Терапия злокачественной опухоли, резистентной к препаратам на основе платины
Иллюстрации
Показать всеИзобретение относится к медицине, а именно к онкологии, и может быть использовано для лечения злокачественных опухолей, резистентных к препаратам на основе платины. Способ по изобретению включает введение пациенту гуманизированного антитела против 2С4 HER2 или его фрагмента и химиотерапетического средства антиметаболита, каждое в количествах, эффективных для лечения злокачественной опухоли. Использование изобретения позволяет лечить такие опухоли, как злокачественная опухоль яичника, перитонеальная карцинома и карцинома фаллопиевой трубы, резистентные к препаратам на основе платины, за счет более активного подавления антителом 2С4 HER2 димеризации HER. 29 з.п. ф-лы, 4 табл., 16 ил.
Реферат
Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение относится к способу лечения резистентных к препаратам на основе платины злокачественной опухоли яичника, первичной перитонеальной карциномы или карциномы фаллопиевой трубы комбинацией антитела против HER2, которое эффективно подавляет димеризацию HER, а также гемцитабина.
Уровень техники
Антитела против HER
Семейство HER рецепторных тирозинкиназ является семейством важных медиаторов роста, дифференциации и выживаемости клеток. Семейство рецепторов включает четыре различных члена, включающих рецептор эпидермального фактора роста (EGFR, ErbB1 или HER1), HER2 (ErbB2 или p185neu), HER3 (ErbB3) и HER4 (ErbB4 или tyro2).
EGFR, кодируемый геном erbB1, в основном принимает участие в развитии злокачественных образований у человека. В частности, наблюдали повышенную экспрессию EGFR в злокачественных опухолях молочной железы, мочевого пузыря, легких, головы, шеи и желудка, а также в глиобластоме. Повышенная экспрессия EGFR-рецептора часто связана с увеличенной продукцией лиганда EGFR, трансформирующего фактора роста альфа (ТФР-α, ТGF-α), теми же опухолевыми клетками, приводя к активации рецептора аутокринным стимулирующим путем. Baselga and Mendelsohn, Pharmac. Ther., 64: 127-154 (1994). Оценивали эффективность моноклональных антител против EGFR или его лигандов, ТФР-α и EGF, в качестве терапевтических средств для лечения таких злокачественных образований. Смотри, например, Baselga and Mendelsohn, выше; Masui et al., Cancer Research, 44: 1002-1007 (1984) и Wu et al., J. Clin. Invest., 95: 1897-1905 (1995).
Второй член семейства HER, p185neu, первоначально был установлен в качестве продукта трансформирующего гена из нейробластомы у обработанных химическими соединениями крыс. Активная форма протоонкогена neu возникает в результате точечной мутации (валин в глутаминовую кислоту) в трансмембранной области кодируемого белка. Амплификацию человеческого гомолога neu наблюдают в злокачественных опухолях молочной железы и яичника, и она коррелирует с плохим прогнозом (Slamon et al., Science, 235: 177-182 (1987); Slamon et al., Science, 244: 707-712 (1989) и патент США № 4968603). К настоящему времени не сообщалось о точечных мутациях, подобных в протоонкогене neu, для человеческих опухолей. Также наблюдали сверхэкспрессию HER2 (часто, но не во всех случаях в результате амплификации гена) в других карциномах, включая карциному желудка, эндометрия, слюнной железы, легких, почки, ободочной кишки, щитовидной железы, поджелудочной железы и мочевого пузыря. Смотри, например, среди прочих King et al., Science, 229: 974 (1985); Yokota et al., Lancet, 1: 765-767 (1986); Fukushige et al., Mol. Cell Biol., 6: 955-958 (1986); Guerin et al., Oncogene Res., 3: 21-31 (1988); Cohen et al., Oncogene, 4: 81-88 (1989); Yonemura et al., Cancer Res., 51: 1034 (1991); Borst et al., Gynecol. Oncol., 38: 364 (1990); Weiner et al., Cancer Research, 50: 421-425 (1990); Kern et al., Cancer Research, 50: 5184 (1990); Park et al., Cancer Res., 49: 6605 (1989); Zhau et al., Mol. Carcinog., 3: 254-257 (1990); Aasland et al., Br. J. Cancer, 57: 358-363 (1988); Williams et al., Pathobiology, 59: 46-52 (1991) и МcCann et al., Cancer, 65: 88-92 (1990). HER2 может сверхэкспрессироваться в злокачественной опухоли простаты (Gu et al., Cancer Lett., 99: 185-9 (1996); Ross et al., Hum. Pathol. 28: 827-33 (1997); Ross et al., Cancer 79: 2162-70 (1997) и Sadasivan et al., J. Urol., 150: 126-31 (1993)).
Описаны антитела против крысиного p185neu и белковых продуктов человеческого HER2. Drebin и соавторы получили антитела против продукта крысиного гена neu, p185neu. Смотри, например, Drebin et al., Cell, 41: 695-706 (1985); Myers et al., Meth. Enzym. 198: 277-290 (1991) и WO 94/22478. Drebin et al., Oncogene, 2: 273-277 (1988) сообщают, что смеси антител, реагирующих с двумя различными областями p185neu, приводят к синергическим противоопухолевым эффектам в отношении трансформированных neu клеток NIH-3T3, имплантированных голым мышам. Также смотри патент США № 5824311 от 20 октября 1998 г.
