторжение трансплантата и реакцию «трансплантат против хозяина».

В другом варианте осуществления изобретение относится к антителу, специфически связывающемуся с любым из описанных выше или ниже полипептидов. Не обязательно, антитело представляет собой моноклональное антитело, гуманизированное антитело, фрагмент антитела или одноцепочечное антитело. В одном из аспектов настоящее изобретение относится к выделенному антителу, связывающему полипептид PRO87299. В другом аспекте антитело мимикрирует активность полипептида PRO87299 (антитело-агонист) или, напротив, антитело ингибирует или нейтрализует активность полипептида PRO87299 (антитело-антагонист). В другом аспекте антитело представляет собой моноклональное антитело, предпочтительно обладающее не относящимися к человеку остатками определяющей комплементарность области (CDR) и относящимися к человеку остатками каркасной области (FR). Антитело может являться меченым и может являться иммобилизованным на твердой подложке. В дополнительном аспекте антитело представляет собой фрагмент антитела, моноклональное антитело, одноцепочечное антитело или антиидиотипическое антитело.

В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к композиции, содержащей анти-PRO87299 антитело в смеси с фармацевтически приемлемым носителем. В одном из аспектов композиция содержит терапевтически эффективное количество антитела. Предпочтительно композиция является стерильной. Композицию можно вводить в форме жидкого фармацевтического состава, который можно консервировать для достижения увеличенной стабильности при хранении. Альтернативно антитело представляет собой моноклональное антитело, фрагмент антитела, гуманизированное антитело или одноцепочечное антитело.

В дополнительном варианте осуществления изобретение относится к изделию, содержащему:

(a) смесь химически связанных веществ, содержащую полипептид PRO87299 или его агонист или антагонист;

(b) контейнер, содержащий указанную композицию; и

(c) ярлык, прикрепленный к указанному контейнеру, или вкладыш в упаковку, содержащийся в указанном контейнере, относящиеся к применению указанного полипептида PRO87299 или его агониста или антагониста в лечении связанного с иммунитетом заболевания. Композиция может содержать терапевтически эффективное количество полипептида PRO87299 или его агониста или антагониста.

В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу диагностики связанного с иммунитетом заболевания у млекопитающего, включающему детекцию уровня экспрессии гена, кодирующего полипептид PRO87299, (a) в тестируемом образце клеток ткани, полученном от млекопитающего, и (b) в контрольном образце известных нормальных клеток ткани того же типа клеток, где более высокий или более низкий уровень экспрессии в тестируемом образце по сравнению с контрольным образцом указывает на присутствие связанного с иммунитетом заболевания у млекопитающего, от которого получены тестируемые клетки ткани.

В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу диагностики иммунного заболевания у млекопитающего, включающему (a) контакт анти-PRO87299 антитела с тестируемым образцом клеток ткани, полученным от млекопитающего, и (b) детекцию формирования комплекса между антителом и полипептидом PRO87299 в тестируемом образце; где формирование указанного комплекса указывает на присутствие или отсутствие указанного заболевания. Детекция может являться качественной или количественной, и ее можно проводить в сравнении с мониторингом формирования комплекса в контрольном образце известных нормальных клеток ткани того же типа клеток. Увеличенное количество комплексов в тестируемом образце указывает на присутствие или отсутствие иммунного заболевания у млекопитающего, от которого получены тестируемые клетки ткани. Антитело предпочтительно несет поддающуюся детекции метку. Формирование комплексов можно мониторировать, например, световой микроскопией, проточной цитометрией, флуорометрией или другими способами, известными в данной области. Тестируемый образец обычно получают от индивидуума, предположительно обладающего дефицитом или патологией иммунной системы.

В другом варианте осуществления изобретение относится к способу определения присутствия полипептида PRO87299 в образце, включающему воздействие на тестируемый образец клеток, предположительно содержащих полипептид PRO87299, анти-PRO87299 антителом и определения связывания указанного антитела с указанным образцом клеток. В конкретном аспекте образец содержит клетку, предположительно содержащую полипептид PRO87299, и антитело связывается с клеткой. Антитело предпочтительно является меченным поддающейся детекции меткой и/или связанным с твердой подложкой.

В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к диагностическому набору для связанного с иммунитетом заболевания, содержащему анти-PRO87299 антитело и носитель в соответствующей упаковке. Набор предпочтительно содержит инструкции для применения антитела для детекции присутствия полипептида PRO87299. Предпочтительно носитель является фармацевтически приемлемым.

В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к диагностическому набору, содержащему анти-PRO87299 антитело в соответствующей упаковке. Набор предпочтительно содержит инструкции для применения антитела для детекции присутствия полипептида PRO87299.

В другом варианте осуществления изобретение относится к способу диагностики связанного с иммунитетом заболевания у млекопитающего, включающему детекцию присутствия или отсутствия полипептида PRO87299 в тестируемом образце клеток ткани, полученном от указанного млекопитающего, где присутствие или отсутствие полипептида PRO87299 в тестируемом образце указывает на присутствие связанного с иммунитетом заболевания у указанного млекопитающего.

