2562861 - Модуляция экспрессии гентингтина

Модуляция экспрессии гентингтина

Иллюстрации

Показать все

Изобретение относится к области биохимии, в частности к соединениям и композициям для ослабления экспрессии гентингтина. Заявлены варианты одноцепочечного модифицированного олигонуклеотида, ингибирующего экспрессию гентингтина. Олигонуклеотид содержит гэп-сегмент из десяти дезоксинуклеозидов, 5′-фланкирующий сегмент из пяти нуклеозидов и 3′-фланкирующий сегмент из пяти нуклеозидов. Гэп-сегмент расположен между 5′- и 3′-фланкирующими сегментами, где все нуклеозиды фланкирующих сегментов содержат 2′-O-метоксиэтил-модифицированный сахар. Межнуклеозидные связи в гэп-сегменте, связи, соединяющие гэп-сегмент с 5′- или 3′-фланкирующим сегментом, и связи для самого крайнего с 5′-конца и самого крайнего с 3′-конца нуклеозидов каждого из фланкирующих сегментов являются фосфоротиоатными связями; межнуклеозидные связи, соединяющие остальные нуклеозиды обоих фланкирующих сегментов, являются фосфодиэфирными связями. Все цитозины являются 5-метилцитозинами. Также заявлены композиция и способы для лечения, профилактики, замедления или облегчения болезни Гентингтона или ее симптомов. Изобретение позволяет повысить ингибирующую активность в ингибировании экспрессии гентингтина. 10 ил., 95 табл., 21 пр.

Реферат

Область техники

Настоящим документом предусмотрены способы, соединения и композиции для ослабления экспрессии мРНК и белка гентингтина у животного. Такие способы, соединения и композиции применимы, на пример, для лечения, профилактики или облегчения болезни Гентингтона.

Уровень техники

Болезнь Гентингтона (БГ) является тяжелым аутосомным доминантным нейродегенеративным заболеванием, вызванным экспансией тринуклеотидных CAG-повторов, кодирующих аномально длинный полиглутаминовый (PolyQ) участок в белке гентингтине. Ген болезни Гентингтона впервые картировали в 1993 г. (The Huntington's Disease Collaborative Research Group. Cell. 1993, 72:971-83), он состоит из гена IT15, который содержит полиморфный тринуклеотидный повтор, являющийся удлиненным и нестабильным в хромосомах БГ. Хотя повторы CAG в диапазоне нормального размера обычно наследуются как менделевские аллели, удлиненные повторы БГ являются нестабильными при мейотической передаче и, как обнаружили, превышают диапазон нормального размера (6-34 единицы повтора) у больных БГ.

И нормальный, и вариантный белки гентингтина локализованы главным образом в цитоплазме нейронов (DiFiglia et al., Neuron 1995, 14:1075-81). В результате чрезмерной длины полиглутамина белок гентингтина образует агрегаты в цитоплазме и в ядре нейронов ЦНС (Davies et al., Cell 1997, 90:537-548). Для исследования эффектов удлиненных polyQ повторов на локализацию и процессинг гентингтина использовали и трансгенных животных, и линии генно-модифицированных клеток. Однако все еще неясно, является ли образование агрегатов per se важным цитотоксическим этапом или следствием клеточной дисфункции.

БГ характеризуется развитием хореи, психиатрических изменений и умственного ухудшения. Это доминирующее нарушение поражает в равной степени как мужчин, так и женщин и наблюдается у всех рас (Gusella and MacDonald, Curr. Opin. Neurobiol. 1995 5:656-62). Симптомы БГ возникают в результате гибели нейронов во многих участках головного мозга, но чаще всего это наблюдается в полосатом теле, в частности, в хвостатом ядре, которое претерпевает нарастающую потерю клеток, что в конечном счете уничтожает всю структуру. Хотя ген, кодирующий гентингтин, экспрессируется убиквитарно (Strong, T.V. et al., Nat. Genet. 1995, 5:259-263), селективная потеря клеток и фибриллярный астроцитоз наблюдаются в головном мозге, в частности, в хвостатом ядре и ограде полосатого тела, а также в коре головного мозга больных БГ (Vonsattel, J-P. et al., Neuropathol. Exp.Neurol. 1985, 44:559-577), и в меньшей степени в гиппокампе (Spargo, E. et al., J. Neurol. Neurosurg. Psychiatry 1993, 56:487-491) и в субталамусе (Byers, R.K. et al., Neurology 1973, 23:561-569).

