Способы применения sns-595 для лечения субъектов с онкологическими заболеваниями, имеющих сниженную активность brca2

Способы применения sns-595 для лечения субъектов с онкологическими заболеваниями, имеющих сниженную активность brca2

Иллюстрации

Показать все

Реферат

1. Родственные заявки

Настоящая заявка испрашивает приоритет предварительной заявки на патент США №№ 61/156449, поданной 27 февраля 2009 г., и 61/170013, поданной 16 апреля 2009 г. Описания указанных выше заявок полностью включены в настоящую заявку путем ссылки.

2. Область техники

Настоящее изобретение относится к способам лечения онкологического заболевания у субъекта, имеющего сниженную активность BRCA2. В определенных вариантах осуществления способы включают введение субъекту терапевтически эффективного количества SNS-595.

3. Предшествующий уровень техники

Онкологические заболевания являются одной из ведущих причин смерти в США. Каждый год более полумиллиона американцев умирают от онкологических заболеваний, и более чем у одного миллиона вновь диагностируются эти заболевания. Онкологические опухоли могут возникнуть в результате того, что клетка избегает регуляторных механизмов ее нормального роста и пролиферирует неконтролируемым образом. Опухолевые клетки могут метастазировать во вторичные участки, если лечение первичной опухоли или неполное, или не начато перед значительным прогрессированием заболевания. Ранняя диагностика и эффективное лечение опухолей может быть существенным для выживания.

Белки, кодируемые генами восприимчивости к раку молочной железы (белки BRCA1 и BRCA2), связывали с предрасположенностью к раку молочной железы, яичников и другим видам рака. Указанные белки экспрессированы и причастны ко многим процессам, фундаментальным для всех клеток, включая репарацию и рекомбинацию ДНК, сверочные точки контроля клеточного цикла и транскрипцию.

BRCA1 и BRCA2 важны для репарации двухнитевого разрыва ДНК (DSB) гомологичной рекомбинацией (HR). Мутации в генах BRCA1 и BRCA2 могут предрасполагать субъектов к различным онкологическим заболеваниям. Мутации зародышевой линии в BRCA1 и BRCA2 ответственны приблизительно за 5-10% всех видов эпителиального рака яичников (см. Li and Karlan, Curr Oncol Rep, 2001 3:27-32). Было показано, что 20-60% случаев рака молочной железы связаны с мутацией зародышевой линии в любом из указанных генов в семьях, где указанным заболеванием страдают многие субъекты (примерно 2-6% всех случаев). Nathanson et al., Nature Med, 2001 7, 552-556, 2001. Носители мутаций BRCA1 и BRCA2 также восприимчивы к онкологическим поражениям предстательной железы, поджелудочной железы и мужской молочной железы. См., Venkitaraman, J. Cell Sci, 2001 114, 3591-98.

В связи со значением мутаций BRCA1 и BRCA2 при онкологических поражениях молочной железы, яичников и других видах рака, существует потребность в способах лечения страдающих онкологическими заболеваниями субъектов, имеющих мутации BRCA2, или у которых иным образом снижена активность BRCA2.

4. Краткое изложение сущности изобретения

Наблюдалось, что присутствие мутаций BRCA2 увеличивает реактивность злокачественных клеток у субъекта на лечение SNS-595, которая представляет собой (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-метокси-4-(метиламино)-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновую кислоту. Соответственно, один вариант осуществления относится к способу лечения субъекта, страдающего онкологическим заболеванием, такого как пациент с онкологическим заболеванием, имеющий мутацию BRCA2, которая нарушает активность BRCA2 (или в клетках которых активность BRCA2 подвергнута понижающей регуляции или снижена относительно нормальной, например, сниженная экспрессия), включающему введение субъекту терапевтически эффективного количества SNS-595.

В определенных вариантах осуществления способы по настоящему изобретению включают диагностику мутации BRCA2 у субъекта SNS-595. В определенных вариантах осуществления способы по настоящему изобретению включают диагностику понижающей регуляции или снижения активности BRCA2 у субъекта с онкологическим заболеванием и лечение субъекта SNS-595.

В определенных вариантах осуществления способы по настоящему изобретению включают введение дозы примерно 10-100 мг/м² SNS-595 субъекту с онкологическим заболеванием, имеющему мутацию BRCA2, или у которого снижена активность (или экспрессия) BRCA2.

В определенных вариантах осуществления способы по настоящему изобретению включают обеспечение контакта злокачественной клетки, имеющей мутацию BRCA2, с некоторым количеством SNS-595, эффективным для вызова двухнитевых разрывов ДНК.

