Штамм вируса гриппа а/гонконг/1/68/162/35 (h3n2)-универсальный донор внутренних генов для реассортантов и реассортантные штаммы а/спб/гк/09 (h1n1) и а/нк/astana/6:2/2010 (h5n1), полученные на его основе

Штамм вируса гриппа а/гонконг/1/68/162/35 (h3n2)-универсальный донор внутренних генов для реассортантов и реассортантные штаммы а/спб/гк/09 (h1n1) и а/нк/astana/6:2/2010 (h5n1), полученные на его основе

Иллюстрации

Показать все

Реферат

Изобретение относится к области медицинской биотехнологии и предназначено для применения при получении реассортантов вируса гриппа A, используемых в производстве живых и инактивированных вакцин.

Изобретение направлено на снижение временных и ресурсных затрат при получении вакцинных штаммов для вакцин против гриппа.

В настоящее время для получения живых (ЖГВ) и инактивированных (ИГВ) вакцин против гриппа используют разные штаммы, полученные методом классической генетики - реассортации генов эпидемических вирусов и вирусов-доноров внутренних генов, обладающих заданными свойствами. Вакцинные штаммы должны содержать гены поверхностных белков от эпидемических вирусов и гены внутренних белков от вируса-донора.

Для живых вакцин против гриппа A в качестве доноров используют 2 холодоадаптированных (ХА) штамма: A/Ленинград/134/17/57 (H2N2) в России и A/Ann Arbor/6/60 (H2N2) в США, которые отвечают основным требованиям к донорам для ЖГВ, в первую очередь ареактогенностью для человека и высокой иммуногенностью [Живая вакцина против гриппа, 1994; СПб. Наука. 151 с.; Antiviral research, 1981; N 1: p.339-365].

Донор A/Arm Arbor/6/60-ca(H2N2) был разработан Maassab H.F. в 1967 г. [Nature, 1967; Vol.213: р.612-614]. «Дикий» штамм предшественник A/Ann Arbor/6/60(H2N2) был выделен на первичной культуре клеток почки курицы (chicken kidney cells - СК клетки) и в последующем пассирован на КЭ при снижаемой после каждых 8-10 пассажей температуре от 33°C до 25°C. В итоге был получен холодоадаптированный вариант A/Ann Arbor/6/60-ca(H2N2). Число пассажей при низкой температуре в названии вируса не обозначено, однако обозначен фенотип вируса: ca=cold adapted. Для ИГВ этот донор не используется.

Исследования эффективности различных вакцин на основе ХА донора A/Ann Arbor/6/60 методом искусственного челленджа (инфекцией диким вирусом, спустя 1-3 месяца после иммунизации), проведенные R.Cough и Т.Cates, показали, что у всех вакцинированных в период челленджа не наблюдалось никаких признаков заболевания, в то время как среди невакцинированных уровень заболеваемости достигал 58-60%.

Донор A/Ленинград/134/17/57(H2N2) разработан отечественными учеными Г.И. Александровой и А.А. Смородинцевым в середине 60-х годов. Путем серии пассажей эпидемического вируса A/Ленинград/134/57 в куриных эмбрионах (КЭ) при оптимальной (32°C) и пониженной (25°C) температуре был получен штамм, безвредный для человека. Накопление мутаций в геноме вируса A/Ленинград/134/57, приведших к выраженной аттенуации (фенотип ca, ts - холодоадаптированный, температурочувствительный), происходило в процессе пассирования при пониженной температуре (25°C-27°C). Для получения ИГВ этот донор не применяют.

Рекомбинанты обоих подтипов H1N1 и H3N2 на основе ХА штамма Ленинград/134/17/57, как правило, сохраняли ts-фенотип своего ХА «родителя». Живая вакцина из этих реассортантов была безвредна и ареактогенна для взрослых, в том числе для лиц с низким исходным уровнем, или совсем не имевших антител против вакцинного штамма. Изучение эффективности вакцин посредством мониторинга заболеваемости среди вакцинированных и невакцинированных в эпидемический период показало высокую эпидемиологическую эффективность препаратов ЖГВ.

Известно, что штаммы-доноры A/Ленинград/134/17/5 7(H2N2) и A/Ann Arbor/6/60-ca(H2N2) помимо способности размножаться при пониженной температуре обладают также свойством ограниченной репликации при повышенной до 39-40°C температуре, то есть являются температурочувствительными. Инфекционная активность штаммов при различных температурах обозначена в табл.1.

Аттенуированность штаммов доноров была показана на различных животных моделях. Оба штамма размножались только в верхних дыхательных путях мышей, размножение в легких мышей было ограниченным и на 3-й день уже не детектировалось. Штамм A/Ann Arbor/6/60-ca был также изучен на хорьках как наиболее близкой к человеку модели для оценки вакцинных штаммов. Репликация штамма A/Ann Arbor/6/60-ca была ограничена носами животных (в отличие от его дикого предшественника).