Гентингтин важен для нормального развития и может рассматриваться как ген выживания клеток (Nasir et al., Human Molecular Genetics, Vol 5, 1431-1435). Нормальная функция гентингтина о стается н е полностью охарактеризованной, но на основе белок-белковых взаимодействий полагают, что она связана с цитоскелетом и необходима для развития нервной клетки (Walling et al., J. Neurosci Res. 1998, 54:301-8). Гентингтин специфично расщепляется во время апоптоза ключевой цистеиновой протеазой апопаином, как известно, играющей основную роль в апоптической клеточной смерти. Скорость расщепления усиливается более длинными полиглутаминовыми участками, что указывает на то, что в основе БГ лежит неадекватный апоптоз.

Метод на основе использования антисмысловых соединений становится эффективным средством для ослабления экспрессии специфичных генных продуктов и, следовательно, может оказаться исключительно применимым в ряде терапевтических, диагностических и исследовательских применений для модуляции экспрессии гентингтина (см. патентные публикации США №№2008/0039418 и 2007/0299027).

Антисмысловые соеди нения для модуляции э кспрессии гентингтина раскрыты в вышеупомянутых опубликованных патентных заявках. Однако остается потребность в дополнительных таких соединениях.

Сущность изобретения

Настоящим документом предусмотрены способы, соединения и композиции для модуляции экспрессии гентингтина и лечения, профилактики, замедления или облегчения болезни Гентингтона и/или ее симптома.

Краткое описание чертежей

Фиг.1

Отношение PK/PD экспрессии мРНК гентингтина в ткани полосатого тела с концентрацией ISIS 387898 в головном мозге мыши. Мышам C57/BL6 вводили один болюс 50 мкг ISIS 387898 и измеряли экспрессию мРНК гентингтина, а также концентрацию антисмыслового олигонуклеотида в ткани. Также рассчитывали ЕС₅₀ ISIS 387898.

Фиг.2

Сравнение экспрессии мРНК гентингтина в ткани полосатого тела и концентрации ISIS 387898 в различных точках времени. Мышам C57/BL6 вводили один болюс 50 мкг ISIS 387898 и измеряли экспрессию мРНК гентингтина, а также концентрацию антисмыслового олигонуклеотида в ткани. Продолжительность действия (измеренная по экспрессии htt мРНК) ISIS 387898 (пунктирная линия), как наблюдали, была больше, даже после концентрации олигонуклеотида (сплошная линия) в ткани.

Фиг.3

Отношение PK/PD экспрессии мРНК гентингтина в ткани передней коры с концентрацией ISIS 387898 в головном мозге мыши. Мышам BACHD вводили внутрицеребровентрикулярную инфузию 75 мкг ISIS 387898 в течение 2 недель и измеряли экспрессию мРНК гентингтина, а также концентрацию антисмыслового олигонуклеотида в ткани. Также рассчитывали EC₅₀ ISIS 387898.

Фиг.4

Сравнение экспрессии мРНК гентингтина в ткани передней коры и концентрации ISIS 387898 в различных точках времени. Мышам BACHD вводили внутрицеребровентрикулярную инфузию 75 мкг ISIS 387898 в течение 2 недель и измеряли экспрессию мРНК гентингтина, а также концентрацию антисмыслового олигонуклеотида в ткани. Продолжительность действия (измеренная по экспрессии htt мРНК) ISIS 387898 (пунктирная линия), как наблюдали, была больше, даже после концентрации олигонуклеотида (сплошная линия) в ткани.

Фиг.5

Сравнение экспрессии мРНК гентингтина в ткани задней коры и концентрации ISIS 388241 в различных точках времени. Мышам BACHD вводили внутрицеребровентрикулярную инфузию 50 мкг ISIS 388241 в течение 2 недель и измеряли экспрессию мРНК гентингтина, а также концентрацию антисмыслового олигонуклеотида в ткани. Продолжительность действия (измеренная по экспрессии htt мРНК) ISIS 388241 (пунктирная линия), как наблюдали, была больше, даже после концентрации олигонуклеотида (сплошная линия) в ткани.

Фиг.6

Сравнение экспрессии мРНК гентингтина в ткани задней коры и концентрации ISIS 443139 точках времени. Мышам BACHD вводили внутрицеребровентрикулярную инфузию 50 мкг ISIS 443139 в течение 2 недель и измеряли экспрессию мРНК гентингтина, а также концентрацию антисмыслового олигонуклеотида в ткани. Продолжительность действия (измеренная по экспрессии htt мРНК) ISIS 443139 (пунктирная линия), как наблюдали, была больше, даже после концентрации олигонуклеотида (сплошная линия) в ткани.