Способы по настоящему изобретению включают лечение онкологических заболеваний молочной железы, яичников, предстательной железы и других видов рака, где злокачественная клетка проявляет мутацию BRCA2.

В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу идентификации субъекта для лечения SNS-595, включающему диагностику мутации BRCA2 у субъекта.

В определенных вариантах осуществления SNS-595 применяется отдельно, т.е. без других химиотерапевтических средств.

В других вариантах осуществления, SNS-595 вводится в комбинации с одним или более терапевтических средств, т.е. фармацевтических средств, обладающих активностью против онкологического заболевания или его симптомов. Примеры способов лечения в пределах объема способов включают без ограничения хирургическое вмешательство, химиотерапию, лучевую терапию, гормональную терапию, биологическую терапию, иммунотерапию и их комбинации. Комбинации включают одновременное, а также последовательное введение.

В некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство выбрано из алкилирующих агентов, антиметаболитов, ингибиторов Аврора-киназы, антагонистов пурина, антагонистов пиримидина, яда сверочной точки сборки веретена, митотических ингибиторов, ингибиторов и ядов топоизомеразы II, ингибиторов топоизомеразы I, антинеопластических антибиотиков, нитрозомочевин, комплексов неорганических ионов, ферментов, гормонов и аналогов гормонов, ингибиторов EGFR (рецепторов эпидермального фактора роста), антител и производных антител, IMID (иммуномодулирующих лекарственных средств), ингибиторов HDAC (деацетилазы гистонов), ингибиторов Bcl-2, ингибиторов тирозинкиназы, стимулируемой VEGF, ингибиторов VEGFR, ингибиторов протеасомы, ингибиторов циклинзависимой киназы, ингибиторов PARP (полимеразы I поли (АДФ-рибозы), ингибиторов ароматазы и дексаметазона.

В конкретном варианте осуществления, комбинированная терапия включает введение SNS-595 и по меньшей мере одного терапевтического средства, выбранного из доцетаксела, таксотера, винорелбина, капецитабина, доксорубицина, госерелина, золедроновой кислоты, паклитаксела, памидроната, анастрозола, экземестана, циклофосфамида, эпирубицина, фулвестранта, летрозола, гемцитабина, лейпролида, филграстима, G-CSF или фактора, стимулирующего колонии гранулоцитов, пегфилграстима, торемифена, тамоксифена, бевацизумаба, трастузумаба, 5-фторурацила, метотрексата, трабектидина, эпоэтина альфа и дарбепоэтина альфа. В другом варианте осуществления комбинированная терапия включает введение SNS-595 и средства поддерживающего лечения.

Изобретение также относится к схемам введения, курсам введения и способам применения SNS-595 у субъектов с онкологическими заболеваниями, имеющими нарушенную активность BRCA2.

В определенных вариантах осуществления изобретение относится к фармацевтическим композициям, содержащим SNS-595 и фармацевтически приемлемый носитель, адъювант или разбавитель, для лечения субъектов с онкологическими заболеваниями, имеющих сниженную активность BRCA2.

5. Краткое описание чертежей

Фиг.1 иллюстрирует ингибирование роста клеток китайского хомячка, которые мутантны в отношении BRCA2 (VC8) и комплементированы в отношении функционального BRCA2 (VC8-B2) в присутствии доксорубицина.

Фиг.2 иллюстрирует ингибирование роста клеток VC8 и VC8-B2 в присутствии SNS-595.

Фиг.3 иллюстрирует разрастание колонии клеток саркомы человека U-20S (клеток дикого типа и клеток с истощенным запасом BRCA2 при использовании миРНК (малой интерферирующей РНК)) после обработки доксорубицином.

Фиг.4 иллюстрирует разрастание колонии клеток саркомы человека U-20S (клеток дикого типа и клеток с истощенным запасом BRCA2 при использовании миРНК) после обработки SNS-595.

На фиг.5 представлен гель-электрофорез в пульсирующем поле (PFGE) для 18-часового периода обработки SNS-595 и доксорубицином, каждым отдельно и при совместной обработке с афидиколином в течение времени включения 240 секунд.

На фиг.6 представлен PFGE для 24-часового периода обработки SNS-595 и доксорубицином, каждым отдельно и при совместной обработке с афидиколином в течение времени включения от 60 до 240 секунд.