Табл. 1.
Инфекционная активность холодоадаптированных штаммов-доноров при различных температурах.
	Инфекционная активность, lgЭИД50/0.2 мл
	25°C	33°C	39-40°C
A/Ленинград/134/17/57(H2N2)	6,5	8,0	1,0
A/Ann Arbor/6/60-ca(H2N2)	6,8	7,8	0,6

В качестве донора внутренних генов для инактивированных вакцин против гриппа используют вирус субтипа AH1N1 - A/Пуэрто Рико/8/34. Вирус давно используется в производстве вакцин, детально изучен, не опасен для человека и имеет громадное преимущество перед другими - высокую репродуктивность - свойство, повышающее рентабельность вакцин.

В 1960 году впервые был применен метод получения антигенно актуального высокорепродуктивного в КЭ штамма путем рекомбинации эпидемического вируса гриппа A подтипа H2N2 и штамма A/Пуэрто Рико/8/34(H1N1) - сокращенно A/PR/8/34. В 1973 г. было предложено использовать штамм A/PR/8/34 в качестве основного донора для конструирования противогриппозных вакцин. На основе этого донора было приготовлено 8 реассортантов вируса гриппа сероподтипов H1N1 и H3N2, которые были всесторонне изучены на восприимчивых людях разного возраста в лабораториях США, Западной Европы и Австралии. Реассортанты, полученные на высокорепродуктивном доноре A/PR/8/34 из-за неизвестной истории культивирования разрешены только для получения ИГВ, но не ЖГВ.

Использование штамма A/PR/5/8/34 в качестве донора было основано на отсутствии реактогенности и высокой иммуногенности испытанных реассортантов, превышающих в 3-4 раза общепринятый минимальный защитный уровень гуморальных антител (1:32). Инфекционная активность штамма A/PR/8/34 в КЭ достигает 9,5-10 lgЭИД50/0,2 мл [Живая вакцина против гриппа, 1994; СПб. Наука, 151 с.].

На данный момент существуют две различные линии штамма PR8 - штамм PR8 университета Кэмбридж (Великобритания) и штамм PR8 университета Маунт-Синай (США). Второй из них является более приспособленным к росту в КЭ и передает это преимущество 6:2 рекомбинантам, наследующим 6 генов от донора и 2 гена от эпидемического штамма. Аминокислотные различия между двумя штаммами 2-х линий имеются практически во всех внутренних генах, в том числе, с изменением свойств в генах PB1, PB2, PB1-F2, NS2, M2 (табл.2).

Табл. 2
Аминокислотные различия между штаммом A/PR/8/34 линии Кэмбридж и штаммом PR8-UW (линии Маунт-Синай)
Белок	А.к. позиция	Аминокислота
A/PR/8/34 - Cambridge	A/PR/8/34-UW	Изменение свойств а.к.
	105	Met	Ile	Нет
251	Lys	Arg	Нет
PB2	299	Lys	Arg	Нет
360	Ser	Tyr	Нет
504	Val	Ile	Нет
702	Arg	Lys	Нет
	175	Lys	Asn	Да
205	Ile	Met	Да
PB1	208	Arg	Lys	Нет
216	Gly	Ser	Нет
563	Arg	Ile	Да
PB1-F2	59	Lys	Arg	Нет
60	Gin	Arg	Да
PA	158	Arg	Lys	Нет
550	Leu	Ile	Нет
	353	Val	Leu	Нет
NP	425	Val	Ile	Нет
430	Thr	Asn	Нет
M2	27	Ala	Thr	Да
39	Ile	Thr	Да
NS1	55	Glu	Lys	Да
101	Glu	Asp	Нет
NS2	89	Val	Ile	Нет

Было проведено сравнение рекомбинантов, с одинаковыми поверхностными антигенами подтипа H5N1, полученных на основе различных линий штаммов-доноров A/PR/8/34 [Virology, 2007; 366: 23-27]. Установлено, что рекомбинанты, созданные на основе разных штаммов A/PR/8/34, обладают разной репродуктивной активностью.

Рекомбинант с поверхностными антигенами штамма A/Вьетнам/1194/2004(H5N1), созданный на основе A/PR/8/34-UW, обладал повышенной репродуктивной активностью (9,17 lgЭИД50/мл) по сравнению со штаммом NIBRG-14 (8,32 lgЭИД50/мл), созданным на основе донора A/PR/8/34 Кэмбриджского университета. Отмеченная инфекционная активность измерялась при 37°C.

При 33°C репродуктивность рекомбинанта на A/PR/8/34-Cambridge не изменялась, а рекомбинанта на A/PR/8/34-UW возрастала в 2,2 раза (+0,2 lgЭИД50/мл). Сравнение рекомбинантов по количеству HA, получаемого из эквивалентного количества аллантоиса, показало, что рекомбинант на A/PR/8/34-UW давал концентрацию HA в 2,7-5,1 раз больше, чем рекомбинант на A/PR/8/34-Cambridge [Virology. 2007. 366: 23-27].

Существование разных доноров внутренних генов для реассортантов, используемых в производстве живых и инактивированных вакцин, требует раздельного создания штаммов для ЖГВ и ИГВ. Получение реассортантных штаммов для вакцин ЖГВ и ИГВ и проверка их соответствия стандартам требует работы разных коллективов в течение 3-4 месяцев, что влечет за собой двойные материальные и временные затраты.