В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу идентификации агониста полипептида PRO87299, включающему:

(a) контакт клеток и тестируемого соединения, подлежащего скринингу, в условиях, подходящих для индукции клеточного ответа, нормально индуцируемого полипептидом PRO87299; и

(b) определение индукции указанного клеточного ответа для определения, является ли тестируемое соединение эффективным агонистом, где индукция указанного клеточного ответа указывает, что указанное тестируемое соединение является эффективным агонистом.

В другом варианте осуществления изобретение относится к способу идентификации соединения, способного ингибировать активность полипептида PRO87299, включающему контакт соединения-кандидата с полипептидом PRO87299 в адекватных условиях и в течение достаточного времени, чтобы позволить взаимодействовать данным двум компонентам, и определение, ингибирована ли активность полипептида PRO87299. В конкретном аспекте или соединение-кандидат, или полипептид PRO87299 иммобилизуют на твердой подложке. В другом аспекте неиммобилизованный компонент обладает поддающейся детекции меткой. В предпочтительном аспекте данный способ включает стадии:

(a) контакта клеток и тестируемого соединения, подлежащего скринингу, в присутствии полипептида PRO87299 в условиях, подходящих для индукции клеточного ответа, нормально индуцируемого полипептидом PRO87299; и

(b) определения индукции указанного клеточного ответа для определения, является ли тестируемое соединение эффективным антагонистом.

В другом варианте осуществления изобретение относится к способу идентификации соединения, ингибирующего экспрессию полипептида PRO87299 в клетках, нормально экспрессирующих полипептид, где способ включает приведение клеток в контакт с тестируемым соединением и определение, ингибирована ли экспрессия полипептида PRO87299. В предпочтительном аспекте данный способ включает стадии:

(a) контакта клеток и тестируемого соединения, подлежащего скринингу, в условиях, подходящих, чтобы позволять экспрессию полипептида PRO87299; и

(b) определения ингибирования экспрессии указанного полипептида.

В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к способу лечения связанного с иммунитетом расстройства у страдающего им млекопитающего, включающему введение млекопитающему молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей или (a) полипептид PRO87299, (b) агонист полипептида PRO87299, или (c) антагонист полипептида PRO87299, где указанный агонист или антагонист может представлять собой анти-PRO87299 антитело. В предпочтительном варианте осуществления млекопитающее представляет собой человека. В другом предпочтительном варианте осуществления нуклеиновую кислоту вводят посредством генной терапии ex vivo. В дополнительном предпочтительном варианте осуществления нуклеиновую кислоту содержит вектор, более предпочтительно аденовирусный, аденоассоциированный вирусный, лентивирусный или ретровирусный вектор.

В другом аспекте изобретение относится к рекомбинантной вирусной частице, содержащей вирусный вектор, по существу состоящий из промотора, нуклеиновой кислоты, кодирующей (a) полипептид PRO87299, (b) полипептид-агонист полипептида PRO87299 или (c) полипептид-антагонист полипептида PRO87299, и сигнальную последовательность для клеточной секреции полипептида, где вирусный вектор связан с вирусными структурными белками. Предпочтительно сигнальная последовательность относится к млекопитающим, такая как из природного полипептида PRO87299.

В дополнительном варианте осуществления изобретение относится к продуцирующей ex vivo клетке, содержащей конструкцию нуклеиновой кислоты, экспрессирующую ретровирусные структурные белки и содержащую также ретровирусный вектор, по существу состоящий из промотора, нуклеиновой кислоты, кодирующей (a) полипептид PRO87299, (b) полипептид-агонист полипептида PRO87299 или (c) полипептид-антагонист полипептида PRO87299, и сигнальную последовательность для клеточной секреции полипептида, где указанная продуцирующая клетка упаковывает ретровирусный вектор совместно со структурными белками для получения рекомбинантных ретровирусных частиц.

В дополнительном варианте осуществления изобретение относится к способу увеличения активности иммунных клеток у млекопитающего, включающему введение указанному млекопитающему (a) полипептида PRO87299, (b) агониста полипептида PRO87299 или (c) антагониста полипептида PRO87299, где активность иммунных клеток у млекопитающего повышается.

В дополнительном варианте осуществления изобретение относится к способу увеличения пролиферации иммунных клеток у млекопитающего, включающему введение указанному млекопитающему (a) полипептида PRO87299, (b) агониста полипептида PRO87299 или (c) антагониста полипептида PRO87299, где пролиферация иммунных клеток у млекопитающего увеличивается.

В дополнительном варианте осуществления изобретение относится к способу уменьшения пролиферации иммунных клеток у млекопитающих, включающему введение указанному млекопитающему (a) полипептида PRO87299, (b) агониста полипептида PRO87299 или (c) антагониста полипептида PRO87299, где пролиферация иммунных клеток у млекопитающего уменьшается.