Фиг.7 иллюстрирует различия повреждающей ДНК активности SNS-595 и доксорубицина, как демонстрируется продукцией более мелких фрагментов ДНК после обработки доксорубицином, чем SNS-595, для 18-часового периода PFGE.

Фиг.8 иллюстрирует различия повреждающей ДНК активности SNS-595 и доксорубицина, как демонстрируется продукцией более мелких фрагментов ДНК после обработки доксорубицином, чем SNS-595, для 24-часового периода PFGE.

Фиг.9 иллюстрирует эффективность клонирования клеток SPD8 после обработка каждым из афидиколина, SNS-595 и доксорубицина, и каждым из SNS-595 и доксорубицина при совместной обработке с афидиколином.

Фиг.10 иллюстрирует частоту реверсии мутации HPRT (гена гипоксантин-гуанин фосфорибозилтрансферазы) клеток SPD8 после обработки афидиколином, SNS-595 и доксорубицином, и каждым из SNS-595 и доксорубицина при совместной обработке с афидиколином.

6. Подробное описание изобретения

6.1 Определения

Все технические и научные термины, используемые в настоящем описании, имеют такое же значение, которое обычно понятно среднему специалисту в данной области. Все патенты, заявки, опубликованные заявки и другие публикации полностью включены в настоящее описание путем ссылки. В случае, когда имеется множество определений для представленного в настоящем описании термина, то, если нет иных указаний, преобладающее значение имеют те, которые приведены в настоящем разделе.

Используемый в настоящем описании термин «SNS-595» означает (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-метокси-4-(метиламино)-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновую кислоту, в также любую ионную форму, соли, сольваты, например, гидраты или другие формы указанного соединения, включая их смеси. Таким образом, композиции, содержащие SNS-595, могут включать (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-метокси-4-(метиламино)-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновую кислоту или ее ионную форму, соль, сольват, например, гидрат, или другую форму соединения. В некоторых вариантах осуществления SNS-595 представлена в виде фармацевтически приемлемой соли. В некоторых вариантах осуществления SNS-595 включает композицию, состоящую по существу из (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-метокси-4-(метиламино)-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновой кислоты, включая менее чем 0,5% масс. других соединений или примесей на основании общей массы композиции. Такие примеси включают соединения, имеющие остов тиазолил-оксо-нафтиридин-3-карбоновой кислоты, такие как (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-гидрокси-4-метиламино-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновая кислота, (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-метокси-4-амино-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновая кислота и/или (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-гидрокси-4-амино-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновая кислота. Иллюстративные композиции SNS-595 описаны во временной заявке на патент США № 61/141856, полное содержание которой включено в настоящую заявку путем ссылки.

Используемый в настоящем описании термин «энантиомерно чистая SNS-595» относится к SNS-595, которая по существу не содержит (-)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-метокси-4-(метиламино)-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновой кислоты. Другими словами, энантиомерно чистая SNS-595 представляет энантиомерный избыток «-» формы. Термин «энантиомерно чистое» или «чистый энантиомер» обозначает, что соединение содержит более чем примерно 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5%, 99,6%, 99,7%, 99,8% или 99,9% масс. SNS-595.

Используемые в настоящем описании, если нет других указаний, термины «лечить» и «лечение» относятся к облегчению или уменьшению тяжести заболевания или симптома, связанного с подвергаемым лечению заболеванием или состоянием.

Используемый в настоящем описании термин «предотвращать», «предотвращение» и другие формы указанного слова включают ингибирование начала или прогрессирования заболевания или расстройства или симптома конкретного заболевания или расстройства. В некоторых вариантах осуществления субъекты с семейным анамнезом онкологических заболеваний являются кандидатами для применения профилактических схем лечения. В целом, в контексте онкологических заболеваний, термин «предотвращение» относится к введению лекарственного средства перед началом признаков или симптомов онкологического заболевания, в частности, у субъектов, имеющих риск развития онкологического заболевания.

Используемый в настоящем описании, и если нет других указаний, термин «ведение пациента» включает предотвращение рецидива конкретного заболевания или расстройства у субъекта, который страдал им, удлинение времени ремиссии заболевания или расстройства, которым страдал субъект, снижение смертности субъектов и/или поддержание снижения тяжести или избегание симптома, связанного с заболеванием или состоянием у подлежащего ведению пациента.

Используемый в настоящем описании термин «субъект» означает животное, обычно млекопитающее, включая человека. Используемый в настоящем описании термин «пациент» означает человека.