Hudziak et al., Mol. Cell Biol., 9(3): 1165-1172 (1989) описывают получение панели антител против HER2, которые были охарактеризованы с использованием клеток опухоли молочной железы SK-BR-3. Определяли относительную клеточную пролиферацию клеток SK-BR-3 после воздействия антител по окрашиванию монослоев кристаллическим фиолетовым через 72 ч. С использованием данного теста максимальное ингибирование получали с антителом, названным 4D5, которое подавляло клеточную пролиферацию на 56%. Другие антитела в данной панели снижали клеточную пролиферацию в меньшей степени в данном тесте. Дополнительно было установлено, что антитело 4D5 сенсибилизирует клетки опухоли молочной железы со сверхэкспрессией HER2 к цитотоксическому действию ТФР-α. Смотри также патент США № 5677171 от 14 октября 1997 г. Антитела против HER2, обсужденные Hudziak et al., были дополнительно охарактеризованы Fendly et al., Cancer Research., 50: 1550-1558 (1990); Kotts et al., In vitro 26(3): 59A (1990); Sarup et al., Growth Regulation 1: 72-82 (1991); Shepard et al., J. Clin. Immunol., 11(3): 117-127 (1991); Kumar et al., Mol. Cell Biol., 11(2): 979-986 (1991); Lewis et al., Cancer Immunol. Immunother., 37: 255-263 (1993); Pietras et al., Oncogene, 9: 1829-1838 (1994); Vitetta et al., Cancer Research, 54: 5301-5309 (1994); Sliwkowski et al., J. Biol Chem., 269(20): 14661-14665 (1994); Scott et al., J. Biol. Chem., 266: 14300-5 (1991); D'souza et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 91: 7202-7206 (1994); Lewis et al., Cancer Research, 56: 1457-1465 (1996); и Schaefer et al., Oncogene, 15: 1385-1394 (1997).
Рекомбинантный гуманизированный вариант мышиного антитела против HER2 4D5 (huMAb4D5-8, rhuMAb, трастузумаб или HERCEPTIN®; патент США № 5821337) является клинически эффективным у пациенток с метастазирующими злокачественными опухолями молочной железы со сверхэкспрессией HER2, которые до этого получали продолжительную противоопухолевую терапию (Baselga et al., J. Clin. Oncol., 14: 737-744 (1996)). Трастузумаб разрешен к применению Администрацией по санитарному надзору за продуктами питания и медикаментами от 25 сентября 1998 г. для лечения пациенток с метастазирующими опухолями молочной железы со сверхэкспрессией белка HER2.
Описаны другие антитела к HER2 с различными свойствами Tagliabue et al., Int. J. Cancer, 47: 933-937 (1991); McKenzie et al., Oncogene, 4: 543-548 (1989); Mair et al., Cancer Res., 51: 5361-5369 (1991); Bakus et al., Molecular Carcinogenesis, 3: 350-362 (1990); Stancovski et al., PNAS (USA) 88: 8691-8695 (1991); Bakus et al., Cancer Research, 52: 2580-2589 (1992); Xu et al., Int. J. Cancer, 53: 401-408 (1993); WO 94/00136; Kasprzyk et al., Cancer Research, 52: 2771-2776 (1992); Hancock et al., Cancer Res., 51: 4575-4580 (1991); Shawver et al., Cancer Res., 54: 1367-1373 (1994); Arteaga et al., Cancer Res., 54: 3758-3765 (1994); Harwerth et al., J. Biol. Chem., 267: 15160-15167 (1992); патент США № 5783186 и Klapper et al., Oncogene, 14: 2099-2109 (1997).
В результате скрининга на гомологию было идентифицировано два других члена семейства рецепторов HER: HER3 (патенты США № 5183884 и 5480968, а также Kraus et al., PNAS (USA) 86: 9193-9197 (1989)) и HER4 (заявка на Европейский патент № 599274; Plowman et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 1746-1750 (1993) и Plowman et al., Nature, 366: 473-475 (1993)). Для обоих данных рецепторов характерна повышенная экспрессия, по меньшей мере, в некоторых клеточных линиях опухолей молочной железы.
Как правило, рецепторы HER обнаруживают в различных комбинациях в клетках, и полагают, что гетеродимеризация повышает разнообразие ответных реакций на различные лиганды HER (Earp et al., Breast Cancer Research and Treatment, 35: 115-132 (1995)). EGFR связывается с шестью различными лигандами: эпидермальным фактором роста (EGF), трансформирующим фактором роста альфа (ТФР-α), амфирегулином, связывающимся с гепарином эпидермальным фактором роста (НВ-EGF), бетацеллюлином и эпирегулином (Groenen et al., Growth Factors, 11: 235-257 (1994)). Семейство белков герегулинов, происходящих в результате альтернативного сплайсинга одного гена, представляют лиганды для HER3 и HER4. Семейство герегулинов включает альфа, бета и гамма герегулины (Holmes et al., Science, 256: 1205-1210 (1992); патент США № 5641869 и Schaefer et al., Oncogene, 15: 1385-1394 (1997)); факторы дифференциации neu (NDF); глиальные факторы роста (GGF); рецептор, индуцирующий активность ацетилхолина (ARIA); и факторы сенсорных и двигательных нейронов (SMDF). Обзор смотри у Groenen et al., Growth Factors, 11: 235-257 (1994); Lemke, G. Molec. & Cell Neurosci., 7: 247-262 (1996); и Lee et al., Pharm. Rev., 47: 51-85 (1995). Недавно было идентифицировано три дополнительных лиганда HER: нейрегулин-2 (NRG-2), о котором сообщалось, что он связывается с HER3 или HER4 (Chang et al., Nature, 387: 509-512 (1997) и Carraway et al., Nature, 387: 512-516 (1997)); нейрегулин-3, который связывается с HER4 (Zhang et al., PNAS (USA), 94(18): 9562-7 (1997)); и нейрегулин-4, который связывается с HER4 (Harari et al., Oncogene, 18: 2681-89 (1999)) HB-EGF, бетацеллюлин и эпирегулин, которые также связываются с HER4.
