Дегтярев Сергей Харитонович (RU)

Изобретение относится к биотехнологии и генной инженерии и касается получения нового штамма, используемого для выделения новой эндонуклеазы рестрикции BisI, которая может быть использована для выявления модифицированной ДНК. Штамм Bacillus subtilis 230, выделенный из почвы в результате поиска продуцентов рестриктаз, обеспечивает получение эндонуклеазы рестрикции BisI, узнающей и расщепляющей обе ц...

Изобретение относится к биотехнологии и генной инженерии и касается получения нового штамма, используемого для выделения новой эндонуклеазы рестрикции Gla I. Такая эндонуклеаза может быть использована для выявления метилированной ДНК. Штамм Glacial ice bacterium I выделен из водоема в результате поиска продуцентов рестриктаз и обеспечивает получение эндонуклеазы рестрикции Gla I, узнающей и расщеп...

Изобретение относится к области биотехнологии и генной инженерии и может быть использовано для анализа ДНК. Из почвы выделен штамм Glacial ice bacterium, обеспечивающий получение сайт-специфической эндонуклеазы, узнающей и расщепляющей обе цепи метилированной нуклеотидной последовательности ДНК 5′-G(m5C)↓NG(m5C)-3′. Применение изобретения обеспечивает получение новой специф...

Изобретение относится к биотехнологии и генной инженерии. Предложен штамм Bacillus simplex 23, выделенный из почвы и обеспечивающий получение сайт-специфической эндонуклеазы, узнающей и расщепляющей обе цепи нуклеотидной последовательности ДНК, содержащей хотя бы одно С5-метилцитозиновое основание в сайте узнавания 5′-GCNGC-3′ с образованием однонуклеотидных 3′-выступающих...

Изобретение относится к области биотехнологии. Получен штамм бактерий Arthrobacter luteus В, продуцент сайт-специфической эндонуклеазы Alu BI. Изобретение может быть использовано для получения эндонуклеазы рестрикции, которая узнает и расщепляет обе цепи нуклеотидной последовательности ДНК 5'-AGCT-3' как без метилированных оснований, так и в случае, если в сайте узнавания метилирован один или два...

Изобретение относится к биотехнологии и может быть использовано для сайт-специфического гидролиза ДНК, содержащей С5-метилцитозиновые основания. Из почвы выделен штамм Paracoccus carotinifaciens 3К, обеспечивающий получение сайт-специфической эндонуклеазы, которая узнает и расщепляет обе цепи нуклеотидной последовательности ДНК, содержащей четыре С5-метилцитозиновых оснований в сайте узнавания 5...

Изобретение относится к биотехнологии и генной инженерии и касается штамма бактерий, продуцирующего новую сайт-специфическую эндонуклеазу KroI. Предложен штамм бактерий Kocuria rosea 307, выделенный из почвы и обеспечивающий получение сайт-специфической эндонуклеазы KroI. Эндонуклеаза KroI узнает и расщепляет обе цепи нуклеотидной последовательности ДНК 5'-GCCGGC-3'/3'-CGGCCG-5', в которых два це...

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к штамму бактерий Arthrobacter oxydans 25K. Штамм бактерий Arthrobacter oxydans 25К выделяют из почвы. Данный штамм обеспечивает получение сайт-специфической эндонуклеазы Aoxl, узнающей и расщепляющей обе цепи нуклеотидной последовательности ДНК 5'-GGCC-3/3'-CCGG-5', в которых два центральных цитозина метилированы в положении С5, с образован...

Изобретение относится к биотехнологии и может быть использовано в медицинской практике. Предложен способ определения гиперметилированных CpG островков в области генов-супрессоров опухолевого роста в ДНК человека, который предусматривает получение образцов высокоочищенной ДНК; фрагментацию выделенной ДНК эндонуклеазой рестрикции, не имеющей сайта узнавания в амплифицируемом районе, в частности Taq...

Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой штамм бактерии Microbacterium testaceum 17В, депонированный под №ВКПМ В-10628 во Всероссийской Коллекции Промышленных микроорганизмов ФГУП ГосНИИгенетика, являющийся продуцентом сайт-специфической эндонуклеазы MteI. Изобретение позволяет получить сайт-специфическую эндонуклеазу, которая узнает и расщепляет обе цепи нуклеотидной последоват...

Изобретение относится к области биотехнологии и генной инженерии и касается штамма бактерий Planomicrobium koreense 78k. Предложенный штамм бактерий Planomicrobium koreense 78k выделен из почвы и обеспечивает получение сайт-специфической эндонуклеазы PkrI, узнающей и расщепляющей обе цепи нуклеотидной последовательности ДНК, которая содержит три или четыре С5-метилцитозиновых оснований в сайте уз...

Изобретение относится к биотехнологии. Предложенный способ предусматривает получение образцов высокоочищенной ДНК, фрагментацию выделенной ДНК эндонуклеазой рестрикции, не имеющей сайта узнавания в амплифицируемом районе, гидролиз фрагментированной ДНК метилзависимой сайт-специфической ДНК-эндонуклеазой GlaI или ее изошизомером, лигирование универсального олигонуклеотидного адаптера к гидролизов...

Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli N41 (pBpuN4/MR), который получен путем трансформации штамма Escherichia coli ER2267 плазмидой pBpuN4/MR N41, полученной на основе плазмиды pUC19 и содержащей ген, кодирующий ДНК-метилтрансферазу M.BpuN4I, метилирующую один из цитозинов в положении С5 в последовательности 5'-GGNNCC-3', и ген...

Изобретение относится к биотехнологии и молекулярной генетике. Способ предусматривает картирование положений ряда метилированных нуклеотидных последовательностей Pu(5mC)GPy в протяженной ДНК для построения эпигенетического профиля и выявления аномально метилированных участков ДНК. Способ включает выделение высокоочищенной геномной ДНК, которую гидролизуют в реакционном буфере метилзависимой сайт...

Изобретение относится к биотехнологии и молекулярной генетике. Описан способ определения нуклеотидной последовательности (сайта) 5'-R(5mC)GY-3'/3'-YG(5mC)R-5' в заданном положении протяженной ДНК. Способ включает гидролиз высокоочищенной геномной ДНК метилзависимой сайт-специфической ДНК-эндонуклеазой GlaI, лигирование универсального олигонуклеотидного адаптера с последующей амплификацией в реал...

Изобретение относится к фармацевтической промышленности, а именно к способу получения рекомбинантного штамма бактерий Escherichia coli N106 (pM.AgsI) . Рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli N106 (pM.AgsI) получают трансформацией клеток штамма Escherichia coli RR1 плазмидой pM.AgsI-106, продуцирующий ДНК-метилтрансферазу M.AgsI, узнающую нуклеотидную последовательность ДНК 5′-TTSAA-3′ и...

Изобретение относится к области биотехнологии и представляет собой штамм Plantibacter flavus 3Kz, депонированный в ВКПМ под регистрационным номером В-12248, являющийся продуцентом метилзависимой сайт-специфической эндонуклеазы PfsI, которая узнает и расщепляет обе цепи последовательности ДНК , перед центральным нуклеотидом N, с образованием однонуклеотидных 5′-выступающих концов, при наличии в...

Группа изобретений относится к области молекулярной биологии и может быть использована в молекулярно-генетической диагностике онкологических заболеваний. Способ предусматривает проведение биоинформационного анализа предшествующих публикаций о генах-онкомаркерах колоректального рака и отбор генов, метилирование сайтов PuCGPy регуляторных областей которых происходит с высокой частотой в ДНК клето...

Изобретение относится к области биотехнологии. Способ предусматривает приготовление реакционной смеси, содержащей буферный раствор и исследуемый образец ДНК. Добавляют к смеси ДНК-метилтрансферазу с активностью 2 е.а./мкл, модифицирующую цитозин в положении С5, выбранную из группы: Fsp4HI, НаеIII, HspAI, AluI, в зависимости от того, какой сайт необходимо расщепить, смесь инкубируют в течение час...

Изобретение относится к области биотехнологии и представляет собой способ сайт-специфического гидролиза С5-метилированной последовательности ДНК. Готовят реакционную смесь, содержащую буферный раствор и образец С5-метилированной ДНК, добавляют к смеси диметилсульфоксид до конечной концентрации 15-25%, а затем MD-эндонуклеазу, смесь инкубируют в течение часа при 30-37°C с последующим анализом ре...

Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli N42 (pElmI), являющийся продуцентом метилзависимой сайт-специфической ДНК-эндонуклеазы ElmI, расщепляющей обе цепи последовательности ДНК 5′-GC^NGC-3′/3′-CGN^CG-5′, в которой не менее трех цитозинов метилированы в положении С5 с образованием 5′-выступающих однонуклеотидных концов. Штамм полу...

Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli N16 (pM.AluBI), являющийся продуцентом ДНК-метилтрансферазы AluBI, переносящей метальную группу с S-аденозил-L-метионина (SAM) на 6-й атом азота аденинового основания сайта узнавания, с образованием метилированной последовательности 5′-(m6A)GCT-3′/3′-TCG(m6A)-5′ на обеих цепях ДНК. Штамм по...

Изобретение относится к области биотехнологии. Штамм Micrococcus luteus, депонированный под регистрационным номером В-12410 во Всеросиийской Коллекции Промышленных Микроорганизмов ФГУП ГосНИИГенетика, является продуцентом сайт-специфической метилзависимой эндонуклеазы MluVI. Изобретение обеспечивает получение нового фермента MD-эндонуклеазы, который узнает и расщепляет обе цепи последовательности...

Изобретение относится к области биохимии. Описана группа изобретений, включающая набор олигонуклеотидных праймеров и флуоресцентно-меченых зондов для идентификации злокачественного поражения толстого кишечника и прямой кишки посредством анализа в образцах ДНК метелирования сайтов RCGY в заданных положениях регуляторных областей генов-онкомаркеров методом GLAD-ПЦР и способ идентификации злокачестве...