Используемый в настоящем описании термин «образец» или «биологический образец» относится к ткани или экстракту, включая клетку и физиологическую жидкость, по которому можно получить информацию относительно статуса BRCA2 у субъекта с помощью способов анализа, известных в данной области. Обычно биологический образец представляет собой образец крови. Однако образец может быть взят из одного или более из разнообразных источников у субъекта, включая образцы биологических жидкостей или образцы ткани. Подходящие образцы ткани включают различные типы опухолевой или злокачественной ткани, ткани органов, такие как образцы, взятые при биопсии. Образец может обрабатываться перед использованием, например, как это происходит при получении плазмы из крови, разбавлении вязких жидкостей и тому подобных видах обработки. Способы обработки образца могут включать фильтрацию, перегонку, экстракцию, концентрацию, инактивацию создающих помехи компонентов, добавление реагентов и тому подобные.

Используемые в настоящем описании, если нет других указаний, термины «терапевтически эффективное количество» и «эффективное количество» соединения относятся к количеству, достаточному для обеспечения терапевтического благоприятного действия при лечении, профилактике заболевания и/или ведении пациента, имеющего данное заболевание, для задержки или минимизации одного или более симптомов, связанных с заболеванием или расстройством, подлежащим лечению. Термины «терапевтически эффективное количество» и «эффективное количество» могут включать количество, которое в целом улучшает терапию, уменьшает или устраняет симптомы или причины заболевания или расстройства или повышает терапевтическую эффективность другого терапевтического средства.

Используемые в настоящем описании, если нет других указаний, термин «фармацевтически приемлемая соль» включает без ограничения соль кислотной или основной группы, которая может присутствовать в соединениях по настоящему изобретению. В определенных кислотных условиях соединение может образовывать широкое разнообразие солей с различными неорганическими и органическими кислотами. Кислоты, которые могут использоваться для получения фармацевтически приемлемых солей таких основных соединений, представляют собой те, которые образуют соли, содержащие фармацевтически приемлемые анионы, включая без ограничения ацетат, бензолсульфонат, бензоат, бикарбонат, битартрат, бромид, кальция эдетат, камсилат, карбонат, хлорид, бромид, иодид, цитрат, дигидрохлорид, эдетат, эдисилат, эстолат, эсилат, фумарат, глюцептат, глюконат, глутамат, гликоллиларсанилат, гексилрезорцинат, гидрабамин, гидроксинафтоат, изетионат, лактат, лактобионат, малат, малеат, манделат, метансульфонат (мезилат), метилсульфат, мускат, напсилат, нитрат, пантотенат, фосфат/дифосфат, полигалактуронат, салицилат, стеарат, сукцинат, сульфат, таннат, тартрат, теоклат, триэтиодид и памоат. В определенных основных условиях, соединение может образовывать основные соли с различными фармакологически приемлемыми катионами. Неограничивающие примеры таких солей включают соли щелочных или щелочноземельных металлов и, в частности, соли кальция, магния, натрия, лития, цинка, калия и железа.

Используемый в настоящем описании, если нет других указаний, термин «гидрат» означает SNS-595 или ее соль, кроме того, включающую стехиометрическое или не стехиометрическое количество воды, связанной нековалентными межмолекулярными силами. Гидраты SNS-595 могут быть кристаллическими или не кристаллическими.

Используемый в настоящем описании, если нет других указаний, термин «сольват» означает сольват, образованный в результате ассоциации одной или более молекул растворителя с соединением по настоящему изобретению. Термин «сольват» включает гидраты (например, моногидрат, дигидрат, тригидрат, тетрагидрат и тому подобные). Сольваты SNS-595 могут быть кристаллическими или не кристаллическими.

Используемая в настоящем описании промежуточная фраза «состоящие по существу» ограничивает объем притязания определенными материалами, и дополнительные материалы существенным образом не воздействуют на основные и новые характеристики заявленного предмета изобретения.

Термины «совместное введение» или «в комбинации с» включают введение двух или более терапевтических средств (например, SNS-595 или композиции по настоящему изобретению и другого противоракового средства или другого активного средства) или одновременно, или совместно, или последовательно без определенных временных пределов. В одном варианте осуществления SNS-595 и по меньшей мере одно другое средство присутствуют в клетке или в организме субъекта в одно и то же время или оказывают свой биологический или терапевтический эффект в одно и то же время. В одном варианте осуществления терапевтические средства содержатся в одной и той же композиции или стандартной лекарственной форме. В другом варианте осуществления терапевтические средства находятся в отдельных композициях или стандартных лекарственных формах.