Несмотря на то, что EGF и ТФРα не связываются с HER2, EGF стимулирует EGFR и HER2 к образованию гетеродимера, который активирует EGFR и приводит к трансфосфорилированию HER2 в гетеродимере. Оказалось, что димеризация и/или трансфосфорилирование активируют тирозинкиназу HER2. Смотри Earp et al., выше. Аналогично, когда HER3 коэкспрессируется с HER2, то образуется активный сигнальный комплекс, и антитела против HER2 способны разрушать данный комплекс (Sliwkowski et al., J. Biol. Chem., 269(20): 14661-14665 (1994)). Дополнительно аффинность HER3 для герегулина (HRG) повышается до состояния более высокой аффинности при коэкспрессии с HER2. Также смотри Levi et al., Journal of Neuroscience, 15: 1329-1340 (1995); Morrissey et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92: 1431-1435 (1995) и Lewis et al., Cancer Res., 56: 1457-1465 (1996) в отношении белкового комплекса HER2-HER3. HER4, подобно HER3, образует активный сигнальный комплекс с HER2 (Carraway and Cantley, Cell, 78: 5-8 (1994)).
Злокачественная опухоль яичника
Злокачественная опухоль яичника является наиболее частой причиной смерти от злокачественных образований органов репродуктивной системы у женщин. Ежегодно в США регистрируется 24000 новых диагнозов при смертности от данного заболевания на уровне примерно 13000. Пациентки с далеко зашедшим раком яичника часто подвергаются лечению химиотерапией препаратами на основе платины, часто в комбинации с таксаном. При отсутствии эффективности данных препаратов имеется небольшой выбор терапевтических средств. Часто пациентки с опухолями, чувствительными к препаратам на основе платины, повторно подвергаются лечению платиной, но у значительной части пациенток наблюдается незначительная продолжительность ответной реакции на повторное лечение. Результативность лечения у пациенток с опухолью, резистентной к препаратам на основе платины, еще ниже. Топотекан разрешен к применению Администрацией по санитарному надзору за продуктами питания и медикаментами (FDA) для пациенток с отсутствием эффективности первоначальной или последующей химиотерапии; липосомальный доксорубицин разрешен только для пациенток со злокачественной опухолью яичника, которая резистентна к химиотерапии препаратами платины и паклитакселом. Было показано, что топотекан и липосомальный доксорубицин вызывают частичную ответную реакцию соответственно у 6 и 12% пациенток с опухолью, резистентной к препаратам на основе платины, при среднем значении выживаемости без прогрессирования заболевания, составляющем 14-18 недель. Совсем недавно сообщалось об обещающих результатах с гемцитабином при опухоли яичника с резистентностью к препаратам платины при наличии частичной ответной реакции на уровне 16%, что привело к повышенному применению данного средства в качестве 2 линии терапии. Однако существует четкая потребность в новых и усовершенствованных лекарственных препаратах для пациенток с далеко зашедшим раком яичника, для которых имеющиеся в настоящее время средства терапии не эффективны.
ErbB или семейство рецепторов человеческого эпидермального фактора роста (HER) принимает участие в патогенезе рака яичника. Для целенаправленного воздействия на сигнальный путь с участием HER был разработан пертузумаб (rhuMAb 2C4) в качестве гуманизированного антитела, которое подавляет димеризацию HER2 с другими HER-рецепторами, тем самым ингибируя лиганд-регулируемые фосфорилирование и активацию и даунстрим активацию путей RAS и АКТ.
Гемцитабин применяли для лечения различных опухолей, и он показан для применения при раке поджелудочной железы и легких. Наиболее частым проявлением токсичности при применении гемцитабина в качестве одного средства является цитопения с частотой проявления анемии и нейтропении, равной соответственно 68 и 63%. Другим обычным видом токсичности является тошнота и рвота при общей частоте на уровне 69%, при 13% III степени и 1% IV степени. Диарея имеет место реже в 19% случаев. Кожные высыпания проявляются чаще в 30% случаев при том, что III степени только в 1% случаев. Гемцитабин комбинировали со многими другими химиотерапевтическими средствами, такими как таксаны, антрациклины и препараты на основе платины, без какой-либо существенной повышенной или неожиданной токсичности.