Цель изобретения состояла в создании штамма вируса гриппа - универсального донора внутренних генов для вакцинных штаммов, используемых при производстве как живой, так и инактивированной гриппозных вакцин.

Задача решена методом классической аттенуации вируса гриппа A путем пассажей в организме чужеродного хозяина - куриных эмбрионах, при оптимальной (32-33°C) и пониженной (25-26°C) температурах.

Сущностью данного изобретения является создание штамма вируса гриппа A(H3N2), обладающего одновременно высокой репродуктивностью (9,0-10,0 lgЭИД50/0,2 мл) и маркерами аттенуации: холодоадаптированностью (ca) и температурочувствительностью (ts), способностью активно репродуцироваться при пониженных температурах и полным отсутствием или низкой активностью репродукции при повышенных температурах. Это делает созданный штамм пригодным для получения на его основе реассортантов как для ЖГВ, так и для ИГВ. При этом, эпидемические вирусы гриппа A могут быть разных подтипов, что подтверждено примерами получения реассортантов донора A/Гонконг/1/68/162/35 с генетически удаленными подтипами вирусов.

Благодаря единому донору аттенуации, разработка новых вакцинных штаммов требует меньше времени, трудозатрат и денежных средств.

1. История вируса. Оценка реактогенности и иммуногенных свойств первых пассажных вариантов вируса A/Гонконг/1/68 на волонтерах.

Штамм A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2) создан на основе эпидемического вируса A/Гонконг/1/68(H3N2), выделенного на куриных эмбрионах от больного человека в 1968 г. в Гонконге, и переданный в НИИ гриппа из Всемирного Центра по гриппу (Лондон) в 1969 г. на уровне 5-го пассажа.

В 1969-70 гг. в НИИ гриппа в процессе подготовки живой гриппозной вакцины для гриппа A(H3N2) на волонтерах были изучены реактогенные и иммуногенные свойства вируса, прошедшего несколько пассажей на развивающихся куриных эмбрионах. Экспериментальные серии препаратов из испытуемых вариантов штамма A/Гонконг/1/68 готовили и контролировали в соответствии с МРТУ-42 на живую гриппозную вакцину. Концентрация активного вируса, вводившегося людям, составляла 10^6,0-7,4 ЭИД_{50/0,2 мл} [Иммунология и специфика профилактики гриппа у детей. Сб. трудов ВНИИ гриппа, 1971; Л., с.166-175].

Вирус, полученный после 12 пассажа в куриных эмбрионах, сохранял способность вызывать клинические проявления гриппозной инфекции у людей, в том числе, средней степени тяжести - у 29,2%. Реактогенные свойства вариантов A/Гонконг/1/15, A/Гонконг/1/21 и A/Гонконг/1/25, полученных после 15, 21 и 25 пассажей, были испытаны на контингентах молодых мужчин численностью от 156 до 569 человек в группах. При интраназальном введении этих вариантов отмечалось появление реакций 1 степени (легкой) у 14,6-24,3% привитых людей, а реакции средней тяжести регистрировались не более, чем у 2,0% волонтеров, что не превышало допустимого уровня остаточной вирулентности для живых гриппозных моновакцин. Среди 128 непривитых людей контрольной группы реакции 1 степени регистрировались в 10,1% случаев и лишь у одного человека отмечен подъем температуры до 37,6((0,8%). Таким образом, варианты вируса A/Гонконг/1/68, прошедшие свыше 15 пассажей в куриных эмбрионах, были безвредными для людей и по показателям реактогенности отвечали требованиям, предъявляемым к вакцинным штаммам вируса гриппа (табл.3) [Иммунология и специфика профилактики гриппа у детей. Сб. трудов ВНИИ гриппа, 1971: Л., с.166-175].

Полученный в 1970 г. вакцинный штамм A/Гонконг/1/68/25 использовался в качестве ЖГВ, но его дальнейшая разработка в качестве донора внутренних генов не предполагалась. Вместе с тем, было очевидно, что пассирование этого вируса привело к усилению таких свойств как гемагглютинирующая активность и репродуктивность, важных для вакцинных производственных штаммов.

В начале 2000-х годов работа с вирусом была возобновлена с целью создания донора аттенуации и высокой репродуктивности, т.е. универсального донора для обоего типа вакцин. Был выбран пассажный вариант A/Гонконг/1/68/25(Н3Н2), приобретший признаки аттенуации. Выбранный кандидат отличался по субтипу от существующих доноров аттенуации A/Ленинград/134/17/57(H2N2) и A/Ann Arbor/6/60-ca(H2N2), и от донора высокой репродуктивности - A/Пуэрто Рико/8/34(H1N1).

