Антитело против глипикана 3
Иллюстрации
Показать всеИзобретение относится к иммунологии и биотехнологии. Предложены варианты антител, способных связываться с глипиканом 3 на участке с аминокислотными остатками 1-563. Каждый вариант характеризуется тем, что содержит три CDRs легкой и три CDRs тяжелой цепи. Описаны кодирующий полинуклеотид, а также вектор экспрессии на его основе и клетка-хозяин на основе вектора. Раскрыты способ получения антитела с использованием клетки-хозяина, ингибитор клеточного роста на основе антитела, варианты применения антитела для лечения рака или гепатомы. Описан пептид для продуцирования антитела против глипикана 3, включающий остатки 546-551 глипикана 3. Предложенные новые антитела обладают более высокой цитотоксичностью по сравнению с известными антителами к глипикану 3 и специфичны к определенному участку глипикана 3. Использование изобретения может найти дальнейшее применение в терапии рака. 13 н. и 3 з.п. ф-лы, 20 ил., 2 табл.
Реферат
Предпосылки создания изобретения
Область изобретения
Настоящее изобретение относится к антителу против глипикана 3, к ингибитору клеточного роста и к противораковому средству, которые содержат антитело в качестве активного ингредиента.
Описание родственной области
Глипикан 3 (GPC3) является членом глипиканового семейства гепарансульфатпротеогликанов, которые присутствуют на клеточной поверхности. Это позволяет предположить, что GPC3 участвует в клеточном делении при развитии или росте раковых клеток, однако его функция еще не вполне ясна.
Было обнаружено, что определенный тип антител, связывающихся с GPC3, ингибирует клеточный рост посредством антителозависимой клеточноопосредованной цитотоксичности (ADCC) и комплементзависимой цитотоксичности (CDC) (международная патентная заявка WO 2003/000883). Кроме того, полагают, что GPC3 расщепляется in vivo и поступает в кровь в виде секретируемой формы GPC3, следовательно, рак можно диагностировать с помощью антител, способных связываться с секретируемой формой GPC3 (международные патентные заявки WO 2004/022739, WO 03/100429 и WO 2004/018667).
Для разработки противоракового средства на основе цитотоксичной активности антитела предпочтительно, чтобы используемое антитело обладало высокой ADCC-активностью или CDC-активностью. Соответственно, требуется антитело против GPC3, обладающее высокой цитотоксичностью, как антитело, распознающее GPC3.
Целью настоящего изобретения является предоставление антитела против GPC3, которое обладает более высокой ADCC-активностью и CDC-активностью, чем традиционное антитело.
Краткое описание изобретения
Авторам настоящего изобретения удалось получить антитело с более высокой цитотоксичностью, чем у традиционного антитела против глипикана 3. Кроме того, авторы анализировали эпитопы такого антитела, и им удалось определить участки GPC3, распознаваемые антителом с высокой цитотоксической активностью.
В одном аспекте настоящее изобретение предлагает антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий участки CDR 1, 2 и 3 по любому из пунктов (1)-(12):
(1) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 123, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 124, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 125;
(2) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 109, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 110, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 111;
(3) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 106, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 107, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 108;
(4) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 132, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 133, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 134;
(5) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 106, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 135, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 136;
(6) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 126, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 127, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 128;
(7) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 129, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 130, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 131;
(8) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 103, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 104, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 105;
(9) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 118, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 121, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 122;
(10) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 115, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 116, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 117;
(11) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 112, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 113, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 114; или
(12) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 118, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 119, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 120.
В другом аспекте данное изобретение предлагает антитело, включающее в себя вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3 по любому из пунктов (1)-(13):
(1) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 143, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(2) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 143, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 145;
(3) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 140, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 141, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 142;
(4) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 167, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 168, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 169;
(5) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 170, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 171;
(6) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 159, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 160, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 161;
(7) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 162, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 147, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 163;
(8) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 164, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 165, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 166;
(9) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 137, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 138, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 139;
(10) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 155, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 156, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 157;
(11) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 149, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 150, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 151;
(12) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 146, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 147, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 148; или
(13) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 152, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 153, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 154.