Трастузумаб сочетали с гемцитабином в нескольких комбинациях различных химиотерапевтических средств на фазе II клинических испытаний, и он также хорошо переносился без проявления сердечной или неожиданной токсичности. Safran et al., Proc. Am. Soc. Clin. Oncol., 20: 130a (2001); Miller et al., Oncology, 15(2): 38-40 (2001). Смотри также Zinner et al., Proc. Am. Soc. Clin. Oncol., 20: 328a (2001); Nagourney et al., Breast Cancer Res. Treat., 57: 116, Abstract, 475 (1999); Bun et al., Proc. Am. Assoc. Canc. Res., 41: 719, Abstract #4571 (2000); Konecny et al., Breast Cancer Res. Treat., 57: 114, Abstract 476 (1999); O'Shaugnessy et al., Sem. Oncol., 2(suppl 3): 22-26 (2004); Sledge et al., Sem. Oncol., 2(suppl 3): 19-21 (2003); Zinner et al., Lung Cancer, 44(1): 99-110 (2004); Gatzemeier et al., Ann. Of Oncol., 15: 19-27 (2004), касающиеся комбинации трастузумаба и гемцитабина.
В фазе I клинических испытаний омнитарга в качестве единственного средства для лечения солидных опухолей 3 пациентки с далеко зашедшим раком яичника подверглись лечению пертузумабом. У одной была длительная частичная ответная реакция и у одной пациентки наблюдали стабилизацию заболевания в течение 15 недель. Agus et al., Proc. Am. Soc. Clin. Oncol., 22: 192, Absract 771 (2003).
Сущность изобретения
Настоящее изобретение относится, в первом аспекте, к способу лечения злокачественной опухоли, резистентной к препаратам на основе платины, выбранной из группы, состоящей из злокачественной опухоли яичника, первичной перитонеальной карциномы и карциномы фаллопиевых труб, включающему введение пациентке антитела против HER2, которое подавляет димеризацию HER более эффективно по сравнению с трастузумабом, и химиотерапевтического средства антиметаболита в количествах, эффективных для лечения злокачественной опухоли.
В другом аспекте изобретение относится к способу лечения злокачественной опухоли, резистентной к препаратам на основе платины, выбранной из группы, состоящей из злокачественной опухоли яичника, первичной перитонеальной карциномы и карциномы фаллопиевых труб, включающему введение пациентке антитела против HER2, которое связывается с гетеродимерным связывающим сайтом в HER2, и гемцитабина в количествах, эффективных для лечения злокачественной опухоли.
В еще одном аспекте изобретение относится к способу лечения злокачественной опухоли, резистентной к препаратам на основе платины, выбранной из группы, состоящей из злокачественной опухоли яичника, первичной перитонеальной карциномы и карциномы фаллопиевых труб, включающему введение пациентке антитела против HER2, которое связывается с доменом II HER2, и гемцитабина в количествах, эффективных для лечения злокачественной опухоли.
Краткое описание чертежей
На фиг.1А и 1В представлено картирование эпитопа остатков 22-645 во внеклеточном домене (ECD) HER2 (аминокислотная последовательность, включая сигнальную последовательность, представленная на фиг.1А; SEQ ID NO: 13), по данным анализа усеченния мутанта и сайт-направленного мутагенеза (Nakamura et al., J. of Virology 67(10): 6179-6191 (1993); и Renz et al., J. Cell Biol., 125(6): 1395-1406 (1994)). Различные усечения HER2-ECD или точечные мутации получали из кДНК с использованием технологии полимеразной цепной реакции. Мутанты HER2 экспрессировали в виде гибридных белков gD в экспрессирующей плазмиде млекопитающих. В данной экспрессирующей плазмиде используется промотор/энхансер цитомегаловируса с сигналами терминации и полиаденилирования SV40, расположенными справа (в положении даунстрим) от вставленной кДНК. Плазмидную ДНК трансфектировали в клетки 293. Через 1 сутки после трансфекции в клетки метаболически вводили метку в течение ночи в среде DMEM без метионина и цистеина с низкой концентрацией глюкозы, содержащей 1% диализованной фетальной телячьей сыворотки и 25 мкКи каждого 35S-метионина и 35S-цистеина. Собирали супернатанты и к супернатантам добавляли моноклональные антитела против HER2 или контрольные антитела и инкубировали в течение 2-4 ч при 4°С. Комплексы преципитировали, наносили на 10-20% градиентный гель трицин-SDS и подвергали электрофорезу при 100 В. Гель электрофоретически переносили на мембрану и авторадиографировали. Как показано на фиг.1В, антитела против HER2 7С2, 7F3, 2C4, 7D3, 3Е8, 4D5, 2H11 и 3Р4 связываются с различными эпитопами HER2 ECD.
На фиг.2А и 2В показано влияние моноклональных антител против HER2 2C4 и 7F3 на активацию rHRGβ1 в клетках МCF7. На фиг.2А представлены кривые зависимости для ингибирования под действием 2C4 или 7F3 стимулированного HRG фосфорилирования тирозина. На фиг.2В представлены кривые зависимости для ингибирования связывания 125I-меченого rHRGβ177-244 с клетками МCF7 под действием антител 2C4 или 7F3.
На фиг.3 показано ингибирование специфического связывания 125I-меченого rHRGβ177-244 с панелью человеческих опухолевых клеток под действием моноклональных антител 2C4 или 7F3 против HER2. Моноклональными контрольными антителами являются изотипные мышиные моноклональные антитела, которые не блокируют связывание rHRG. Неспецифическое связывание 125I-меченого rHRGβ177-244 определяли с использованием параллельных инкубационных смесей в присутствии 100 нМ rHRGβ1. Значения неспецифического связывания 125I-меченого rHRGβ177-244 составляло менее 1% от общего значения для всех тестированных клеток.