B. Дополнительные варианты осуществления

В других вариантах осуществления по настоящему изобретению изобретение относится к векторам, содержащим ДНК, кодирующую любой из описанных здесь полипептидов. Предоставлена также клетка-хозяин, содержащая любой такой вектор. В качестве примера, клетки-хозяева могут представлять собой клетки CHO, E. coli или дрожжей. Дополнительно представлен способ получения любого из описанных здесь полипептидов, включающий культивирование клеток-хозяев в условиях, подходящих для экспрессии желаемого полипептида, и выделение желаемого полипептида из культуры клеток.

В других вариантах осуществления изобретение относится к химерным молекулам, содержащим любой из описанных здесь полипептидов, слитый с гетерологичной полипептидной или аминокислотной последовательностью. Примеры таких химерных молекул содержат любой из описанных здесь полипептидов, слитый с последовательностью эпитопа-метки или Fc-областью иммуноглобулина.

В другом варианте осуществления изобретение относится к антителу, специфически связывающему любой из описанных выше или ниже полипептидов. Не обязательно, антитело представляет собой моноклональное антитело, гуманизированное антитело, фрагмент антитела или одноцепочечное антитело.

В других вариантах осуществления изобретение относится к олигонуклеотидным зондам, применимым для выделения нуклеотидных последовательностей, геномных и кДНК, или в качестве антисмысловых зондов, где данные зонды можно получить из любой из описанных выше или ниже нуклеотидных последовательностей.

В других вариантах осуществления изобретение относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, кодирующую полипептид PRO87299.

В одном из аспектов выделенная молекула нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, обладающую, по меньшей мере, приблизительно 80% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 81% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 82% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 83% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 84% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 85% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 86% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 87% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 88% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 89% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 90% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 91% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 92% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 93% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 94% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 95% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 96% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 97% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 98% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты и альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 99% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с (a) молекулой ДНК, кодирующей полипептид PRO87299, обладающий полноразмерной аминокислотной последовательностью, как описано здесь, аминокислотную последовательностью без сигнального пептида, как описано здесь, внеклеточный домен трансмембранного белка, с сигнальным пептидом или без, как описано здесь, или любой другой конкретно определенный фрагмент полноразмерной аминокислотной последовательности, как описано здесь, или (b) молекулой ДНК, комплементарной (a).

В других аспектах выделенная молекула нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, обладающую, по меньшей мере, приблизительно 80% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 81% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 82% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 83% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 84% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 85% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 86% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 87% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 88% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 89% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 90% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 91% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 92% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 93% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 94% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 95% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 96% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 97% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 98% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты и альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 99% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с (a) молекулой ДНК, содержащей кодирующую последовательность кДНК полноразмерного полипептида PRO87299, как описано здесь, кодирующую последовательность полипептида PRO87299 без сигнального пептида, как описано здесь, кодирующую последовательность внеклеточного домена трансмембранного полипептида PRO87299 с сигнальным пептидом или без, как описано здесь, или кодирующую последовательность любого другого конкретно определенного фрагмента полноразмерной аминокислотной последовательности как описано здесь, или (b) молекулой, комплементарной ДНК (a).

В дополнительном аспекте изобретение относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, обладающую, по меньшей мере, приблизительно 80% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 81% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 82% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 83% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 84% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 85% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере приблизительно 86% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 87% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 88% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 89% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 90% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 91% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 92% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 93% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 94% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 95% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 96% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 97% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты, альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 98% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты и альтернативно, по меньшей мере, приблизительно 99% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с молекулой ДНК, кодирующей такой же зрелый полипептид, как показано на фиг. 2 (SEQ ID NO:2).

В другом аспекте изобретение относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, кодирующую полипептид PRO87299, который обладает или делетированным трансмембранным доменом, или инактивированным трансмембранным доменом, или являющейся комплементарной такой кодирующей нуклеотидной последовательностью, где трансмембранный домен(ы) такого полипептида описаны здесь. Таким образом, рассматривают растворимые внеклеточные домены полипептидов PRO87299.

Другой вариант осуществления относится к последовательности, кодирующей фрагменты полипептида PRO87299 или комплементраной ей, которую можно применять, например, в качестве зондов для гибридизации, для кодирования фрагментов полипептида PRO87299, которые могут, не обязательно, кодировать полипептид, содержащий участок связывания для антитела анти-PRO87299 или в качестве антисмысловых олигонуклеотидных зондов. Такие фрагменты нуклеиновой кислоты обычно обладают длиной, по меньшей мере, приблизительно 20 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 30 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 40 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 50 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 60 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 70 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 80 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 90 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 100 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 110 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей мере, приблизительно 120 нуклеотидов, альтернативно длиной, по меньшей