Предпочтительно антитело данного изобретения выбрано из группы, состоящей из антител по любому из пунктов (1)-(13):
(1) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 143, 144 и 158, соответственно;
(2) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 109, 110 и 111, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 143, 144 и 145, соответственно;
(3) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 106, 107 и 108, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 140, 141 и 142, соответственно;
(4) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 132, 133 и 134, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 167, 168 и 169, соответственно;
(5) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 106, 135 и 136, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 170, 144 и 171, соответственно;
(6) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 126, 127 и 128, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 159, 160 и 161, соответственно;
(7) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 129, 130 и 131, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 162, 147 и 163, соответственно;
(8) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 129, 130 и 131, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 164, 165 и 166, соответственно;
(9) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 103, 104 и 105, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 137, 138 и 139, соответственно;
(10) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 118, 121 и 122, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 155, 156 и 157, соответственно;
(11) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 115, 116 и 117, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 149, 150 и 151, соответственно;
(12) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 112, 113 и 114, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 146, 147 и 148, соответственно; и
(13) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 118, 119 и 120, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 152, 153 и 154, соответственно.
В другом аспекте данное изобретение предлагает антитело, содержащее вариабельный участок тяжелой цепи по любому из пунктов (1)-(7):
(1) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 84;
(2) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 85;
(3) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 86;
(4) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 87;
(5) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 88;
(6) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 89; или
(7) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 90.
В другом аспекте данное изобретение предлагает антитело, содержащее вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 92.
Предпочтительно антитело данного изобретения выбрано из группы, состоящей из антител по любому из пунктов (1)-(7):
(1) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 84, и вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 92;
(2) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 85, и вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 92;
(3) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 86, и вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 92;
(4) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 87, и вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 92;
(5) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 88, и вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 92;
(6) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 89, и вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 92; и
(7) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 90, и вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 92.
В другом аспекте данное изобретение предлагает антитело, включающее в себя вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3 по любому из пунктов (1)-(15):
(1) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 174, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(2) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 175, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(3) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 176, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(4) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 177, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(5) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 178, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(6) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 179, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(7) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 180, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(8) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 181, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(9) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 182, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(10) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 183, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(11) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 184, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(12) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 185, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(13) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 186, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158;
(14) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 187, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158; или
(15) CDR1, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 188, CDR2, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 144, и CDR3, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 158.
В другом аспекте данное изобретение предлагает антитело, выбранное из группы, состоящей из антител пунктов (1)-(15):
(1) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 174, 144 и 158, соответственно;
(2) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 175, 144 и 158, соответственно;
(3) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 176, 144 и 158, соответственно;
(4) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 177, 144 и 158, соответственно;
(5) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 178, 144 и 158, соответственно;
(6) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 179, 144 и 158, соответственно;
(7) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 180, 144 и 158, соответственно;
(8) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 181, 144 и 158, соответственно;
(9) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 182, 144 и 158, соответственно;
(10) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 183, 144 и 158, соответственно;
(11) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 184, 144 и 158, соответственно;
(12) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 185, 144 и 158, соответственно;
(13) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 186, 144 и 158, соответственно;
(14) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 187, 144 и 158, соответственно; и
(15) антитело, включающее в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 188, 144 и 158, соответственно.
В следующем аспекте данное изобретение предлагает антитело, содержащее вариабельный участок легкой цепи, выбранный из вариабельных участков (1)-(15):
(1) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 191;
(2) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 192;
(3) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 193;
(4) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 194;
(5) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 195;
(6) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 196;
(7) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 197;
(8) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 198;
(9) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 199;
(10) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 200;
(11) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 201;
(12) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 202;
(13) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 203;
(14) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 204; и
(15) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 205.
В другом аспекте данное изобретение предлагает антитело, содержащее вариабельный участок легкой цепи, выбранный из группы, состоящей из вариабельных участков (1)-(15):
(1) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 191;
(2) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 192;
(3) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 193;
(4) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 194;
(5) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 195;
(6) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 196;
(7) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 197;
(8) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 198;
(9) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 199;
(10) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 200;
(11) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 201;
(12) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 202;
(13) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 203;
(14) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 204; и
(15) вариабельный участок легкой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 205;
и вариабельный участок тяжелой цепи, выбранный из группы, состоящей из вариабельных участков (1)-(7):
(1) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 84;
(2) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 85;
(3) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 86;
(4) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 87;
(5) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 88;
(6) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 89; и
(7) вариабельный участок тяжелой цепи, имеющий аминокислотную последовательность, описанную в SEQ ID NO: 90.
Вариабельный участок тяжелой цепи (H), вариабельный участок легкой цепи (L) и аминокислотная последовательность CDR 1, 2 и 3, а также номера SEQ ID NO приведены в таблице 1.