На фиг.4А и 4В показано влияние моноклональных антител 2C4 или 4D5 на пролиферацию клеток MDA-MB-175 (фиг.4А) и SK-BR-3 (фиг.4В). Клетки MDA-MB-175 и SK-BR-3 высевали в 96-луночные планшеты и давали прикрепиться в течение 2 ч. Опыт проводили в среде, содержащей 1% сыворотки крови. Вносили антитела против HER2 или одну среду и клетки инкубировали в течение 2 ч при 37°С. Затем добавляли rHRGβ1 (1 нМ) или одну среду и клетки инкубировали в течение 4 суток. Монослои промывали и окрашивали/фиксировали 0,5% кристаллическим фиолетовым. Пролиферацию клеток оценивали по поглощению при 540 нм.
На фиг.5А и 5В показано влияние моноклонального антитела 2C4, антитела трастузумаба или анти-EGFR-антитела на зависимую от герегулина (HRG) ассоциацию HER2 с HER3 в клетках MCF7, экспрессирующих низкий/нормальный уровень HER2 (фиг.5А), и клетках SK-BR-3, экспрессирующих высокие уровни HER2 (фиг.5В); смотри пример 2 ниже.
На фиг.6А и 6В приводится сравнение активности интактного мышиного моноклонального антитела 2С4 (mu 2С4) и химерного Fab-фрагмента антитела 2С4. На фиг.6А показано ингибирование связывания 125I-HRG с клетками MCF7 химерным Fab-фрагментом 2С4 или интактным мышиным моноклональным антителом 2С4. Клетки MCF7 высевали в 24-луночные планшеты (1×105 клеток/лунку) и культивировали до 85% слияния в течение 2 суток. Опыты по связыванию проводили, как описано Lewis et al., Cancer Researh, 56: 1457-1465 (1996). На фиг.6В показано ингибирование активации rHRGβ1 фосфорилирования тирозина р180 в клетках MCF7, проводимое, как описано Lewis et al., Cancer Researh, 56: 1457-1465 (1996).
На фиг.7А и 7В представлено сопоставление аминокислотных последовательностей вариабельного домена легкой цепи (VL) (фиг.7А) и вариабельного домена тяжелой цепи (VН) (фиг.7В) мышиного моноклонального антитела 2С4 (соответственно SEQ ID NO 1 и 2); доменов VL и VН гуманизированного варианта 2С4 574 (соответственно SEQ ID NO 3 и 4) и консенсусных каркасных областей человеческих VL и VН (hum κ1, подгруппа I легкой цепи каппа; humIII, подгруппа III тяжелой цепи) (соответственно SEQ ID NO 5 и 6). Звездочки указывают различия между гуманизированным вариантом 2С4 574 и мышиным моноклональным антителом 2С4, или гуманизированным вариантом 2С4 574 и человеческой каркасной областью. В рамках находятся определяющие комплементарность области (CDR).
На фиг.8А-С показано связывание химерного Fab 2С4 (Fab.v1) и нескольких гуманизированных вариантов 2С4 с внеклеточным доменом HER2 (ECD) по данным определения ELISA в примере 3.
Фиг.9 представляет ленточную схему доменов VL и VН моноклонального антитела 2С4 с представленным в белом цвете остовом CDR (L1, L2, L3, H1, H2, H3). Также показаны боковые цепи VН, определенные мутагенезом во время гуманизации (смотри пример 3, таблица 2).
На фиг.10 показано влияние моноклонального антитела 2С4 или трастузумаба на опосредуемую EGR, ТФР-α и HRG активацию митоген-активированной протеинкиназы (МАРК).
На фиг.11А и 11В представлены аминокислотные последовательности соответственно легкой цепи трастузумаба (SEQ ID NO: 14) и тяжелой цепи трастузумаба (SEQ ID NO: 15).
На фиг.12А и 12В представлены аминокислотные последовательности соответственно легкой цепи пертузумаба (SEQ ID NO: 16) и тяжелой цепи пертузумаба (SEQ ID NO: 17).
На фиг.13 схематично показано связывание 2С4 с гетеродимерным связывающим сайтом HER2, посредством чего предупреждается гетеродимеризация с активированными EGFR и HER3.
На фиг.14 показана связь HER2/HER3 с путями МАРК и Akt.
На фиг.15 приводится сравнение активности трастузумаба и пертузумаба.
На фиг.16 схематично представлены различные домены HER2.
Подробное описание предпочтительных вариантов осуществления
I. Определения
"Рецептор HER" представляет рецепторную протеин-тирозинкиназу, которая относится к семейству рецепторов HER и включает рецепторы EGFR, HER2, HER3 и HER4 и другие члены данного семейства, которые будут установлены в будущем. Как правило, рецептор HER содержит внеклеточный домен, который может связываться с лигандом HER; липофильный трансмембранный домен; консервативный внутриклеточный домен тирозинкиназы и С-концевой сигнальный домен, содержащий несколько остатков тирозина, которые могут фосфорилироваться. Рецептор HER может быть рецептором HER с "природной последовательностью" или его "вариантом аминокислотной последовательности". Предпочтительно рецептор HER представляет рецептор HER с природной человеческой последовательностью.
Внеклеточный домен HER2 включает четыре домена, домен I (аминокислотные остатки примерно 1-195), домен II (аминокислотные остатки примерно 196-320), домен III (аминокислотные остатки примерно 321-488) и домен IV (аминокислотные остатки примерно 489-632) (нумерация остатков без сигнального пептида). Смотри Garrett et al., Mol. Cell., 11: 495-505 (2003); Cho et al., Nature, 421: 756-760 (2003); Franklin et al., Cancer Cell., 5: 317-328 (2004) и Рlowman et al., Рroc Natl. Acad. Sci., 90: 1746-1750 (1993), и фиг.16 здесь.