Табл. 3
Реактогенность и приживаемость вариантов вируса A/Гонконг/1/68 на разных этапах аттенуации
Число пассажей вируса на куриных эмбрионах	Количество привитых людей	Из них дали температурную реакцию	Приживаемость вируса
1 степени	2-3 степени	Число обследованных людей	Вирус выделен
всего	%	всего	%	всего	%
12	24	12	50,0	7	29,2	18	12	66,6
15	156	38	24,3	3	2,0	-
21	596	109	18,3	11	1,8	88	49	55,6
25	253	37	14,6	5	1,9	-	-	-
Плацебо	128	12	10,1	1

2. Аттенуация штамма A/Гонконг/1/68 (H3N2) путем пассирования на куриных эмбрионах при оптимальной 32-33°C и пониженной (25°C-26°C) температурах.

Дальнейшую аттенуацию штамма A/Гонконг/1/68/25 проводили путем пассирования через развивающиеся куриные эмбрионы с инкубацией последних при температуре 32-33°C в течение 48 часов. Проведено 137 пассажей, всего - 162 пассажа.

Одним из основных требований к вирусам - донорам внутренних генов для вакцинных штаммов является способность активно репродуцироваться при пониженной температуре - холодоадаптированность и сниженная способность репродуцироваться при повышенной температуре - температурочувствительность. В связи с этим штамм A/Гонконг/1/68/162 (A/ГК/162) был подвергнут холодовой адаптации путем последовательных пассажей на КЭ при 25-26°C с инкубацией после заражения при температуре 25-26°C. При этой температуре вирус прошел 35 пассажей.

Всего в целях аттенуации штамма проведено 162 пассажа в куриных эмбрионах при температуре 32°C и 35 пассажей при пониженной (26°C) температуре.

3. Биологические свойства вируса A/Гонконг/1/68/162/35.

В процессе аттенуации были изучены следующие биологические свойства вируса: способность размножаться в развивающихся куриных эмбрионах, гемагглютинирующая активность в отношении эритроцитов кур, чувствительность к ингибиторам сывороток животных, антигенные свойства в перекрестной реакции торможения гемаггютинации (РТГА) с различными типоспецифическими сыворотками, безвредность для лабораторных животных.

Полученные штаммы взаимодействовали с термостабильными γ-ингибиторами сывороток различных лабораторных животных до титра 1:80-1:320. Чувствительность вируса к сывороточным ингибиторам не менялась в процессе пассажей на куриных эмбрионах. В перекрестной РТГА вирус нейтрализовался штаммоспецифической крысиной сывороткой A/Гонконг/1/68 до титра 1:160 и не реагировал с типоспецифическими сыворотками к вирусам A/H1N1, A/H2N2, A/H3N2, B и сыворотками к вирусам Сендай и NDV. Вирус обладал высокой гемагглютинирующей активностью в отношении куриных эритроцитов.

Инфекционная и гемагглютинирующая активность увеличивалась по мере нарастания пассажей как при оптимальной, так и при пониженной температуре (табл.4).

Характеристика инфекционной активности исходного штамма A/Гонконг/1/68/ (H3N2), холодоадаптированного штамма A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2) и промежуточных вариантов при оптимальной (32°C) и пониженной (26°C) температурах представлена также в табл.5. Для сравнения использованы штаммы A/PR/8/34(H1N1) - общепринятый донор для получения высокоурожайных реассортантов для инактивированных гриппозных вакцин и донор аттенуации А/Ленинград/134/17/57(Н2М2), используемый в РФ для приготовления вакцинных штаммов для живой гриппозной вакцины [Живая вакцина против гриппа, 1994; СПб. Наука. 151 с.].

Табл. 4
Биологические свойства пассажных вариантов вируса A/Гонконг/1/68
	Инфекционная активность в КЭ при оптимальной температуре (32°C), lg ЭИД50/0,2 мл		Инфекционная активность в КЭ при пониженной температуре (26°C), lg ЭИД50/0,2 мл
Гемагглютинирующая активность, ГАЕ/50 мкл
Вариант штамма
A/Гонконг/1/68/15	7,2	64	2,5
A/Гонконг/1/68/150	8,5	512	2,5
A/Гонконг/1/68/162/10	8.5	512-1024	3,0
A/Гонконг/1/68/162/35	9,0	1024-2048	8,5

По своей инфекционной активности разработанный штамм A/Гонконг/1/68/162/35 превосходил донор аттенуации A/Ленинград/134/57/17 при пониженной температуре (26°C) на 2,0 lg ЭИД 50/0,2 мл, а при оптимальной (32°C) на 1,0 lg ЭИД 50/0,2 мл, то есть штамм обладал более выраженными свойствами холодовой адаптации (ca), чем существующий донор для ЖГВ, и инфекционной активностью, равной донору для ИГВ (табл.5). Полученный вирус чрезвычайно слабо размножался при 139-40°C, то есть обладал вторым маркером аттенуации - темперотурочувствительностью (ts).

Также новый донор был сопоставим по активности с используемым в настоящее время для получения производственных штаммов штаммом - донором высокой репродуктивности - A/PR/8/34.

Были изучены ростовые характеристики штамма A/Гонконг /1/68/162/35/09 в культуре клеток MDCK, а также его репродуктивная активность в верхних и нижних дыхательных путях мышей. В носовых ходах мышей вирус репродуцировался до 5,5 lg ЭИД 50/мл, в легких - до 2,75 lg ЭИД 50/мл.