Термин «средство поддерживающего лечения» относится к любому активному средству, которое лечит, предотвращает, справляется или устраняет побочный или нежелательный эффект лечения SNS-595 отдельно или в комбинации с другими терапевтическими средствами. Примеры описаны в настоящей заявке.

6.2 SNS-595

Соединение для применения в способах по настоящему изобретению, включая комбинированную терапию, и в композициях по настоящему изобретению, представляет собой энантиомерно чистую (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-метокси-4-(метиламино)-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновую кислоту, которая также известна как SNS-595 или AG-7352. Советом по номенклатуре лекарственных средств, принятой в США (USANC) соединению присвоено название «ворелоксин».

SNS-595 имеет следующую химическую структуру:

В определенных вариантах осуществления в способах и композициях по настоящему изобретению применяются фармацевтически приемлемые соли, сольваты, гидрат или пролекарства SNS-595.

В определенных вариантах осуществления SNS-595 вводится в виде композиции, состоящей по существу из энантиомерно чистой (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-метокси-4-(метиламино)-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновой кислоты, включающей менее чем 0,5% масс. других соединений или примесей на основании общей массы композиции. Такие примеси включают соединения, имеющие остов тиазолил-оксо-нафтиридин-3-карбоновой кислоты, такие как (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-гидрокси-4-метиламино-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновая кислота, (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-метокси-4-амино-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновая кислота и/или (+)-1,4-дигидро-7-[(3S,4S)-3-гидрокси-4-амино-1-пирролидинил]-4-оксо-1-(2-тиазолил)-1,8-нафтиридин-3-карбоновая кислота.

SNS-595 может быть получена способами, известными специалисту в данной области, например, в соответствии с процедурой, описанной в заявке на патент США № 12/650390, поданной 30 декабря 2009 г.; международной публикации № WO 2007/146335; патенте США № 5817669; и заявке на патент Японии № Hei 10-173986, полные содержания которых включены в настоящую заявку путем ссылки. Определенные иллюстративные фармацевтические композиции, содержащие SNS-595, и способы их применения описаны в заявках на патенты США №№ 2005/0203120; 2005/0215583; 2006/0025437; 2006/0063795, 2006/0247267 и временных заявках на патенты США №№ 61/240161, поданной 4 сентября 2009 г., 61/240113, поданной 4 сентября 2009 г., и 61/288213, поданной 18 сентября 2009 г., которые полностью включены в настоящее описание путем ссылки.

6.3 Способы лечения

Процесс гомологичной рекомбинационной репарации (HRR) представляет собой основной путь репарации ДНК, которая действует на двухнитевые разрывы (DSB) и межнитевые поперечные сшивки. HRR обеспечивает механизм безошибочного удаления повреждения, присутствующего в ДНК, которая была реплицирована. Таким образом, HRR действует решающим образом, в координации с механизмом сверочных точек контроля S и G2, для устранения хромосомных разрывов перед тем как происходит клеточное деление. См. публикацию Thompson et al., Mutation Research/Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis, 2001, 477, 131-153.

Злокачественные клетки с мутациями BRCA2, которая нарушает активность BRCA2, могут иметь нарушенную гомологичную рекомбинантную репарацию. Без предполагаемой связи с какой-либо конкретной теорией функции, такие клетки могут иметь более высокую чувствительность к лечению SNS-595, потому что лечение SNS-595 может привести к увеличению числа двухнитевых разрывов ДНК, которые не могут быть восстановлены ввиду недостаточной HRR в указанных клетках. Аналогичным образом, если активность BRCA2 в клетках снижена, по сравнению с нормальными уровнями, например, наличием понижающей регуляции экспрессии BRCA2, такие клетки могут иметь более высокую чувствительность к SNS-595. Таким образом, способы по настоящему изобретению включают лечение, профилактику или ведение субъекта с онкологическим заболеванием, например, пациента, имеющего мутацию BRCA2, введением терапевтически эффективного количества SNS-595. В определенных вариантах осуществления способы включают лечение онкологических заболеваний молочной железы, яичников, предстательной железы, поджелудочной железы и других онкологических заболеваний у субъекта, такого как пациент, у которого проявляется мутация BRCA2. В одном варианте осуществления онкологическое заболевание представляет собой рак молочной железы у субъекта, такого как пациентка, у которой проявляется мутация BRCA2.