Термины "ErbB1", "HER1", "рецептор эпидермального фактора роста" и "EGFR" используются здесь взаимозаменяемо и относятся к EGFR, раскрытому, например, Carpenter et al. Ann. Rev. Biochem. 56:881-914 (1987), включающему его природные мутантные формы (например, смотри мутантный EGFR как результат делеции у Humphrey et al. PNAS (USA) 87: 4207-4211 (1990)). erbB1 относится к гену, кодирующему белковый продукт, EGFR.
Выражения "ErbB2" и "HER2" используются здесь взаимозаменяемо и относятся к человеческому белку HER2, описанному, например, Semba et al., PNAS (USA), 82: 6497-6501 (1985) и Yamamoto et al., Nature, 319: 230-234 (1986) (номер для доступа в Genеbank X033363). Термин "erbB2" относится к гену, кодирующему человеческий ErbB2, и "neu" относится к гену, кодирующему крысиный р185neu. Предпочтительный HER2 представляет природную человеческую последовательность HER2.
"ErbB3" и "HER3" относятся к рецепторному полипептиду, раскрытому, например, в патентах США № 5183884 и 5480968, а также Kraus et al., PNAS (USA) 86: 9193-9197 (1989).
"ErbB4" и "HER4" относятся здесь к рецепторному полипептиду, раскрытому, например, в заявке на Европейский патент № 599274; Plowman et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 1746-1750 (1993); и Plowman et al., Nature, 366: 473-475 (1993), включая его изоформы, например, раскрытые в WO 99/19488, опубликованной 22 апреля 1999 г.
Под "лигандом HER" понимается полипептид, который связывается и/или активирует рецептор HER. Представляющим особый интерес лигандом HER является лиганд HER с человеческой природной последовательностью, такой как эпидермальный фактор роста (EGF) (Savage et al., J. Biol. Chem., 247: 7612-7621 (1972)); трансформирующий фактор роста-альфа (TGF-α) (Marquardt et al., Science, 223: 1079-1082 (1984)); амфирегулин, также известный как шванома или аутокринный фактор роста кератиноцитов (Shoyab et al., Science, 243: 1074-1076 (1989)); Kimura et al., Nature, 348: 257-260 (1990) и Cook et al., Mol. Cell Biol., 11: 2547-2557 (1991)); бетацеллюлин (Shing et al., Science, 259: 1604-1607 (1993)) и Sasada et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 190: 1173 (1993)); гепарин-связывающий эпидермальный фактор роста (HB-EGF) (Higashiyama et al., Science, 251: 936-939 (1991)); эпирегулин (Toyoda et al., J. Biol. Chem., 270: 7495-7500 (1995) и Komurasaki et al., Onkogene, 15: 2841-2848 (1997); герегулин (смотри ниже); нейрегулин-2 (NRG-2) (Carraway et al., Nature, 387: 512-516 (1997); нейрегулин-3 (NRG-3) (Zhang et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 94: 9562-9567 (1997); нейрегулин-4 (NRG-4) (Harari et al. Oncogene, 18: 2681-89 (1999) или крипто (CR-1) (Kannan et al. J. Biol. Chem., 272(6): 3330-3335 (1997)). Лиганды HER, которые связываются с EGFR, включают EGF, TGF-α, амфирегулин, бетацеллюлин, НВ-EGF и эпирегулин. Лиганды HER, которые связываются с HER3, включают герегулины. Лиганды, которые способны связываться с HER4, включают бетацеллюлин, эпирегулин, НВ-EGF, NRG-2, NRG-3, NRG-4 и герегулины.
"Герегулин" (HRG) в том смысле, в котором здесь используется данный термин, относится к полипептиду, кодируемому продуктом гена герегулина, раскрытому в патенте США № 5641869 или Marchionni et al., Nature, 362: 312-318 (1993). Примеры герегулинов включают герегулин-α, герегулин-β1, герегулин-β2 и герегулин-β3 (Holmes et al., Science, 256: 1205-1210 (1992) и патент США № 5641869); фактор дифференциации neu (NDF) (Peles et al., Cell, 69: 205-216 (1992)); индуцирующий активность ацетилхолинового рецептора (ARIA) (Falls et al., Cell, 72: 801-815 (1993)); глиальные факторы роста (GGF) (Marchionni et al., Nature, 362: 312-318 (1993)); факторы, полученные из сенсорных и двигательных нейронов (SMDF) (Ho et al., J. Biol. Chem., 270: 14523-14532 (1995)); γ-герегулин (Schaefer et al., Oncogene, 15: 1385-1394 (1997)). Термин включает биологически активные фрагменты и/или варианты аминокислотных последовательностей полипептида HRG с природной последовательностью, такие как EGF-подобные фрагменты его домена (например, HRGβ1177-244).