Фиг.7

Эффект обработки антисмысловым олигонуклеотидом на двигательную характеристику мышей BACHD с использованием анализа с вращающимся стержнем. Мышей BACHD обрабатывали 50 мкг/сутки ICV ISIS 388241 или PBS в течение двух недель. Контрольные группы нетрансгенных детенышей одного помета обрабатывали подобным образом ISIS 388241 или PBS. Затем выполняли анализ с ускоряющимся вращающимся стержнем. Животных помещали на вращающийся стержень при скорости 2 оборота в минуту; вращающийся стержень ускоряли до 40 оборотов в минуту за 5 минут.Регистрировали отрезок времени до падения. Исходные значения в 6-месячном возрасте брали перед лечением, и данными точками времени являлся возраст мышей, в котором выполняли анализ. Столбики представляют длительность периода до падения в секундах у мышей BACHD, обработанных ISIS 388241 (черный); у мышей BACHD, обработанных PBS (заштрихованный); и у нетрансгенных детенышей одного помета, обработанных PBS (белый). У обработанных ISIS 388241 мышей наблюдали увеличенный отрезок времени до падения и, следовательно, улучшенную двигательную характеристику на вращающемся стержне по сравнению с контролем PBS.

Фиг.8

Эффект обработки антисмысловым олигонуклеотидом на массу головного мозга мышей R6/2. Шестимесячных мышей R6/2 обрабатывали 50 мкг/сутки ICV ISIS 388817 или контрольным олигонуклеотидом ISIS 141923 или PBS в течение 4 недель. Контрольные группы нетрансгенных детенышей одного помета обрабатывали подобным образом ISIS 388817 или PBS. В исследование включали контрольную группу восьминедельных не проявляющих симптомов мышей R6/2, не получающих какой-либо обработки. Столбики представляют массу головного мозга восьминедельных необработанных мышей R6/2; мышей R6/2, обработанных ISIS 141923; мышей R6/2, обработанных PBS; мышей R6/2, обработанных ISIS 388817; нетрансгенных детенышей одного помета, обработанных PBS; и нетрансгенных детенышей одного помета, обработанных ISIS 388817. У мышей R6/2, обработанных ISIS 388817, была увеличена масса головного мозга по сравнению с контролем PBS.

Фиг.9

Поведенческая характеристика обработанных антисмысловым олигонуклеотидом мышей YAC128 с использованием анализа открытого поля. П ятимесячных мышей YAC128 обрабатывали 50 мкг/сутки ICV ISIS 388241 или контрольным олигонуклеотидом ISIS 141923 или PBS в течение 14 дней. В исследование включали нетрансгенных детенышей одного помета FVB/NJ, не получающих какой-либо обработки. Мышей помещали на арену открытого поля с применением прерываний луча света для измерения горизонтального и вертикального передвижений за 30-минутный сеанс тестирования. Данные анализировали с использованием программного обеспечения Activity Monitor для проверки полного передвижения в виде ходьбы по арене и передвижения в центре арены как меры тревожности. Столбики представляют время в секундах, проведенное в центре поля мышами FVB/NJ, мышами YAC128, обработанными PBS, и мышами YAC128, обработанными ISIS 388241. Мыши YAC128, обработанные ISIS 388241, провели больше времени в центре и, следовательно, считались менее склонными к тревожности, чем контроль PBS.

Фиг.10

Поведенческая характеристика обработанных антисмысловым олигонуклеотидом мышей YAC128 с использованием анализа с приподнятым крестообразным лабиринтом. Пятимесячных мышей YAC128 обрабатывали 50 мкг/сутки ICV ISIS 388241, или контрольным олигонуклеотидом ISIS 141923, или PBS в течение 14 дней. В качестве необработанного контроля включали контрольную группу нетрансгенных детенышей одного помета FVB/NJ. Мышей помещали в центр аппарата, который состоял из двух открытых отделений и двух закрытых отделений, каждый размером 65х6,25 см, и приподнимали на 50 см над поверхностью. Регистрировали расположение мышей в аппарате и количество времени, проведенного в открытых отделениях, за 5-минутный сеанс тестирования как меру тревожности. Столбики представляют процентное отношение времени, проведенного в открытых отделениях контрольными мышами FVB/NJ, мышами YAC128, обработанными PBS, и мышами YAC128, обработанными ISIS 388241. Мыши YAC128, обработанные ISIS 388241, провели больше времени в открытых отделениях и, следовательно, считались менее склонными к тревожности, чем контроль PBS.