Таблица 1 | ||
Антитело и вариабельные участки | SEQ ID NO | |
M3C11 | H | 22 |
M13B3 | H | 23 |
M1E7 | H | 24 |
M3B8 | H | 25 |
M11F1 | H | 26 |
M19B11 | H | 27 |
M6B1 | H | 28 |
M18D4 | H | 29 |
M5B9 | H | 30 |
M10D2 | H | 31 |
L9G11 | H | 32 |
M3C11 | L | 44 |
M13B3 | L | 45 |
M1E7 | L | 46 |
M3B8 | L | 47 |
M11F1 | L | 48 |
M19B11 | L | 49 |
M6B1 | L | 50 |
M18D4 | L | 51 |
M5B9 | L | 52 |
M10D2 | L | 53 |
L9G11 | L | 54 |
GC199 | H | 60 |
GC202 | H | 61 |
GC33 | H | 62 |
GC179 | H | 63 |
GC194 | H | 64 |
GC199 | L | 71 |
GC202 | L | 72 |
GC33 | L | 73 |
GC179 | L | 74 |
GC194(1) | L | 75 |
GC194(2) | L | 76 |
GC33.ver.a | H | 84 |
GC33.ver.c | H | 85 |
GC33.ver.f | H | 86 |
GC33.ver.h | H | 87 |
GC33.ver.i | H | 88 |
GC33.ver.j | H | 89 |
GC33.ver.k | H | 90 |
GC33.ver.a | L | 92 |
M13B3(H) | CDR1 | 103 |
CDR2 | 104 | |
CDR3 | 105 | |
M3B8(H) | CDR1 | 106 |
CDR2 | 107 | |
CDR3 | 108 | |
M11F1(H) | CDR1 | 109 |
CDR2 | 110 | |
CDR3 | 111 | |
M5B9(H) | CDR1 | 112 |
CDR2 | 113 | |
CDR3 | 114 | |
M6B1(H) | CDR1 | 115 |
CDR2 | 116 | |
CDR3 | 117 | |
M10D2(H) | CDR1 | 118 |
CDR2 | 119 | |
CDR3 | 120 | |
L9G11(H) | CDR1 | 118 |
CDR2 | 121 | |
CDR3 | 122 | |
GC33(H) | CDR1 | 123 |
CDR2 | 124 | |
CDR3 | 125 | |
GC179(H) | CDR1 | 126 |
CDR2 | 127 | |
CDR3 | 128 | |
GC194(H) | CDR1 | 129 |
CDR2 | 130 | |
CDR3 | 131 | |
GC199(H) | CDR1 | 132 |
CDR2 | 133 | |
CDR3 | 134 | |
GC202(H) | CDR1 | 106 |
CDR2 | 135 | |
CDR3 | 136 | |
M13B3(L) | CDR1 | 137 |
CDR2 | 138 | |
CDR3 | 139 | |
M3B8(L) | CDR1 | 140 |
CDR2 | 141 | |
CDR3 | 142 | |
M11F1(L) | CDR1 | 143 |
CDR2 | 144 | |
CDR3 | 145 | |
M5B9(L) | CDR1 | 146 |
CDR2 | 147 | |
CDR3 | 148 | |
M6B1(L) | CDR1 | 149 |
CDR2 | 150 | |
CDR3 | 151 | |
M10D2(L) | CDR1 | 152 |
CDR2 | 153 | |
CDR3 | 154 | |
L9G11(L) | CDR1 | 155 |
CDR2 | 156 | |
CDR3 | 157 | |
GC33(L) | CDR1 | 143 |
CDR2 | 144 | |
CDR3 | 158 | |
GC179(L) | CDR1 | 159 |
CDR2 | 160 | |
CDR3 | 161 | |
GC194(L)1 | CDR1 | 162 |
CDR2 | 147 | |
CDR3 | 163 | |
GC194(L)2 | CDR1 | 164 |
CDR2 | 165 | |
CDR3 | 166 | |
GC199(L) | CDR1 | 167 |
CDR2 | 168 | |
CDR3 | 169 | |
GC202(L) | CDR1 | 170 |
CDR2 | 144 | |
CDR3 | 171 | |
GC33(L) | G34A | 174 |
GC33(L) | G34D | 175 |
GC33(L) | G34E | 176 |
GC33(L) | G34F | 177 |
GC33(L) | G34H | 178 |
GC33(L) | G34N | 179 |
GC33(L) | G34P | 180 |
GC33(L) | G34Q | 181 |
GC33(L) | G34I | 182 |
GC33(L) | G34K | 183 |
GC33(L) | G34L | 184 |
GC33(L) | G34V | 185 |
GC33(L) | G34W | 186 |
GC33(L) | G34Y | 187 |
GC33(L) | G34R | 188 |
Кроме того, в данном изобретении описывается антитело, обладающее активностью, эквивалентной активности описанного выше антитела, и имеющее описанную выше аминокислотную последовательность, в которой один или несколько аминокислотных остатков замещены, удалены или добавлены и/или вставлены.