В определенных вариантах осуществления способы включают лечение онкологических заболеваний молочной железы, яичников, предстательной железы, поджелудочной железы и других онкологических заболеваний, где в злокачественной клетке проявляется мутация BRCA2. В одном варианте осуществления онкологическое заболевание представляет собой рак молочной железы, где в злокачественной клетке проявляется мутация BRCA2.

В другом аспекте изобретение относится к способу идентификации субъекта для лечения SNS-595, включающему диагностику мутации BRCA2 у субъекта.

В определенных вариантах осуществления способы по настоящему изобретению включают обеспечение контакта злокачественной клетки у субъекта или полученной у субъекта, имеющей мутацию BRCA2, с терапевтически эффективным количеством SNS-595. В целом, количество используемой SNS-595 эффективно для вызова двухнитевых разрывов ДНК. Контакт может происходить in vitro, in vivo или ex vivo. В одном варианте осуществления способ включает обеспечение контакта злокачественной клетки in vivo.

В одном варианте осуществления изобретение относится к способу идентификации страдающего онкологическим заболеванием субъекта, подходящего для лечения SNS-595, включающему: (a) получение биологического образца у кандидата, страдающего онкологическим заболеванием; (b) скрининг биологического образца для выявления мутации BRCA2; и (c) если у кандидата имеется мутация BRCA2, идентификацию кандидата как страдающего онкологическим заболеванием субъекта, подходящего для лечения SNS-595. В другом варианте осуществления кандидаты, идентифицированные как страдающие онкологическими заболеваниями субъекты, подходящие для лечения SNS-595, получают лечение SNS-595.

В другом варианте осуществления изобретение относится к способу идентификации одного или более страдающих онкологическими заболеваниями субъектов, подходящих для лечения SNS-595, из множества страдающих онкологическими заболеваниями субъектов, являющихся кандидатами для лечения. Способ включает идентификацию одного или более страдающих онкологическими заболеваниями субъектов, имеющих мутацию BRCA2, из множества страдающих онкологическими заболеваниями субъектов, подходящих для лечения SNS-595. В одном варианте осуществления один или более подходящих субъектов получают лечение SNS-595.

В одном варианте осуществления один или более субъектов, у которых уровни активности BRCA2 находятся в нормальном диапазоне (или значимо не снижены), не получают лечение SNS-595. В определенных вариантах осуществления все субъекты, у которых уровни активности BRCA2 находятся в нормальном диапазоне (или значимо не снижены), не получают лечение SNS-595. Например, субъект, у которого уровень активности BRCA2 является нормальным (или значимо не снижен), может получать лечение с использованием альтернативного терапевтического средства, такого как химиотерапевтическое средство, на противораковую активность которого не воздействует статус BRCA2. Альтернативно, субъект, имеющий нормальную или почти нормальную активность BRCA2, может получать лечение SNS-595 с использованием другого протокола лечения, такого как схема лечения, при которой дозы SNS-595 вводятся чаще или используются более высокие дозы SNS-595, чем те, которые рассматривались бы для пациента, у которого активность BRCA2 снижена.

В одном варианте осуществления один или более субъектов, у которых не проявляется мутация BRCA2, не получают лечение SNS-595. В определенных вариантах осуществления все субъекты, у которых не проявляется мутация BRCA2, не получают лечение SNS-595. Например, субъект, не имеющий мутацию BRCA2, может лечиться с использованием альтернативного терапевтического средства, такого как химиотерапевтическое средство, на противораковую активность которого не воздействует мутацию BRCA2. Альтернативно, субъект, не имеющий мутацию BRCA2, может лечиться SNS-595 с использованием другого протокола лечения, такого как схема лечения, при которой дозы SNS-595 вводятся чаще или используются более высокие дозы SNS-595, чем те, которые рассматривались бы для пациента, имеющего мутацию BRCA2.

Мутацию BRCA2 в злокачественной клетке можно диагностировать любой подходящей методикой, известной в данной области, такой как генное секвенирование, включая тестирующий анализ BRACAnalysis® от компании Myriad Genetic Laboratories, Inc., мультиплексная зависимая от лигирования амплификация зондов (MLPA), высокоразрешающий анализ кривой расплава (см., Dufresne et al., Arch Pathol Lab Med, 2006, 130:185-187 и Takano et al., BMC Cancer, 2008, 8:59), тест усечения белка (PTT), денатурирующий градиентный гель-электрофорез (DGGE) и/или денатурирующая высокоэффективная жидкостная хроматография (DHPLC).