Подробное описание изобретения

Следует понимать, что и приведенное выше краткое раскрытие, и последующее подробное раскрытие являются иллюстративными и исключительно пояснительными, а не ограничивают заявленное настоящее изобретение. В настоящем документе применение единственного числа предусматривает множественное число, если конкретно не указано иное. Как используется в настоящем документе, применение «или» означает «и/или», если не указано иное. Кроме того, применение термина «содержащий», а также других форм, таких как «содержит» и «содержащийся», не является ограничивающим. Также термины, такие как «элемент» или «компонент», охватывают и элементы, и компоненты, содержащие одну единицу, а также и элементы, и компоненты, которые содержат более чем одну субъединицу, если конкретно не указано иное.

Подзаголовки разделов, используемые в настоящем документе, служат исключительно организационным целям и не должны истолковываться как ограничивающие описываемый субъект.Все документы или части документов, цитированные в настоящей заявке, включая без ограничения патенты, заявки на выдачу патента, статьи, книги и научные труды, тем самым определенно включены ссылкой как части документа, обсуждаемого в настоящем документе, а также во всей их полноте.

Определения

Если не представлены особенные определения, номенклатура, используемая по отношению к перечисленному далее, процедуры и методы аналитической химии, химии органического синтеза, а также медицинской и фармацевтической химии, описанные в настоящем документе, хорошо известны и широко применимы в предшествующем уровне техники. Стандартные методы могут быть использованы для химического синтеза и химического анализа. Там, где это допустимо, все патенты, заявки, опубликованные заявки и другие публикации, номера доступа в GENBANK и связанная с ними информация о последовательностях, доступная в базах данных, таких как Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), и другие данные, упомянутые в раскрытии настоящего документа, включены посредством ссылки на части документа, обсуждаемого в настоящем документе, а также во всей их полноте.

Если не указано иное, следующие выражения характеризуются следующими значениями.

Термин «2'-O-метоксиэтил» (также 2'-МОЕ и 2'-O(СН₂)₂-ОСН₃) относится к модификации O-метоксиэтила в 2'-положении фурозильного кольца. 2'-O-метоксиэтил-модифицированный сахар является модифицированным сахаром.

Термин «2'-O-метоксиэтилнуклеотид» означает нуклеотид, содержащий 2'-O-метоксиэтил-модифицированную сахарную часть.

Термин «5-метилцитозин» означает цитозин, модифицированный метильной группой, присоединенной в 5'-положении. 5-Метилцитозин является модифицированным нуклеотидным основанием.

Термин «активное фармацевтическое средство» означает вещество или вещества в фармацевтической композиции, которые обеспечивают терапевтическое благоприятное воздействие при введении субъекту. Например, согласно определенным вариантам осуществления активным фармацевтическим средством является антисмысловой олиго нуклеотид, нацеленный на гентингтин.

Термин «активный мишеневый участок» или «мишеневый участок» означает участок, на который нацелены одно или несколько активных антисмысловых соединений. Термин «активные антисмысловые соединения» означает антисмысловые соединения, которые снижают содержание мишеневой нуклеиновой кислоты или содержание белка.

Термин «вводимые одновременно» относится к совместному введению двух средств каким-либо путем, при котором фармакологические эффекты обоих проявляются у пациента в одно и то же время. Одновременное введение не требует, чтобы оба средства вводились в одной фармацевтической композиции, в одной лекарственной форме или одним и тем же путем введения. Эффекты обоих средств не должны проявляться в одно и то же время. Эффекты только должны перекрываться за период времени и не должны быть совпадающими.

Термин «введение» означает предоставление фармацевтического средства субъекту и предусматривает без ограничения введение медиком и самостоятельное введение.

Термин «облегчение» относится к уменьшению по меньшей мере одного показателя, признака или симптома ассоциированного заболевания, нарушения или состояния. Тяжесть показателей может быть определена субъективными или объективными измерениями, к оторые известны специалистам в настоящей области техники.

Термин «животное» относится к человеку или отличному от человека животному, включая без ограничения мышей, крыс, кроликов, собак, кошек, свиней и отличных от человека приматов, включая без ограничения обезьян и шимпанзе.

Термин «антисмысловая активность» означает какую-либо выявляемую или измеряемую активность, свойственную гибридизацию антисмыслового соединения с его мишеневой нуклеиновой кислотой. Согласно определенным вариантам осуществления антисмысловая активность заключается в снижении количества или экспрессии мишеневой нуклеиновой кислоты или белка, кодируемого такой мишеневой нуклеиновой кислотой.

Термин «антисмысловое соединение» означает олигомерное соединение, которое способно претерпевать гибридизацию с мишеневой нуклеиновой кислотой посредством водородной связи.

Термин «антисмысловое ингибирование» означает снижение содержания мишеневой нуклеиновой кислоты или содержания мишеневого белка в присутствии антисмыслового соединения, комплементарного мишеневой нуклеиновой кислоте, по сравнению с содержанием мишеневой нуклеиновой кислоты или содержания мишеневого белка в отсутствие антисмыслового соединения.