Табл. 5
Характеристика инфекционной активности вариантов штамма A/Гонконг/1/68
Штамм	Инфекционная активность (lg ЭИД50/0,2 мл) при температуре:	Гемагглютинирующая активность, ГАЕ/50 мкл
26°C	32°C	39°C
A/Гонконг/1/68/15	2,5	7,2	н/и	64
A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2)	8,5	9,0	1,0	1024-2048
A/Ленинград/134/57/17(H2N2)	6,5	8,0	1,0	64-128
A/PR/8/34	3,5	9,0-9,5	8,5	1024

Сравнительная характеристика основных биологических свойств исходного штамма A/Гонконг/1/68/ и холодоадаптированного штамма A/Гонконг/1/68/162/35 представлена в табл.6.

Табл. 6
Сравнительная характеристика репродуктивных свойств штаммов вируса гриппа A/Гонконг/1/68 и A/Гонконг /1/68/162/35/09
Штамм	Инфекционная активность при температуре (lg ЭИД50/0,2 мл)	RCT26	RCT39	Фенотип	Гемагглютинирующая активность, ГАЕ/50 м кл
26°C	32°C	39°C
A/Гонконг/1/68/15	2,5	7,25	5,0	4,75	2,25	non-ca, non-ts	64
A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2)	8,5	9,0	1,0	0,5	8,0	ca, ts	1024-2048

Штамм A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2) был проконтролирован на токсичность для белых мышей и морских свинок. Испытания проводили в соответствии с Методическими указаниями МУК4.1/4.2.588-96, заражая мышей внутрибрюшинно в дозе 1 мл, морских свинок подкожно в той же дозе, и наблюдая за животными в течение 7 суток. Согласно проведенным исследованиям вирусная популяция не была токсична для лабораторных животных. Все животные остались живы. Максимальная потеря веса не превышала для мышей 7%, для свинок - 4%.

Таким образом, в результате пассирования инфекционная активность вируса гриппа A/Гонконг/1/68/162/35, по сравнению с исходным штаммом, выросла более, чем на 1,5 lg ЭИД_{50/0,2 мл} при 32°С и на 6 lg ЭИД_{50/0,2 мл} при 26°C. Гемагглютинирующая активность возросла в 20-40 раз. Штамм приобрел ca, ts-фенотип, был нетоксичен для лабораторных животных.

4. Секвенирование вируса A/Гонконг/1/68/162/35(Н3Н2).

Шесть «внутренних» генов штамма A/Гонконг/1/162/35(H3H2), двух промежуточных вариантов (A/ГК/1/68/7 и A/ГК/1/68/162) были секвенированы и сопоставлены с нуклеотидными и аминокислотными последовательностями вируса A/ГК/1/68, взятыми из Gene Bank, с целью выявления мутаций в указанных генах в процессе пассирования в КЭ.

Вирусную РНК выделяли с использованием коммерческого набора РИБО-сорб (ФГУ ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Россия). Различные сегменты генома амплифицировали методом ОТ-ПЦР с использованием специально подобранных пар праймеров, набора PEBEPTA-L для обратной транскрипции и комплекта реагентов для ПЦР производства ФГУ ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора (Россия). Очистку ПЦР продуктов осуществляли методом горизонтального ЭФ в 1,7% агарозном геле с последующим выделением ДНК из геля с помощью коммерческого набора QIA Quick Gel Extraction Kit (Qia-gen, США). Реакцию секвенирующей ПЦР ставили с использованием коммерческого набора ABI PRISM BigDye Terminator v3.1 Kit (Applied Biosystems, США). Анализ продуктов реакции секвенирования, очищенных от остаточных терминаторов, производились системой ABI PRISM 3100-Avant Genetic Analyzer (Applied Biosystems, США). Сборку нуклеотидных последовательностей, их обработку и выравнивание осуществляли в программном пакете Vector NTI 10 Advance (Invitrogen, США). В качестве референс-контроля использовали последовательности сегментов генома эпидемического штамма A/Гонконг/1/68(H3K2), взятые из базы данных GenBank (accession numbers: AF348170, AF348172, AF348174, AF348180, AF348188, AF348198).

Секвенирование генов вируса A/Гонконг/1/68/162/35(H3N2) выявило по сравнению с исходным эпидемическим вирусом ряд мутаций в генах PB-2, PB-1, PA, NP, M1 и NS (табл.7). Фенотипически часть мутаций проявилась в аминокислотных заменах, в том числе, со сменой заряда и гидрофильности: по 1 замене в генах PB2, PA, M, NS и по 2 замены в генах PB1 и NP. На стадии холодовой адаптации произошли мутации в генах PB2 (C 2256Т), PA (G 1347А) и NP (A 875G). Мутации в двух последних генах сопровождались заменами аминокислот в соответствующих белках: Met 441 Не и Glu 232 Gly.