"Димер HER" представляет нековалентно связанный димер, содержащий, по меньшей мере, два различных рецептора HER. Такие комплексы могут образоваться, когда клетка, экспрессирующая два или более рецепторов HER, подвергается воздействию лиганда HER, и их можно выделить, например, иммунопреципитацией и подвергнуть анализу электрофорезом в SDS-PAGE, как описано Sliwkowski et al., J. Biol. Chem., 269(20): 14661-14665 (1994). Примеры таких димеров HER включают гетеродимеры EGFR-HER2, HER2-HER3 и HER3-HER4. Кроме того, димер HER может включать два или более рецепторов HER2 в комбинации с другим рецептором HER, таким как HER3, HER4 или EGFR. С димером могут быть связаны другие белки, такие как субъединица рецептора цитокина (например, gp 130).
"Гетеродимерный связывающий сайт" в HER относится к области во внеклеточном домене HER2, который контактирует или граничит с областью во внеклеточном домене EGFR, HER3 или HER4 при образовании с ним димера. Данная область обнаружена в домене II HER2. Franklin et al., Cancer Cell, 5: 317-328 (2004).
"Активация HЕR" или "активация HER2" относится к активации или фосфорилированию одного или более рецепторов HЕR или рецепторов HЕR2. Как правило, активация HЕR приводит к передаче сигнала (например, который индуцируется внутриклеточным доменом киназы рецептора HЕR, фосфорилируя остатки тирозина в рецепторе HЕR или полипептиде-субстрате). Активация HЕR может опосредоваться лигандом HЕR, связывающимся с димером HЕR, содержащим интересующий HЕR-рецептор. Связывание лиганда HЕR с димером HЕR может активировать домен киназы одного или более рецепторов HЕR в димере и, тем самым, приводить к фосфорилированию остатков тирозина в одном или более рецепторов HЕR и/или фосфорилированию остатков тирозина в дополнительном субстрате-полипептиде(ах), таком как внутриклеточные киназы Akt или МАРК.
Полипептид с "природной последовательностью" представляет таковой, который имеет такую же аминокислотную последовательность в виде полипептида (например, рецептор HЕR или лиганд HЕR), полученного из природы. Такие полипептиды с природной последовательностью можно выделить из природы или можно получить рекомбинантными или синтетическими путями. Таким образом, полипептид с природной последовательностью может иметь аминокислотную последовательность природного человеческого полипептида, мышиного полипептида или полипептида от любого другого вида млекопитающих.
Термин "вариант аминокислотной последовательности" относится к полипептидам, имеющим аминокислотные последовательности, которые до некоторой степени отличаются от полипептида с природной последовательностью. Как правило, варианты аминокислотных последовательностей будут обладать, по меньшей мере, примерно 70% гомологией, по меньшей мере, с одним доменом связывания рецептора природного лиганда HЕR или, по меньшей мере, с одним доменом связывания лиганда природного рецептора HЕR, и, предпочтительно, они будут, по меньшей мере, на 80%, более предпочтительно, по меньшей мере, примерно на 90% гомологичны с доменами связывания такого рецептора или лиганда. Варианты аминокислотных последовательностей включают замены, делеции и/или вставки в определенных положениях аминокислотной последовательности природной аминокислотной последовательности.
"Гомология" определяется как процент остатков в варианте аминокислотной последовательности, которые являются идентичными после сопоставления последовательностей и введения пробелов, если это необходимо, для достижения максимальной процентной гомологии. Способы и компьютерные программы для сопоставления хорошо известны в данной области. Одной такой компьютерной программой является "Align 2" производства Genentech, Inc., которая была подана с документацией для пользователя в United States Copyright Office, Washington, DC 20559, 10 декабря 1991.
Термин "антитело" в том смысле, в котором он здесь используется, применятся в самом широком смысле, и, в частности, он включает интактные моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела (например, биспецифически антитела), образованные, по меньшей мере, из двух интактных антител, и фрагменты антитела, при условии, что они обладают желаемой биологической активностью.
Термин "моноклональное антитело" в том смысле, в котором он здесь используется, относится к антителу, полученному из популяции в основном однородных антител, т.е. отдельные антитела, составляющие популяцию, являются идентичными и/или связываются с одним эпитопом, за исключением возможных вариантов, которые могут появиться во время получения моноклонального антитела, где такие варианты, как правило, присутствуют в минорных количествах. В противоположность препаратам поликлональных антител, которые, как правило, включают различные антитела против различных детерминант (эпитопов), каждое моноклональное антитело направлено против одной детерминанты в антигене. Помимо их специфичности моноклональные антитела обладают тем преимуществом, что они не содержат примесей других иммуноглобулинов. Определение "моноклональное" указывает на характер антитела как полученного в основном из однородной популяции антител и не сводится к необходимости получения антитела каким-либо конкретным методом. Например, моноклональные антитела для применения по настоящему изобретению можно получить гибридомным методом, впервые описанным Kohler et al., Nature, 256: 495 (1975), или можно получить методами рекомбинантной ДНК (смотри, например, патент США № 4816567). "Моноклональные антитела" также можно выделить из фаговых библиотек антител с использованием, например, методов, описанных Clackson et al., Nature, 352: 624-628 (1991) и Marks et al., J. Mol. Biol., 222: 581-597 (1991).
Моноклональные антитела здесь, в частности, включают "химерные" антитела, в которых область тяжелой и/или легкой цепи является идентичной или гомологичной с соответствующими последовательностями в антителах, полученных от определенного вида или относящимся к определенному классу или подклассу антител, в то время как остальная часть цепи(ей) идентична или гомологична соответствующим последовательностям в антителах, полученных от другого вида или относящимся к другому классу или подклассу антител, а также фрагменты таких антител, при условии, что они проявляют желаемую биологическую активность (патент США № 4816567 и Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855 (1984)). Интересующие химерные антитела здесь включают "приматизированные" антитела, содержащие антигенсвязывающие последовательности вариабельного домена, полученные от примата, не относящегося к человеку (например, низшие узконосые обезьяны, высшие обезьяны и т.д.), и последовательности человеческой константной области.