Термин «антисмысловой олигонуклеотид» означает одноцепочечный олигонуклеотид, характеризующийся последовательностью нуклеотидных оснований, которая обеспечивает гибридизацию с соответствующим участком или сегментом мишеневой нуклеиновой кислоты.

Термин «бициклический сахар» означает фурозильное кольцо, модифицированное путем образования мостиковой связи двух негеминальных кольцевых атомов. Бициклический сахар является модифицированным сахаром.

Термин «бициклическая нуклеиновая кислота» или «BNA» относится к нуклеозиду или нуклеотиду, где фуранозная часть нуклеозида или нуклеотида содержит мостик, соединяющий два атома углерода в фуранозном кольце, таким образом, образуя бициклическую кольцевую систему.

Термин «кэп-структура» или «концевая кэп-часть» означает химические модификации, которые были включены на одном из двух концов антисмыслового соединения.

Термин «химически отличающийся участок» относится к участку антисмыслового соединения, который некоторым образом химически отличается от другого участка того же антисмыслового соединения. Например, участок, содержащий 2'-O-метоксиэтильные нуклеотиды, является химически отличающимся от участка, содержащего нуклеотиды без 2'-O-метоксиэтильных модификаций.

Термин «химерное антисмысловое соединение» означает антисмысловое соединение, которое содержит по меньшей мере два химически отличающихся участка.

Термин «совместное введение» означает введение двух или более фармацевтических средств субъекту. Два или более фармацевтических средства могут находиться в одной фармацевтической композиции или могут находиться в отдельных фармацевтических композициях. Каждое из двух или более фар мацевтических средств может быть введено одним и тем же или различными путями введения. Совместное введение подразумевает параллельное или последовательное введение.

Термин «комплементарность» означает способность к спариванию между нуклеотидными основаниями первой нуклеиновой кислоты и второй нуклеиновой кислоты.

Термин «смежные нуклеотидные основания» означают нуклеотидные основания, непосредственно прилегающие друг к другу.

Термин «разбавитель» означает ингредиент композиции, который не обладает фармакологической активностью, но фармацевтически необходим или желателен. Например, разбавителем в инъекционной композиции может быть жидкость, например, солевой раствор.

Термин «доза» означает определенное количество фармацевтического средства, введенного в одном введении или за определенный период времени. Согласно определенным вариантам осуществления доза может быть введена в виде одного, двух или более болюсов, таблеток или инъекций. Например, согласно определенным вариантам осуществления, когда желательно подкожное введение, для желаемой дозы необходим объем, который не помещается в одной инъекции, следовательно, могут быть использованы две или более инъекции для достижения желаемой дозы. Согласно определенным вариантам осуществления фармацевтическое средство вводится путем инфузии в течение длительного периода времени или постоянно. Дозы могут быть установлены как количество фармацевтического средства в час, сутки, неделю или месяц.

Термин «эффективное количество» означает количество активного фармацевтического средства, достаточное для достижения желаемого физиологического результата у субъекта, нуждающегося в указанном средстве. Эффективное количество может быть разным для субъектов в зависимости от состояния здоровья и физического состояния субъекта, подлежащего лечению, таксономической группы субъектов, подлежащих лечению, состава композиции, оценки клинического состояния субъекта и других соответствующих факторов.

Термин «нуклеиновая кислота гентингтина» означает какую-либо нуклеиновую кислоту, кодирующую гентингтин. Например, согласно определенным вариантам осуществления нуклеиновая кислота гентингтина содержит последовательность ДНК, кодирующую гентингтин, последовательность РНК, транскрибированную с ДНК, кодирующей гентингтин (в том числе геномной ДНК, содержащей интроны и экзоны), и последовательность мРНК, кодирующую гентингтин. Термин «мРНК гентингтина» означает мРНК, кодирующую белок гентингтин.

Термин «полностью комплементарное» или «на 100% комплементарное» означает, что каждое нуклеотидное основание последовательности нуклеотидных оснований первой нуклеиновой кислоты имеет комплементарное нуклеотидное основание во второй последовательности нуклеотидных оснований второй нуклеиновой кислоты. Согласно определенным вариантам осуществления первой нуклеиновой кислотой является антисмысловое соединение, а мишеневая нуклеиновая кислота является второй нуклеиновой кислотой.

Термин «гэпмер» означает химерное антисмысловое соединение, в котором внутренний участок, содержащий несколько нуклеозидов, которые обеспечивают расщепление РНКазой Н, расположен между внешними участками, содержащими один или несколько нуклеозидов, где нуклеозиды внутреннего участка химически отличаются от нуклеозида или нуклеозидов внешних участков. Внутренний участок может быть назван «гэп-сегментом», а внешние участки могут быть названы «фланкирующими сегментами».