Для существующего донора A/Ленинград/134/17/57(H2N2) мутациями, определяющими температурочувствительность, были мутации в генах PB2 и PB1, приведшие к замене аминокислот Val 478 Leu (PB2) и Lys 265 Asn, Val 591 Ile (PB1). Мутации в генах PB2 и PA определили холодовую адаптацию (Leu 28 Pro, Val 341 Leu в гене PA и Val 478 Leu в PB2) [Основы аттенуации вируса гриппа. Автореферат И.В. Киселевой на соискание степени д.б.н. 2001. СПб. 33 с.]. При этом, решающую роль в образовании ts фенотипа имели мутации в PB2 гене.

Какие мутации ответственны за появление маркеров аттенуации - ts и ca в едином доноре A/Гонконг/1/68/162/35(H3N2) определили путем целенаправленного получения и исследования свойств одногенных и двугенных мутантов.

После 10-кратного пассирования вируса A/Гонконг/1/68/162/35(H3N2) на КЭ, был проведен повторный сиквенс внутренних генов. Показано, что все отмеченные мутации сохранились, новые мутации не выявлены, то есть вирусный геном сохранил стабильность. По этим признакам полученный штамм соответствовал требованиям к новым донорам.

Таким образом, при длительном пассировании в гетерологичной системе репродукции развивающихся куриных эмбрионов был получен аттенуированный высокорепродуктивный штамм, имеющий множественные мутации в геноме, безвредный для лабораторных животных, и обладающий высокими показателями инфекционной и гемагглютинирующей активности.

Табл.7
Мутации в доноре A/Гонконг/1/68/162/35(H3N2), обозначен ГК ca, по отношению к исходному вирусу A/Гонконг/1/68, обозначен ГК/1/68, и пассажными вариантами A/Гонконг/1/68/7, обозначен ГК7, и A/Гонконг/1/68/162, обозначен ГК162
Ген	Нуклеотид	ГКЛ/68	ГК7	ГК162	ГК ca	ак	ГК/1/68	ГК7	ГК162	ГК ca
	375	G	G	T	T	120	Glu	Glu	Asp	Asp
1093	T	T	C	C	360	Туг	Tyr	His	His
PB2	1299	G	G	A	A	-	-	Leu	Leu	-	!!
	1554	C	A	A	A	-	-	Leu	Leu	-
1765	A	G	G	G	584	Не	Val	Val	Val
2256	C	C	C	T			-	-	-
	654	G	G	A	A	-	-	-	-	-
1145	С	С	A	A	374	Ala	Ala	Glu	Glu	!!
1314	A	G	A	A	-	-	-	Arg	-
РВ1	1903	C	C	T	T	627	Pro	Pro	Ser	Ser	!!
	2145	A	A	G	G	-	-	-	-	-
2175	C	C	A	A	-	-	-	-	-	не код. обл.
	410	T	C	T	T	129	Ile	Thr	Ile	Ile
990	T	T	C	C	-	-	-	-	-	!!
1347	G	G	G	A	441	Met	Met	Met	Ile
PA	1428	C	C	T	T	-	-	-	-	-
1464	C	C	T	T	-	-	-	-	-
1503	A	G	G	G	-	-	-	-	-
1551	T	T	C	C	-	-	-	-	-
2042	A	G	G	G	673	Lys	Arg	Arg	Arg
	24	G	A	n/a	A	-	-	-	n/a	-
304	G	G	A	A	102	Gly	Gly	Arg	Arg
NP	540	C	C	T	T	-	-	-	-
869	A	G	A	A	290	Asp	Gly	Asp	Asp
875	A	A	A	G	292	Glu	Glu	Glu	Gly	!!
916	C	C	T	T	-	-	-	-	-	!!
1179	A	A	G	G	-	-	-	-	-
	105	G	G	A	A	-	-	-	-	-
M	613	G	G	A	A	M1:205	Val	Val	Ile	Ile
691	G	G	A	A	M1:231	Asp	Asp	Asn	Asn
785	A	A	C	C	M2:33	Ile	Ile	Leu	Leu	!!
787	C	T	T	T		Ile	Ile	Leu	Leu
	13	A	C	C	C	-	-	-	-	-
NS	264	С	G	G	G	NS1:81	Ile	Met	Met	Met
676	A	A	G	G	NS1:219	Lys	Lys	Glu	Glu	не код. обл.
Условные обозначенияГК/1/68 - штамм A/Гонконг/1/68(H3N2), нуклеотидные последовательности генов которого взяты из базы данных GenBank (номера последовательностей: AF348170, AF348172, AF348174, AF348180, AF348188, AF348198)Нуклеотидные последовательности штаммов ГК7, ГК162 и ГКca определены по данным секвенированияНумерация нуклеотидных и аминокислотных замен дана относительно штамма ГКca- - означает, что замена нуклеотида по данному положению не приводит к замене аминокислоты!! - аминокислотные замены сопровождаются сменой заряда/полярности/гидрофильности аминокислотыак - аминокислота

Полученный вирус A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2), кратко: A/ГК/1/68/162/35 (H3N2) представляет собой универсальный донор, соответствующий требованиям к новым донорам аттенуации (табл.8), изложенным в приказе Минздрава России и РАМН №156/29 от 07.05.1998 г., и может быть использован для получения высокорепродуктивных аттенуированных реассортантных штаммов вируса гриппа для живых и инактивированных вакцин. Штамм был депонирован в Государственную коллекцию вирусов под номером ГКВ №2442 (паспорт штамма и свидетельство о депонировании прилагаются).