"Фрагменты антитела" включают участок интактного антитела, предпочтительно содержащий его антигенсвязывающую или вариабельную область. Примеры фрагментов антитела включают фрагменты Fab, Fab', F(ab')2 и Fv; диатела; линейные антитела; молекулы одноцепочечных антител и мультиспецифические антитела, полученные из фрагмента(ов) антитела.
"Интактное антитело" представляет таковое, которое содержит антигенсвязывающую вариабельную область, а также константный домен легкой цепи (CL) и константные домены тяжелой цепи СН1, СН2 и СН3. Константные домены могут представлять собой константные домены с природной последовательностью (например, константные домены с человеческой природной последовательностью) или их вариант аминокислотной последовательности. Предпочтительно интактное антитело обладает одной или более эффекторных функций.
"Эффекторные функции" антитела относятся к таким биологическим активностям, присущим области Fс (Fс-область природной последовательности или Fс-область варианта аминокислотной последовательности) антитела. Примеры эффекторных функций антитела включают связывание C1q; комплемент-зависимую цитотоксичность; связывание Fс-рецептора; антителозависимую клеточноопосредованную цитотоксичность (ADCC); фагоцитоз; даун-регуляцию рецепторов клеточной поверхности (например, рецептора В-клеток; BCR) и т.д.
В зависимости от аминокислотной последовательности константного домена их тяжелых цепей интактные антитела можно подразделить на различные "классы". Существует пять основных классов интактных антител: IgA, IgD, IgE, IgG и IgМ, и некоторые из них можно дополнительно подразделить на "подклассы" (изотипы), например IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgА1 и IgА2. Константные домены тяжелой цепи, которые соответствуют различным классам антител, обозначают соответственно α, δ, ε, γ и µ. Структуры субъединиц трехмерные конфигурации различных классов иммуноглобулинов хорошо известны.
"Антителозависимая клеточноопосредованная цитотоксичность" и "АDCC" относятся к клеточноопосредованной реакции, в которой неспецифические цитотоксические клетки, которые экспрессируют Fс-рецепторы (FсR) (например, природные клетки-киллеры (NK), нейтрофилы и макрофаги), распознают связанное антитело на клетке-мишени и затем вызывают лизис клетки-мишени. Основные клетки для опосредования АDCC, клетки NK, экспрессируют только FсγRIII, в то время как моноциты экспрессируют FсγRI, FсγRII и FсγRIII. Экспрессия FсR на гематопоэтических клетках в обобщенном виде представлена в таблице 3 на странице 464 у Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol., 9: 457-92 (1991). Для оценки активности АDCC интересующей молекулы можно провести тест АDCC в условиях in vitro, такой как описан в патентах США № 5500362 или 5821337. Подходящие эффекторные клетки для постановки таких тестов включают мононуклеарные клетки периферической крови (РВМС) и природные клетки-киллеры (NK). Альтернативно или дополнительно активность АDCC интересующей молекулы можно оценить в условиях in vivo на животной модели, такой как раскрыта Clynes et al. PNAS (USA), 95: 652-656 (1998).
"Человеческие эффекторные клетки" представляют лейкоциты, которые экспрессируют один или более FсR и осуществляют эффекторные функции. Предпочтительно клетки экспрессируют, по меньшей мере, FсγRIII и осуществляют эффекторные функции АDCC. Примеры человеческих лейкоцитов, которые опосредуют АDCC, включают мононуклеарные клетки периферической крови (РВМС), природные клетки-киллеры (NK), моноциты, цитотоксические Т-клетки и нейтрофилы; при том, что РВМС и NK являются предпочтительными. Эффекторные клетки можно выделить из их природного источника, например из крови или РВМС, как здесь описано.
Термины "Fс-рецептор" или "FсR" используются для обозначения рецептора, который связывается с Fс-областью антитела. Предпочтительный FсR представляет человеческий FсR с природной последовательностью. Кроме того, предпочтительным FсR является таковой, который связывается с IgG антителом (гамма-рецептор) и включает рецепторы подклассов FсγRI, FсγRII и FсγRIII, в том числе аллельные варианты и альтернативно сплайсированные формы таких рецепторов. Рецепторы FсγRII включают FсγRIIА ("активирующий рецептор") и FсγRIIВ ("ингибирующий рецептор"), которые имеют аналогичные аминокислотные последовательности, в основном различающиеся по их цитоплазматическим доменам. Активирующий рецептор FсγRIIА содержит иммунорецепторный мотив активации на основе тирозина (ITAM) в его цитоплазматическом домене. Ингибирующий рецептор FсγRIIВ содержит иммунорецепторный мотив ингибирования на основе тирозина (ITIM) в его цитоплазматическом домене (смотри обзор Daëron, Annu. Rev. Immunol., 15: 203-234 (1997)). Имеются обзоры по FсR у Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol., 9: 457-92 (1991); Capel et al., Immunomethods, 4: 25-34 (1994) и de Haas et al., J. Lab. Clin. Med., 126: 330-41 (1995). Другие FсR, включая таковые, которые будут открыты в будущем, объединяются здесь термино