Термин «гэп-фланкированный» означает химерное антисмысловое соединение, содержащее гэп-сегмент из 12 или более смежных 2'-дезоксирибонуклеозидов, расположенных между 5'- и 3'-фланкирующими сегментами, содержащими от одного до шести нуклеозидов, и непосредственно прилегающих к ним.

Термин «гибридизация» означает отжиг комплементарной молекулы нуклеиновой кислоты. Согласно определенным вариантам осуществления комплементарные молекулы нуклеиновой кислоты содержат антисмысловое соединение и мишеневую нуклеиновую кислоту.

Термин «непосредственно прилегающие» означает отсутствие промежуточных элементов между непосредственно прилегающими элементами.

Термин «субъект» означает человека или отличного от человека животного, выбранного для лечения или терапии.

Термин «межнуклеозидная связь» относится к химической связи между нуклеозидами.

Термин «связанные нуклеозиды» означают прилегающие нуклеозиды, которые связаны вместе.

Термин «ошибочное спаривание» или «некомплементарное нуклеотидное основание» относится к случаю, когда нуклеотидное основание первой нуклеиновой кислоты не способно спариваться с соответствующим нуклеотидным основанием второй или мишеневой нуклеиновой кислоты.

Термин «модифицированная межнуклеозидная связь» относится к замене или какому-либо изменению природной межнуклеозидной связи (т.е. фосфодиэфирной межнуклеозидной связи).

Термин «модифицированное нуклеотидное основание» относится к какому-либо нуклеотидному основанию, отличному от аденина, цитозина, гуанина, тимидина или урацила. Термин «немодифицированное нуклеотидное основание» означает пуриновые основания - аденин (А) и гуанин (G), и пиримидиновые основания - тимин (Т), цитозин (С) и урацил (U).

Термин «модифицированный нуклеотид» означает нуклеотид, независимо содержащий модифицированную сахарную часть, модифицированную межнуклеозидную связь или модифицированное нуклеотидное основание. Термин «модифицированный нуклеозид» означает нуклеозид, независимо содержащий модифицированную сахарную часть или модифицированное нуклеотидное основание.

Термин «модифицированный олигонуклеотид» означает олигонуклеотид, содержащий по меньшей мере один модифицированный нуклеотид.

Термин «модифицированный сахар» относится к замене или изменению в нормальном сахаре.

Термин «мотив» означает паттерн химически отличающихся участков в антисмысловом соединении.

Термин «природная межнуклеозидная связь» означает 3'- - 5'-фосфодиэфирную связь.

Термин «природная сахарная часть» означает сахар, встречающийся в ДНК (2'-Н) или РНК (2'-ОН).

Термин «нуклеиновая кислота» относится к молекулам, состоящим из мономерных нуклеотидов. Нуклеиновая кислота включает в себя рибонуклеиновые кислоты (РНК), дезоксирибонуклеиновые кислоты (ДНК), одноцепочечные нуклеиновые кислоты, двухцепочечные нуклеиновые кислоты, малые интерферирующие рибонуклеиновые кислоты (siRNA) и ми кроРНК (miRNA). Нуклеиновая кислота также может содержать комбинацию из этих элементов в одной молекуле.

Термин «нуклеотидное основание» означает гетероциклическую часть, способную к спариванию с основанием другой нуклеиновой кислоты.

Термин «последовательность нуклеотидных оснований» означает порядок смежных нуклеотидных оснований, независимый от какой-либо модификации сахара, связи или нуклеотидного основания.

Термин «нуклеозид» означает нуклеотидное основание, связанное с сахаром.

Термин «нуклеотид» означает нуклеозид, содержащий фосфатную группу, ковалентно связанную с сахарной частью нуклеозида.

Термин «олигомерное соединение» или «олигомер» означает полимер из связанных мономерных субъединиц, который способен гибридизоваться по меньшей мере с участком молекулы нуклеиновой кислоты.

Термин «олигонуклеотид» означает полимер из связанных нуклеозидов, каждый из которых может быть модифицированным или немодифицированным независимо друг от друга.

Термин «парентеральное введение» означает введение путем инъекции или инфузии. Парентеральное введение включает в себя подкожное введение, внутривенное введение, внутримышечное введение, внутриартериальное введение, внутрибрюшинное введение или внутричерепное введение, например, внутриоболочечное или внутрицеребровентрикулярное введение. Введение может быть постоянным или хроническим или коротким или интермиттирующим.