Предпочтительно антитело данного изобретения представляет собой гуманизированное антитело.
Так, в другом аспекте данное изобретение предлагает гуманизированное антитело, способное связываться с глипиканом 3.
В следующем аспекте данное изобретение предлагает антитело, способное связываться с пептидом, состоящим из последовательности аминокислотных остатков 524-563 глипикана 3.
Предпочтительно антитело данного изобретения способно связываться с пептидом, состоящим из последовательности аминокислотных остатков 537-563 глипикана 3. Более предпочтительно антитело данного изобретения не связывается с пептидом, состоящим из последовательности аминокислотных остатков 550-563 глипикана 3.
Предпочтительно антитело способно связываться с пептидом, состоящим из последовательности аминокислотных остатков 544-553 глипикана 3, или с пептидом, состоящим из последовательности аминокислотных остатков 546-551 глипикана 3.
В следующем аспекте данное изобретение предлагает антитело, способное связываться с эпитопом, с которым может связываться вторичное антитело, где упомянутое вторичное антитело включает в себя вариабельный участок тяжелой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 123, 124 и 125, соответственно, и вариабельный участок легкой цепи, содержащий CDR 1, 2 и 3, имеющие аминокислотные последовательности, описанные в SEQ ID NO: 143, 144 и 158, соответственно. А именно антитело данного изобретения может конкурировать с вторичным антителом за связывание с GPC3.
В предпочтительном воплощении антитело данного изобретения может связываться с глипиканом 3 и обладает высокой CDC-активностью по отношению к клеткам, экспрессирующим глипикан 3, и/или высокой ADCC-активностью по отношению к клеткам, экспрессирующим глипикан 3.
В другом аспекте данное изобретение предлагает полинуклеотид, кодирующий вариабельный участок тяжелой цепи или вариабельный участок легкой цепи антитела данного изобретения.
Предпочтительно полинуклеотид данного изобретения имеет последовательность, описанную в SEQ ID NO: 11-21, 33-43, 55-59, 65-70 и 77-83.
В следующем аспекте данное изобретение предлагает ингибитор клеточного роста и противораковое средство, содержащие в качестве активного ингредиента антитело данного изобретения. Предпочтительно противораковое средство данного изобретения используют для лечения гепатомы.
В следующем аспекте данное изобретение предлагает пептид, содержащий последовательность аминокислотных остатков 524-563 глипикана 3, последовательность аминокислотных остатков 537-563 глипикана 3, последовательность аминокислотных остатков 544-553 глипикана 3 или последовательность аминокислотных остатков 546-551 глипикана 3.
Краткое описание чертежей
На фиг.1 показана связывающая активность антитела против GPC3 в клетке CHO, клетке CHO, экспрессирующей полноразмерные GPC3, HepG2 и HuH-7, измеренная с помощью проточной цитометрии. M1E7 (сплошная линия) и M11F1 (пунктирная линия) используют в концентрации 5 мкг/мл, соответственно.
На фиг.2 приведена таблица, демонстрирующая результаты классификации по эпитопам, полученные с помощью конкурентного анализа ELISA. Степень конкурентного ингибирования связывания биотинилированного антитела против GPC3 приведена в процентах. Эпитопы подразделяют на пять групп, от a до e, в соответствии с характером конкурентного ингибирования.
На фиг.3 приведены результаты вестерн-блоттинга, которые показывают, с каким фрагментом растворимой формы корового белка GPC3 связывается антитело против GPC3: с N-концевым фрагментом размером 40 кДа или с C-концевым фрагментом размером 30 кДа. Было обнаружено, что L9G11 связывается с N-концевым фрагментом, а M3C11 связывается с С-концевым фрагментом.
На фиг.4 показаны результаты детекции секретируемой формы GPC3 в культуральном супернатанте HepG2 с помощью сэндвич-метода ELISA. Секретируемая форма хорошо детектируется при использовании сочетания антител, которые связываются с N-концевым фрагментом, таким как M6B1, M18D4 или M19B11, и плохо детектируется при использовании сочетания антител, которые связываются с С-концевым фрагментом, та