В определенных вариантах осуществления мутации в BRCA2 представляют собой мелкие делеции или вставки, которые могут быть обнаружены наряду с цельным протеином. Способы по настоящему изобретению включают лечение страдающих онкологическими заболеваниями субъектов с любой мутацией BRCA2, известной специалисту в данной области. Примеры таких мутаций включают, например, 999del5, 6174delT, 8803delC, 4486delG, 5445del5 и 2024del5, 763insAT, 763insAT, 983delACAG, A3058T, 3758delACAG, 3908delTG, 4706delAAAG, 5804delTTAA, C6137A, 6174delT, 6305insA, 9132delC, del2352ins12, dup9700, dell518 и другие, описанные, например, Loman et al., J Natl Cancer Inst, 2001, 93(16):1215-1223; Peto et al., J Natl Cancer Inst, 1999, 91(11):943-949; и Walsh et al., JAMA, 2006, 295(12): 1379-88.

Без связи с какой-либо определенной теорией, считается, что SNS-595 вызывает сайт-селективное повреждение ДНК селективным интеркалированием в ДНК и отравлением топоизомеразы II, приводящим к зависимому от репликации повреждению ДНК, необратимой остановке G2 и быстрому апоптозу. Напротив, схемы лечения на основе антрациклина, вызывают опосредованные топоизомеразой II двухнитевые разрывы (DSB) ДНК, а также повреждающую ДНК активность посредством не связанных с топоизомеразой II механизмов, включая генерирование аддуктов ДНК, образование поперечных сшивок ДНК и продукцию реактивных видов кислорода (ROS). См. Gewirtz D., Biochem Pharmacol 1999, 57:727-41.

Целевые взаимодействия ДНК-фермента при терапии SNS-595 отличаются от механистических более разнородными и высоко интеркаляционными антрациклинами, которые применяются клинически (O'Reilly et al., Biochemistry 2002, 41:7989-97; Wang J., Nat Rev Mol Cell Biol, 2002, 3:430-40). Указанные отличительные признаки указывают на то, что роль BRCA2 в репарации вызванного SNS-595 повреждения ДНК нельзя непосредственно перенести из данных, относящихся к антрациклинам, таким как доксорубицин, или ингибиторам топоизомеразы II, таким как этопозид. Данные, представленные в разделе «Примеры», которые демонстрируют сенсибилизацию клеток с мутацией BRCA2 к SNS-595, подтверждают роль BRCA2 в репарации повреждения ДНК, вызванного SNS-595.

В определенных вариантах осуществления способы лечения по настоящему изобретению включают введение субъекту дозы примерно от 10 до 100 мг/м² SNS-595. В определенных вариантах осуществления способы лечения включают введение субъекту дозы примерно 10-100 мг/м², примерно 20-90 мг/м², примерно 30-90 мг/м², примерно 40-90 мг/м², примерно 30-80 мг/м², примерно 40-80 мг/м² или примерно 30-50 мг/м².

В некоторых вариантах осуществления способы включают введение субъекту терапевтически эффективного количества SNS-595 в комбинации с терапевтически эффективным количеством второго активного средства. В некоторых вариантах осуществления второе активное средство представляет собой терапевтическое антитело к раковому антигену, гематопоэтический фактор роста, цитокин, противораковое средство, антибиотик, ингибитор cox-2, иммуномодулирующее средство, иммуносупрессивное средство, кортикостероид или его фармакологически активный мутант или производное. В других вариантах осуществления второе активное средство представляет собой алкилирующий агент, антинеопластический антибиотик, антиметаболит, платиновый координационный комплекс, ингибитор или яд топоизомеразы II, ингибитор CDK (циклинзависимой киназы), ингибитор Аврора-киназы, антагонист пурина, антагонист пиримидина, веретенный яд, митотический ингибитор, ингибитор топоизомеразы I, нитрозомочевину, комплекс неорганических ионов, фермент, гормон или аналог гормона, ингибитор EGFR, антитело или производное антитела, IMID, ингибитор HDAC, ингибитор Bcl-2, ингибитор тирозинкиназы, стимулируемой VEGF, ингибитор VEGFR, ингибитор протеасомы, ингибитор ароматазы, ингибитор PARP, дексаметазон или облучение.

6.3.1 Субъекты

В определенных вариантах осуществления способов по изобретению подлежащий лечению субъект представляет собой животное, например, млекопитающее или примата, не являющегося человеком. В конкретных вариантах осуществления субъект представляет собой человека-пациента. Субъект может относиться к мужскому или женскому полу.