Термин «пептид» означает молекулу, образованную посредством связывания по меньшей мере двух аминокислот амидными связями. Пептид относится к полипептидам и белкам.

Термин «фармацевтическая композиция» означает смесь веществ, подходящих для введения субъекту. Например, фармацевтическая композиция может содержать одно или несколько активных фармацевтических средств и стерильный водный раствор.

Термин «фармацевтически приемлемые соли» означают физиологически и фармацевтически приемлемые соли антисмысловых соединений, т.е. соли, которые сохраняют желаемую биологическую активность исходного олигонуклеотида и при этом не обладают нежелательными токсикологическими эффектами.

Термин «фосфоротиоатная связь» означает связь между нуклеозидами, при этом фосфодиэфирная связь модифицирована путем замещения одного из необразующих мостиковую связь атомов кислорода атомом серы. Фосфоротиоатная связь является модифицированной межнуклеозидной связью.

Термин «часть» означает определенное число смежных (т.е. связанных) нуклеотидных оснований нуклеиновой кислоты. Согласно определенным вариантам осуществления частью является определенное число смежных нуклеотидных оснований мишеневой нуклеиновой кислоты. Согласно определенным вариантам осуществления частью является определенное число смежных нуклеотидных оснований антисмыслового соединения.

Термин «профилактика» относится к задерживанию или к предупреждению начала или развития заболевания, нарушения или состояния в течение периода времени от минут до неограниченного периода. Термин «профилактика» также означает снижение риска развития заболевания, нарушения или состояния.

Термин «пролекарство» означает терапевтическое средство, которое получают в неактивной форме, которая превращается в активную форму в организме или в его клетках под действием эндогенных ферментов или других химических веществ или условий.

Термин «побочные эффекты» означает физиологические ответы, сопровождающие лечение, отличные от желаемых эффектов. Согласно определенным вариантам осуществления побочными эффектами являются реакции в месте инъекции, патологии при тесте функции печени, патологии функции почек, печеночная токсичность, почечная токсичность, патологии центральной нервной системы, миопатии и дискомфорт.Например, повышенное содержание аминотрансферазы в сыворотке крови может указывать на печеночную токсичность или патологию функции печени. Например, повышенное содержание билирубина может указывать на печеночную токсичность или патологию функции печени.

Термин «одноцепочечный олигонуклеотид» означает олигонуклеотид, который не гибридизован с комплементарной нитью.

Термин «специфично гибридизуемый» относится к антисмысловому соединению, характеризующемуся достаточной степенью к омплементарности между антисмысловым олигонуклеотидом и мишеневой нуклеиновой кислотой для индуцирования желаемого эффекта, при этом оказывающему минимальные эффекты или не оказывающему эффектов на немишеневые нуклеиновые кислоты, при условиях, при которых желательно специфичное связывание, т.е. при физиологических условиях в случае анализов in vivo и методов терапевтического лечения.

Термин «нацеливание» или «нацеленный» означает процесс разработки и выбора антисмыслового соединения, которое будет специфично гибридизоваться с мишеневой нуклеиновой кислотой и индуцировать желаемый эффект.

Термины «мишеневая нуклеиновая кислота», «мишеневая РНК» и «транскрипт мишеневой РНК» относятся к нуклеиновой кислоте, способной быть мишенью антисмыслового соединения.

Термин «мишеневый сегмент» означает последовательность нуклеотидов мишеневой нуклеиновой кислоты, на которую нацелено антисмысловое соединение. Термин «5'-мишеневый сайг» относится к самому крайнему нуклеотиду с 5'-конца мишеневого сегмента. Термин «3'-мишеневый сайт» относится к самому крайнему нуклеотиду с 3'-конца мишеневого сегмента.

Термин «терапевтически эффективное количество» означает количество фармацевтического средства, которое оказывает терапевтический эффект на субъекта.

Термин «лечение» относится к введению фармацевтической композиции для эффекта изменения или положительной динамики заболевания, нарушения или состояния.

Термин «немодифицированный нуклеотид» означает нуклеотид, состоящий из природных нуклеотидных оснований, сахарных частей и межнуклеозидных связей. Согласно определенным вариантам осуществления немодифицированным нуклеотидом является нуклеотид РНК (т.е. β-D-рибонуклеозиды) или нуклеотид ДНК (т.е. β-D-дезоксирибонуклеозид).

Определенные варианты осуществления

Согласно определенным вариантам осуществления предусмотрены способы, соединения и композиции для ингибирования экспрессии гентингтина.