Табл. 8
Соответствие штамма A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2) требованиям к новым донорам аттенуации (Приложение N 4 к приказу Минздрава России и РАМН от 07.05.1998 г. N 156/29)
ТРЕБОВАНИЯ К НОВЫМ ДОНОРАМ АТТЕНУАЦИИ	НОВЫЙ ДОНОР A/ГОНКОНГ/1/68/162/35 (H3N2)
донор должен быть получен на основе вируса гриппа человека с известной историей культивирования, исключая пассажи на перевиваемых клеточных культурах.	Соответствует (получен от больного человека, пассажная история - 197 пассажей на КЭ).
донор должен быть получен методом холодовой адаптации, который обеспечивает безопасность и генетическую стабильность ХА вариантов.	Соответствует (162 пассажа при оптимальной - 32°C и 35 при пониженной t°-26°C).
донор должен иметь комплекс генетических маркеров и исследован в молекулярно-биологических и биохимических тестах, включая секвенирование "внутренних" генов исходного и ХА вариантов.	Сделан полный синквес внутренних генов исходного вируса и донора на разных этапах аттенуации. Паспортизированы биологические свойства.
геном донора аттенуации должен иметь мутации всех (или большей части) генов, кодирующих негликозилированные белки.	Соответствует (содержит мутации в генах PB2, PB1, PA, NP, M и NS.)

5. Получение и характеристика реассортантов разных подтипов вируса гриппа, полученных на основе донора A/Гонклнг/68/162/35(H3N2).

Пример 1. Получение вакцинного штамма A/СПб/ГК/09 (H1N1).

Штамм был получен методом классической генетической реассортации с последующей селекцией на основе результатов тестов РГА, РТГА и ПЦР.

В качестве родительских штаммов были взяты вирусы - донор аттенуации и высокой репродуктивной активности A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2) и эпидемический штамм A/Санкт-Петербург/48/09 (H1N1), подобный референс штамму A/Бризбен /59/07(H1N1).

Реассортант получен по классической схеме:

1. Смешанный пассаж вирусов в куриных эмбрионах. Вирусы смешивали в соотношении 1:1 и культивировали при 32°C в течение 24 ч. По итогам пассажа собран общий пул вирусов (титр в РГА - 1:1024).

2. Первый селективный пассаж в присутствии кроличьей иммунной сыворотки к вирусу A/ГК/1/68/162/35 (H3N2). Для селекции в работу брали сыворотку, обработанную RDE, с титром 1:1280. Отобранную вируссодержащую жидкость (ВАЖ) смешивали с иммунной сыворткой A/ГК/1/68/162/35 (H3N2) в соотношении 1:1. Смесь выдерживали при комнатной температуре в течение часа и заражали куриные эмбрионы. Эмбрионы культивировали при 25°C в течение 72 ч. По окончании культивирования с ВАЖ от каждого эмбриона ставили РГА. По результатам (отсутствие гемагглютинации) был собран общий пул ВАЖ от всех эмбрионов.

3. Слепой пассаж. Заражали курные эмбрионы цельной аллантоисной жидкостью, собранной после первого селективного пассажа со всех КЭ. По окончании инкубации титры геммаглютинирующей активности ВАЖ составили 1:128-1:256.

4. Второй селективный пассаж в присутствии кроличьей иммунной сыворотки к вирусу A/ГК/1/68/162/35/ (H3N2). Заражали куриные эмбрионы ВАЖ после накопления, инкубировали при 25°C в течение 72 часов. По результатам РГА и ОРТГА с ВАЖ от каждого эмбриона для клонирования был выбран вариант с наибольшей геммаглютинирующей активностью, который в тесте обратной РТГА не взаимодействовал с сывороткой к A/ГК/1/68/162/35 (H3N2) и взаимодействовал с сывороткой к вирусу A/СПб/48/09 (H1N1).

5. Первое клонирование методом предельных разведений проводили в присутствии кроличьей иммунной сыворотки к вирусу A/ГК/1/68/162/35 (H3N2). Делали последовательные 10-кратные разведения ВАЖ от 2 селективного пассажа и каждым разведением от 10^-2 до 10^-8 заражали по 10 КЭ. Эмбрионы инкубировали при оптимальной 32°C и при пониженной температуре 25°C. По окончании инкубирования с ВАЖ от каждого эмбриона ставили РГА и ОРТГА.

6. Вирусы, проявившие наибольшую гемагглютинирующую активность, были протестированы методом ПЦР со специфичными праймерами и ОТ-ПЦР рестрикционного анализа. По результатам был отобран 1 клон с заданной структурой генома 6:2.