В частности, субъекты, подлежащие лечению в соответствии со способами по настоящему изобретению, включают субъектов, страдающих раком молочной железы, яичников, поджелудочной железы или предстательной железы, и имеют сниженную активность BRCA2. В конкретном варианте осуществления, субъект страдает раком молочной железы. В определенных вариантах осуществления рак молочной железы был устойчив к предшествующему лечению и/или после предшествующего лечения произошел его рецидив. Снижение активности BRCA2 может быть связано с любой мутацией BRCA2, известной специалистам в данной области. Во многих вариантах осуществления, мутация BRCA2 представляет собой мутацию, которая нарушает активность BRCA2, которая может проявляться в различных механистических формах. Например, мутация может нарушить экспрессию BRCA2, т.е. количество протеина BRCA2, продуцируемого в клетках, или мутация может нарушить биологическую активность протеина, такую как взаимодействие BRCA2 с другим протеином или нуклеиновой кислотой, или ферментативную активность протеина BRCA2. Мутация или недостаточная активность BRCA2 может диагностироваться у субъекта любой методикой, считающейся подходящей специалистом в данной области. Иллюстративные методики описаны в публикациях Oncogene, 1998, 16(23): 3069-82, Kuznetsov et al., Nature Medicine, 2008, 14, 875-881, Dufresne et al., Arch Pathol Lab Med, 2006, 130:185-187 и Takano et al., BMC Cancer, 2008, 8:59.

Настоящее изобретение также включает способы лечения субъекта независимо от возраста субъекта, хотя некоторые заболевания и расстройства более распространены в определенных возрастных группах. В некоторых вариантах осуществления субъект представляет собой человека-пациента в возрасте по меньшей мере 18 лет. В некоторых вариантах осуществления возраст пациента составляет 10, 15, 18, 21, 24, 35, 40, 45, 50, 55, 65, 70, 75, 80 или 85 лет или более.

В некоторых вариантах осуществления способы по изобретению находят применение у пациентов в возрасте по меньшей мере 50 лет, хотя данные способы могут также оказать благоприятное воздействие на пациентов более молодого возраста. В других вариантах осуществления возраст пациентов составляет по меньшей мере 55, по меньшей мере 60, по меньшей мере 65 и по меньшей мере 70 лет. В определенных вариантах осуществления способы по изобретению могут применяться у пациентки, у которой имеется личный анамнез раннего начала рака молочной железы (до 50-летнего возраста) или раннего начала рака молочной железы и яичников в любом возрасте. В другом варианте осуществления пациентка представляет собой женщину, имеющую семейный анамнез рака молочной железы или рака молочной железы и яичников. В другом варианте осуществления пациент представляет собой мужчину с личным или семейным анамнезом рака молочной железы у мужчин.

В определенных вариантах осуществления способы по настоящему изобретению включают лечение субъектов, которые ранее не получали лечение по поводу онкологических заболеваний. В других вариантах осуществления способы включают лечение субъектов, которые ранее получали лечение, но не реагируют на стандартные способы лечения, а также субъектов, которые получают лечение в настоящее время по поводу онкологического заболевания. Например, возможно, субъекты ранее получали лечение или в настоящее время получают лечение по поводу онкологического заболевания с использованием стандартной схемы лечения, известной практикующему онкологу.

В некоторых вариантах осуществления субъект ранее не подвергался лечению SNS-595. В некоторых вариантах осуществления субъект ранее подвергался лечению SNS-595.

6.3.2 Дозировки

В определенных репрезентативных вариантах осуществления способ лечения, профилактики и ведения пациентов с онкологическими заболеваниями по настоящему изобретению включает введение субъекту эффективного количества SNS-595 любым приемлемым путем введения. В целом, способ включает введение субъекту на основании площади поверхности тела дозы примерно 10-100 мг/м² SNS-595. В другом варианте осуществления способ по изобретению включает введение дозы примерно 20-90 мг/м² SNS-595. В другом варианте осуществления способ по изобретению включает введение дозы примерно 40-90 мг/м² SNS-595. В другом варианте осуществления способ включает введение дозы примерно 30-50 мг/м² SNS-595. В другом варианте осуществления способ включает введение дозы примерно 30-90 мг/м² SNS-595. В другом варианте осуществления способ включает введение дозы примерно 40-90 мг/м² SNS-595. В другом варианте осуществления способ включает введение дозы примерно 30-80 мг/м² SNS-595. В другом варианте осуществления способ включа