Согласно определенным вариантам осуществления предусмотрены антисмысловые соединения, нацеленные на нуклеиновую кислоту гентингтина. Согласно определенным вариантам осуществления нуклеиновой кислотой гентингтина является любая из последовательностей, изложенных под №доступа в GENBANK NM_002111.6 (включенных в настоящий документ как SEQ ID NO:1), под №доступа в GENBANK NT_006081.17, процессированных из нуклеотидов 462000-634000 (включенных в настоящий документ как SEQ ID NO:2), под №доступа в GENBANK NM_010414.1 (включенных в настоящий документ как SEQ ID NO:3), комплементарной последовательности с №доступа в GENBANK NW_001109716.1, процессированной из нуклеотидов 698000-866000 (включенной в настоящий документ как SEQ ID NO:4), и под №доступа в GENBANK NM_024357.2 (включенной в настоящий документ как SEQ ID NO:5).

Согласно определенным вариантам осуществления предусмотрены соединения, содержащие модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 12-30 связанных нуклеозидов, где связанные нуклеозиды содержат по меньшей мере 8 смежных нуклеотидных оснований последовательности, выбранной из последовательностей нуклеотидных оснований, изложенных в SEQ ID NO:6, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 19, 20, 21, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 32, 33, 35, 36, 10, 11, 12, 13, 18, 22, 32. Согласно определенным вариантам ос уществления модифицированный о лигонуклеотид содержит по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11 или по меньшей мере 12 смежных нуклеотидных оснований последовательности, выбранной из последовательностей нуклеотидных оснований, изложенных в SEQ ID NO:6, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 19, 20, 21, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 32, 33, 35, 36, 10, 11, 12, 13, 18, 22, 32. Согласно определенным вариантам осуществления последовательности нуклеотидных оснований изложены в SEQ ID NO:24, 25, 26, 6, 12, 28, 21, 22, 32, 13. Согласно определенным вариантам ос уществления модифицированный о лигонуклеотид содержит по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, или по меньшей мере 12 смежных нуклеотидных оснований последовательности, выбранной из последовательностей нуклеотидных оснований, изложенных в SEQ ID NO:12, 22, 28, 30, 32 и 33.

Согласно определенным вариантам осуществления предусмотрены соединения, содержащие модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 15-25 связанных нуклеозидов, где связанные нуклеозиды содержат по меньшей мере 8 смежных нуклеотидных оснований последовательности, выбранной из последовательностей нуклеотидных оснований, изложенных в SEQ ID NO:6, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 19, 20, 21, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 32, 33, 35, 36, 10, 11, 12, 13, 18, 22, 32. Согласно определенным вариантам ос уществления модифицированный о лигонуклеотид содержит по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14 или по меньшей мере 15 смежных нуклеотидных оснований последовательности, выбранной из последовательностей нуклеотидных оснований, изложенных в SEQ ID NO:6, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 19, 20, 21, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 32, 33, 35, 36, 10, 11, 12, 13, 18, 22, 32. Согласно определенным вариантам осуществления последовательности нуклеотидных оснований изложены в SEQ ID NO:24, 25, 26, 6, 12, 28, 21, 22, 32, 13. Согласно определенным вариантам осуществления модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14 или по меньшей мере 15 смежных нуклеотидных оснований последовательности, выбранной из последовательностей нуклеотидных оснований, изложенных в SEQ ID NO:12, 22, 28, 30, 32 и 33.

Согласно определенным вариантам осуществления предусмотрены соединения, содержащие модифицированный олигонуклеотид, состоящий из 18-21 связанных нуклеозидов, где связанные нуклеозиды содержат по меньшей мере 8 смежных нуклеотидных оснований последовательности, выбранной из последовательностей нуклеотидных оснований, изложенных в SEQ ID NO:6, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 19, 20, 21, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 32, 33, 35, 36, 10, 11, 12, 13, 18, 22 и 32. Согласно определенным вариантам ос уществления модифицированный о лигонуклеотид содержит по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17 или по меньшей мере 18 смежных нуклеотидных оснований последовательности, выбранной из последовательностей нуклеотидных оснований, изложенных в SEQ ID NO:6, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 19,20, 21,23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 32, 33, 35, 36, 10, 11, 12, 13, 18, 22 и 32. Согласно определенным вариантам осуществления последовательности нуклеотидных оснований изложены в SEQ ID NO:24, 25, 26, 6, 12, 28, 21, 22, 32, 13. Согласно определенным вариантам осуществления модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, или по меньшей мере 18 смежных нуклеотидных оснований последовательности, выбранной из последовательностей нуклеотидных оснований, изложенных в SEQ ID NO:12, 22, 28, 30, 32 и 33.

Модуляция экспрессии гентингтина

Патент 2562861