7. Второе клонирование методом предельных разведений в присутствии кроличьей иммунной сыворотки к вирусу A/ГК/1/68/162/35 (H3N2). Делали последовательные 10-кратные разведения отобранного клона и каждым разведением от 10^-7 до 10^-10 заражали по 10 КЭ. Эмбрионы инкубировали при 32°C в течение 48 часов. По окончании инкубирования с ВАЖ от каждого эмбриона ставили РГА и ОРТГА.

8. Методом ПЦР со специфичными праймерами и ОТ-ПЦР рестрикционного анализа были проанализированы 2 клона. Клоны имели структуру генома 6:2 (6 генов от донора A/Гонгонг/1/68/162/35 (H3N2) и 2 гена от эпидемического вируса A/СПб/48/09 (H1N1).

Результаты ПЦР и RFLP анализа.

Для анализа состава генома реассортантов на основе A/Гонконг/1/68/162/35(H3N2) и A/Санкт-Петербург/48/09 (H1N1-Brizbane/59 like) применялась специально разработанная схема ПЦР-рестрикционного анализа. Схема была составлена на основе сравнения нуклеотидных последовательностей генов штаммов A/Гонконг/1/68/162/35(H3N2) и A/Бризбен/59/07(H1N1) (GenBank accession numbers: CY058484-CY058486, CY058491). В табл.9 перечислены исследованные гены внутренних и неструктурных белков, участки, содержащие точечные отличия и соответствующие рестриктазы с указанием позиции сайта расщепления. Положение рестриктазы в графе под определенным штаммом означает, что амплифицированная копия фрагмента РНК данного вируса подвергается рестрикции указанным ферментом.

Табл. 9
Схема ПЦР-рестрикционного анализа для определения состава генома реассортантов на основе штаммов A/Гонконг/1/68/162/35(H3N2) и A/Санкт-Петербург/48/09 (H1N1)
Ген	Участок	A/ГК/1/68/162/35	A/СПб/48/09
PB2	851-1264	EcoPI (1100)	-
PB1	1237-1649	HindIII (1504)	-
PA	1474-2195	Ama87I (1612)	-
NP	6-743	BamHI (262,478)	BamHI (478)
M	551-957	Bsa29 I (845)	-
NS	342-882	-	BsmFI (585, 666)

По результатам анализа предварительных образцов, реассортанты с соотношением генов 6:2 были отобраны для дальнейшей работы.

После ряда дополнительных клонирований с целью очистки популяции и выявления наиболее репродуктивно активного штамма, был получен и накоплен итоговый образец.

Подготовлено 2 серии лиофилизированного штамма A/СПб/ГК/09 (H1N1). Полуфабрикат и лиофилизированный вирус охарактеризован и проконтролирован в соответствии с требованиями к реассортантным штаммам.

Изучение репродуктивной активности реассортанта A/СПб/ГК/09 (H1N1) при различных температурах показало, что реассортат получил признак холодоаптированности от донора A/ГК/1/68/162/35 (H3N2) и характеризовался высокой урожайностью (9,3 lg ЭИД₅₀/мл) при оптимальной температуре. Результаты приведены в табл.10

Табл. 10
Инфекционная активность реассортанта A/СПб/ГК/09 (H1N1) на основе донора A/ГК/1/68/162/35/09 (H3N2) при различных температурах.
Штамм	Инфекционная активность при температуре (lg ЭИД50/мл)	RCT26	RCT39	Фенотип
26°C	32°C	39°C
A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2)	8,5	9,0	1,5	0,5	7,5	са, ts
A/СПб/ГК/09 (H1N1) (реассортант)	6,5	9,3	3,5	2,8	5,8	са, ts
A/СПб/48/09(H1N1)	4,0	8,25	3,75	4,25	4,5	non-ca, ts

Гемагглютинирующую активность вируса оценивали в РТГА с эритроцитами кур. Как следует из представленных в табл.17 данных, гемагглютинирующая активность реассортанта (1:512) была выше, чему у «дикого» вируса A/СПб/48/09 (1:256), хотя уступала гемагглютинирующей активности донора (1:1024).

Изучение безвредности реассортантного штамма A/СПб/ГК/09 (H1N1) и родительских вирусов A/Санкт-Петербург/48/09 (H1N1) и A/Гонконг/1/68/162/35 (H3N2) на самках мышей линии BALB/c (по 15 в группе) при интраназальном инфицировании под легкой анестезией аллантоисной жидкостью, содержащей A/СПб/ГК/09 (H1N1) или родительские штаммы в дозе 10⁶ ЭИД₅₀, показало, что реассортантный штамм не является патогенным для мышей, то есть он не вызывает гибель, снижения массы тела и развития клинических симптомов инфекции. Результаты представлены на рис.1 «Показатели снижения веса мышей после заражения реассортантом A/СПб/ГК/09 (H1N1) (а) и родительскими вирусами A/Санкт-Петербург/48/09 (H1N1) (б) и A/Гонконг/1/68/162/35/09 (H3N2) (в)», где по оси абсцисс указаны сутки наблюдения, по оси ординат - масса жив